研究課題/領域番号 |
21K06242
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分44040:形態および構造関連
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研究機関 | 北海道大学 |
研究代表者 |
市原 健介 北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 助教 (60610095)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
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キーワード | 有性生殖 / アロ認証 / 海藻 / ゲノム編集 / 進化 / 緑色植物 |
研究開始時の研究の概要 |
生物は、細胞間の相互作用・認識によって、同種の異性を見つけ出し、有性生殖を行なう。緑色海藻スジアオノリの生殖様式は単純な異形配偶子接合で、雌雄の配偶子を混合すると、配偶子は凝集し、鞭毛の先でお互いの性や種を認識し、同種の異性であることがわかると瞬時に細胞融合が進む。スジアオノリ配偶子の性差は、認識に機能する鞭毛と、細胞融合を開始する接合装置に集約されているようだ。本研究では、ゲノム編集とタンパク質の相互作用解析によって、アオノリ配偶子間の「認識」と「融合」に重要な役割をもつタンパク質の実体と機能を明らかにし、種と性の「認識」と細胞の「融合」という有性生殖の根幹となるシステムを理解したい。
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研究実績の概要 |
本研究の目的は、アオノリ配偶子間の「認識」と「融合」に重要な役割をもつタンパク質の実体と機能を明らかにすることを通して、雌雄性というものがどのような構造の違いや性質の違いから始まったものであるかを明らかにすることである。当該年度は以前行ったスジアオノリ雌雄配偶子の細胞膜および鞭毛のプロテオーム解析の結果から、配偶子間の「認識」と「融合」に関与すると思われるタンパク質を探索した。アノテーション用のデータベースには雌雄配偶子の形成過程で経時的にサンプリングしたRNAseqの結果をde novo assemblyしたものを利用した。解析の結果、鞭毛からは緑藻クラミドモナスで発見された鞭毛に存在し、雌雄や種の認識に機能すると考えられているアグルチニン様タンパク質が発見された。また、雄の細胞膜に特異的なタンパク質として、植物の受精因子として知られるGEX2遺伝子のホモログも発見することができた。 今年度は新たに雌雄配偶子形成過程の細胞からRNAを抽出し、stranded RNAseqを行った。この実験と、前年度ゲノム支援で得られたIso-seqデータを利用することで、より正確な遺伝子モデルを予測する事ができた。またゲノム編集を利用したノックイン実験系の開発を試みたところ、長鎖の一本鎖DNAを利用することで、GEX2のC末端側にEGFPを付加することに成功した。今後はこのゲノム編集個体を利用して、GEX2の局在、また細胞融合の雌側因子の探索を行う予定である。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
昨年度発見した雌側の候補因子(膜貫通ドメインを持つEGF-domainを含むタンパク質やLeucine-Rich Repeatsを持つキナーゼ等)について、ゲノム編集でノックアウト変異体を作成したが、接合子形成に関して、顕著な表現型は確認できず、細胞融合には関与していない事が示唆される結果が得られた。また上述のGEX2-EGFPノックイン変異体は作成直後は藻体の生長が芳しくなく、EGFPの挿入はシーケンスから確認できているが、配偶子での発現が確認できていない。
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今後の研究の推進方策 |
GEX2にEGFPを挿入した株については、現在生育が良好になってきており、来年度に発現の確認、局在確認までは達成できる見込みである。またGEX2-EGFPをバイトとした雌側因子の探索にも取り組める予定である。 雌側の配偶子融合因子の探索のために、今年度おこなったstranded RNAseqの結果を利用し、より正確な遺伝子モデルの構築、発現解析を行い、膜タンパク質プロテオームの結果と合わせて解析することで、新たな候補遺伝子の探索も同時に進める予定である。
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