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シングルセル遺伝子発現解析/エピゲノム解析による骨巨細胞腫の発生・進展過程の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K16648
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分56020:整形外科学関連
研究機関東京大学

研究代表者

津田 祐輔  東京大学, 医学部附属病院, 助教 (70896018)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2022年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2021年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
キーワードシングルセルRNAシークエンス / Regulatory T cell / 組織微小環境 / シングルセル解析 / 軟部明細胞肉腫 / 腫瘍免疫 / 腫瘍免疫環境 / シングルセル遺伝子発現解析 / 骨巨細胞腫 / エピゲノム解析
研究開始時の研究の概要

骨巨細胞腫は骨を破壊しながら増大し患者の機能的予後に大きな影響を及ぼすが、その発生・進展機序の理解は不十分であり、治療法も外科的切除が困難な症例に関しては確立されていない。本研究では、骨巨細胞腫を構成する細胞を1細胞レベルで解析することで、骨巨細胞腫において、腫瘍内の構成細胞、遺伝子発現異常、エピゲノム異常を1細胞レベルで明らかにする。腫瘍細胞に高発現し破骨細胞を誘導するRANKLの阻害剤であるデノスマブを投与することで腫瘍内の不均一性や、腫瘍細胞、破骨細胞の遺伝子発現やエピゲノムがどのように変化するかを解明する。シングルセル遺伝子発現解析とシングルセルエピゲノム解析などの先端的な手法を駆使する。

研究成果の概要

明細胞肉腫のシングルセル解析を行い、特にリンパ節内にはCD4+細胞やCD8+細胞は、BATF+ FOXP3+ CTLA4+ CD4+ T cell (Regulatory T cell, Treg)やLAG3+ PD1+ CD8+ T cell(Exhausted T cell)が多く、免疫抑制的な腫瘍環境を形成していた。T regはTGFβ1やCXCL12によって分化誘導されることが知られており、MacrophageやEndothelial cellのTGFβ1リガンドとT細胞におけるTGFβ1受容体、FibroblastのCXCL12リガンドとT細胞のCXCR4受容体との結合が示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

シングルセル解析により、軟部明細胞肉腫の組織微小環境中の細胞種多様性を明らかにし、免疫細胞を含め異なる細胞種間相互作用を抽出した。免疫抑制的な環境が構築されていることが示唆された。特に、CTLA4+ Tregが増加しており、皮膚メラノーマと同様に抗CTLA4抗体による免疫治療が有効である可能性が考えられた。軟部明細胞肉腫に対するシングルセル解析を行った報告はなく、学術的意義が高い研究である。

報告書

(3件)
  • 2023 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (22件) (うち国際共著 10件、 査読あり 22件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Generating in vitro models of NTRK-fusion mesenchymal neoplasia as tools for investigating kinase oncogenic activation and response to targeted therapy.2023

    • 著者名/発表者名
      Vanoli F, Herviou L, Tsuda Y, Sung P, Xie Z, Fishinevich E, Min SS, Mallen W, de Wardin HT, Zhang Y, Jasin M, Antonescu CR.
    • 雑誌名

      Oncogenesis.

      巻: - 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41389-023-00454-6

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Role of perioperative chemotherapy and radiotherapy for localized high-grade malignant peripheral nerve sheath tumor at the extremities and trunk wall: a population-based cohort study2023

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi H, Zhang L, Okajima K, Hirai T, Tsuda Y, Ikegami M, Kawai A, Tanaka S.
    • 雑誌名

      Jpn J Clin Oncol.

      巻: 53 号: 2 ページ: 138-145

    • DOI

      10.1093/jjco/hyac178

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] CORR Insights: What Proportion of Patients With Musculoskeletal Tumors Demonstrate Thromboelastographic Markers of Hypercoagulability? A Pilot Study2023

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Tsuda
    • 雑誌名

      Clin Orthop Relat Res.

      巻: 481 号: 3 ページ: 562-563

    • DOI

      10.1097/corr.0000000000002372

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dramatic response to entrectinib in a patient with malignant peripheral nerve sheath tumor harboring novel SNRNP70-NTRK3 fusion gene2023

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi H, Makise N, Shinozaki-Ushiku A, Zhang L, Ishibashi Y, Ikegami M, Tsuda Y, Kohsaka S, Ushiku T, Oda K, Miyagawa K, Aburatani H, Mano H, Tanaka S.
    • 雑誌名

      Genes Chromosomes Cancer.

