研究課題/領域番号 |
21K19203
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研究種目 |
挑戦的研究(萌芽)
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配分区分 | 基金 |
審査区分 |
中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
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研究機関 | 公益財団法人がん研究会 (2022-2023) 東北大学 (2021) |
研究代表者 |
大学 保一 公益財団法人がん研究会, がん研究所 がんゲノム動態プロジェクト, プロジェクトリーダー (80619875)
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研究期間 (年度) |
2021-07-09 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
完了 (2023年度)
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配分額 *注記 |
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2022年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2021年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
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キーワード | DNA複製 / DNAポリメラーゼ / 転写 / 複製開始点 / 染色体編成 |
研究開始時の研究の概要 |
DNA複製の際も遺伝子発現は常に起きているため,ゲノムDNAの複製を円滑に行う上で,RNA転写との調和は重要である.特に,RNAポリメラーゼはDNA複製装置と干渉し合う関係にあり,その影響は染色体異常の原因になることが報告されている.本研究では,特定のDNAポリメラーゼ合成を全ゲノムに渡ってプロファイリングする実験系:Polymerase usage sequencing (Pu-seq)を用い,転写によるゲノム複製への影響を検証する.さらに,その知見をもとに,人工的な転写制御を介して,外部から導入したDNAの複製をコントロールすることを目指す.
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研究実績の概要 |
本年度は、遺伝子転写による複製への影響をより高精度に解析をおこなうため、期間を延長して研究を実施した。2022年度の研究から、遺伝子領域内で転写機構がDNAポリメラーゼの機能に影響を及ぼすことが示されたが、本年度は、ヒトゲノム上で特に、この影響が大きい領域の探索を行った。その結果、ゲノム上に数ある染色体脆弱部位(Common Fragile site)のうち、最も不安定な領域であるFRA3BやFRA16Dにおいて、リーディング鎖合成を担うPolεの機能が低下することが示された。 FRA3BやFRA16D領域には長い遺伝子(それぞれFHIT、WWOX)が存在するが、同様に傾向がその他の長い遺伝子の近傍(150kb-1。5Mb)において示された。これらのことから、長い遺伝子の領域内では、転写と複製フォークが干渉する頻度が高く、フォークの進行に付随したリーディング鎖合成へ影響を及ぼしたと考えられる。
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