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GONAD法を用いた乳がんゲノム複数変異導入モデルの作成及びシングルセル発現解析

研究課題

研究課題/領域番号 21K08644
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分55010:外科学一般および小児外科学関連
研究機関山口大学

研究代表者

渡邉 健司  山口大学, 大学研究推進機構, 助教 (50711264)

研究分担者 諌山 慧士朗  山口大学, 大学研究推進機構, 助教 (30780887)
水上 洋一  山口大学, 大学研究推進機構, 教授 (80274158)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2023年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2022年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
キーワード乳がん / 次世代シークエンサー / GONAD法 / NGS / 体細胞変異 / 変異解析 / 遺伝子変異
研究開始時の研究の概要

がん組織ゲノムDNA に検出される変異は、がんの主要な特徴の一つである。遺伝子変異は、腫瘍の形成、治療薬に対する耐性獲得の原因となる。本研究では、乳がん患者で起こっている遺伝子変異をGenome-editing via Oviductal Nucleic Acids Delivery (GONAD) 法と呼ばれる遺伝子改変マウス作成を簡便にした画期的な手法を用いてマウスで再現し、解析を行うことで、変異遺伝子の機能を理解し、治療標的分子を同定する。

研究実績の概要

乳がんは、女性の罹患率第 1 位のがんであり、死亡者数は未だに上昇している。乳がんを含め、がんのゲノム DNA には、多くの体細胞変異が検出されており、がんの主要な特徴の一つである。近年、次世代シークエンサー (NGS) によるハイスループットシークエンス技術の発展により、多くの体細胞変異が検出されている。検出される体細胞変異は、腫瘍形成の促進、治療薬に対する耐性獲得に寄与するが、多くの変異遺伝子の機能は不明である。これまでの研究では、1 遺伝子に 1 カ所変異を有するシングル変異遺伝子についての解析が行われてきた。しかしながら、ほとんどすべてのがんゲノムには複数の変異が検出されており複数の遺伝子変異が腫瘍形成に重要であることが示された (Neil Vasan et al., Science, 2019)。本研究では、複数変異遺伝子の機能を明らかにし、乳がん治療の標的分子を同定するために、乳がんで検出された複数のがん遺伝子変異を導入した in vivo、in vitroモデルの作成を試みた。乳がんにおける複数変異遺伝子検出のため、乳がん組織ゲノムDNAについて、次世代シークエンサーを用いた変異解析を行った結果、PIK3CA 遺伝子に複数変異が検出された。変異箇所の組み合わせを詳細に確認した結果、PIK3CA 遺伝子の中に、これまで報告されていない新たな体細胞変異の組み合わせを見出した。PIK3CA変異体を発現する細胞を作成し、細胞増殖における機能を検討した結果、一部の変異体導入細胞は、野生型の細胞と比較し、細胞増殖が促進していた。細胞増殖が促進していた変異について、変異導入 in vivo モデルを作成するため、Genome-editing via Oviductal Nucleic Acids Delivery (GONAD) 法を用いたノックインマウスの作成を試みた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

本研究の目的を達成するために、現在、乳がん組織で検出した機能的な体細胞変異についてGenome-editing via Oviductal Nucleic Acids Delivery (GONAD) 法を用いてマウスに遺伝子変異を導入し、in vivo モデルを作成を行っている。
PIK3CA 変異の機能のスクリーニングの結果、細胞増殖が促進された機能的な変異について、 in vivo での機能を評価するため、GONAD 法による変異体導入マウスの作成を行った。gRNAおよび PIK3CA 変異を含む1本鎖オリゴを設計し、交配後のマウスの卵管に導入した。1匹複数塩基の欠損マウスを確認できたが、その他ほとんどのマウスが WT であり、想定していたPIK3CA変異導入マウスが作成できなかった。

今後の研究の推進方策

私たちは、複数変異遺伝子の機能を明らかにし、乳がん治療の標的分子を同定するために、現在、治療標的となりうる複数変異遺伝子を導入した in vivo モデルの作成を試みている。NGS による変異解析で検出したPIK3CA 遺伝子変異を細胞に導入し、細胞増殖への効果を確認した結果、いくつかの遺伝子変異導入細胞で、細胞増殖の促進を確認した。機能に変化があった遺伝子変異の in vivo モデルの作成を行った。gRNAおよび PIK3CA 変異を含む1本鎖オリゴを設計し、交配後のマウスの卵管に Cas9 タンパク質と共にエレクトロポレーション法により導入した。
1匹複数塩基の欠損マウスを確認できたが、その他ほとんどのマウスが WT であった。gRNA の認識効率が悪いもしくは、1本鎖オリゴ配列の品質に問題があると考えられる。
次年度は、再度 gRNA を設計、ノックインの際の組み換え効率を高めた1本鎖オリゴ配列を作成し、再度検討を行う。また、エレクトロポレーションの電圧条件を確認し、改善を試みる。