      巻: 62 号: 1 ページ: 47-51

    • DOI

      10.1002/gcc.23089

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Atypical Neurofibromatous Neoplasm with Uncertain Biologic Potential in the Posterior Mediastinum of a Young Patient with Neurofibromatosis Type 1: A Case Report2022

    • 著者名/発表者名
      Miyamoto K, Kobayashi H, Zhang L, Tsuda Y, Makise N, Yasunaga Y, Ikemura M, Nakai Y, Shibata E, Ushiku T, Tanaka S.
    • 雑誌名

      Case Rep Oncol .

      巻: 15 号: 3 ページ: 988-994

    • DOI

      10.1159/000526844

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Preoperative arterial embolization and wound complications after resection of malignant bone tumor in the pelvis: a nationwide database study2022

    • 著者名/発表者名
      Zhang L, Michihata N, Matsui H, Fushimi K, Yasunaga H, Tsuda Y, Tanaka S, Kobayashi H.
    • 雑誌名

      Jpn J Clin Oncol.

      巻: 52 ページ: 1176-1182

    • DOI

      10.1093/jjco/hyac100

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Clinical characteristics of undifferentiated pleomorphic sarcoma of bone and the impact of adjuvant chemotherapy on the affected patients: a population-based cohort study.2022

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi H, Zhang L, Hirai T, Tsuda Y, Ikegami M, Tanaka S.
    • 雑誌名

      Jpn J Clin Oncol

      巻: hyac017 号: 6 ページ: 589-598

    • DOI

      10.1093/jjco/hyac017

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role of adjuvant chemotherapy in patients with localized, undifferentiated pleomorphic sarcoma of soft tissue: a population-based cohort study.2022

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi H, Zhang L, Hirai T, Tsuda Y, Ikegami M, Tanaka S.
    • 雑誌名

      Int J Clin Oncol

      巻: 27 号: 4 ページ: 802-810

    • DOI

      10.1007/s10147-021-02102-8

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Impact of the national sarcoma guidelines on the prevalence and outcome of inadvertent excisions of soft tissue sarcomas: An observational study from a UK tertiary referral centre.2022

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara T, Evans S, Stevenson J, Tsuda Y, Gregory J, Grimer R, Abudu A.
    • 雑誌名

      Eur J Surg Oncol

      巻: Mar;48(3) 号: 3 ページ: 533-540

    • DOI

      10.1016/j.ejso.2021.11.013

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Comparison of clinical features and outcomes of patients with leiomyosarcoma of bone and soft tissue: a population-based cohort study.2022

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi H, Zhang L, Hirai T, Tsuda Y, Ikegami M, Tanaka S.
    • 雑誌名

      Jpn J Clin Oncol.

      巻: 52 号: 2 ページ: 143-150

    • DOI

      10.1093/jjco/hyab176

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clinical analysis of multimodal treatment for localized synovial sarcoma: A multicenter retrospective study.2021

    • 著者名/発表者名
      Hagiwara Yoko、Iwata Shintaro、Ogura Koichi、Kawai Akira、Susa Michiro、Morioka Hideo、Hiruma Toru、Tsuda Yusuke、Kawano Hirotaka、Yonemoto Tsukasa、Ishii Takeshi、Okazaki Ken.
    • 雑誌名

      Journal of Orthopaedic Science

      巻: S0949-2658(21) 号: 1 ページ: 00340-7

    • DOI

      10.1016/j.jos.2021.09.012

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] How Are Indeterminate Pulmonary Nodules at Diagnosis Associated with Survival in Patients with High-Grade Osteosarcoma?2021

    • 著者名/発表者名
      Tsoi KM, Lowe M, Tsuda Y, Lex JR, Fujiwara T, Almeer G, Gregory J, Stevenson J, Evans SE, Botchu R, Jeys LM.
    • 雑誌名

      Clin Orthop Relat Res.

      巻: 479(2) 号: 2 ページ: 298-308

    • DOI

      10.1097/corr.0000000000001491

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Epithelioid hemangioma of bone harboring FOS and FOSB gene rearrangements: A clinicopathologic and molecular study.2021

    • 著者名/発表者名
      Tsuda Y, Suurmeijer AJH, Sung YS, Zhang L, Healey JH, Antonescu CR.
    • 雑誌名

      Genes Chromosomes Cancer

      巻: Jan;60(1) 号: 1 ページ: 17-25

    • DOI

      10.1002/gcc.22898

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Impact of NICE guidelines on the survival of patients with soft-tissue sarcomas2021

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara T, Grimer RJ, Evans S, Medellin Rincon MR, Tsuda Y, Le Nail LR, Abudu S.
    • 雑誌名

      Bone Joint J.

