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Pathogenomics and eco-epidemiology of Mycobacterium orygis, an emerging zoonotic tuberculosis organism

研究課題

研究課題/領域番号 21K14969
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分42020:獣医学関連
研究機関北海道大学

研究代表者

THAPA JEEWAN  北海道大学, 人獣共通感染症国際共同研究所, 助教 (40837449)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2022年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2021年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワードTuberculosis / Mycobacterium orygis / Pathogenomics / Molecular epidemiology / Nepal / tuberculosis / molecular epidemiology / epidemiology
研究開始時の研究の概要

Mycobacterium orygis is an emerging causative agent of zoonotic tuberculosis (TB) and animal TB, and is epidemiologically associated with the South Asian region. However, how and why does M. orygis causes TB differently from other members of M. tuberculosis complex bacteria is still unknown. We will understand TB disease by taking M. orygis as a model. In addition, molecular epidemiological surveillance across the wildlife/livestock/human interface in Nepal will be conducted to understand the eco-epidemiology of M. orygis.

研究成果の概要

我々が行ったMycobacterium orygisの比較全ゲノム解析により、この菌が南アジアの風土病起因菌として分布しており、南アジア近隣地域ではMycobacterium orygis関連結核の脅威があることが明らかになった。ネパールのサイから分離されたMycobacterium orygisのゲノム解析により、Mycobacterium orygisに特有の変異があることが判明した。そこで、簡易診断法として RD301領域をターゲットとしたMycobacterium orygis特異的PCR法を開発した。更にはネパールにおける人獣共通感染症結核の生態疫学を理解するために調査を実施した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

The research identified that the Mycobacterium orygis is an important causative agent of zoonotic tuberculosis (TB) in south Asia region, and there is a threat from Mycobacterium orygis-associated TB in south Asia and beyond.

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2023 2022 2021 その他

すべて 国際共同研究 (8件) 雑誌論文 (15件) (うち国際共著 15件、 査読あり 15件、 オープンアクセス 13件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 4件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] NATA, German Nepal Tuberculosis Project(ネパール)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] NATA, German Nepal Tuberculosis Project/National Trust for Nature Conservation/Chitwan National Park(ネパール)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Agriculture and Forestry University(ネパール)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Zambian National Public Health Institute(ザンビア)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University College Dublin(アイルランド)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] NATA, German Nepal Tuberculosis Project/National Trust for Nature Conservation/Chitwan National Park(ネパール)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [国際共同研究] Agriculture and Forestry University(ネパール)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University Teaching Hospital(ザンビア)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Direct detection of Mycobacterium bovis by a dry loop-mediated isothermal amplification assay in cattle samples collected during routine abattoir examination in Malawi2023

    • 著者名/発表者名
      Kapalamula Thoko Flav、Thapa Jeewan、Hayashida Kyoko、Chizimu Joseph、Tanomsridachchai Wimonrat、Nyenje Mirriam Ethel、Mkakosya Rajab、Nakajima Chie、Suzuki Yasuhiko
    • 雑誌名

      Journal of Veterinary Diagnostic Investigation

      巻: 35 号: 3 ページ: 307-310

    • DOI

      10.1177/10406387231164596

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of DNA Gyrase Activity and Elucidation of the Impact of Amino Acid Substitution in GyrA on Fluoroquinolone Resistance in Mycobacterium avium2023

    • 著者名/発表者名
      Thapa Jeewan、Chizimu Joseph Yamweka、Kitamura Soyoka、Akapelwa Mwangala Lonah、Suwanthada Pondpan、Miura Nami、Toyting Jirachaya、Nishimura Tomoyasu、Hasegawa Naoki、Nishiuchi Yukiko、Gordon Stephen V.、Nakajima Chie、Suzuki Yasuhiko
    • 雑誌名

      Microbiology Spectrum

      巻: - 号: 3

    • DOI

      10.1128/spectrum.05088-22

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Insight into the genetic diversity of Mycobacterium bovis isolated from cattle in Malawi2023

    • 著者名/発表者名
      Kapalamula Thoko Flav、Chizimu Joseph Yamweka、Akapelwa Mwangala Lonah、Barnes David Atomanyi、Toyting Jirachaya、Bwalya Precious、Basikolo Linda、Squarre David、Chambaro Herman M.、Gordon Stephen V.、Thapa Jeewan、Nakajima Chie、Suzuki Yasuhiko
    • 雑誌名

      Research in Veterinary Science

      巻: 164 ページ: 105030-105030

    • DOI

      10.1016/j.rvsc.2023.105030

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Molecular Characterisation of Mycobacterium bovis Isolates from Cattle Slaughtered in Adamawa and Gombe States, North-Eastern Nigeria2023