報告書

(3件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 2件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (10件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Autocrine TNF-α Increases Penetration of Myelin-Associated Glycoprotein Antibodies Across the Blood-Nerve Barrier in Anti-MAG Neuropathy2023

    • 著者名/発表者名
      Sato Ryota、Shimizu Fumitaka、Kuwahara Motoi、Mizukami Yoichi、Watanabe Kenji、Maeda Toshihiko、Sano Yasuteru、Takeshita Yukio、Koga Michiaki、Kusunoki Susumu、Kanda Takashi
    • 雑誌名

      Neurology - Neuroimmunology Neuroinflammation

      巻: 10 号: 3

    • DOI

      10.1212/nxi.0000000000200086

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Akr1b7 functions as a master regulator in ovarian aging2023

    • 著者名/発表者名
      Isayama Keishiro、Watanabe Kenji、Ohtsuka Masato、Kimura Seisuke、Murata Tomoaki、Honda Takeshi、Asagiri Masataka、Sato Shun、Tamura Hiroshi、Sugino Norihiro、Mizukami Yoichi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2023.08.09.552567

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Highly concentrated trehalose induces prohealing senescence-like state in fibroblasts via CDKN1A/p212023

    • 著者名/発表者名
      Muto J, Fukuda S, Watanabe K, Dai X, Tsuda T, Kiyoi T, Kameda K, Kawakami R, Mori H, Shiraishi K, Murakami M, Imamura T, Higashiyama S, Fujisawa Y, Mizukami Y, Sayama K
    • 雑誌名

      Commun Biol.

      巻: 6(1) 号: 1 ページ: 1-18

    • DOI

      10.1038/s42003-022-04408-3

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Jo-1 Antibodies From Myositis Induce Complement-Dependent Cytotoxicity and TREM-1 Upregulation in Muscle Endothelial Cells2023

    • 著者名/発表者名
      Honda Masaya、Shimizu Fumitaka、Sato Ryota、Mizukami Yoichi、Watanabe Kenji、Takeshita Yukio、Maeda Toshihiko、Koga Michiaki、Kanda Takashi
    • 雑誌名

      Neurology - Neuroimmunology Neuroinflammation

      巻: 10 号: 4 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1212/nxi.0000000000200116

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書 2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Ethanolamine plasmalogens derived from whale brain stimulate both follicle‐stimulating hormone and luteinizing hormone secretion by bovine gonadotrophs2023

    • 著者名/発表者名
      Saito Risa、Bando Takeharu、Kotaniguchi Miyako、Tamura Tsutomu、Kuno Tomoe、Watanabe Kenji、Mizukami Yoichi、Kitamura Shinichi、Kadokawa Hiroya
    • 雑誌名

      Animal Science Journal

      巻: 94 号: 1 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1111/asj.13839

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An elemental diet protects mouse salivary glands from 5-fluorouracil-induced atrophy2022

    • 著者名/発表者名
      Harada Koji、Ferdous Tarannum、Fujiwara Rieko、Watanabe Kenji、Mizukami Yoichi、Mishima Katsuaki
    • 雑誌名

      Oncology Letters

      巻: 23 号: 6 ページ: 178-178

    • DOI

      10.3892/ol.2022.13298

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Anti-inflammatory effects of differential molecular weight hyaluronic acids on UVB-induced calprotectin-mediated keratinocyte inflammation.2022

    • 著者名/発表者名
      Hu, L. Nomura, S., Sato, Y., Takagi, K., Ishii, T., Honma, Y., Watanabe, K., Mizukami, Y., Muto, J.
    • 雑誌名

      J Dermatol Sci

      巻: 107 号: 1 ページ: 24-31

    • DOI

      10.1016/j.jdermsci.2022.06.001

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Age-associated changes in gene expression in the anterior pituitary glands of female Japanese black cattle.2022

    • 著者名/発表者名
      Abdillaha, D.A., Kereilwe, O., Mizukami, Y., Watanabe, K., Kadokawa, H.
    • 雑誌名

      Mamm Genome.

      巻: 33 号: 4 ページ: 606-618

    • DOI

      10.1007/s00335-022-09958-9

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Liver-specific dysregulation of clock-controlled output signal impairs energy metabolism in liver and muscle2021

    • 著者名/発表者名
      Matsumura T, Ohta Y, Taguchi A, Hiroshige S, Kajimura Y, Fukuda N, Yamamoto K, Nakabayashi H, Fujimoto R, Yanai A, Shinoda K, Watanabe K, Mizukami Y, Kanki K, Shiota G, Tanizawa Y.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun .

      巻: 534 ページ: 415-421

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.11.066

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] GRP78 Antibodies Are Associated With Blood-Brain Barrier Breakdown in Anti-Myelin Oligodendrocyte Glycoprotein Antibody-Associated Disorder2021

    • 著者名/発表者名
      Shimizu F, Ogawa R, Mizukami Y, Watanabe K, Hara K, Kadono C, Takahashi T, Misu T, Takeshita Y, Sano Y, Fujisawa M, Maeda T, Nakashima I, Fujihara K, Kanda T.
    • 雑誌名

      Neurol Neuroimmunol Neuroinflamm

      巻: 9 号: 1

    • DOI

      10.1212/nxi.0000000000001038

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Hydrogen sulfide suppresses the proliferation of intestinal epithelial cells through cell cycle arrest2021

    • 著者名/発表者名
      Xu Wenxi、Watanabe Kenji、Mizukami Yoichi、Yamamoto Yoshinari、Suzuki Takuya
    • 雑誌名

      Archives of Biochemistry and Biophysics

      巻: 712 ページ: 109044-109044

    • DOI

      10.1016/j.abb.2021.109044

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 乳癌組織のミトコンドリア遺伝子体細胞変異はエネルギー代謝経路を変化させる2023

    • 著者名/発表者名
      渡邉 健司、山本 滋、前田 訓子、西村 愛代、諌山 慧士朗、八木 美佳子、康 東天、岡 正朗、永野浩昭、水上 洋一
    • 学会等名
      第96回日本生化学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア呼吸鎖複合体遺伝子体細胞変異の機能解析2023

    • 著者名/発表者名
      渡邉 健司、山本 滋、前田 訓子、西村 愛代、諌山 慧士朗、八木 美佳子、康 東天、岡 正朗、永野浩昭、水上 洋一
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 乳癌患者から検出したミトコンドリアDNAの体細胞変異は代謝パスウェイを活性化する2022

    • 著者名/発表者名
      渡邉 健司、山本 滋、前田 訓子、西村 愛代、諌山 慧士朗、岡 正朗、永野浩昭、水上 洋一
    • 学会等名
      第45回分子生物学会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ネギの葉色に関する遺伝分析2022

    • 著者名/発表者名
      中島徹也, 中田怜奈, 下見悠輔, 藤井宏栄, 妻鹿良亮, 渡邉健司, 水上洋一, 平川英樹, 佐藤修正, 執行正義
    • 学会等名
      第14回中国地域育種談話会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 乳癌組織で検出された転写抑制因子SIN3A変異体は核外移行しエストロゲン受容体を増加させ増殖を促進する2021

    • 著者名/発表者名
      渡邉 健司、山本 滋、前田 訓子、西村 愛代、諌山 慧士朗、岡 正朗、永野浩昭、水上 洋一
    • 学会等名
      第44回分子生物学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 犬のリンパ球における5-アミノレブリン酸のIL-17産生増強作用2021

    • 著者名/発表者名
      伊賀瀬 雅也, 岩谷 直, 酒井 和紀, 渡邉 健司, 水上 洋一, 水野 拓也
    • 学会等名
      第164回日本獣医学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Transcriptome analysis in the pulp of ‘Saijo’ persimmon during storage at low temperature2021

    • 著者名/発表者名
      A. Nakatsuka, T. Esumi, Y. Mizukami, K. Watanabe and H. Itamura
    • 学会等名
      7th International Symposium on Persimmon
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 高濃度トレハロースを用いた自家細胞由来3次元皮膚シート作製法開発2021

    • 著者名/発表者名
      武藤 潤、福田信治、渡邉健司、水上洋一、佐山浩二
    • 学会等名
      第5回エラスチン/関連分子研究会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 加齢に伴って変化する子宮遺伝子群のトランスクリプトーム解析2021

    • 著者名/発表者名
      諌山 慧士朗, 渡邉 健司, 坂口 修一, 村田 智昭, 水上 洋一
    • 学会等名
      第44回分子生物学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ロボット分注装置を用いた新型コロナウイルスPCR検査の迅速解析方法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      水上 洋一, 畑中千春, 中川真喜子, 西村愛美, 渡邉 健司
    • 学会等名
      第32回日本医学看護学教育学会学術学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

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