      巻: 103-B(3) 号: 3 ページ: 569-577

    • DOI

      10.1302/0301-620x.103b3.bjj-2020-0743.r1

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Pelvic reconstruction using an ice-cream cone prosthesis: correlation between the inserted length of the coned stem and surgical outcome.2021

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara T, Stevenson J, Parry M, Le Nail LR, Tsuda Y, Grimer R, Jeys L.
    • 雑誌名

      Int J Clin Oncol.

      巻: Jun;26(6) 号: 6 ページ: 1139-1146

    • DOI

      10.1007/s10147-021-01882-3

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Prognostic factors and impact of surgery in patients with metastatic soft tissue sarcoma at diagnosis: A population-based cohort study2021

    • 著者名/発表者名
      Zhang Liuzhe、Akiyama Toru、Fukushima Takashi、Iwata Shintaro、Tsuda Yusuke、Takeshita Katsushi、Kawai Akira、Tanaka Sakae、Kobayashi Hiroshi
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Clinical Oncology

      巻: - 号: 6 ページ: 918-926

    • DOI

      10.1093/jjco/hyab033

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Limb-salvage reconstruction following resection of pelvic bone sarcomas involving the acetabulum.2021

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara T, Medellin Rincon MR, Sambri A, Tsuda Y, Clark R, Stevenson J, Parry MC, Grimer RJ, Jeys L.
    • 雑誌名

      Bone Joint J

      巻: 103-B(4) 号: 4 ページ: 795-803

    • DOI

      10.1302/0301-620x.103b4.bjj-2020-0665.r1

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Surgical outcomes of bone sarcoma of the foot2021

    • 著者名/発表者名
      Tsuda Y, Fujiwara T, Stevenson JD, Abudu A.
    • 雑誌名

      Jpn J Clin Oncol 2021

      巻: Oct 5;51(10) 号: 10 ページ: 541-1546

    • DOI

      10.1093/jjco/hyab118

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Regional variation in the survival of patients with a soft-tissue sarcoma of the extremity and trunk wall under a centralized care system : what has been the impact of national policies in the UK?2021

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara T, Evans S, Stevenson J, Tsuda Y, Gregory J, Grimer RJ, Abudu S.
    • 雑誌名

      Bone Joint J

      巻: Sep;103-B(9) 号: 9 ページ: 1541-1549

    • DOI

      10.1302/0301-620x.103b9.bjj-2020-2554.r1

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Hemangioma of the Rib Mimicking Chondrosarcoma: A Report of Two Cases and Literature Review.2021

    • 著者名/発表者名
      Tsuda Y, Kobayashi H, Makise N, Zhang L, Shinoda Y, Ushiku T, Tanaka S.
    • 雑誌名

      Case Rep Orthop.

      巻: - ページ: 1-5

    • DOI

      10.1155/2021/9996380

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Extra-articular resection of the hip joint for pelvic sarcomas: Are there any oncological and functional risks compared with intra-articular resection?2021

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara T, Tsuda Y, Stevenson J, Parry M, Jeys L.
    • 雑誌名

      J Bone Oncol

      巻: Nov 1;31 ページ: 100401-100401

    • DOI

      10.1016/j.jbo.2021.100401

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Predictive factors of the 30-day mortality after surgery for spinal metastasis: Analysis of a nationwide database2020

    • 著者名/発表者名
      Sawada Ryoko、Yamana Hayato、Shinoda Yusuke、Tsuda Yusuke、Matsui Hiroki、Fushimi Kiyohide、Kobayashi Hiroshi、Matsubayashi Yoshitaka、Yasunaga Hideo、Tanaka Sakae、Haga Nobuhiko
    • 雑誌名

      Journal of Orthopaedic Science

      巻: - 号: 4 ページ: 666-671

    • DOI

      10.1016/j.jos.2020.07.015

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] シングルセルRNAシークエンスによる軟部明細胞肉腫の腫瘍内免疫環境の解析2022

    • 著者名/発表者名
      津田祐輔
    • 学会等名
      第55回日本整形外科学会骨軟部腫瘍学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] シングルセルRNAシークエンスによる軟部明細胞肉腫の腫瘍内免疫環境の解析2021

    • 著者名/発表者名
      津田祐輔、岡田寛之、平井利英、宮原潤也、張劉哲、小俣康徳、田中栄、小林寛
    • 学会等名
      第55回日本整形外科学会骨軟部腫瘍学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [備考] 東京大学医学部附属病院 整形外科・脊椎外科

    • URL

      http://www.u-tokyo-ortho.jp/

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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