    • 著者名/発表者名
      Damina Sadiq Mohammed、Barnes David Atomanyi、Inuwa Bitrus、Ularamu Gulak Hussaini、Bello Mohammed、Okaiyeto Olu Solomon、Kudi Ayuba Caleb、Thapa Jeewan、Nakajima Chie、Suzuki Yasuhiko
    • 雑誌名

      Current Issues in Molecular Biology

      巻: 45 号: 7 ページ: 6055-6066

    • DOI

      10.3390/cimb45070382

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Whole-Genome Investigation of Zoonotic Transmission of Livestock-Associated Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Clonal Complex 398 Isolated from Pigs and Humans in Thailand2023

    • 著者名/発表者名
      Narongpun Pawarut、Chanchaithong Pattrarat、Yamagishi Junya、Thapa Jeewan、Nakajima Chie、Suzuki Yasuhiko
    • 雑誌名

      Antibiotics

      巻: 12 号: 12 ページ: 1745-1745

    • DOI

      10.3390/antibiotics12121745

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Exploration of the novel fluoroquinolones with high inhibitory effect against quinolone-resistant DNA gyrase of Salmonella Typhimurium2023

    • 著者名/発表者名
      Toyting Jirachaya、Miura Nami、Utrarachkij Fuangfa、Tanomsridachchai Wimonrat、Belotindos Lawrence P.、Suwanthada Pondpan、Kapalamula Thoko Flav、Kongsoi Siriporn、Koide Kentaro、Kim Hyun、Thapa Jeewan、Nakajima Chie、Suzuki Yasuhiko
    • 雑誌名

      Microbiology Spectrum

      巻: 11 号: 6

    • DOI

      10.1128/spectrum.01330-23

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The Impact of Substitutions at Positions 1 and 8 of Fluoroquinolones on the Activity Against Mutant DNA Gyrases of Salmonella Typhimurium2023

    • 著者名/発表者名
      Suwanthada Pondpan、Kongsoi Siriporn、Miura Nami、Belotindos Lawrence P.、Piantham Chayada、Toyting Jirachaya、Akapelwa Mwangala L.、Pachanon Ruttana、Koide Kentaro、Kim Hyun、Thapa Jeewan、Nakajima Chie、Suzuki Yasuhiko
    • 雑誌名

      Microbial Drug Resistance

      巻: 29 号: 12 ページ: 552-560

    • DOI

      10.1089/mdr.2023.0014

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Prevalence and risk factors of bovine tuberculosis in slaughtered cattle, Malawi2023

    • 著者名/発表者名
      Thoko Flav Kapalamula, Francis Kawonga, Misheck Shawa, Joseph Chizimu, Jeewan Thapa, Mirriam Ethel Nyenje, Rajhab Sawasawa Mkakosya, Kyoko Hayashida, Stephen Gordon, Chie Nakajima, Musso Munyeme, Bernard M Hang'ombe, Yasuhiko Suzuki
    • 雑誌名

      Heliyon

      巻: 9 号: 2 ページ: e13647-e13647

    • DOI

      10.1016/j.heliyon.2023.e13647

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Threat from Mycobacterium orygis-associated tuberculosis in south Asia2022

    • 著者名/発表者名
      Jeewan Thapa, Stephen V. Gordon, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 雑誌名

      The Lancet Microbe

      巻: 3 号: 9 ページ: e641-e642

    • DOI

      10.1016/s2666-5247(22)00149-5

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Detection of Mutations in pncA in Mycobacterium tuberculosis Clinical Isolates from Nepal in Association with Pyrazinamide Resistance2022

    • 著者名/発表者名
      Dipti Shrestha, Bhagwan Maharjan, Jeewan Thapa, Mwangala Lonah Akapelwa, Precious Bwalya, Joseph Yamweka Chizimu, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 雑誌名

      Current Issues in Molecular Biology

      巻: 44 号: 9 ページ: 4132-4141

    • DOI

      10.3390/cimb44090283

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genetic Diversity and Transmission of Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis strains in Lusaka, Zambia2022

    • 著者名/発表者名
      Joseph Yamweka Chizimu, Eddie Samuneti Solo, Precious Bwalya, Thoko Flav Kapalamula, Mwangala Lohah Akapelwa, Partick Lungu, Dipti Shrestha, Yukari Fukushima, Victor Mukonka, Jeewan Thapa, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 雑誌名

      International Journal of Infectious Diseases

      巻: 114 ページ: 142-150

    • DOI

      10.1016/j.ijid.2021.10.044

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Whole-Genome Sequencing Reveals Recent Transmission of Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis CAS1-Kili Strains in Lusaka, Zambia2022

    • 著者名/発表者名
      Joseph Yamweka Chizimu, Eddie Samuneti Solo, Precious Bwalya, Wimonrat Tanomsridachchai, Herman Chambaro, Misheck Shawa, Thoko Flav Kapalamula, Partick Lungu, Yukari Fukushima, Victor Mukonka, Jeewan Thapa, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 雑誌名

