| 研究課題/領域番号 |
21K20638
|
|---|
| 研究種目 |
研究活動スタート支援
|
| 配分区分 | 基金 |
|---|
| 審査区分 |
0701:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
|
|---|
| 研究機関 | 愛媛大学 |
|---|
研究代表者 |
山上 龍太 愛媛大学, 理工学研究科(工学系), 助教 (70767227)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2021-08-30 – 2023-03-31
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2022年度)
|
| 配分額 *注記 |
3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2022年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
|
|---|
| キーワード | RNA / tRNA / tRNA修飾 / tRNA修飾酵素 / 網羅解析 / 変異プロファイリング法 / RNAメチル化酵素 / 次世代シーケンス / 変異プロファイリング / RNAシーケンス / 核酸関連タンパク質 |
|---|
| 研究開始時の研究の概要 |
近年の研究より、RNAの配列や構造因子は、多くの遺伝子の発現を調節することが明らかになっています。RNAは、転写後にプロセシングやRNA修飾などの様々な成熟過程を経て、その機能性を獲得します。その一方で、「RNAの配列と構造がどのようにしてRNA成熟化酵素と相互作用し、どのようにRNA成熟化機構の制御に関わるのか」に関するメカニズムの全貌は、未解明です。本研究では、RNA修飾酵素やプロセシング酵素と基質RNAとの相互作用をハイスループットに解析する技術を開発します。本技術を用いて、RNAの配列や構造を介したRNA成熟化反応の制御機構とそれによる遺伝子発現調節機構を探ります。
|
| 研究成果の概要 |
本課題は、RNAとRNAを修飾する酵素の相互作用をハイスループットに分析する方法を開発し、RNA修飾酵素の機能解析を行うことを研究目標とし、以下の研究成果を報告した。（１）5000種類以上の変異tRNAの中から基質tRNAと非基質tRNAを一挙に区別する手法（tRNA-MaP法）を開発した。（２）tRNA-MaP法を使い、Geobacillus stearothermophilus由来tRNA m1A22メチル化酵素(TrmK)の基質認識機構を明らかにした。（３）tRNA-MaP法とタンパク質オーソロジー解析を行い、G. stearothermophilusのtRNA修飾酵素遺伝子を予測した。
|
| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
本研究は、RNAとRNA修飾酵素の相互作用機構とその機能の理解を深めることを目的としています。本研究によって開発されたtRNA-MaP法は、本目的の達成を加速させるものであり、幅広い分野での応用が期待できます。
This project aims to enhance our understanding of RNA modification enzymes and their functions, and the developed tRNA-MaP technique has potential implications for further studies in this field.
|
