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自律活性化型CRISPRを利用した正確なゲノム編集に必要な要素の探索

研究課題

研究課題/領域番号 21K14740
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関広島大学

研究代表者

松本 大亮  広島大学, 医系科学研究科(薬), 助教 (20889381)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2022年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2021年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードゲノム編集 / CRISPR-Cas9 / Anti-CRISPR / 相同性組換え / 細胞周期 / 遺伝子修復
研究開始時の研究の概要

CRISPR-Cas9システムの登場によりゲノム編集の難易度は格段に下がったが、相同性組換えを介した標的配列における正確な修復効率は依然として低いままである。本課題では、Cas9ヌクレアーゼ(Cas9)を阻害するAnti-CRISPRと細胞周期に依存して発現量が変化するCdt1のユビキチン化に関与する配列を融合した人工Cas9阻害剤を利用することで、相同性組換え効率が向上する新規手法の発見を基に、より詳細な細胞周期と正確な遺伝子編集効率の関連性の解明を試みる。また、ここで得られた知見を基盤とし、高い相同性組換え効率を実現するゲノム編集システムの開発を目指す。

研究成果の概要

これまでに開発したAnti-CRISPRを用いた細胞周期依存的なCRISPRの活性化系をCas9自体の細胞周期依存的な発現制御と組み合わせることによって、相同性組換え効率に対して相乗効果が得られるのかを評価した。その結果、Cas9の細胞周期依存的な発現自体でも通常のCas9と比較して相同性組換え効率の向上が見られたが、オフターゲット作用が高頻度で起きていた。一方で、Anti-CRISPRを用いた活性化系と組み合わせることによって、相同性組換え効率がさらに向上し、オフターゲット作用も低くなることが示された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ゲノム編集を臨床といった正確な遺伝子の書き換えを行う上で、相同性組換えを介した修復は重要である。本研究成果によって、細胞周期を厳密に限定したCRISPR-Cas9の活性制御によって相同性組換えの向上とオフターゲット作用の低減が可能であることが示唆された。この結果を踏まえ、より詳細な遺伝子修復とCRISPRを用いたDNA切断の関係性を解明していくことによって、より安全なゲノム編集技術の開発に貢献できると期待される。

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Cas9-Geminin and Cdt1-fused anti-CRISPR protein synergistically increase editing accuracy2023

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Matsumoto, Kanae Kishi, Erina Matsugi, Yuto Inoue, Kiyomi Nigorikawa, Wataru Nomura
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 597 号: 7 ページ: 985-994

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14608

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular Switch Engineering for Precise Genome Editing2021

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Matsumoto, Wataru Nomura
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry

      巻: 32 号: 4 ページ: 639-648

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.1c00088

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 高精度なゲノム編集を可能とする手法の開発 -安全なゲノム編集を目指して-2023

    • 著者名/発表者名
      松本大亮
    • 学会等名
      香川大学応用生命科学研究センター
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞周期依存型ゲノム編集のためのSaCas9に対するanti-CRISPR活性の解析2023

    • 著者名/発表者名
      松木 依理奈、長瀬 興平、松本 大亮、濁川 清美、野村 渉
    • 学会等名
      日本薬学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 相同性組換え修復を優先的に引き起こす引き起こすゲノム編集法の検討2023

    • 著者名/発表者名
      松本大亮、松木依理奈、久保田小茉利、井上雄翔、岸果苗、濁川清美、野村 渉
    • 学会等名
      日本薬学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] CRISPRaの仕組みを利用したanti-CRISPRの細胞内でのCas9阻害作用解析2023

    • 著者名/発表者名
      岸 果苗、濁川 清美、長谷川 有希、松本 大亮、野村 渉
    • 学会等名
      日本化学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 特定の細胞周期でのCRISPR-Cas9活性化によるゲノム編集効率の向上2022

    • 著者名/発表者名
      松本大亮、岸果苗、松木依理奈、井上雄翔、濁川清美、野村 渉
    • 学会等名
      ケミカルバイオロジー学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Development of Precise Genome Editing Technology by Cell Cycle Depending Activation of CRISPR-Cas92022

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Matsumoto, Kanae Kishi, Erina Matsugi, Yuto Inoue, Kiyomi Nigorikawa, Wataru Nomura
    • 学会等名
      CBI学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 細胞周期依存的なhigh fidelity Cas9の活性化によるゲノム編集の正確性向上の検討2022

    • 著者名/発表者名
      松本大亮、岸果苗、松木依理奈、井上雄翔、濁川清美、野村 渉
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 特定の細胞周期におけるタンパク質分解の複合化によるゲノム編集と精度の向上2022

    • 著者名/発表者名
      井上雄翔、松本大亮、岸果苗、松木依理奈、濁川清美、野村渉
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] CRISPRaを用いた自律制御型ゲノム編集におけるAnti-CRISPR作用の解析2022

    • 著者名/発表者名
      岸 果苗、濁川 清美、長谷川 有希、松本 大亮、野村 渉
    • 学会等名
      日本薬学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞周期依存的なCRISPR活性制御によるゲノム編集法の開発2021

    • 著者名/発表者名
      松本 大亮、野村 渉
    • 学会等名
      2021年若手ペプチド夏の勉強会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Cell cycle dependent expression of anti-CRISPR improves genome editing accuracy2021

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Matsumoto, Wataru Nomura
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第6回年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-01-30  

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