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大腸菌SecMの翻訳途上鎖が協働的に翻訳アレストを安定化する分子機序の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K15433
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分49050:細菌学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

丹澤 豪人  大阪大学, 蛋白質研究所, 特任研究員(常勤) (80899328)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2022年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2021年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードタンパク質合成 / リボソーム / クライオ電子顕微鏡構造解析 / 翻訳アレスト / SecM / クライオ電子顕微鏡単粒子解析 / クライオ電子顕微鏡 / 単粒子解析
研究開始時の研究の概要

リボソームにおけるタンパク質合成の途中で,ストレス応答といった負の要因からタンパク質の局在輸送といった正の要因までの様々な条件下において,翻訳を一時停止させる「翻訳アレスト」現象が広く報告されている.これまでの研究で,大腸菌secM mRNA上で翻訳アレストが起きると,リボソーム出口トンネルの外に露出した新生鎖がリボソーム表面に結合することで協働的に翻訳アレストを安定化することが1分子力学測定により示された.本申請研究では,クライオ電子顕微鏡を用いてsecMの翻訳アレスト複合体の単粒子解析を行い,secM新生鎖のリボソーム上での翻訳アレスト安定化メカニズムを分子構造レベルで理解する.

研究成果の概要

本申請研究は,タンパク質合成を一時停止させるsecM mRNAに着目し,70Sリボソーム-SecM新生鎖複合体の構造解明により,SecM翻訳アレスト機構を理解することを目的とする.
大腸菌の内在性70Sを単離し,secM mRNAのin vitro転写後,市販の大腸菌無細胞翻訳系の中で70S-SecM新生鎖複合体を調製した.ショ糖密度勾配遠心法,負染色電子顕微鏡観察およびクライオ電子顕微鏡を用いて複合体形成を確認した.SecMアレストはリボソームAサイトにtRNAが結合すると報告されており,3つのtRNAが結合した70S複合体の単粒子解析に成功した.現在,新生鎖領域の解析を継続している.

研究成果の学術的意義や社会的意義

オニールレポートの2050年問題に取り上げられているように,薬剤耐性菌感染症による死亡率上昇の危険度は高まる一方であり,新規・改良型抗生物質の開発が急務である.
本研究で注目する真正細菌リボソームは主要な創薬ターゲットであり,現存する抗生物質の実に7割以上がリボソームを標的とする.SecMは生命維持に必須なATP駆動型膜タンパク質輸送チャネル(SecA)の上流ペプチドでSecA翻訳を調節するため,SecM翻訳アレストの分子レベルでの理解は新規薬剤探索への応用が期待できる.またSecMアレスト配列は分子生物学研究で広く利用されており,本研究成果はより精密な実験系の提案にも寄与できると期待している.

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] RRFとtRNAによるリボソームリサイクリングに関する構造的洞察2022

    • 著者名/発表者名
      丹澤豪人
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 62 号: 5 ページ: 303-304

    • DOI

      10.2142/biophys.62.303

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Structural basis on translational arrest in ribosome2023

    • 著者名/発表者名
      丹澤豪人
    • 学会等名
      International Symposium on Structure and Folding of Disease Related Proteins
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Attempt to visualize the synthetic polypeptide during translational arrest2022

    • 著者名/発表者名
      丹澤豪人
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 翻訳アレスト時のポリペプチド鎖を可視化する試み2022

    • 著者名/発表者名
      丹澤豪人,加藤貴之
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] アミノアシルtRNAはリボソームAサイトへ如何に正確に導入されるか2022

    • 著者名/発表者名
      丹澤豪人,Matthieu G. Gagnon
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] aa-tRNAはリボソームAサイトへ如何に正確に導入されるか2022

    • 著者名/発表者名
      丹澤豪人,Matthieu G. Gagnon
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第48回討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2024-01-30  

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