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発生緩衝と進化可能性における、生態系解析法を活用した新規システム的解釈

研究課題

研究課題/領域番号 21K06287
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分45020:進化生物学関連
研究機関お茶の水女子大学

研究代表者

佐藤 敦子  お茶の水女子大学, 基幹研究院, 准教授 (90589433)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2023年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2022年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワード発生緩衝 / 進化可能性 / カタユウレイボヤ / 母性効果 / ゆらぎ / ネットワーク解析
研究開始時の研究の概要

近年、遺伝子診断が個人レベルでも普及してきたが、仮に病気と関わる変異をゲノム中に持っていたとしても、発病するとは限らない。その主要な原因のひとつが、生物の発生をゲノムの変異や環境ストレスに関わらず一定に保つ「発生緩衝」である。発生緩衝は、種を一定に保つはたらきを担う一方で、発生緩衝度合いの変化によって、ゲノムに潜在する変異が表現型となり、進化的変化を方向付ける。本研究では、環境が発生に及ぼす影響について、トランスクリプトームの継代的変化における数学的パターンやシステム的特性を明らかにすることにより、進化の数学的予測を目指す。

研究実績の概要

カタユウレイボヤの親個体に熱ストレスを与えたものと与えないものとで、卵の母性mRNAのばらつきがどのくらい異なるか、また、親の発生緩衝度合いはばらつきの変化にどのように影響するかを明らかにした。去年度の解析結果を投稿論文にまとめ、BMC Ecology and Evolutionに発表した。また、米国の研究者らの招待を受け、これまで自らが行ってきたカタユウレイボヤ研究をまとめた論文を執筆し、Genesisに出版した。そのほか、スペイン、フランス、英国での10ヶ所でセミナーを行い、本研究の成果を発表した。セミナー発表毎に、関連する研究者らとディスカッションを行い、これまでの発生緩衝についての研究が、発生分野における近年の他の研究から支持されていることが分かった。このディスカッションの内容を、総説にまとめている。このほか、温度ストレスが発生に関連した遺伝子の空間的発現パターンに与える影響について、数理モデルを作成するため、スペインのEMBL Barcelonaとの共同研究を開始した。独立形成基盤支援を利用して取得した、時系列トランスクリプトームデータを用いて、解析を開始している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

研究成果を国際学術雑誌の投稿論文として発表できたほか、スペイン・フランス・英国の研究者に広く知ってもらうことが出来たため。

今後の研究の推進方策

2024年度に開催される国際学会Euro Evo Devoで、発生緩衝に関連した研究を行っている研究者を一堂に集める国際シンポジウムの提案が採択され、2024年6月にヘルシンキで開催することになった。また、米国で開催される国際学会International Tunicate Meetingに招待されており、7月に本研究の成果を発表する予定である。

報告書

(3件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2024 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] Marine Biological Association of the UK/Plymouth University(英国)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [国際共同研究] EMBL Barcelona(スペイン)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Marine Biological Association of the UK/Plymouth University(英国)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Marine Biological Association of the UK(英国)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Heterogeneity in maternal mRNAs within clutches of eggs in response to thermal stress during the embryonic stage2024

    • 著者名/発表者名
      Sato Atsuko、Mihirogi Yukie、Wood Christine、Suzuki Yutaka、Truebano Manuela、Bishop John
    • 雑誌名

      BMC Ecology and Evolution

      巻: 24 号: 1 ページ: 21-21

    • DOI

      10.1186/s12862-024-02203-8

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Two <i>Ciona</i> sister species are not just complex, but wonderful: A study of maternal <scp>mRNAs</scp> to safeguard life on earth2023

    • 著者名/発表者名
      Sato Atsuko
    • 雑誌名

      genesis

      巻: 61 号: 6

    • DOI

      10.1002/dvg.23555

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Co-expression network analysis of environmental canalization in the ascidian Ciona.2022

    • 著者名/発表者名
      Sato, A., Gina M Oba., Nathanael Aubert-Kato., Yura, K., Bishop, J. D. D.
    • 雑誌名

      BMC Ecology and Evolution

      巻: 22 号: 1 ページ: 53-53

    • DOI

      10.1186/s12862-022-02006-9

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] How developmental buffering stabilizes development in the face of thermal stress?2022

    • 著者名/発表者名
      Sato A, Gina M Oba, Nathanael Aubert-Kato, Kei Yura, John Bishop
    • 学会等名
      International Tunicate Meeting
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] How developmental buffering stabilize CNS development in the face of thermal stress2022

    • 著者名/発表者名
      Sato A, Gina M Oba, Nathanael Aubert-Kato, Kei Yura, John Bishop
    • 学会等名
      Euro Evo Devo meeting
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] カタユウレイボヤ姉妹種における熱ストレスへの適応戦略2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤敦子
    • 学会等名
      第92回 日本動物学会 オンライン米子大会関連集会 第39回ホヤの生物学談話会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] 発生が温度環境から守られるしくみについて、遺伝子ネットワーク解析の論文がアクセプトされました

    • URL

      http://www-p.sci.ocha.ac.jp/bio-atsuko/20220404_152419.html

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

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