| 研究課題/領域番号 |
21K08194
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(C)
|
| 配分区分 | 基金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 審査区分 |
小区分53030:呼吸器内科学関連
|
|---|
| 研究機関 | 独立行政法人国立病院機構大阪刀根山医療センター(臨床研究部) |
|---|
研究代表者 |
木田 博 独立行政法人国立病院機構大阪刀根山医療センター(臨床研究部), 独立行政法人国立病院機構大阪刀根山医療センター, 呼吸器内科部長 (80512988)
|
|---|
| 研究分担者 |
福島 清春 大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任助教(常勤) (00752156)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
|
| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
|
|---|
| キーワード | MGIT-seq法 / NALC-seq法 / MLST法 / mlstverse / target capture sequence / マクロライド耐性肺MAC症 / MGIT-seq / NALC-seq / Mycobacterium gordonae / 新種 / マクロライド耐性 / MLST / 非結核性抗酸菌 / 菌種同定 / 薬剤感受性 / 亜種 / ツカムレラ / 肺非結核性抗酸菌症 / 迅速診断 |
|---|
| 研究開始時の研究の概要 |
本研究の概要は、大阪大学微生物病研究所遺伝情報実験センター感染症メタゲノム研究分野、中村らと共同で、メタゲノム解析による肺非結核性抗酸菌症の迅速かつ網羅的診断システム“刀根山モデル”の開発を開始し、喀痰採取より３時間以内に175種のNTM菌同定を目指し、最適化を進める研究である。さらにこの手法を用いて、臨床検査における同定不能菌の新規同定を行い肺非結核性抗酸菌疫学の実態を明らかにするとともに、臨床的難治症例（治療失敗、再発）における問題点も明らかにする。
|
| 研究成果の概要 |
肺NTM症診療において喀痰抗酸菌培養・菌種同定・薬剤感受性検査は複雑な作業行程からなる労力・時間を要する検査である。研究協力者らが開発した新規MLST法網羅的NTM菌種同定システム(mlstverse法)を肺NTM症診療に位置付けることが本研究課題の第一目的であった。我々はmlstverseを液体培養(MGIT)と連動させ、薬剤感受性予測検査を追加したMGIT-seq法の有用性を前向き臨床試験で示した。またmlstverse法で5つの新種NTM菌を発見した。さらにNALC処理後の喀痰検体を培養せず直接菌種同定が可能なNALC-seq法の開発に成功した。
|
| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
MGIT-seq法は抗酸菌菌種同定、薬剤感受性検査を精緻化、時短化するだけでなく、検査技師人材不足に悩む病院でもインターネットに接続可能なら実施可能であるため、肺NTM症診療の均てん化に貢献する。また省力化によって、全ての病院で抗酸菌菌種同定、薬剤感受性検査が普及し、例えばマクロライド耐性可塑性など、感染症学における重要なテーマを提供するようになる。mlstverseによる新種発見が細菌学の裾野を拡げることは言うまでもない。NALC-seq法による培養を経ない菌種同定検査法はさらなる時短化とともに培養検査よるバイアスフリーの気道感染菌情報を提供し、呼吸器感染症学におけるブレークスルーを起こす。
|
