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薬剤耐性細菌の包括的レジストーム解析による伝播経路の探索

研究課題

研究課題/領域番号 21K10423
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分58020:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含む
研究機関神戸常盤大学

研究代表者

大澤 佳代  神戸常盤大学, 保健科学部, 教授 (50324942)

研究分担者 重村 克巳  神戸大学, 保健学研究科, 准教授 (00457102)
白川 利朗  神戸大学, 科学技術イノベーション研究科, 教授 (70335446)
三浦 真希子  神戸常盤大学, 保健科学部, 特命講師 (00610320)
研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード基質拡張型β-ラクタマーゼ(ESBL) / カルバペネマーゼ / インドネシア / 腸内細菌目細菌 / Acinetobacter baumanii / 肺炎桿菌 / サルモネラ / 基質拡張型βラクタマーゼ / 薬剤耐性細菌 / 薬剤耐性遺伝子 / プラスミド / 多国間比較 / 多国間 / 全ゲノム解析 / RNA-seq解析
研究開始時の研究の概要

本研究では、日本国内およびアジア諸国であるインドネシア、ネパール、台湾など各国での薬剤耐性細菌を採取し、薬剤耐性細菌がもつ薬剤耐性遺伝子について、ヒト・動物・環境から得られた各種細菌やサンプルの薬剤耐性遺伝子について、高速シークエンスを用いて網羅的に分析し、かつ遺伝子発現量を定量する包括的レジストーム解析を行うことにより、薬剤耐性遺伝子が医療現場から市中環境でどのような機構により残存・拡散するのか、その動向を解明し、各国に応じた薬剤耐性細菌への対策に対する知見を得る。

研究実績の概要

インドネシアおよび日本における薬剤耐性細菌における詳細な疫学解析を行い、論文掲載や学会発表により報告を行っている。今年度は2019年インドネシアで採取された水における薬剤耐性菌の検出結果について論文発表を行った(Microorganisms. 2024 Jan 18;12(1):199.)。また、インドネシア ジョグジャカルタからの尿路感染症患者から検出された76株においてAcinetobacter baumannii, Pseudomonas spp., そして腸内細菌目細菌が同定され、なかでもA. baumaniiがもっとも多く各種薬剤耐性遺伝子を有していたことを学会にて発表した(第71回日本化学療法学会学術集会,2023)。カルバペネマーゼ産生性Klebsiella pneumoniaeと非産生性Klebsiella pneumoniaeにおける抗菌薬耐性ならびに耐性機構の比較検討も併せて行い、学会発表をした(第71回日本化学療法学会学術集会,2023)。また、2019年のインドネシア スラバヤ地区の市中病院UTI患者から分離された第三世代セファロスポリン耐性大腸菌の内、ESBL確認試験にて陽性を示した51株を対象として検出されたESBL遺伝子は、CTX-M-55やCTX-M-15がほとんどを占めていたことを学会にて発表した(令和5年度日臨技近畿支部医学検査学会[第62回], 2023)。また、インドネシア スラバヤ地区で分離された鶏肉由来E. coli 40株と鶏の腸管由来E. coli 9株の計49株では、ESBL産生株が21.6%でCTX-M-55とCTX-M-15を持っていた。キノロン耐性株ではqnrS を多く保有していたことを学会発表した(令和5年度日臨技近畿支部医学検査学会[第62回], 2023)。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

現在までの達成度として、インドネシアに関しては予定通り進行しているが、ネパールに関しては新型コロナウイルス感染症によりこれまで行き来が難しく、以前のサンプル解析やサンプル採取が出来なかった。ようやく今年度サンプル採取を行える運びとなっている。

今後の研究の推進方策

現在、引き続き、インドネシア、日本のカルバペネムを含む薬剤耐性細菌について、薬剤感受性試験と一部薬剤耐性遺伝子を確認するなど進行中である。また、インドネシアやネパール、日本の環境中(病院近辺や川)あるいは食肉(チキン)からの薬剤耐性細菌の検出を行っており、すでに薬剤感受性試験を終了し、次世代ゲノムシークエンスを一部解析しており、今後学会発表や論文作成を進めているところである。

報告書

(3件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2024 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 8件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (15件) (うち国際学会 2件)

  • [国際共同研究] アイルランガ大学/ガジャマダ大学(インドネシア)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [国際共同研究] アイルランガ大学(インドネシア)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] アイルランガ大学(インドネシア)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Metagenome and Resistome Analysis of Beta-Lactam-Resistant Bacteria Isolated from River Waters in Surabaya, Indonesia2024

    • 著者名/発表者名
      Nomoto Ryohei、Osawa Kayo、Kinoshita Shohiro、Kitagawa Koichi、Nakanishi Noriko、Sarassari Rosantia、Raharjo Dadik、Fujisawa Masato、Kuntaman Kuntaman、Shirakawa Toshiro
    • 雑誌名

      Microorganisms

      巻: 12 号: 1 ページ: 199-199

    • DOI

      10.3390/microorganisms12010199

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular characteristics and genetic analysis of the genes related to carbapenemase, efflux pump, and outer membrane proteins in carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae2023

    • 著者名/発表者名
      Reo Onishi, Katsumi Shigemura, Kayo Osawa, Young-Min Yang, Koki Maeda, Hiroshi Tanimoto, Mitsuki Kado, Shiuh-Bin Fang, Masato Fujisawa
    • 雑誌名

      Letters in Applied Microbiology

      巻: 76 号: 2

    • DOI

      10.1093/lambio/ovac069

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Comparative genetic analysis of the antimicrobial susceptibilities and virulence of hypermucoviscous and non-hypermucoviscous ESBL-producing Klebsiella pneumoniae in Japan2023

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Tanimoto, Katsumi Shigemura, Kayo Osawa, Mitsuki Kado, Reo Onishi, Shiuh-Bin Fang, Shian-Ying Sung, Takayuki Miyara, Masato Fujisawa
    • 雑誌名

      J Microbiol Immunol Infect

      巻: 56 号: 1 ページ: 93

    • DOI

      10.1016/j.jmii.2022.08.010

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Impact on quinolone resistance of plasmid-mediated quinolone resistance gene and mutations in quinolone resistance-determining regions in extended spectrum beta lactamase-producing Klebsiella pneumoniae isolated from urinary tract infection patients2022

    • 著者名/発表者名
      Reo Onishi, Katsumi Shigemura, Kayo Osawa, Young-Min Yang, Koki Maeda, Hiroshi Tanimoto, Mitsuki Kado, Shiuh-Bin Fang, Shian-Ying Sung, Takayuki Miyara, Masato Fujisawa
    • 雑誌名

      Pathogens and Disease

      巻: 80 号: 1

    • DOI

      10.1093/femspd/ftac030

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Antibiotic Resistance in Non-Typhoidal Salmonella enterica Strains Isolated from Chicken Meat in Indonesia2022

    • 著者名/発表者名
      Minori Takaichi, Kayo Osawa, Ryohei Nomoto, Noriko Nakanishi, Masanori Kameoka, Makiko Miura, Katsumi Shigemura, Shohiro Kinoshita, Koichi Kitagawa, Atsushi Uda, Takayuki Miyara, Ni Made Mertaniasih, Usman Hadi, Dadik Raharjo, Ratna Yulistiani, Masato Fujisawa, Kuntaman Kuntaman, Toshiro Shirakawa
    • 雑誌名

      Pathogens (Basel, Switzerland)

      巻: 11 号: 5 ページ: 543-543

    • DOI

      10.3390/pathogens11050543

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The Antimicrobial Resistance Characteristics of Imipenem-Non-Susceptible, Imipenemase-6-Producing Escherichia coli2021

    • 著者名/発表者名
      Onishi Reo、Shigemura Katsumi、Osawa Kayo、Yang Young-Min、Maeda Koki、Fang Shiuh-Bin、Sung Shian-Ying、Onuma Kenichiro、Uda Atsushi、Miyara Takayuki、Fujisawa Masato
    • 雑誌名

      Antibiotics

      巻: 11 号: 1 ページ: 32-32

    • DOI

      10.3390/antibiotics11010032

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Cross-Resistance and the Mechanisms of Cephalosporin-Resistant Bacteria in Urinary Tract Infections Isolated in Indonesia2021

    • 著者名/発表者名
      Ishii A, Shigemura K, Kitagawa K, Harada M, Kan Y, Hayashi F, Osawa K, Kuntaman K, Shirakawa T, Fujisawa M.
    • 雑誌名

      Curr Microbiol.

      巻: 78 号: 5 ページ: 1771

    • DOI

      10.1007/s00284-021-02415-x

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Differential effects of chromosome and plasmid bla<sub>CTX-M-15</sub> genes on antibiotic susceptibilities in extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli isolates from patients with urinary tract infection2021

    • 著者名/発表者名
      Yang Young‐min、Osawa Kayo、Kitagawa Koichi、Hosoya Samiko、Onishi Reo、Ishii Aya、Shirakawa Toshiro、Hirai Itaru、Kuntaman Kuntaman、Tanimoto Hiroshi、Shigemura Katsumi、Fujisawa Masato
    • 雑誌名

      International Journal of Urology

      巻: 28 号: 6 ページ: 623

    • DOI

      10.1111/iju.14498

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] インドネシアにおける尿路感染症由来のESBL 産生大腸菌の調査2023

    • 著者名/発表者名
      梅村 崇史, 大澤 佳代, 野本 竜平. 楠木 まり, 木下 承皓, K. Kuntaman, 白川 利朗
    • 学会等名
      令和5年度日臨技近畿支部 医学検査学会(第62回)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] インドネシアの鶏肉および鶏の腸管から分離された大腸菌のESBL 遺伝子の保有状況2023

    • 著者名/発表者名
      德野 瑠奈, 大澤 佳代, 野本 竜平. 楠木 まり, 木下 承皓, K. Kuntaman, 白川 利朗
    • 学会等名
      令和5年度日臨技近畿支部 医学検査学会(第62回)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] インドネシアの尿路感染症患者から分離された多剤耐性およびカルバペネム耐性グラム陰性桿菌の薬剤耐性と保有遺伝子の特性2023