      Antibiotics (Basel)

      巻: 11 号: 1 ページ: 29-29

    • DOI

      10.3390/antibiotics11010029

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of embB mutations involved in ethambutol resistance in multi-drug resistant Mycobacterium tuberculosis isolates in Zambia2022

    • 著者名/発表者名
      Precious Bwalya, Eddie S Solo, Joseph Y Chizimu, Dipti Shrestha, Grace Mbulo, Jeewan Thapa, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 雑誌名

      Tuberculosis (Edinb)

      巻: 133 ページ: 102184-102184

    • DOI

      10.1016/j.tube.2022.102184

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Evaluation of Xpert MTB/RIF with microscopy and culture for the diagnosis of tuberculosis in a referral laboratory in Nepal<i> </i>2021

    • 著者名/発表者名
      Bhagwan Maharjan, Jeewan Thapa, Dhirendra Kumar Shah, Bhabana Shrestha, Korkut Avsar, Yasuhiko Suzuki, Chie Nakajima
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Infectious Diseases

      巻: advpub 号: 0 ページ: 517-521

    • DOI

      10.7883/yoken.JJID.2020.921

    • NAID

      130008119504

    • ISSN
      1344-6304, 1884-2836
    • 年月日
      2021-03-31
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Tuberculosis seroprevalence and comparison of hematology and biochemistry parameters between seropositive and seronegative captive Asian elephants of Nepal2021

    • 著者名/発表者名
      Jeewan Thapa, Susan K. Mikota, Kamal Prasad Gairhe, Sarad Paudel, Dinesh Kumar Singh, Ishwari Prasad Dhakal, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 雑誌名

      The Journal of Veterinary Medical Science

      巻: 83 号: 8 ページ: 1278-1283

    • DOI

      10.1292/jvms.21-0113

    • NAID

      130008073416

    • ISSN
      0916-7250, 1347-7439
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Threat from Mycobacterium orygis-associated tuberculosis for wildlife conservation in South Asia2023

    • 著者名/発表者名
      Jeewan Thapa, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 学会等名
      The 16th Asian Society of Conservation Medicine
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] WQ-3810: A novel fluoroquinolone with a strong potential against fluoroquinolone-resistant Mycobacterium avium2023

    • 著者名/発表者名
      Sasini Jayaweera, Jeewan Thapa, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 学会等名
      Sapporo Summer Symposium for One Health (SaSSOH 2023)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Surveillance of elephant tuberculosis in captive and wild elephants of Nepal2023

    • 著者名/発表者名
      Arjun Pandit, Jeewan Thapa, Yasuhiko Suzuki, Chie Nakajima, Amir Sadaula, Shrestha Bijaya Kumar, Naresh Subedi, Susan Mikota, Michito Shimozuru, Bhawana Shrestha, Sarad Paudel, Baburam Lamichhane, Toshio Tsubota
    • 学会等名
      Sapporo Summer Symposium for One Health (SaSSOH 2023)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Mycobacterium orygis-associated tuberculosis2022

    • 著者名/発表者名
      Jeewan Thapa
    • 学会等名
      U.S.-Japan Cooperative Medical Science Program, International Conference on Emerging Infectious Diseases
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Evaluation of rapid molecular diagnostic methods with microscopy and culture for the diagnosis of tuberculosis in Nepal2022

    • 著者名/発表者名
      Jeewan Thapa, Bhagwan Maharjan, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 学会等名
      ASM Microbe 2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Role of quinolone resistance-associated mutations in gyrA of Mycobacterium avium to the fluoroquinolone resistance2022

    • 著者名/発表者名
      Jeewan Thapa, Joseph Chizumu, Soyoka Kitamura, Mwangala Lonah Akapelwa, Pondpan Suwantada, Nami Miura, Jirachaya Toyting, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 学会等名
      第6回抗酸菌研究会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Role of fluoroquinolone resistance-associated mutations in Mycobacterium avium gyrA to resistance2022

    • 著者名/発表者名
      Jeewan Thapa, Joseph Chizumu, Soyoka Kitamura, Mwangala Lonah Akapelwa, Pondpan Suwantada, Nami Miura, Jirachaya Toyting, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 学会等名
      96th Annual Meeting of Japanese Society of Bacteriology
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Mycobacterium orygis associated tuberculosis is an emerging threat for wildlife conservation in Nepal2021

    • 著者名/発表者名
      Jeewan Thapa, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 学会等名
      The 13th International Virtual Conference of Asian Society of Conservation Medicine (ASCM)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Development of methyl green dry loop-mediated isothermal amplification method for the simple detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical samples2021

    • 著者名/発表者名
      Jeewan Thapa, Bhagwan Maharjan, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki
    • 学会等名
      World Microbe Forum 2021
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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