研究課題/領域番号 |
21K08567
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分54040:代謝および内分泌学関連
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研究機関 | 近畿大学 |
研究代表者 |
能宗 伸輔 近畿大学, 医学部, 准教授 (90460849)
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研究分担者 |
池上 博司 近畿大学, 医学部, 教授 (20221062)
馬場谷 成 近畿大学, 医学部, 講師 (10449837)
廣峰 義久 近畿大学, 医学部, 講師 (30460851)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2023年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
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キーワード | 1型糖尿病 / 遺伝子解析 / 次世代シーケンス / 濃厚発症家系 |
研究開始時の研究の概要 |
1型糖尿病は生命維持に必要不可欠なインスリンを分泌する膵β細胞が破壊され、発症するためインスリン注射を生涯継続しなければならない。欧米に比し、日本は有病率が低く全体数は少ないものの、家系内に複数発症する頻度が高いという特有の疫学的特徴がある。従って健常者にほとんど認められず、親から受け継ぐと高い確率で発症に至る強力な遺伝子変異が発症に関与している可能性が高いことが想定される。この仮説を元に1型糖尿病の濃厚発症家系を集積し、最新技術(次世代シーケンス)を用いて染色体上の全遺伝子を解析することで、わが国特有の新規1型糖尿病遺伝子を同定し、1型糖尿病発症の機序解明、発症予知、治療法の確立を目指す。
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研究実績の概要 |
1型糖尿病は多因子疾患であり、一般的には複数の効果量の小さい疾患感受性遺伝子が集積した個体に環境因子が働き発症に至るCommon diseeaseにされる。しかし本邦における1型糖尿病は欧米に比し有病率が低く、また家族内集積率は高い傾向がある。本研究は有病率が高い欧米と本邦における疫学的特徴の差異に着目し、Common diseaseの発症に関わる高頻度、かつ効果量の小さい疾患感受性遺伝子とは別に、頻度は低いが効果量の大きい新規Rare varinatを見いだすことにより、我が国特有の体質を分子レベルで解明することを目的としている。Common variantの同定には大規模サンプルを集積して全ゲノム関連解析が適していると考えられるが本邦における有病率の低さが1型糖尿病症例の大規模サンプルの集積の障害となり、統計的パワーの不足から効果量の低いcommon variantの同定を困難なものとしていた。一家系に複数の1型糖尿病発症者を有する家系の集積についても母集団が限られているため決して容易ではないが、大きな効果量と浸透率をもつrare variantを同定できる可能性がある。我々はこれまで着実に濃厚発症家系の集積を進め、現在15家系54名(罹患者35名、非罹患者19名)について、既に全エクソームシーケンス作業を完了している。初年度に独立基盤形成支援にともなう交付決定後増額を得たことにより各家系の発端者に対してさらに全ゲノムシーケンス(WGS)を実施することができ、全エクソームシーケンス(WES)だけでは検出し得ない、染色体上の大きな構造変異の探索やミスアライメントの検証など変異解析の精度を飛躍的に向上させることができた。 現在、次世代シーケンス解析によって同定された遺伝子変異が偽陽性である可能性を除外するため、サンガー法を用いたDirect sequencing、またはTaqman法を用いて遺伝子型を決定する作業をおこなっている。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
研究開始後も着実に家系集積が進んでいること、また初年度において独立基盤形成支援による交付決定後増額により全エクソームシーケンスに加え、発端者における全ゲノムシーケンス作業も完了し、構造変異に関する解析も順調に進んでいるため
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今後の研究の推進方策 |
得られた変異ファイルから偽陽性を除去し、真の変異を確認する目的で、サンガー法によるDirect sequencingおよびTaqman法を用いた遺伝子タイピングを施行し、真の遺伝子変異を探索する。また見いだした候補変異についてこれまで集積している弧発例1型糖尿病においても遺伝型解析をおこない、関連解析をおこなうことで、家族性1型糖尿病のみならず弧発例においても発症に関わるかどうかの検証をおこなう。
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