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放射線誘発DNA二本鎖切断に応答する53BP1の超高解像度3次元動態解析

研究課題

研究課題/領域番号 21K17888
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分63020:放射線影響関連
研究機関慶應義塾大学 (2023)
群馬大学 (2021-2022)

研究代表者

内原 脩貴  慶應義塾大学, 薬学部(芝共立), 助教 (10883712)

研究期間 (年度) 2021-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2023年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードDNA修復 / 53BP1 / 超高解像度解析 / DNA二本鎖切断 / クロマチン動態 / DNA損傷修復
研究開始時の研究の概要

放射線照射により生じるDNA二本鎖切断(DSB)は、細胞運命決定に影響を与えうる重篤な損傷である。これまでにDSB近傍に集積する修復分子である53BP1は、ヌクレオソームが約100 nmの大きさで凝集するクロマチンドメインに密集していることを見出しているが、この密集 (53BP1ナノドメイン) がDSB修復に果たす役割は不明である。本研究では、53BP1ナノドメインを超高解像イメージにより3次元動態的に解析することで、その生理的意義の解明に挑戦する。本研究の達成は、放射線障害の重要な課題の一つであるゲノム安定化維持機構に関わる情報基盤の確立に大きく貢献すると考えている。

研究成果の概要

放射線照射により生じたDNA二本鎖切断部位 (DSB) において53BP1 fociが形成されるが、超解像度蛍光顕微鏡により、このfociはナノドメインから形成されることが知られている。本研究では、超解像度蛍光顕微鏡3D-SIM (OMX) を用いて53BP1ナノドメイン間の距離 (DMS) を3次元的に測定する実験系を構築した。本実験系を用いてDMSの放射線照射後の経時的な変化を解析し、DSB損傷後の時間に関わらず、53BP1ナノドメイン間の距離は維持されることを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

DNA二本鎖切断部位 (DSB) に集積する53BP1は、DSBを中心として左右に約1~2 Mb分布するが、その意義は明らかとなっていない。本研究において構築された実験系および成果は、未だ多くが未知である53BP1の機能解明やゲノム安定性維持機構に関わる知見に貢献すると考えている。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2024 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 7件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (11件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Inhibition of intracellular ATP synthesis impairs the recruitment of homologous recombination factors after ionizing radiation2024

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Ryota、Okumura Hikaru、Isono Mayu、Yamauchi Motohiro、Unami Daiki、Lusi Rahmartani Tania、Yamamoto Masamichi、Kato Yu、Uchihara Yuki、Shibata Atsushi
    • 雑誌名

      Journal of Radiation Research

      巻: - 号: 3 ページ: 263-271

    • DOI

      10.1093/jrr/rrae005

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of the signal transduction cascade for inflammatory gene expression in fibroblasts with ATM-ATR deficiencies after Ionizing radiation2024

    • 著者名/発表者名
      Haruna Shunji、Okuda Ken、Shibata Akiko、Isono Mayu、Tateno Kohei、Sato Hiro、Oike Takahiro、Uchihara Yuki、Kato Yu、Shibata Atsushi
    • 雑誌名

      Radiotherapy and Oncology

      巻: 194 ページ: 110198-110198

    • DOI

      10.1016/j.radonc.2024.110198

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Calreticulin Upregulation in Cervical Cancer Tissues From Patients After 10 Gy Radiation Therapy2023

    • 著者名/発表者名
      Okada Kohei、Sato Hiro、Kumazawa Takuya、Mori Yasumasa、Permata Tiara Bunga Mayang、Uchihara Yuki、Noda Shin-ei、Suzuki Keiji、Ikota Hayato、Yokoo Hideaki、Gondhowiardjo Soehartati、Nakano Takashi、Ohno Tatsuya、Shibata Atsushi
    • 雑誌名

      Advances in Radiation Oncology

      巻: 8 号: 3 ページ: 101159-101159

    • DOI

      10.1016/j.adro.2022.101159

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] DNA damage promotes HLA class I presentation by stimulating a pioneer round of translation-associated antigen production2022

    • 著者名/発表者名
      Uchihara Yuki、Permata Tiara Bunga Mayang、Sato Hiro、Kawabata-Iwakawa Reika、Katada Sayako、Gu Wenchao、Kakoti Sangeeta、Yamauchi Motohiro、Kato Reona、Gondhowiardjo Soehartati、Hosen Naoki、Yasuhara Takaaki、Shibata Atsushi
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 82 号: 14 ページ: 2557-2570.e7

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2022.04.030

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] 放射線照射により惹起されるHLAクラスⅠ提示の分子機構2022

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴、柴田 淳史
    • 雑誌名

      放射線生物研究

      巻: 57 ページ: 265-284

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RAP80 suppresses the vulnerability of R-loops during DNA double-strand break repair2022

    • 著者名/発表者名
      Yasuhara Takaaki、Kato Reona、Yamauchi Motohiro、Uchihara Yuki、Zou Lee、Miyagawa Kiyoshi、Shibata Atsushi
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 38 号: 5 ページ: 110335-110335

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110335

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] High linear energy transfer carbon-ion irradiation upregulates PD-L1 expression more significantly than X-rays in human osteosarcoma U2OS cells2021

    • 著者名/発表者名
      Permata Tiara Bunga Mayang、Sato Hiro、Gu Wenchao、Kakoti Sangeeta、Uchihara Yuki、Yoshimatsu Yukihiko、Sato Itaru、Kato Reona、Yamauchi Motohiro、Suzuki Keiji、Oike Takahiro、Tsushima Yoshito、Gondhowiardjo Soehartati、Ohno Tatsuya、Yasuhara Takaaki、Shibata Atsushi
    • 雑誌名

