研究課題/領域番号 |
21K16382
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研究種目 |
若手研究
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配分区分 | 基金 |
審査区分 |
小区分55010:外科学一般および小児外科学関連
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研究機関 | 長崎大学 |
研究代表者 |
田中 彩 長崎大学, 病院(医学系), 助教 (50893244)
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研究期間 (年度) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2023年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
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キーワード | 甲状腺癌 / 甲状腺乳頭癌 / ctDNA / 血中循環腫瘍DNA / ゲノム / クローン進化 |
研究開始時の研究の概要 |
これまで甲状腺乳頭癌(PTC)の手術検体を用い、再発と関連するマーカーの研究を行ってきた。しかし、術後の再発や転移によ治療が必要となるもの、耐性を獲得していく高度進行難治性PTCについては、検体採取の困難さから未だ分子機構は明らかでない。また、抗体や手術術式により既存の腫瘍マーカーが使用できず、病態モニタリングが難しい症例もある。 本研究では手術検体を用いない解析手段として血中循環腫瘍DNA(ctDNA)に着目し、PTCの新たな治療戦略基盤の構築を目指す。ctDNAの量・質を経時的に解析することにより、①ctDNA解析による病態モニタリング、②PTCの治療耐性獲得に寄与する分子異常の同定を行う。
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研究実績の概要 |
初回手術例において、手術にて摘出された腫瘍サンプルにおける変異と血液cell-free DNA (cfDNA)で検出される変異、特にTERTプロモーター領域の変異について相関が低く、もともと甲状腺癌におけるcfDNA中の腫瘍由来DNAの量がかなり少ない可能性も考えられた。そこでcfDNAのみを研究対象とすることで研究の進捗が遅れる危険性を考慮し、当初の研究目的を達成するため、一部他の手段を用いることとした。大きく以下のa, b二つの方法となる。(a) cfDNA解析手法の改良を行い感度を上げる方法を検討しつつ、(b) 治療抵抗性そのものの機序を明らかにするため、放射性ヨウ素治療等を施行し、様々な治療反応性を示した多くの症例の腫瘍サンプルを解析するため、それらの手術標本の収集も同時に行なうこととした。以下、それぞれの本年度における実績を記す。 (a) cfDNAの断片長が短いため、PCR用のプライマーを再設計、さらに野生型アレルからの増幅を抑えるため、その部分に結合し、PCR反応を抑制する阻害オリゴヌクレオチドを設計して条件検討を行った。しかし、現在までのところ腫瘍サンプルとcfDNAで高い相関を示すまでの感度を得られていない。 (b) 近年に、放射性ヨウ素等の治療を行った症例約70例を自施設や共同研究機関より抽出し、術後の腫瘍組織ホルマリン固定パラフィン包埋切片の収集を開始した。2022年度末までに約半数の症例について収集を完了し、順次DNA・RNAの抽出を行った。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
cfDNA中の変異解析で十分な感度が得られていない。
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今後の研究の推進方策 |
cfDNA中のcirculating tumor DNA (ctDNA)変異の検出感度を上げるため、様々な工夫を加えていく。また、本年度より開始した手術標本の収集を完了させ、遺伝子解析を行って病態との関連を明らかにしていく。
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