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転写反応の「場」の超解像イメージングによる新規エンハンサー作用機序の解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K20627
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分基金
審査区分 0701:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

川崎 洸司  東京大学, 定量生命科学研究所, 特任研究員 (90911925)

研究期間 (年度) 2021-08-30 – 2022-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2021年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードエンハンサー / ライブイメージング / 超解像顕微鏡 / ショウジョウバエ / 胚発生 / 転写制御
研究開始時の研究の概要

エンハンサーと呼ばれるゲノム上の調節領域は、標的遺伝子から数十kbから数百kb離れた遠位から転写を制御することができるという特筆すべき重要な性質を持つ。しかし、遠くに位置するエンハンサーがどのように標的遺伝子に作用し転写の開始を誘導するのか、という最も基本的な分子機構は依然として未解明である。本研究では、近年注目を集めている転写因子の濃縮された核内微小環境に着目し、エンハンサーによる転写活性化機構の解析を行う。独自の転写ライブイメージング系と超解像顕微鏡技術を新たに組み合わせることでエンハンサー活性と転写因子の時空間的な動態の同時計測を実現し、転写活性化の「場」の作用実態の解明を目指す。

研究実績の概要

本研究では、ショウジョウバエ初期胚を用いて、エンハンサー活性と転写因子の時空間的な動態を一細胞レベルの解像度でライブ計測できる実験系の構築を目指した。まず、内在性転写因子とのクロストークを避けつつエンハンサー活性をよりシンプルに評価するために、ウイルス由来の外来転写因子VP16をショウジョウバエ初期胚中に発現させ、MS2レポーター配列近傍にテザリングした。興味深いことにレポーター配列から10 kbも離れたゲノム領域にVP16をテザリングするだけで標的遺伝子から明瞭な転写バーストが引き起こされた。その他にも転写メディエーターのサブユニットをテザリングすることでも同様に標的遺伝子の転写が活性化された。これらの結果は、遠位エンハンサー活性の発揮には転写因子単独のテザリングのみで十分である可能性を示唆しており、エンハンサーの作用動態を考える上で重要な知見となり得ると考えられる。
また、上記で作製したMS2レポーター系と超解像顕微鏡技術を組み合わせることで、VP16タンパク質の核内動態とエンハンサー活性を同時に可視化することに成功した。転写バーストが引き起こされる際にはエンハンサー上において一過的にVP16タンパク質のクラスターが生じており、その濃縮度は転写バーストの強度と強く相関していることが明らかとなった。

報告書

(1件)
  • 2021 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2021 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] University of Granada(スペイン)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [雑誌論文] Dynamic modulation of enhancer responsiveness by core promoter elements in living <i>Drosophila</i> embryos2021

    • 著者名/発表者名
      Yokoshi Moe、Kawasaki Koji、Camb?n Manuel、Fukaya Takashi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 50 号: 1 ページ: 92-107

    • DOI

      10.1093/nar/gkab1177

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Dynamic clustering of transcription factors mediates long-range regulatory communication in Drosophila embryos2021

    • 著者名/発表者名
      Koji Kawasaki, Takashi Fukaya
    • 学会等名
      第59回 日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ハブの形成を介した転写動態制御機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      川崎 洸司, 深谷 雄志
    • 学会等名
      第39回 染色体ワークショップ・第19回 核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] [プレスリリース]コアプロモーターを介した転写バースト制御メカニズムを解明

    • URL

      https://www.iqb.u-tokyo.ac.jp/pressrelease/211213/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2021-10-22   更新日: 2022-12-28  

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