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Cellular resolution macro analysis tools for functional and structural brain imaging

研究課題

研究課題/領域番号 21K12665
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分90110:生体医工学関連
研究機関広島大学

研究代表者

KASARAGOD DEEPAKAMATH (カサラゴッド デイーパカマス)  広島大学, 医系科学研究科(医), 助教 (40773908)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2023年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードOptical Imaging / Fluorescence Microscopy / Brain Imaging / optical imaging / fluorescence microscopy / 3d brain imaging / neuroinformatics / brain imaging / fluorescence microscope / 3D imaging
研究開始時の研究の概要

The research focus is to:

1. Establish 3-dimensional microscopy using novel deep ultraviolet fluorescence microscopy for volumetric analysis of brain structures in normal and diseased models

2. Develop open microscopy and open data toolkit to be put in the public domain for general purpose use.

研究成果の概要

蛍光顕微鏡は、脳内のさまざまな空間スケールおよび時間スケールにわたる画像化を可能にする神経科学における重要なツールです。この研究プロジェクトは、三次元脳イメージングを行うにあたり深紫外線を用いた新規の蛍光顕微鏡を確立することであった。他の研究室が簡単に使用できるようにするための、オープンソースのハードウェアおよびソフトウェアのセットアップも課題であった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

We developed and established a simple and cost-effective imaging tool (fluorescence microscopy set-up) for whole brain and volumetric imaging using novel light source - deep ultraviolet illumination. Open source tools were adopted and developed for data acquisition and image analysis.

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2024 2023 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 3件)

  • [雑誌論文] Deep ultraviolet fluorescence microscopy of three-dimensional structures in the mouse brain2023

    • 著者名/発表者名
      Deepa Kamath Kasaragod and Hidenori Aizawa
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 ページ: 8553-8553

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Open microscopy for serial block-face deep ultraviolet fluorescent imaging2024

    • 著者名/発表者名
      Deepa Kamath Kasaragod
    • 学会等名
      Focus on Microscopy 2024, Genoa Italy
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Kinetics of the extracellular dopamine in the mouse striatum with fiber photometry using biosensor2023

    • 著者名/発表者名
      Deepa Kamath Kasaragod
    • 学会等名
      Neuro2023- Japan Neuroscience Society Annual Meeting 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Deep ultraviolet based serial block-face imaging for 3-dimensional morphological assessment of the rodent brains2021

    • 著者名/発表者名
      Deepa Kamath KASARAGOD
    • 学会等名
      Optics and Photonics International Congress - BISC 2021
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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