研究課題/領域番号 |
21K05954
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分42020:獣医学関連
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研究機関 | 岩手大学 |
研究代表者 |
関 まどか 岩手大学, 農学部, 助教 (20700488)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
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キーワード | 肝蛭 / 遺伝子型解析 / 定量的PCR / 単為生殖型肝蛭 / 人獣共通感染症 / 寄生虫 / 単為生殖 / 2倍体 / 3倍体 / 獣医学 / 寄生虫学 |
研究開始時の研究の概要 |
肝蛭症は人獣共通感染性の吸虫症である。アジアには単為生殖型肝蛭が分布する。単為生殖型肝蛭には祖先種と同じ2倍体に加えて、3倍体がある。3倍体は病害が強いため、被害状況の把握が強く求められているが、アジアでは人体症例の原因種すら正確に診断されていない。また、分類学的な種が未確定のため、医療・獣医療従事者に認識されていない。本研究では、定量的PCR法を開発し、単為生殖型3倍体の遺伝子型を解析する。これにより、3倍体の ① 分子学的鑑別法が世界で初めて確立され、②大規模疫学調査が実現する。さらに、遺伝子型の解析により3倍体の出現様式を解明できるため、③ 単為生殖型肝蛭の分類学的位置を決定できる。
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研究実績の概要 |
本年度は、予定外のリアルタイムPCR装置の変更に伴い、昨年度に確立した定量的PCRの条件を再度検討した。その結果、これまで以上の精度で遺伝子型を判定可能になった。 一方、サンプリング条件が整わず、死後時間が経過してから固定された虫体から抽出したゲノムDNAを用いると、定量的PCCRで理論通りの遺伝子型判定が困難であることが判明した。したがって、今後、判定に適するDNAの品質を検討する必要が示された。 また、これまでは核DNAマーカーであるホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ(pepck)とDNAポリメラーゼδ(pold)をターゲットとしてきたが、より多くのマーカーを用いれば遺伝子型の判定精度が上がると考えたことから、新たな核DNAマーカーとしてFatty acid binding protein type I(FABP typeI)に着目した。pepckとpoldと同様にFABP type Iも、種鑑別マーカーとして十分な信頼性を有しており、単為生殖型肝蛭の遺伝子型判定に有用であることが明らかとなった。現在、FABP type Iをターゲットにした遺伝子型判定のための定量的PCRを検討中である。 次年度以降は、DNAの品質の課題を解決するとともに、世界各地の肝蛭を用いた疫学調査を行い、単為生殖型肝蛭2倍体と3倍体の分布状況と遺伝子型を明らかにし、3倍体の出現様式を解明する予定である。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
機材変更に左右されない定量的PCRの条件を確立できたため。また、新たな核DNAマーカーとしてFABP type Iが有効であることを明らかにできたため。
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今後の研究の推進方策 |
新たに見出したFABP type Iを用いた定量的PCRを確立する。また、最終年度にはTaqManプローブを用いた定量的Multiplex PCRの開発も実現したい。
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