研究課題/領域番号 |
21KK0164
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研究種目 |
国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))
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配分区分 | 基金 |
審査区分 |
中区分57:口腔科学およびその関連分野
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研究機関 | 国立感染症研究所 |
研究代表者 |
中尾 龍馬 国立感染症研究所, 細菌第一部, 主任研究官 (10370959)
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研究分担者 |
Lee Seohyun 東京大学, 定量生命科学研究所, 特任助教 (00847973)
矢原 寛子 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 研究所, 日本学術振興会 特別研究員(RPD) (10757488)
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研究期間 (年度) |
2021-10-07 – 2025-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
18,980千円 (直接経費: 14,600千円、間接経費: 4,380千円)
2024年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円)
2023年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
2022年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2021年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
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キーワード | 細菌由来膜小胞 / 細菌膜小胞 / small RNA / 歯周病 |
研究開始時の研究の概要 |
歯周病の病態形成における OMV-sRNA の意義と分子機構の解明を目指し、OMV-sRNA を標的とした歯周病の診断や治療薬の開発を展望する。
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研究実績の概要 |
Porphyromonas gingivalis (Pg)のRNAseqに関して、Pg 菌体 (WC) と外膜小胞 (OMV)からのRNA抽出方法を確立した。また、Pg WCとOMVに含まれるRNA成分をRNA-seqにより解析し、OMVs中に蓄積されるRNA成分が明らかになった。Pg WC由来RNAを使ってCappable-seqを行い、Pg ゲノム上の2,354ヵ所の転写開始点を同定できた。 Pg WC OMVsをマウスへ静脈内投与した後の、各臓器 (blood, brain, heart, limb, liver, lung, kidney, spleen, pancreas) からDNAを抽出し、リアルタイムPCRで検出を試みたところ、PgのWC投与の場合、48時間後、調べた臓器のいずれからもからもDNAが検出されなかった。一方PgのOMVs投与の場合は、48時間後には、脳で検出されたが、その他の臓器からは検出されなかった。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
RNAseqデータやin vivo実験でのPg OMVの生体内での運命についての新知見が得られているため。 Pg OMVsの体内動態についての理解が進んだため。
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今後の研究の推進方策 |
Pg OMVに蓄積しているRNA種をRT-PCR等で定量し、詳しく検証し、新奇non-coding RNAの全塩基長や発現時期をノーザンブロットで解析する。Pgゲノム網羅的な転写開始点データをもとに、Pgゲノムにおけるコンセンサスプロモーター配列を決定する。Pg OMVsの生体内運命に関し、in vivoイメージング装置を活用し、より詳細な解析を行う。
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