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cQSARコンセプトによる野生動物の“非侵襲的”化学物質感受性評価法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 21K14988
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分42020:獣医学関連
研究機関北里大学

研究代表者

武田 一貴  北里大学, 獣医学部, 講師 (00896350)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2022年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2021年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード動物種差 / 化学物質感受性 / 中毒 / AlphaFold2 / 分子動力学 / 分子ドッキング / 農薬 / 医薬品 / 野生動物 / AlphaFold / 環境汚染 / タンパク質立体構造 / 機械学習 / 環境化学物質 / シミュレーション
研究開始時の研究の概要

目的:野生動物の化学物質感受性の非侵襲的評価法の確立
環境化学物質は野生動物に対し種々の被害を与え、時に局所的な大量死を生じる事がある。この原因として化学物質感受性には数百倍もの動物種差があるのに対し、現在の安全性評価は実験動物でしか行われていない事が挙げられる。一方、膨大な化学物質全てに対し野生動物への致死的な曝露試験を行う事は不可能であり、現状野生動物の化学物質感受性を評価する手法は乏しい。れに対し被毛などから非侵襲的に入手できるDNA情報の利用に着目し、本研究はDNA情報を利用したシミュレーションと機械学習により化学物質感受性の種差を予測する新規手法counter-QSARの構築を目指す。

研究成果の概要

化学物質は野生動物へ種々の被害を引き起こし、時に個体群の局所的な絶滅を生じる事もある。このため野生動物の化学物質感受性評価は必須だが、これらを用いた動物実験は禁忌である。このため非侵襲的に入手できるDNAなど限られた情報を用い野生動物の感受性評価を行う手法を確立する必要がある。感受性に影響を与える主要因は標的分子・解毒代謝酵素の種差である。これらの非侵襲的な評価手法としてDNA情報から構築した標的分子・代謝酵素の3D構造を用いたシミュレーションを実施した。成果の一例として、一アミノ酸多型が与える殺鼠剤抵抗性の影響の評価も可能となり、遺伝情報を用いた化学物質感受性評価の可能性を示した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

野生動物での毒性試験は希少種保護の観点から困難であり、これらの化学物質感受性評価は立ち遅れている。一方、DNAは被毛から非侵襲的に入手できるため野生動物においても遺伝子解析は容易である。本研究で実施したin silicoモデリング評価系は、DNA情報を活用する事で野生動物研究の制限を超え、生体レベルでの感受性評価を可能とする独創的な研究である。本研究手法は標的分子・代謝酵素を変える事で殺鼠剤以外の化学物質へも応用可能だと予想される。当該研究は従来種差の壁が阻んでいた野生動物の化学物質感受性評価を世界に先駆け可能とする環境毒性学におけるトランスフォーマティブリサーチとなり得る。

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 1件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Development of a sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) to quantify γ-glutamyl-carboxylated clotting factor IX and assess redox susceptibility of anticoagulant chemicals2022

    • 著者名/発表者名
      SATO Ryo、WATANABE Kanami、KAMATA Ryo、TAKEDA Kazuki
    • 雑誌名

      The Journal of Veterinary Medical Science

      巻: 84 号: 6 ページ: 804-808

    • DOI

      10.1292/jvms.22-0079

    • ISSN
      0916-7250, 1347-7439
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Estimating susceptibility of rodenticide by molecular dynamics & machine learning using 3D structures of vitamin k epoxide reductase2022

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Takeda, Nobuaki Yasuo, Kanami Watanabe, Ryo Sato, Ryo Kamata, Masakazu Sekijima
    • 雑誌名

      The Pure and Applied Chemistry International Conference 2022 (PACCON2022) “Frontiers in Chemical Sciences for Health, Energy, and Sustainability”

      巻: 1 ページ: 971-975

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Toxicokinetic analysis of the anticoagulant rodenticides warfarin & diphacinone in Egyptian fruit bats (Rousettus aegyptiacus) as a comparative sensitivity assessment for Bonin fruit bats (Pteropus pselaphon)2022

    • 著者名/発表者名
      Takeda Kazuki、Manago Kosuke、Morita Ayuko、Kawai Yusuke K.、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu、Ikenaka Yoshinori、Hashimoto Takuma、Minato Ryuichi、Oyamada Yusuke、Horikoshi Kazuo、Suzuki Hajime、Ishizuka Mayumi、Nakayama Shouta M.M.
    • 雑誌名

      Ecotoxicology and Environmental Safety

      巻: 243 ページ: 113971-113971

    • DOI

      10.1016/j.ecoenv.2022.113971

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Observation of hapten-induced sensitization responses for the development of a mouse skin sensitization test, including the elicitation phase2022

    • 著者名/発表者名
      Kamata Ryo、Okawa Yukiko、Hamaguchi Yuto、Tabata Soma、Terasaki Masanori、Takeda Kazuki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 19898-19898

    • DOI

      10.1038/s41598-022-24547-1

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The effects of fipronil on emotional and cognitive behaviors in mammals2021

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Tomohiro、Hirai Anri、Khidkhan Kraisiri、Nimako Collins、Ichise Takahiro、Takeda Kazuki、Mizukawa Hazuki、Nakayama Shouta M.M.、Nomiyama Kei、Hoshi Nobuhiko、Maeda Mizuki、Hirano Tetsushi、Sasaoka Kazuyoshi、Sasaki Noboru、Takiguchi Mitsuyoshi、Ishizuka Mayumi、Ikenaka Yoshinori
    • 雑誌名

      Pesticide Biochemistry and Physiology

      巻: 3 ページ: 104847-104847

    • DOI

      10.1016/j.pestbp.2021.104847

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Sensitivity of turtles to anticoagulant rodenticides: Risk assessment for green sea turtles (Chelonia mydas) in the Ogasawara Islands and comparison of warfarin sensitivity among turtle species2021

