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ゲルマイクロドロップレットによる難培養微生物の培養と抗がん化合物の探索

研究課題

研究課題/領域番号 21K14953
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分41050:環境農学関連
研究機関三重大学

研究代表者

市川 俊輔  三重大学, 教育学部, 准教授 (50781118)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2022年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード土壌微生物 / マイクロドロップレット / 複合培養 / 菌叢解析 / 生理活性化合物 / Water in oil ドロップレット / ゲルマイクロドロップレット / 難培養微生物 / 二次代謝産物
研究開始時の研究の概要

多様な二次代謝産物を産生する土壌微生物は、創薬のための魅力的な資源である。本研究ではゲルマイクロドロップレットによって難培養微生物を含めた多様な微生物を複合培養し、その培養液中から新規抗がん化合物の取得に挑戦する。がん移植ゼブラフィッシュモデルをスクリーニングに利用することで、土壌微生物培養液のin vivoでの抗がん活性と生体毒性などの特徴を多角的に評価する。抗がん活性を示す土壌微生物複合培養液のメタゲノム解析を行い、培養液中の微生物組成や二次代謝産物生産遺伝子群を推定する。最終的に候補の微生物培養液より、抗がん化合物を単離・同定し、その薬理学的特性を決定する。

研究成果の概要

環境中の大部分の微生物は未探索な状況 (Microbial dark matter) である。多くの細菌は増殖が遅く、また他の微生物由来の化合物を要求するために、培養することが難しい。ドロップレットへの微生物包埋と複合培養は、微生物間の化合物相互作用を維持しながら、液体培地中で多種の細菌を分離培養できるために、難培養微生物を培養するための方法として期待されている。本研究では、土壌細菌のマイクロドロップレットへの包埋を活用することで、特定の細菌の優占を防いで均等度を保持した菌叢をもつ複合培養液を調製できることを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

わたしたちは食品・健康・農業・環境などあらゆる場面で微生物の力を活用してきた。一方でいまだ未探索な環境微生物が膨大に存在していることがわかっている。これら微生物を培養して特徴を明らかにすることで、新しい微生物価値を見出すことが可能となる。本研究では、マイクロドロップレットを活用した微生物培養法によって、多様な微生物を複合培養できることを明らかにした。本研究成果をもとに、さらに応用性の高い目的に沿ったスクリーニング系を開発することによって、期待する機能をもつ微生物を探索できるものと考えている。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2024 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] University of Delaware(米国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [雑誌論文] Stable cellulolytic activity of Clostridium thermocellum against cellulosic biomass pretreated with ionic liquid 1-ethyl 3-methylimidazolium acetate2024

    • 著者名/発表者名
      Ito Daichi、Kitamura Kazumasa、Higashi Koushi、Kondo Makoto、Ogawa Satoru、Kikuchi Aoi、Karita Shuichi、Ichikawa Shunsuke
    • 雑誌名

      Bioresource Technology Reports

      巻: 25 ページ: 101739-101739

    • DOI

      10.1016/j.biteb.2023.101739

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 小学校理科化学分野におけるワークシートのデジタル化とその実践2024

    • 著者名/発表者名
      市川俊輔, 米川美有, 伊藤敏之, 山田邦裕, 井戸田琉那, 益野真寿美, 杉澤学
    • 雑誌名

      STEM教育研究

      巻: -

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 簡易な化合物濃度測定法の開発と高校探究学習に向けた有用性検証2024

    • 著者名/発表者名
      市川俊輔, 長谷川駿介, 荻原彰, 米川美有, 杉澤学
    • 雑誌名

      STEM教育研究

      巻: -

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Paraburkholderia sabiae administration alters zebrafish anxiety-like behavior via gut microbial taurine metabolism2023

    • 著者名/発表者名
      Ichikawa Shunsuke、Abe Reimi、Fujimoto Haruka、Higashi Koushi、Zang Liqing、Nakayama Hiroko、Matsuoka Izumi、Shimada Yasuhito
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 14 ページ: 1079187-1079187

    • DOI

      10.3389/fmicb.2023.1079187

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The expression of alternative sigma-I7 factor induces the transcription of cellulosomal genes in the cellulolytic bacterium Clostridium thermocellum2022

    • 著者名/発表者名
      Ichikawa Shunsuke、Ito Daisuke、Asaoka Sayuri、Abe Reimi、Katsuo Norito、Ito Toshiyuki、Ito Daichi、Karita Shuichi
    • 雑誌名

      Enzyme and Microbial Technology

      巻: 156 ページ: 110002-110002

    • DOI

      10.1016/j.enzmictec.2022.110002

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Rare UV-resistant cells in clonal populations of Escherichia coli2022

    • 著者名/発表者名
      Ichikawa Shunsuke、Okazaki Mika、Okamura Mina、Nishimura Norihiro、Miyake Hideto
    • 雑誌名

      Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology

      巻: 231 ページ: 112448-112448

    • DOI

      10.1016/j.jphotobiol.2022.112448

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 科学的リテラシーの育成を目指すカフェインを題材とした家庭科授業の実践2022

    • 著者名/発表者名
      中西理紗、平島円、荻原彰、市川俊輔、村田晋太朗、後藤太一郎、磯部由香
    • 雑誌名

      三重大学教育学部研究紀要

      巻: 73 ページ: 383-391

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] 有機肥料の肥効は在来の土壌微生物叢に依存する ―圃場試験・土壌培養実験・微生物叢解析の結果から―2024

    • 著者名/発表者名
      前采花、村井朝香、濵嶋賢、後藤真唯子、加藤ひなた、市川俊輔、渡辺晋生、関谷信人
    • 学会等名
      日本作物学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] UV-LED光処理後に生存する環境水中の細菌PriestiaのUV耐性発現2023

    • 著者名/発表者名
      市川俊輔、岡﨑美香、藤本晴香、アヴシャル恵利子、西村訓弘、三宅秀人
    • 学会等名
      日本水環境学会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] マイクロドロップレットを用いた土壌微生物複合培養とその菌叢解析2022

    • 著者名/発表者名
      市川 俊輔、本間 宣行、勝尾 徳斗、石毛 真行
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ウシ胎児血清成分によるBacillus属細菌の抗がん活性誘導とRNA-seq解析2022

    • 著者名/発表者名
      市川 俊輔、勝尾 徳斗、岡﨑 文美、中山 寛子、西村 訓弘、島田 康人
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌クローン集団中のUV耐性細胞の存在とそのUV殺菌条件の確立2022

    • 著者名/発表者名
      市川 俊輔、岡﨑 美香、岡村 実奈、西村 訓弘、三宅 秀人
    • 学会等名
      日本水環境学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌クローン集団中に存在する希少なUV耐性細胞2021

    • 著者名/発表者名
      市川 俊輔、岡﨑 美香、岡村 実奈、三宅 秀人
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Cellulose degradation mechanism of a cellulolytic bacterium Clostridium thermocellum2021

    • 著者名/発表者名
      Shunsuke Ichikawa
    • 学会等名
      International Conference on Bioresource Technology for Bioenergy, Bioproducts & Environmental Sustainability
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 三重県土壌由来Bacillus属細菌の抗がん活性とそのゲノム解析2021

    • 著者名/発表者名
      市川 俊輔、勝尾 徳斗、岡﨑 文美、中山 寛子、西村 訓弘、島田 康人
    • 学会等名
      生物工学若手研究者の集い夏のオンラインセミナー
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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