ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援

• 研究領域: ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援
• 研究課題/領域番号: 221S0002
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 小原 雄治 国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 特任教授 (70135292)
• 研究分担者: 加藤 和人 大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (10202011) ; 豊田 敦 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 特任准教授 (10267495) ; 黒木 陽子 東北大学, 東北メディカルメガバンク機構, 非常勤講師 (10344037) ; 菅野 純夫 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (60162848) ; 鈴木 穣 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (40323646) ; 林 哲也 九州大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (10173014) ; 山本 健 久留米大学, 医学部, 教授 (60274528) ; 辻 省次 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (70150612) ; 井ノ上 逸朗 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 教授 (00192500) ; 黒川 顕 東京工業大学, 地球生命研究所, 教授 (20343246) ; 森下 真一 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (90292854) ; 中村 保一 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授 (60370920) ; 田畑 哲之 公益財団法人かずさDNA研究所, その他部局, 所長 (70197549) ; 久原 哲 九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (00153320) ; 岩崎 渉 東京大学, 大学院理学系研究科, 准教授 (50545019) ; 瀬々 潤 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 創薬基盤研究部門, 主任研究員 (40361539) ; 高橋 弘喜 千葉大学, 真菌医学研究センター, 准教授 (60548460) ; 浅井 潔 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (30356357) ; 笠原 雅弘 東京大学, 新領域創成科学研究科, 講師 (60376605) ; 榊原 康文 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (10287427) ; 矢田 哲士 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (10322728) ; 桑野 良三 新潟大学, 脳研究所, フェロー (20111734) ; 徳永 勝士 東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (40163977) ; 小笠原 直毅 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (10110553)
• 連携研究者: 山縣 然太朗 山梨大学, 大学院医学工学総合研究部, 教授 (10210337) ; 武藤 香織 東京大学, 医科学研究所, 教授 (50345766) ; 位田 隆一 同志社大学, 大学院グローバルスタディーズ研究科, 特別客員教授 (40127543) ; 増井 徹 慶應義塾大学, 医学部臨床遺伝学センター, 教授 (50150082) ; 栗山 真理子 独立行政法人国立成育医療研究センター, 共同研究員 ; 高木 利久 東京大学, 大学院理学系研究科, 教授 (30110836) ; 藤山 秋佐夫 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授 (60142311) ; 服部 正平 早稲田大学, 理工学術院, 教授 (70175537) ; 小椋 義俊 九州大学, 大学院医学研究院, 准教授 (40363585) ; 徳永 勝士 東京大学, 大学院医学系研究科, 教授 (40163977) ; 桑野 良三 新潟大学, 脳研究所, フェロー (20111734) ; 大橋 順 東京大学, 大学院理学系研究科, 准教授 (80301141) ; 伊藤 武彦 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 教授 (90501106) ; 平川 英樹 かずさDNA研究所, 研究員 (80372746) ; 野口 英樹 国立遺伝学研究所, 先端ゲノミクス推進センター, 特任准教授 (50333349) ; 松岡 聡 東京工業大学, 学術国際情報センター, 教授 (20221583) ; 小笠原 直毅 奈良先端科学技術大学院大学, 学長 (10110553) ; 中村 建介 前橋工科大学, 生命情報学科, 教授 (20212095) ; 浜田 道昭 早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (00596538) ; 金谷 重彦 奈良先端科学技術大学院大学, 教授 (90224584)
• 研究協力者: 安西 祐一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 ; 岡田 清孝 自然科学研究機構, 理事 ; 榊 佳之 静岡雙葉学園, 理事長 ; 高久 史麿 日本医学会, 会長 ; 豊島 久真男 理化学研究所, 研究顧問 ; 中村 桂子 JT生命誌研究館, 館長 ; 堀田 凱樹 (財)井上科学振興財団, 理事長 ; 米澤 明憲 千葉工業大学, 人工知能・ソフトウェア技術研究センター, 所長 ; 吉川 寛 大阪大学, 名誉教授 ; 吉田 光昭 (財)がん研究会, 理事 ; 猪子 英俊 東海大学, 医学部, 教授 ; 戸田 達史 神戸大学, 大学院医学研究科, 教授 ; 稲澤 譲治 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 ; 五條掘 孝 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授 ; 漆原 秀子 筑波大学, 教授・名誉教授 ; 武田 洋幸 東京大学, 大学院理学研究科, 教授 ; 城石 俊彦 国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 教授 ; 伊藤 隆司 九州大学, 大学院医学研究院, 教授 ; 佐藤 矩行 沖縄科学技術大学院大学, 教授 ; 松田 秀雄 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授 ; 五斗 進 京都大学, 化学研究所, 准教授 ; 津田 雅孝 東北大学, 大学院生命科学研究科, 教授
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• キーワード: 次世代DNAシーケンサー / RNA-seq / ChIP-seq / de novo配列決定 / 個人ゲノム / リシーケンシング / GWAS / インフォームドコンセント / 次世代DNAシーケンサ