    • 著者名/発表者名
      Yamamura Yoshiya、Takeda Kazuki、Kawai Yusuke K.、Ikenaka Yoshinori、Kitayama Chiyo、Kondo Satomi、Kezuka Chiho、Taniguchi Mari、Ishizuka Mayumi、Nakayama Shouta M.M.
    • 雑誌名

      Aquatic Toxicology

      巻: 233 ページ: 105792-105792

    • DOI

      10.1016/j.aquatox.2021.105792

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Evaluation of Subchronic Toxicological Effects of Low Concentration Mixed Exposure of Nine Linear PFAS on Mice2023

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Takeda, Taki Saito, Sakura Sasaki, Akifumi Eguchi, Ryo Kamata
    • 学会等名
      6th International Chemical Hazard Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] AlphaFold2によるタンパク質立体構造予測を利用した毒性評価の試み2023

    • 著者名/発表者名
      武田一貴
    • 学会等名
      第50回日本毒性学会学術年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] AlphaFold2と分子シミュレーションを活用した天然記念物オ ガサワラオオコウモリの殺鼠剤感受性評価2023

    • 著者名/発表者名
      武田 一貴, 川合 佑典, 安尾 信明, 関嶋 政和, 真砂 皓大, 池中 良徳, 堀越 和夫, 鈴木 創, 石塚 真由美, 中山 翔太
    • 学会等名
      第2回環境化学物質3学会合同大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 培養細胞発現系と AI による構造推定を用いた血液凝固 第 IX 因子スプライシングバリアント 2 の機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      渡邉可菜実, 佐藤玲, 鎌田亮, 武田一貴
    • 学会等名
      第5回環境化学討論会 北海道東北地区部会・中国四国地区部会 合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 血液凝固第IX因子 スプライシングバリアント2の機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      渡邉可菜実, 佐藤玲, 鎌田亮, 武田一貴
    • 学会等名
      第4回日本比較薬理学・毒性学会春季研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ゼブラフィッシュを用いた増感剤関連物質の芳香族炭化水素受容体 (AhR)活性化能の評価2022

    • 著者名/発表者名
      更田 葵依, 武田 一貴, 清水 敬太, 寺崎 正紀, 鎌田 亮
    • 学会等名
      環境化学物質3学会合同大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] パーフルオロアルキル化合物(PFASs)のマウスへの低濃度混合曝露による毒性影響評価2022

    • 著者名/発表者名
      武田一貴, 斎藤多喜, 佐々木さくら, 江口哲史, 鎌田亮
    • 学会等名
      環境化学物質3学会合同大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ESTIMATING SUSCEPTIBILITY OF RODENTICIDE BY MOLECULAR DYNAMICS & MACHINE LEARNING USING 3D STRUCTURES OF VITAMIN K EPOXIDE REDUCTASE2022

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Takeda, Nobuaki Yasuo, Kanami Watanabe, Ryo Sato, Ryo Kamata, Masakazu Sekijima
    • 学会等名
      The Pure and Applied Chemistry International Conference 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 分子シミュレーションを用いたヒトの一塩基多型から化学物質感受性の動物種差を予測する手法の構築2022

    • 著者名/発表者名
      武田一貴, 安尾信明, 関嶋政和
    • 学会等名
      第49回日本毒性学会学術年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 培養細胞法とAlphafold2による血液凝固第IX因子スプライシングバリアント2の機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      渡邉可菜実, 佐藤玲, 鎌田亮, 武田一貴
    • 学会等名
      第49回日本毒性学会学術年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] インク由来化学物質群のゼブラフィッシュ胚への芳香族炭化水素受容体(AhR)を介する毒性影響評価2022

    • 著者名/発表者名
      更田 葵依, 武田 一貴, 清水 敬太, 寺崎 正紀, 鎌田 亮
    • 学会等名
      第165回日本獣医学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] AlphaFold2を用いた高精度タンパク質立体構造予測の毒性評価への応用可能性 ~環境汚染物質を例として~2022

    • 著者名/発表者名
      武田一貴
    • 学会等名
      第5回医薬品毒性機序研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 血液凝固第IX因子 スプライシングバリアント2の機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      渡邉可菜実 佐藤玲 鎌田亮 武田一貴
    • 学会等名
      第4回日本比較薬理学・毒性学会春季研究会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 培養細胞発現系と AI による構造推定を用いた血液凝固 第 IX 因子スプライシングバリアント 2 の機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      渡邉可菜実 佐藤玲 鎌田亮 武田一貴
    • 学会等名
      第5回環境化学討論会 北海道東北地区部会・中国四国地区部会 合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションと機械学習によるビタミン K エポキシド還元酵素遺伝子多型からの殺鼠剤感受性の評価法の確立2021

    • 著者名/発表者名
      武田 一貴, 安尾 信明, 渡邉 可菜実, 佐藤 玲, 鎌田 亮, 関嶋 政和
    • 学会等名
      第29回環境化学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Anticoagulant rodenticide in Bonin Islands, Japan “Galapagos of the Orient” - investigation of rodenticide-susceptibility of the endemic species by toxicokinetic analysis -2021

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Takeda, Shouta M.M. Nakayama, Kosuke Manago, Yoshiya Yamamura, Yusuke Kawai, Ayuko Morita, Yoshinori Ikenaka, Noriyuki Komatsu, Chiyo Kitayama, Satomi Kondo, Takuma Hashimoto, Ryuichi Minato, Yusuke Oyamada, Kazuo Horikoshi, and Mayumi Ishizuka
    • 学会等名
      The 2021 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-01-30  

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