    • 著者名/発表者名
      門 実槻, 重村 克巳, 大澤 佳代, 前田 光毅, 林 花奈, 平田 悠人, 中野 雄造, 藤澤 正人
    • 学会等名
      第72回日本化学療法学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] カルバペネマーゼ産生性Klebsiella pneumoniaeと非産生性Klebsiella pneumoniaeにおける抗菌薬耐性ならびに耐性機構の比較検討2023

    • 著者名/発表者名
      林 花奈, 重村 克巳, 大澤 佳代, 門 実槻, 平田 悠人, 前田 光毅, 中野 雄造, 藤澤 正人
    • 学会等名
      第72回日本化学療法学会総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Salmonella entericaにおける薬剤耐性の動向2023

    • 著者名/発表者名
      松本 京佳, 大澤 佳代, 橘 美希, 吉田 弘之
    • 学会等名
      第34回日本臨床微生物学会総会・学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 基質拡張型β-ラクタマーゼ産生Klebsiella pneumoniaeの過粘稠性株と非過粘稠性株における薬剤感受性と病原性の比較2022

    • 著者名/発表者名
      谷本 啓, 重村 克巳, 大澤 佳代, 大西 玲於, 梁 英敏, 前田 光毅, 中野 雄造, 宮良 高維, 門 実槻, 藤澤 正人
    • 学会等名
      第70回日本化学療法学会総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] インドネシアの尿路感染症患者より分離されたカルバペネム耐性グラム陰性桿菌の薬剤感受性調査2022

    • 著者名/発表者名
      大西 玲於, 重村 克巳, 大澤 佳代, 梁 英敏, 前田 光毅, 谷本 啓, 大沼 健一郎, 中野 雄造, 宮良 高維, 藤澤 正人
    • 学会等名
      第70回日本化学療法学会総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Prevalence of carriage of extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae among pregnant women in the primary health care center and hospital in Indonesia.2022

    • 著者名/発表者名
      Kayo Osawa, Rochmanah Oktaviani, Wahyu Setyarini, Hari Parathon, Koichi Kitagawa, Noriko Nakanishi, Ryohei Nomoto, Shohiro Kinoshita, K Kuntaman, Toshiro Shirakawa
    • 学会等名
      第17回アジア臨床病理・臨床検査医学会(ASCPaLM)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Kayo Osawa, Minori Takaichi, Katsumi Shigemura, Ni Made Mertaniasih, Usman Hadi, Dadik Raharjo, Ratna Yulistiani, Masato Fujisawa, K Kuntaman, Toshiro Shirakawa2022

    • 著者名/発表者名
      Antibiotic resistance in non-typhoidal Salmonella enterica strains isolated from chicken meat in Indonesia
    • 学会等名
      第17回アジア臨床病理・臨床検査医学会(ASCPaLM)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] GES-24型カルバペネマーゼ産生Pseudomonas putidaを分離した1症例2021

    • 著者名/発表者名
      中谷 英雄, 福井 淳宏, 楠木 まり, 大沼 健一郎, 大澤 佳代, 荒川 創一
    • 学会等名
      第33回日本臨床微生物学会総会・学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] インドネシアにおける鶏肉由来のキノロン耐性non-typhoidal Salmonella entericaの遺伝子解析2021

    • 著者名/発表者名
      高市 果希, 大澤 佳代, 重村 克巳, 北川 孝一, 木下 承晧, 亀岡 正典, 楠木 まり, 宮良 高維, 藤沢 正人, 白川 利朗
    • 学会等名
      第95回日本感染症学会総会・学術講演会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] インドネシアにおけるヒト及び環境由来のESBL産生Escherichia coliの分布調査2021

    • 著者名/発表者名
      坂本 夏那, 大澤 佳代, 重村 克巳, 北川 孝一, 木下 承晧, 亀岡 正典, 楠木 まり, 宮良 高維, 藤沢 正人, 白川 利朗
    • 学会等名
      第95回日本感染症学会総会・学術講演会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] インドネシアにおける食肉から分離された薬剤耐性Salmonella entericaの遺伝子解析2021

    • 著者名/発表者名
      西澄美香、織田月楓、大澤佳代、高市果希、三浦真希子、重村克巳、北川孝一、宮良高維、藤澤正人、白川利朗
    • 学会等名
      第15回日本臨床検査学教育学会学術大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] カルバペネム耐性Escherichia coliの遺伝子解析2021

    • 著者名/発表者名
      大西玲於、重村克巳、大澤佳代、北川孝一、谷本啓、梁英敏、前田光毅、門実槻、三浦真希子、宮良高維、藤澤正人
    • 学会等名
      第69回日本化学療法学会西日本支部総会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 基質拡張型β-ラクタマーゼ産生過粘稠性Klebsiella pneumoniaeの薬剤感受性と遺伝子解析2021

    • 著者名/発表者名
      谷本啓、重村克巳、大澤佳代、北川孝一、大西玲於、梁英敏、前田光毅、門実槻、三浦真希子、宮良高維 、藤澤正人
    • 学会等名
      第69回日本化学療法学会西日本支部総会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-12-25  

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