研究課題/領域番号 |
21K07222
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
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研究機関 | 鹿児島大学 |
研究代表者 |
横山 勢也 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (20569941)
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研究分担者 |
谷本 昭英 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 教授 (10217151)
濱田 大治 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (30771480)
東 美智代 鹿児島大学, 医歯学域鹿児島大学病院, 准教授 (60315405)
杉本 知之 滋賀大学, データサイエンス学部, 教授 (70324829)
赤羽 俊章 鹿児島大学, 医歯学総合研究科, 特任研究員 (70754480)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
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キーワード | 膵臓癌 / 胆管癌 / DNAメチル化 / バイオマーカー / 予後予測 / 機械学習 / PDAC / DNA methylation / MPS / BSAS / prognosis prediction / cholangiocarcinoma / NGS |
研究開始時の研究の概要 |
膵癌は,数ある癌の中でも早期発見はもちろん,治癒を望める段階での診断が困難な難治性の癌である.それゆえ,膵癌の悪性度診断法の確立が望まれている.本課題においては,膵臓癌組織および膵液検体を対象に,膵臓腫瘍の悪性度に関連する一連の糖たんぱく質であるムチンファミリー遺伝子群を含むがん遺伝子・がん抑制遺伝子のDNAメチル化状況を詳細に解析する.同一検体における病理学解析結果や臨床情報を統合し,計算科学的検討を行うことで,膵癌の早期発見や発癌リスク・摘出術の奏功性を含めた悪性度判別法の開発と,その臨床応用へ向けた有用性を評価することを目的とする.
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研究成果の概要 |
従来のメチル化特異的電気泳動法のボトルネックを解消するため、NGSを用いたバイサルファイトアンプリコンシークエンス(BSAS)パネルを開発。これにより、FFPE、LBC、凍結検体でのDNAメチル化解析が可能となり、膵臓癌の悪性度予測に有効であることが示された。さらに、MUC1プロモーター領域のメチル化解析は、膵胆道癌の予後指標として有用であることが確認された。
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研究成果の学術的意義や社会的意義 |
従来のメチル化特異的電気泳動法のボトルネックを解消するため、NGSを用いたバイサルファイトアンプリコンシークエンス(BSAS)パネルを開発しました。これにより、FFPE、LBC、凍結検体でのDNAメチル化解析が可能となり、膵臓癌の悪性度予測に有効であることが示されました。MUC1プロモーター領域のメチル化解析が、膵胆道癌の予後指標として有用であることも確認されました。この研究は、膵臓癌の早期診断と治療戦略に革新をもたらし、社会的意義として、患者の生存率向上と治療コストの削減に貢献する可能性があります。
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