• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

低分子が誘起する新奇RNA立体構造の実証

研究課題

研究課題/領域番号 21K19050
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分37:生体分子化学およびその関連分野
研究機関九州大学 (2022-2024)
大阪大学 (2021)

研究代表者

村田 亜沙子  九州大学, 総合理工学研究院, 准教授 (50557121)

研究期間 (年度) 2021-07-09 – 2025-03-31
研究課題ステータス 完了 (2024年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2023年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2022年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2021年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードRNA / 立体構造解析 / 低分子化合物
研究開始時の研究の概要

本研究は、低分子NA(Naphthyridine Azaquinolone)で誘起される新奇RNA立体構造の実証を目的とする。本研究の目的達成のために、NAと標的RNAとの結合評価、および、種々の構造解析手法を用いたNA-標的RNA複合体の立体構造解析を行う。さらに、NAで誘起される新奇RNA立体構造の、RNA編集反応における反応活性制御への応用を検討する。

研究成果の概要

本研究は、低分子NA(Naphthyridine Azaquinolone)で誘起される新奇RNA立体構造の実証を目的とした。先行研究により、低分子NAが特徴的なRNAモチーフに結合することが示唆された。表面プラズモン共鳴測定、熱融解温度測定、質量分析等により、NAと標的RNAモチーフとの相互作用を解析し、3塩基×3塩基の内部ループ構造が結合に必須であることを示した。また、NMR解析を通じて、NA-RNA複合体の立体構造を明らかにした。NA結合により誘起されるRNA立体構造は、これまでに報告例のない新規の立体構造であり、NAのRNA標的低分子としての可能性を提案するものである。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、低分子NA(Naphthyridine Azaquinolone)によって誘起される新奇RNA立体構造を実証した。NAと標的RNAとの結合様式を各種手法により詳細に解析し、さらにNMR解析によりNA-RNA複合体の立体構造を明らかにした。本研究の成果は、低分子NAのRNA標的分子としての新たな応用可能性を示すとともに、RNA標的低分子創薬におけるケミカルスペースの拡大に貢献するものである。

報告書

(5件)
  • 2024 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2024 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 12件)

  • [雑誌論文] A new small molecule DoNA binding to CAG repeat RNA2024

    • 著者名/発表者名
      Chen Qingwen、Yamada Takeshi、Miyagawa Koichi、Murata Asako、Shoji Mitsuo、Nakatani Kazuhiko
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      巻: 98 ページ: 117580-117580

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2023.117580

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Interaction between a small molecule, NA, and an RNA with the ACG/AUA internal loop2023

    • 著者名/発表者名
      Aina Fujiwara, Qingwen Chen, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani, Gota Kawai
    • 学会等名
      The 50th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2023)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Evaluation of APOBEC-catalyzed cytosine deamination for the repeat DNAs with binding small molecules binding2023

    • 著者名/発表者名
      Luyan Zhang, Tomonori Shibata, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      The 50th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2023)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Computer-aided classification of small molecules targeting CAG-repeat DNA2022

    • 著者名/発表者名
      Lu Ni, Takeshi Yamada, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      XXIV International Round Table (IRT2022)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] An RNA internal loop of C, U and A/CC motifs specific fluorescence probe ANP772022

    • 著者名/発表者名
      Anisa Ulhusna, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      XXIV International Round Table (IRT2022)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A Fluorescence Probe ANP77 for Sensing RNA Internal Loops and Their Binding Molecules2022

    • 著者名/発表者名
      Bimolendu Das, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      The 49th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2022)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Inhibition of the Activity of Base Excision Repair Enzymes by Mismatch Binding Ligand Binding to Uracil-containing DNA2022

    • 著者名/発表者名
      Anisa Ulhusna, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      The 49th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2022)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Evaluation of APOBEC-catalyzed cytosine deamination for the repeat DNAs2022

    • 著者名/発表者名
      Luyan Zhang, Tomonori Shibata, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      The 49th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2022)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Evaluation of the effect of small-molecule binding to mRNA on ribosomal frameshifting in SARS-CoV-22022

    • 著者名/発表者名
      Asako Murata, Hiyori Fujii, Risa Anami, Ayako Sugai,, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      The 49th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2022)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Machine learning assisted classification of small molecules targeting CAG repeat DNA2022

    • 著者名/発表者名
      Qingwen Chen, Takeshi Yamada, Asako Murata, Yasuyuki Matsushita, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      The 49th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2022)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Computer-aided classification of small molecules targeting CAG-repeat DNA2021

    • 著者名/発表者名
      Qingwen Chen, Asako Murata, Takeshi Yamada, Ayako Sugai, Yasuyuki Matsushita, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2021)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] An RNA internal loop of C, U and A/CC motifs specific fluorescence probe ANP772021

    • 著者名/発表者名
      Bimolendu Das, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2021)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Using machine learning to classify and extract features of small-molecule libraries targeting DNA and RNA2021

    • 著者名/発表者名
      Qingwen Chen, Yasuyuki Matsushita, Asako Murata, Takeshi Yamada, Ayako Sugai, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pcific Basin Societies 2021 (Pacifichem 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会

URL: 

公開日: 2021-07-13   更新日: 2026-01-16  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi