| 研究課題/領域番号 |
21K06122
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分43050:ゲノム生物学関連
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| 研究機関 | 岡山大学 |
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研究代表者 |
宮地 まり 岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (50349255)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2025-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2022年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2021年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
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| キーワード | ニューロエピジェネティクス / ゲノム構造 / 終末分化 / 神経細 / 核内構造 / 神経細胞 / 神経特異的遺伝子 / ニューロン / 核構造 / 遺伝子発現制御 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
ラット初代培養神経細胞を用いて，CTCFとSP120のChIP-seqおよびSP120のCLIP-seqを行うことによりトポIIβ，SP120, CTCFによって制御される核内構造よって神経特異的遺伝子の発現が共制御される分子機構を明らかにする．ゲノムワイド解析から共制御のモデル立て，モデル領域の遺伝子発現に関与するSP120結合RNAをノックダウンすることにより共制御が喪失するかを確認することでモデルを検証する．
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| 研究実績の概要 |
DNAトポイソメラーセ (トポ) IIβはDNAの高次構造を変換する酵素で，私たちはトポIIβが一群の神経特異的遺伝子の発現を誘導，または抑制することを明らかにしてきた．本研究では，ラット初代培養神経細胞を用いて，試験管内で分化を誘導，この過程でトポIIβが制御する遺伝子群をRNA-seq法により，トポIIβが正または，負に制御する一群の神経特異的遺伝子を同定した．Gene Ontology解析から，トポIIβが正に制御する遺伝子群は，終末分化した神経細胞で機能する遺伝子が有意に多く，一方，負に制御される遺伝子群には，神経前駆細胞で機能する遺伝子が有意に多かった．ゲノム上の配置を解析し，これらの遺伝子群がゲノム上で固まって存在していることを示した．以上の結果は，トポIIβが個々の遺伝子をローカルに発現制御するだけでなく，ゲノム構造変換を介してグローバルに制御することにより，神経前駆細胞から神経細胞へ終末分化のスイッチ機能を有することを支持する結果である．
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
投稿論文の リバイス対応に時間を割かれたため，研究の進行は遅れているが，着実に進めている．
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| 今後の研究の推進方策 |
結果をまとめ，投稿準備中である．2024年度中に投稿予定である．
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