研究成果の概要

国際的にも解析技術が予想以上の速度で進展した中、拠点集約により情報解析を含めた最先端の技術支援を進めることができた。毎年60-90件、総数465件の公募選定課題を支援し、シーラカンスゲノム解読など363報の論文成果が得られた。支援課題は科研費のすべての種目、生物系のほぼすべての分科に及び、この活動が生命科学の基盤として必須であることを示した。また、困難なゲノム解読の切り札ともなったゲノムアッセンブルソフトウェアPlatanusの独自開発に成功したことなど、支援と解析技術の高度化の好循環が進んだ。

研究成果

• [雑誌論文] The Gonium pectorale genome demonstrates cooption of cell cycle regulation during the evolution of multicellularity (2016)
  • 著者名/発表者名: Erik R. Hanschen, Tara N. Marriage, Patrick J. Ferris, Takashi Hamaji, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Rafik Neme, Hideki Noguchi, Yohei Minakuchi, Masahiro Suzuki, Hiroko Kawai-Toyooka, David R. Smith, Halle Sparks, Jaden Anderson, Robert Bakaric, Victor Luria, Amir Karger, Marc Kirschner, et al.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 7 ページ: 11370-11370
  • DOI: 10.1038/ncomms11370
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Oncofetal protein IGF2BP3 facilitates the activity of proto-oncogene protein eIF4E through the destabilization of EIF4E-BP2 mRNA. (2016)
  • 著者名/発表者名: Mizutani R., Imamachi N., Suzuki Y., Yoshida H., Tochigi N., Oonishi T., Suzuki Y., Akimitsu N.
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 2015 Nov 2
  • DOI: 10.1038/onc.2015.410
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ezh2 regulates the Lin28/let-7 pathway to restrict activation of fetal gene signature in adult hematopoietic stem cells. (2016)
  • 著者名/発表者名: Oshima M, Hasegawa N, Mochizuki-Kashio M, Muto T, Miyagi S, Koide S, Yabata S, Wendt G, Saraya A, Wang C, Shimoda K, Suzuki Y, Iwama A.
  • 雑誌名: Exp Hematol. 巻: 44(4) ページ: 282-296
  • DOI: 10.1016/j.exphem.2015.12.009
  • 査読あり
• [雑誌論文] From the laboratory to the field: assaying histone methylation at FLOWERING LOCUS C in naturally growing Arabidopsis halleri. (2016)
  • 著者名/発表者名: Nishio H, Buzas DM, Nagano AJ, Suzuki Y, Sugano S, Ito M, Morinaga S, Kudoh H.
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 2016 May 2 号: 1 ページ: 15-26
  • DOI: 10.1266/ggs.15-00071
  • NAID: 130005165463
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Histone H3K36 trimethylation is essential for multiple silencing mechanism in fission yeast. (2016)
  • 著者名/発表者名: Shota Suzuki, Hiroaki Kato, Yutaka Suzuki, Yuji Chikashige, Yasushi Hiraoka, Hiroshi Kimura, Koji Nagao, Chikashi Obuse, Shinya Takahata and Yota Murakami
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 44 (9) ページ: 4147-4162
  • DOI: 10.1093/nar/gkw008
  • NAID: 120005819302
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] COSMOS: accurate detection of somatic structural variations through asymmetric comparison between tumor and normal samples. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yamagata, Koichi; Yamanishi, Ayako; Kokubu, Chikara; Takeda, Junji; Sese, Jun
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 44 (8)
  • DOI: 10.1093/nar/gkw026
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Next-generation sequencing of 28 ALS-related genes in a Japanese ALS cohort (2016)
  • 著者名/発表者名: Ryoichi Nakamura, Jun Sone, Naoki Atsuta, Genki Tohnai, Hazuki Watanabe, Daichi Yokoi, Masahiro Nakatochi, Hirohisa Watanabe, Mizuki Ito, Jo Senda, Masahisa Katsuno, Fumiaki Tanaka, Yuanzhe Li, Yuishin Izumi, Mitsuya Morita, Akira Taniguchi, Osamu Kano, Masaya Oda, Satoshi Kuwabara, Koji Abe.
  • 雑誌名: Neurobiol Aging. 巻: 39 ページ: 219-219
  • DOI: 10.1016/j.neurobiolaging.2015.11.030
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The complete genome sequencing of Prevotella intermedia strain OMA14 and a subsequent finescale, intra-species genomic comparison reveal an unusual amplification of conjugative and mobile transposons and identify a novel Prevotella-lineage-specific repeat. (2016)
  • 著者名/発表者名: Mariko Naito, Yoshitoshi Ogura, Takehiko Itoh, Mikio Shoji, Masaaki Okamoto, Tetsuya Hayashi, and Koji Nakayama
  • 雑誌名: DNA Res 巻: 23 ページ: 11-16
  • DOI: 10.1093/dnares/dsv032
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] HTLV-1 bZIP Factor Impairs Anti-viral Immunity by Inducing Co-inhibitory Molecule, T cell Immunoglobulin and ITIM Domain (TIGIT). (2016)
  • 著者名/発表者名: Yasuma K, Yasunaga JI, Takemoto K, Sugata K, Takenouchi N, Nakagawa M, Suzuki Y, and Matsuoka M.
  • 雑誌名: PLoS Pathog 巻: 12
