| 研究課題/領域番号 |
21K06284
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 審査区分 |
小区分45010:遺伝学関連
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| 研究機関 | 京都産業大学 |
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研究代表者 |
河邊 昭 京都産業大学, 生命科学部, 教授 (10582405)
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| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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| 配分額 *注記 |
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2023年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
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| キーワード | トランスポゾン / 動原体 / アブラナ科 / シロイヌナズナ |
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| 研究開始時の研究の概要 |
動原体周辺へのトランスポゾンの局在は、ヘテロクロマチンや動原体をターゲットする転移特異性という能動的な機構と、自然選択の結果動原体周辺などの遺伝子密度が低い領域ではトランスポゾンの除去が起こらないという受動的な可能性の二つの仮説が考えられてきた。COPIA93ファミリーは植物で初めて同定された動原体への転移特異性を持つトランスポゾンであり、トランスポゾンの局在を理解する研究材料となりうる。本研究ではゲノム情報を用いた比較ゲノム解析的アプローチと、転移能を持つコピーの転移特性の分子生物学的アプローチの両面から研究をおこない、特異的な転移特性の成立とその分子的な機構の両面の解明を目指す。
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| 研究成果の概要 |
動原体領域をターゲットとする転移様式を持ったトランスポゾンファミリーに関して、アブラナ科の種を材料として特性の把握と進化様式の解析をおこなった。ナズナ属では動原体領域とそれ以外の領域に存在する異なるタイプのサブグループを見出した。アブラナ科のシロイヌナズナとは比較的遠縁な種においても動原体領域に局在することが示され、アブラナ科においてはこのグループが動原体をターゲットにした転移特性を持つことが確認された。しかし多くの種で、動原体以外に分布するグループが出現しており、幾つかは高コピー領域をターゲットとする可能性が示唆される。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
トランスポゾンはゲノムの構造の詳細や変化パターン、進化機構を考えるうえで非常に重要なファクターである。トランスポゾンはゲノム中にランダムに分布するわけではなく動原体やヘテロクロマチンに多く局在することがわかっていたがその詳細な機構は不明であった。本研究ではCopia93/20ファミリーについて、その進化様式をアブラナ科全体で調査し、動原体をターゲットとする挿入特異性が広くみられること、動原体特異性は幾つかの種や種の中でも特定のサブグループで失われていることを明らかにした。これらのパターンはトランスポゾンの局在する機構やその変化を理解するうえで重要である。
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