      Journal of Radiation Research

      巻: 62 号: 5 ページ: 773-781

    • DOI

      10.1093/jrr/rrab050

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Modulation of immune responses by DNA damage signaling2021

    • 著者名/発表者名
      Uchihara Yuki、Permata Tiara Bunga Mayang、Sato Hiro、Shibata Atsushi
    • 雑誌名

      DNA Repair

      巻: 104 ページ: 103135-103135

    • DOI

      10.1016/j.dnarep.2021.103135

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Expression of non-homologous end joining factor, Ku80, is negatively correlated with PD-L1 expression in cancer cells after X-ray irradiation2021

    • 著者名/発表者名
      Kumazawa Takuya、Mori Yasumasa、Sato Hiro、Permata Tiara、Uchihara Yuki、Noda Shin-Ei、Okada Kohei、Kakoti Sangeeta、Suzuki Keiji、Ikota Hayato、Yokoo Hideaki、Gondhowiardjo Soehartati、Nakano Takashi、Ohno Tatsuya、Shibata Atsushi
    • 雑誌名

      Oncology Letters

      巻: 23 号: 1 ページ: 29-29

    • DOI

      10.3892/ol.2021.13147

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 53BP1およびRAP80による放射線誘発DNA二本鎖切断部位の高次クロマチン構造制御2023

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴、宇波 大輝、林 僚汰、奥村 光遥、堅田 明子、磯野 真由、宮成 悠介、安原 崇哲、山内 基弘、加藤 優、柴田 淳史
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第66回大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 53BP1およびRAP80を介したDNA二本鎖切断部位の高次クロマチン構造制御2023

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴、柴田 淳史
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] DNA損傷応答シグナル伝達を介したHLAクラスIの抗原提示2023

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴, Permata Tiara Bunga Mayang, 佐藤 浩央, 川端 麗香, 堅田 明子, Gu Wenchao, Kakoti Sangeeta, 山内 基弘, 加藤 玲於奈, Gondhowiardjo Soehartati, 保仙 直毅, 安原 崇哲, 柴田 淳史
    • 学会等名
      第143回 日本薬学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA damage promotes HLA class I presentation by stimulating a pioneer round of translation-associated antigen production2023

    • 著者名/発表者名
      Yuki Uchihara, Tiara Bunga Mayang Permata, Hiro Sato, Reika Kawabata-Iwakawa, Sayako Katada, Wenchao Gu, Sangeeta Kakoti, Motohiro Yamauchi, Reona Kato, Soehartati Gondhowiardjo, Naoki Hosen, Takaaki Yasuhara, Atsushi Shibata
    • 学会等名
      The International Ataxia-Telangiectasia Workshop 2023
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] DNA損傷シグナルによるHLAクラスIの抗原提示の分子メカニズム2022

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴, Permata Tiara Bunga Mayang, 佐藤 浩央, 川端 麗香, 堅田 明子, Gu Wenchao, Kakoti Sangeeta, 山内 基弘, 加藤 玲於奈, Gondhowiardjo Soehartati, 保仙 直毅, 安原 崇哲, 柴田 淳史
    • 学会等名
      2022年度 日本生化学会関東支部例会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 放射線照射により促進されるパイオニアラウンド翻訳を介したHLAクラスIの提示2022

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴, Permata Tiara Bunga Mayang, 佐藤 浩央, 川端 麗香, 堅田 明子, Gu Wenchao, Kakoti Sangeeta, 山内 基弘, 加藤 玲於奈, Gondhowiardjo Soehartati, 保仙 直毅, 安原 崇哲, 柴田 淳史
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第65回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA損傷が惹起するATR-AKT-mTORC1-S6Kシグナル伝達経路を介したHLAクラスIの提示2022

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴, 柴田 淳史
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA損傷シグナルに伴い活性化されるHLAクラスI提示の分子機構2022

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴, 柴田 淳史
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA損傷が惹起するHLAクラスIの抗原提示の分子機構2022

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴, Permata Tiara, Bunga Mayang, 佐藤 浩央, 川端 麗香, 堅田 明子, Gu Wenchao, Kakoti Sangeeta, 山内 基弘, 加藤 玲於奈, Gondhowiardjo Soehartati, 保仙 直毅, 安原 崇哲, 柴田 淳史
    • 学会等名
      日本薬学会第142年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 放射線照射により促進されるHLAクラスIの抗原提示の分子機構2021

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴, Permata Tiara, Bunga Mayang, 佐藤 浩央, 川端 麗香, 堅田 明子, Gu Wenchao, Kakoti Sangeeta, 山内 基弘, 加藤 玲於奈, Gondhowiardjo Soehartati, 保仙 直毅, 安原 崇哲, 柴田 淳史
    • 学会等名
      日本放射線影響学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA損傷が惹起するナンセンス変異依存mRNA分解機構を介した抗原産生およびHLAクラスIの提示2021

    • 著者名/発表者名
      内原 脩貴, Permata Tiara, Bunga Mayang, 佐藤 浩央, 川端 麗香, 堅田 明子, Gu Wenchao, Kakoti Sangeeta, 山内 基弘, 加藤 玲於奈, Gondhowiardjo Soehartati, 保仙 直毅, 安原 崇哲, 柴田 淳史
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書

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公開日: 2021-04-28   更新日: 2025-01-30  

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