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血液型物質グライコフォリンの遺伝子多型はマラリアの赤血球侵入に影響するか

研究課題

研究課題/領域番号 21K06993
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分49040:寄生虫学関連
研究機関長崎大学

研究代表者

成瀬 妙子  長崎大学, 熱帯医学研究所, 助教 (80422476)

研究分担者 平山 謙二  長崎大学, 熱帯医学・グローバルヘルス研究科, 教授 (60189868)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードグライコフォリン / マラリア原虫リガンド / 赤血球侵入 / 遺伝子多型
研究開始時の研究の概要

グライコフォリン;Glycophorin(GYP)分子群は赤血球表面に発現し、MN, Ss等の血液型を決定している。本研究ではGYP血液型がマラリア原虫の赤血球侵入にいかなる影響を与えるのかについて答えを得るために、I.流行地の集団を対象としたマラリア重症度と血液型との相関解析、II.GYP遺伝子型が異なる赤血球への培養マラリア原虫の侵入効率の観察を行う。マラリア重症化に及ぼすGYP多型の意義が明確となり、もしもアフリカマラリア流行地域の原虫陰性者に特徴的な遺伝子多型の組み合わせを見出すことができれば、マラリア抵抗性を獲得している可能性が高く、将来的にワクチン製剤開発の糸口になると考える。

研究実績の概要

グライコフォリン;Glycophorin(GYP)分子群は赤血球表面に発現し、MN, Ss, Gerbich, Dantu等の古典的血液型を決定している。最近、GYP分子群は熱帯熱マラリア原虫の赤血球侵入に関わるレセプターとして機能していることが報告された。本研究ではGYP分子群の多型(血液型)がマラリア原虫の赤血球侵入にいかなる影響を与えるのかについて答えを得るために、2つのアプローチを試みる。1)流行地の集団を対象とした熱帯熱マラリア重症度と血液型との相関解析、2)GYP分子をコードする遺伝子の各アレルの遺伝子導入細胞(赤血球)への培養マラリア原虫の侵入効率の観察。上記の解析により、マラリア重症化に及ぼすGYP多型の意義が明確となり、マラリア死に直結する重症マラリアの予防治療法の開発に資することを目的とする。 令和5年度は、熱帯熱マラリア患者のうち、重症マラリア患者50名、無症候性マラリア患者100名、および有熱マラリア患者100名より抽出した保存ゲノミックDNA中に存在する熱帯熱マラリア原虫(Pf)由来DNAを対象として、原虫上に存在するGYPリガンドであるEba-175, Eba-181, Eba-140, Ebl-1をコードする遺伝子領域の多型について、次世代シーケンサー(NGS)にて各遺伝子の塩基配列を解析した。得られた塩基配列情報から、遺伝子塩基配列多型について解析を進め、現在3つの遺伝子領域で複数の新規塩基配列多型を同定した。 その一方で、検出結果は患者由来のマラリア原虫数に影響を受けていることも明らかとなり、検出法のさらなる改良と、検出できた多型についても確認解析を進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

前年度に遅れが生じていた、宿主赤血球レセプターであるヒトGYPレセプターに対応する熱帯熱マラリア原虫リガンド多型については、GYP遺伝子同様に次世代シーケンサーによる解析を進めたが、今年度に作成した広範囲をカバーする改良版プライマーセットは、リファレンスである培養株3D7を用いた検討では問題なく均一な増幅結果が得られたが、実際に患者250名より抽出した保存DNAを用いた解析では、一部のサンプルでは得られたリード数やリシーケンスの際のマッピングレートが低かった。この事から各サンプル由来の増幅効率は血液中の原虫数に依存すると考え、増幅効率との関連を精査したところ、信頼可能なリード数を得るためにはおおよそ1,000コピー程度が必要であることが分かった。しかしながら、低リード数を示す検体にはコピー数20,000程度と十分であるものも含まれていたことから、今後はDNA溶液中に存在するマラリア原虫ゲノムのみを高効率に増幅可能な選択的全ゲノム増幅法とnasted-PCRの手法を併用など、追加実験の必要性が生じた。さらに、解析に成功したサンプルの結果についても確認の必要性が生じた。

今後の研究の推進方策

宿主側レセプター側であるヒトGYP遺伝子については、新規の非同義置換多型や一般集団と比較して各群に特徴的な多型が検出されていることから、対応する熱帯熱マラリア原虫リガンド多型について早急に多型情報を明らかにし、マラリア重症度との関連を明らかにする手掛かりとしたい。マラリア原虫ゲノムのみを高効率に増幅可能な選択的全ゲノム増幅法とnasted-PCRの手法を併用し、出来るだけ速やかにGYPレセプター/EBAリガンドペアについて解析を解析を完了したいと考える。

報告書

(3件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] <i>Killer cell immunoglobulin‐like receptor three domains long cytoplasmic tail 1 gene *007</i> may modulate disease progression of human immunodeficiency virus‐1 infection in the Japanese population2023

    • 著者名/発表者名
      Naruse Taeko K.、Konishi‐Takemura Makiko、Yanagida Risa、Sharma Gaurav、Vajpayee Madhu、Terunuma Hiroshi、Mehra Narinder K.、Kaur Gurvinder、Kimura Akinori
    • 雑誌名

      International Journal of Immunogenetics

      巻: 50 号: 2 ページ: 48-52

    • DOI

      10.1111/iji.12617

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Super high-resolution single-molecule sequence-based typing of HLA class I alleles in HIV-1 infected individuals in Ghana2022

    • 著者名/発表者名
      Nii-Trebi Nicholas I.、Matsuoka Saori、Kawana-Tachikawa Ai、Bonney Evelyn Y.、Abana Christopher Z.、Ofori Sampson B.、Mizutani Taketoshi、Ishizaka Aya、Shiino Teiichiro、Ohashi Jun、Naruse Taeko K.、Kimura Akinori、Kiyono Hiroshi、Ishikawa Koichi、Ampofo William K.、Matano Tetsuro
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 17 号: 6 ページ: e0269390-e0269390

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0269390

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 熱帯熱マラリア原虫 surface-associated interspersed gene (surf) 13.1 遺伝子に対する強い平衡選択圧について2023

    • 著者名/発表者名
      成瀬妙子、Mathenge Peterson、馬場みなみ、金子 明、Jasse Gitaka、金子 修
    • 学会等名
      第92回日本寄生虫学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ケニアおよびタイの熱帯熱マラリア原虫集団への選択の差について2022

    • 著者名/発表者名
      Mathenge Peterson、成瀬妙子、金子 明、Jasse Gitaka、金子 修
    • 学会等名
      第28回分子寄生虫学ワークショップ、第18回分子寄生虫・マラリアフォーラム合同大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Next-Generation-Sequencing-based analysis of the polymorphism of malaria genes in an indigenous population of Palawan Island2021

    • 著者名/発表者名
      Gnamian Alain , 成瀬 妙子 , Cherif Mahamoud Sama , Avenido-Cervantes Eleonor , Luchavez S Jennifer , Mathenge Peterson Gitonga , 楢原 知里 , Mercado Edelwisa S , Jiz Mario A II , Teklemichael Awet Alem , 平山 謙二
    • 学会等名
      第90回 日本寄生虫学会・日本臨床寄生虫学会合同大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

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