研究課題
基盤研究(C)
ミスマッチ修復欠損・マイクロサテライト不安定性(dMMR/MSI-H)を示す大腸癌は、全大腸癌の15%、転移再発例の4%と低頻度であるが、免疫活性化と免疫逃避、免疫チェックポイント阻害剤(ICI)の適応など、日常臨床において最も確立したサブタイプである。しかしdMMR/MSI-Hは、部分的な重複と相反する特徴が混在し極めて広汎なスペクトラムを内包しており、この不均一性は既知のゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、免疫学的因子などによって説明することはできない。本研究ではdMMR/MSI-H大腸癌を、個別化治療が可能な複数の希少サブフラクションの集合として再認識することである。
ミスマッチ修復欠損・マイクロサテライト不安定性(dMMR/MSI-H)を示す大腸癌は、全大腸癌のうち15%程度であり、転移再発例においては4-5%と低頻度であるが、免疫活性化と免疫逃避、免疫チェックポイント阻害剤(ICI)の適応など、日常臨床において最も確立したサブタイプといえる。しかしdMMR/MSI-Hは、部分的な重複と相反する特徴が混在し極めて広汎なスペクトラムを内包しており、この不均一性は既知のゲノム、エピゲノム、トランスクリプトーム、免疫学的因子などによって容易に説明することはできない。本研究の目的は、dMMR/MSI-H大腸癌を、個別化治療が可能な複数の希少サブフラクションの集合として再認識することである。dMMR/MSI-H大腸癌の不均一性は、単一の因子により説明することはできない。網羅的・多層的視点が必須であり、本研究では、大規模かつ複数のdMMR/MSI-H大腸癌マルチオミクスコホートを用いて、網羅的プラットフォーム(マイクロアレイ、RNA-seq、コピー数解析、ゲノムseq)、非網羅的プラットフォーム(免疫組織学的検討、in vitro実験系、免疫学的実験系)を統合し、遺伝子だけでなく免疫・間質のプロファイルを活用しながら検討を進めた。
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