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祖先的な亜硫酸生成反応の起源に迫る酵素の探索

研究課題

研究課題/領域番号 21K14025
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分17050:地球生命科学関連
研究機関北海道大学

研究代表者

渡邉 友浩  北海道大学, 低温科学研究所, 准教授 (80731968)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2022年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2021年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
キーワード生命進化 / 微生物 / エネルギー代謝 / 亜硫酸 / 硫黄酸化 / ヘテロジスルフィド還元酵素 / トランスクリプトーム / スルファン硫黄 / 硫黄酸化菌 / リポ酸
研究開始時の研究の概要

ある種の硫黄酸化菌の亜硫酸生成反応に、未知の酵素が関与するという仮説を提案する。本酵素は、祖先的なエネルギー代謝の進化を理解する上で本質的に重要だと考えられる。本研究では、この未知酵素を情報生物学と生化学を駆使して研究する。比較ゲノムおよびトランスクリプトーム解析によって候補遺伝子を絞り込み、酵素反応仮説を硫黄酸化菌の細胞粗酵素液や組み換えタンパク質を用いて検証する。

研究成果の概要

初期の地球生命のエネルギー代謝には、亜硫酸が関与していた可能性がある。近年、一部の硫黄酸化菌において、ヘテロジスルフィド還元酵素様の酵素複合体(以下、sHdr)と正体不明の酵素が、異化的な亜硫酸合成反応を推進する可能性が提案された。本研究では、この未知酵素の正体を検討した。Sulfuricellaceae科の8種の硫黄酸化菌をモデルとして、ゲノムとトランスクリプトームを比較した結果、亜硫酸合成を推進する未知酵素の存在は否定された。したがって、sHdrは未知のメカニズムによって亜硫酸合成反応を推進する可能性がある。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究以前は、ヘテロジスルフィド還元酵素様の酵素複合体(sHdr)が単独で亜硫酸を合成することは難しいと考えられており、sHdrと一緒に反応を推進する未知酵素の存在を予想した。しかし本研究の結果は未知酵素の存在を否定した。このことは、sHdrが単独で亜硫酸合成反応を推進する可能性を支持しており、この反応メカニズムは既知の酵素反応では説明できない、すなわち新たな亜硫酸合成反応メカニズムの存在を示唆する。sHdrによる未知の亜硫酸合成反応を証明してその進化起源を解明することで、亜硫酸を用いるエネルギー代謝の起源および祖先的な微生物エネルギー代謝の理解が大きく前進する。

報告書

(3件)
  • 2023 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Dissimilatory microbial sulfur and methane metabolism in the water column of a shallow meromictic lake2022

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Tomohiro、Kubo Kyoko、Kamei Yoshiharu、Kojima Hisaya、Fukui Manabu
    • 雑誌名

      Systematic and Applied Microbiology

      巻: 45 号: 3 ページ: 126320-126320

    • DOI

      10.1016/j.syapm.2022.126320

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-megadalton complex of methanogenic electron-bifurcating and CO2-fixing enzymes2021

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Tomohiro、Pfeil-Gardiner Olivia、Kahnt Joerg、Koch Juergen、Shima Seigo、Murphy Bonnie J.
    • 雑誌名

      Science

      巻: 373 号: 6559 ページ: 1151-1156

    • DOI

      10.1126/science.abg5550

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Transcriptomic analysis of tetrathionate oxidation by freshwater sulfur-oxidizing bacteria in the family Sulfuricellaceae2023

    • 著者名/発表者名
      Tomohiro Watanabe, Tomofumi Nomura, Jackson Tsuji, Manabu Fukui
    • 学会等名
      6th International Symposium on Microbial Sulfur Metabolism
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 硫黄酸化細菌におけるテトラチオン酸酸化経路の検討2022

    • 著者名/発表者名
      野村朋史、渡邉友浩、福井学
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第35回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 硫黄温泉周辺の沼に発達する微生物マットの特徴づけ2022

    • 著者名/発表者名
      林沙弥香、渡邉友浩、福井学
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第35回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] メタン菌の電子管理術:エネルギーに乏しい環境に特化した酵素機構2021

    • 著者名/発表者名
      渡邉友浩,Olivia Pfeil-Gardiner, Joerg Kahnt, Juergen Koch, 嶋盛吾, Bonnie J. Murphy
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第 34 回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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