• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

クライオ電子顕微鏡による細胞内分子構造解析法:微小管形成の場を原子レベルで捉える

研究課題

研究課題/領域番号 21K19352
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分48:生体の構造と機能およびその関連分野
研究機関神戸大学

研究代表者

仁田 亮  神戸大学, 医学研究科, 教授 (40345038)

研究期間 (年度) 2021-07-09 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2022年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2021年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワードクライオ電子顕微鏡 / クライオ電子線トモグラフィー / クライオCLEM / クライオFIB-SEM / 微小管 / 単粒子解析
研究開始時の研究の概要

本研究では、細胞生物学的解析と構造生物学的解析とのギャップを埋めるため、微小管結合タンパク質CAMSAP2が先導する非中心体性微小管ネットワーク形成過程を題材に、クライオ電子線トモグラフィー法による細胞内構造解析スキームを整備する。遺伝子導入、グリッド上での細胞培養、急速凍結、クライオ蛍光顕微鏡による標的分子の位置特定、クライオFIB-SEMによる試料の菲薄化、クライオトモグラフィー撮影、立体構築、画像解釈の各工程を最適化し、ルーチン的に細胞内構造解析を行う環境を整備し、医学・生命科学的課題に応用できる技術を開拓する。

研究成果の概要

本研究課題では、中心体非依存性微小管ネットワークの形成の場を題材に、クライオ電子顕微鏡法による細胞内分子構造解析法の整備を行った。目的タンパク質を蛍光標識したCOS7細胞をグリッド上で培養・急速凍結し、クライオ蛍光顕微鏡で標的分子のグリッド上でのマップを作成、その後、細胞周辺の薄い部分を狙ってクライオ電子線トモグラフィー撮影を行った。得られた画像を3次元再構成し、その解釈は深層学習またはテンプレートマッチングにより自動化に成功した。また、iPS心筋細胞を用いて、核周辺のZ軸方向に5-10μmの厚さのある部分をFIB-SEMにて薄切し、クライオ電子線トモグラフィー法のスキームを一通り確立した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

細胞レベルのクライオ電子線トモグラフィー解析は、細胞内局所で起こる様々な生理的・病理的反応の場を、細胞内の分子構造変化として捉えることができる唯一の手法である。ゆえに本研究により、細胞内で起こっている現象を分子レベルで可視化することが可能となり、細胞生物学・分子病理学などの大きなブレークスルーにつながることが期待される。今後の課題は、本手法のスループットを如何に向上させ、一般的な技術として定着させるかである。

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (12件) (うち国際学会 3件、 招待講演 12件)

  • [雑誌論文] CAMSAP2 organizes a γ-tubulin-independent microtubule nucleation centre through phase separation2022

    • 著者名/発表者名
      Imasaki T et al.,
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 11

    • DOI

      10.7554/elife.77365

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural model of microtubule dynamics inhibition by kinesin-4 from the crystal structure of KLP-12 ?tubulin complex2022

    • 著者名/発表者名
      Taguchi S et al.,
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 11

    • DOI

      10.7554/elife.77877

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Recruitment of Irgb6 to the membrane is a direct trigger for membrane deformation2022

    • 著者名/発表者名
      Yamada Hiroshi、Abe Tadashi、Nagaoka Hikaru、Takashima Eizo、Nitta Ryo、Yamamoto Masahiro、Takei Kohji
    • 雑誌名

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      巻: 12 ページ: 2022-2022

    • DOI

      10.3389/fcimb.2022.992198

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural basis of membrane recognition of <i>Toxoplasma gondii</i> vacuole by Irgb62021

    • 著者名/発表者名
      Saijo-Hamano Yumiko、Sherif Aalaa Alrahman、Pradipta Ariel、Sasai Miwa、Sakai Naoki、Sakihama Yoshiaki、Yamamoto Masahiro、Standley Daron M、Nitta Ryo
    • 雑誌名

      Life Science Alliance

      巻: 5 号: 1 ページ: e202101149-e202101149

    • DOI

      10.26508/lsa.202101149

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Cross-scale analyses of centrosome-independent microtubule network formation.2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nitta
    • 学会等名
      The 4th RIKEN BDR-Kobe University Joint Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡で見る医学・生命科学2023

    • 著者名/発表者名
      仁田 亮
    • 学会等名
      東北大学学際研ライフサイエンスセミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡で見る医学・生命科学2022

    • 著者名/発表者名
      仁田 亮
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会関西支部講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細胞骨格ネットワーク構築の分子機構とその破綻2022

    • 著者名/発表者名
      仁田 亮
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第78回学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クロススケール計測が解明する細胞骨格ネットワーク構築とその破綻2022

    • 著者名/発表者名
      仁田 亮
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡による細胞骨格イメージング2022

    • 著者名/発表者名
      仁田 亮
    • 学会等名
      第8回日本筋学会学術集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] X線・クライオ電顕で観る構造医科学 微小管ネットワーク形成機構と原虫感染における寄生虫・宿主の攻防2022

    • 著者名/発表者名
      仁田 亮
    • 学会等名
      第70回SPring-8先端利用技術ワークショップ
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Cross-scale analyses of centrosome-independent microtubule network formation2022

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nitta
    • 学会等名
      Frontier of Dynamic Structural Biology
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 凍結電子顕微鏡技術とシングルセル解析技術の融合による構造・機能連関2022

    • 著者名/発表者名
      仁田 亮
    • 学会等名
      第45会日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡で見る医学・生命科学2021

    • 著者名/発表者名
      仁田 亮
    • 学会等名
      横浜市立大学大学院医学研究科 大学院医学セミナー
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Challenges of cryo-EM applications for medical and biological science2021

    • 著者名/発表者名
      Ryo Nitta
    • 学会等名
      RIKEN-BDR Online Retreat
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡で見る医学・生命科学2021

    • 著者名/発表者名
      仁田 亮
    • 学会等名
      京都大学大学院理学研究科 大学院セミナー
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演

URL: 

公開日: 2021-07-13   更新日: 2024-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi