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チューブリン結合によるダイニン活性化の構造基盤の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K06096
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分43040:生物物理学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

今井 洋  大阪大学, 大学院理学研究科, 助教 (60391869)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2023年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードダイニン / 微小管 / クライオ電子顕微鏡 / 構造解析 / モータータンパク質 / 分子モーター / 細胞骨格 / 単粒子解析 / チューブリン
研究開始時の研究の概要

細胞質ダイニンは、細胞骨格である微小管に沿って、細胞内物質を輸送する重要なタンパク質である。例えば、細胞膜周辺部から核に向けて、ミトコンドリア、mRNA、アミロイドβタンパク質などを運ぶ。細胞質ダイニンが微小管に結合した構造は、2つの部分構造として報告されている。しかし、多くのタンパク質複合体で、全体構造が解明されたときに、複数の部分構造を合わせたものと全体構造とに差異があることが報告されている。そこで、本研究では、細胞質ダイニンが微小管に結合した全体構造を、クライオ電子顕微鏡を使って明らかにすることを目的とする。この構造がわかると、ヒトの神経変性疾患の発病の分子メカニズムの解明などに役立つ。

研究実績の概要

細胞質ダイニンは、真核生物の細胞内物質を能動的に輸送する主要なタンパク質である。特に、細胞質ダイニンは、細胞周辺部から細胞中心方向への物質輸送を行うという機能を果たしている。細胞内の積荷は、成長因子やミトコンドリアなどのオルガネラなどである。ダイニンによる力発生はATPの化学的なエネルギーを力学的なエネルギーに変換することで達成される。ダイニンの力発生前と力発生後という2つの極端な状態での構造は報告されているが、それらの間でどのような中間状態があるかは依然としてなぞである。この疑問を解くために、私達は、細胞質ダイニンが力発生を行うドメインであるモータードメインの構造変化をクライオ電子顕微鏡・単粒子解析法で解析することにした。
その結果、これまでに報告されていない複数の新規構造を近原子分解能で得ることができた。2023年12月には米国ボストンで開催されたアメリカ細胞生物学会でポスター発表した。現在、論文投稿に向けて、執筆を行っている。
次に、細胞質ダイニンが微小管に結合するときの構造変化を捉えるために、微小管に細胞質ダイニンを結合させて、クライオ電子顕微鏡で撮影している。撮影できたものから構造解析を進行させている。
さらに、細胞質ダイニンだけでなく、繊毛ダイニンは、精子などを水中で前進させるために、繊毛の駆動力を発生させるダイニンであるが、この構造解析も行っている。繊毛ダイニンは約10種類あることが遺伝子配列から知られているが、近原子分解能の構造が分かっているのは、3種類のみである。私達は、複数の繊毛ダイニンの構造を近原子分解能で得ることができ、2024年1月の生体運動合同班会議で口頭発表した。現在、論文投稿の準備を進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

細胞膣ダイニンの新たな中間構造を近原子分解能で得たが、学会発表した際に、ヌクレオチド結合部位の分解能が問題になった。そこで、分解能を改善すべく、撮影枚数を以前の10倍に増やすことで、ダイニンとして世界最高分解能で、近原子分解能で構造を得ることに成功した。撮影と解析をやり直したために、半年ほど計画よりも遅れてしまったが、質の高いデータで、よりよい論文を目指したいと考えている。現在、論文投稿を目指して、図の作成、文章の作成を進行させている。

今後の研究の推進方策

まず初めに、細胞膣ダイニンの新たな中間構造を近原子分解能で得たので、これを論文として、発表する。そして、微小管に結合した細胞質ダイニンの撮影を進めていき、近原子分解能の構造を得ることを目指す。

報告書

(3件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2024 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件) 備考 (6件)

  • [国際共同研究] Prof. Peter Knight/University of Leeds(英国)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Two different linker conformations of the cytoplasmic dynein motor domain in the presence of ADP2024

    • 著者名/発表者名
      H. Imai, R. Kanazawa, R. Shimo-Kon, T. Kon
    • 雑誌名

      Molecular Biology of the Cell

      巻: 35

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] 微小管の自発的核生成2023

    • 著者名/発表者名
      IMAI Hiroshi、MUTO Etsuko
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 63 号: 6 ページ: 299-302

    • DOI

      10.2142/biophys.63.299

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Effects of high hydrostatic pressure to swimming sea urchin sperm flagella2023

    • 著者名/発表者名
      H. Imai, M. Nishiyama, Y. Kaminoe, Y. Harada, T. Kon, S. Kamimura
    • 雑誌名

      Molecular Biology of the Cell

      巻: 35

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] 繊毛ダイニン・細胞質ダイニン・IFT ダイニンの構造的共通性と多様性2024

    • 著者名/発表者名
      雷宜慈, 今井洋, 山本遼介, 下理恵子, 宮田知子, 梶村直子, 八木俊樹, 上村慎治, 光岡薫, 難波啓一, 昆隆英
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議2024
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 繊毛微小管内部タンパク質 Rib43a は正常な繊毛運動と繊毛軸糸の物理的安定性に重要である2024

    • 著者名/発表者名
      丹羽蘭丸, 山本遼介, 今井洋, 柴小菊, 八木俊樹, 稲葉一男, 昆隆英
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議2024
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Two different linker conformations of the cytoplasmic dynein motor domain in the presence of ADP2023

    • 著者名/発表者名
      H. Imai, R. Kanazawa, R. Shimo-Kon, T. Kon
    • 学会等名
      Cell Bio2023(アメリカ細胞生物学会)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Effects of high hydrostatic pressure to swimming sea urchin sperm flagella2023

    • 著者名/発表者名
      H. Imai, M. Nishiyama, Y. Kaminoe, Y. Harada, T. Kon, S. Kamimura
    • 学会等名
      Cell Bio2023(アメリカ細胞生物学会)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡による 14 本から 16 本プロトフィラメント GMPCPP 微小管の構造解析2023

    • 著者名/発表者名
      前嶋 捷久, 岡本 玲菜, 今井 洋, 梶村 直子, 光岡 薫, 廣瀬 未果, 加藤 貴之, 成田 哲博, 昆 隆英
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] New insights into the mechanism of dynein force generation2023

    • 著者名/発表者名
      今井 洋, 昆隆英
    • 学会等名
      第59回内藤コンファレンス
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 電子顕微鏡単粒子解析法による繊毛ダイニン新規構造の解明2023

    • 著者名/発表者名
      雷宜慈 1, 今井洋 1, 山本遼介 1,重兼拓実 1, 下理恵子 1, 上村慎治 2, 八木俊樹 3, 梶村直子 4, 光岡薫 4, 昆隆英 1 (1 大阪大学理学研究科, 2 中央大学理工学部, 3 県立広島大学生物資源科学部, 4 大阪大学超高圧電子 顕微鏡センター)
    • 学会等名
      2023 年 生体運動研究合同班会議
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ダイニンメカニズム解明の新展開2022

    • 著者名/発表者名
      重兼 拓実 (大阪大学)
    • 学会等名
      第11回分子モーター討論会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 電子顕微鏡を利用した繊維状蛋白質の解離定数の新規測定法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      渡邊 真人, 今井 洋, 宮田 知子, 牧野 文信, 武藤 悦子, Gerle Christoph, 光岡 薫, 栗栖 源嗣, 難波 啓一, 昆 隆英
    • 学会等名
      第59回 日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ネガティブ染色電子顕微鏡法により明らかにされた繊毛ダイニンの新規構造2021

    • 著者名/発表者名
      雷 宜慈, 今井 洋, 山本 遼介, 下 理恵子, 上村 慎治, 八木 俊樹, 梶村 直子, 廣瀬 未果, 加藤 貴之, 光岡 薫, 昆 隆英
    • 学会等名
      第59回 日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [備考] 大阪大学大学院 理学研究科 生物科学専攻 昆研究室ホームページ

    • URL

      https://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/bio_web/lab_page/kon/

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] 大阪大学大学院 理学研究科 生物科学専攻 研究室案内 昆研究室

    • URL

      https://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/pdf/bio_konlab.pdf

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [備考] 大阪大学 大学院 理学研究科 生物科学専攻 昆研究室

    • URL

      https://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/bio_web/lab_page/kon/

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 大阪大学 大学院 理学研究科 生物科学専攻 研究室紹介

    • URL

      https://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/laboratory/

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] 大阪大学 大学院 理学研究科 生物科学専攻 昆研究室

    • URL

      https://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/bio_web/lab_page/kon/

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [備考] 大阪大学 大学院 理学研究科 生物科学専攻 研究室紹介

    • URL

      https://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/laboratory/

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

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