  • DOI: 10.1371/journal.ppat.1005372
  • NAID: 120005763385
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study of clinically defined gout identifies multiple risk loci and its association with clinical subtypes. (2016)
  • 著者名/発表者名: Matsuo H, et al.
  • 雑誌名: Annals of the Rheumatic Diseases 巻: 印刷中 ページ: 625-659
  • DOI: 10.1136/annrheumdis-2014-206191
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The genomic basis of parasitism in the Strongyloides clade of nematodes (2016)
  • 著者名/発表者名: Hunt, V. L. Tsai, I. J. Coghlan, A. Reid, A. J. Holroyd, N. Foth, B. J. Tracey, A. Cotton, J. A. Stanley, E. J. Beasley, H. Bennett, H. M. Brooks, K. Harsha, B. Kajitani, R. Kulkarni, A. Harbecke, D. Nagayasu, E et.al
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 48 ページ: 299-307
  • DOI: 10.1038/ng.3495
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ethics of stem cell research - learning from human genome ELSI research (2016)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato.
  • 雑誌名: Proceedings of Uehara Carnegie Oxford Conference 巻: - ページ: 117-124
• [雑誌論文] MOCCS: clarifying DNA-binding motif ambiguity using ChIP-Seq data (2016)
  • 著者名/発表者名: Ozaki H, Iwasaki W
  • 雑誌名: Comput. Biol. Chem. 巻: in press
  • DOI: 10.1016/j.compbiolchem.2016.01.014
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic and metagenomic analysis of microbes in a soil environment affected by the 2011 Great East Japan Earthquake Tsunami (2016)
  • 著者名/発表者名: Hiraoka S, Machiyama A, Ijichi M, Inoue K, Oshima K, Hattori M, Yoshizawa S, Kogure K, and Iwasaki W
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 17 ページ: 53-53
  • DOI: 10.1186/s12864-016-2380-4
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Bioinformatics tools for lncRNA research. (2016)
  • 著者名/発表者名: Junichi Iwakiri, Michiaki Hamada, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms 巻: 1859(1) ページ: 23-30
  • DOI: 10.1016/j.bbagrm.2015.07.014
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Draft genome sequence of the pathogenic filamentous fungus Aspergillus lentulus IFM 54703T. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kusuya Y, Sakai K, Takahashi H, Yaguchi T
  • 雑誌名: Genome Announc 巻: 4
  • DOI: 10.1128/genomea.01568-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Analysis of RNA decay factor mediated RNA stability contributions on RNA abundance (2015)
  • 著者名/発表者名: Sho Maekawa, Naoto Imamachi, Takuma Irie, Hidenori Tani, Kyoko Matsumoto, Rena Mizutani, Katsutoshi Imamura, Miho Kakeda, Tetsushi Yada, Sumio Sugano, Yutaka Suzuki and Nobuyoshi Akimitsu.
  • 雑誌名: BMC genomics 巻: 16 ページ: 1-1
  • DOI: 10.1186/s12864-015-1358-y
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A novel mutation in ELOVL4 leading to spinocerebellar ataxia (SCA) with the hot cross bun sign but lacking erythrokeratodermia: a broadened spectrum of SCA34. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ozaki K, Doi H, Mitsui J, Sato N, Iikuni Y, Majima T, Yamane K, Irioka T, Ishiura H, Doi K, Morishita S, Higashi M, Sekiguchi T, Koyama K, Ueda N, Miura Y, Miyatake S, Matsumoto N, Yokota T, Tanaka F, Tsuji S, Mizusawa H, Ishikawa K.
  • 雑誌名: JAMA Neurol. 巻: 72 ページ: 797-805
  • DOI: 10.1001/jamaneurol.2015.0610
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The tRNA splicing endonuclease complex cleaves the mitochondria-localized CBP1 mRNA. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsuboi, T., Yamazaki, R., Nobuta, R., Ikecuhi, K., Makino, S., Ohtaki, Y., Suzuki, Y., Yoshihisa, T., Trotta, C., and Inada, T.
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 290 ページ: 16021-16030
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.634592
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] IKZF1, a new susceptibility gene for cold medicine-related Stevens-Johnson syndrome/toxic epidermal necrolysis with severe mucosal involvements. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ueta M, Sawai H, Sotozono C, Hitomi Y, Kaniwa N, Kim MK, Seo KY, Yoon KC, Joo CK, Kannabiran C, Wakamatsu TH, Sangwan V, Rathi V, Basu S, Ozeki T, Mushiroda T, Sugiyama E, Maekawa K, Nakamura R, Aihara M, Matsunaga K, Sekine A, Gomes JÁP, Hamuro J, Saito Y, Kubo M, Kinoshita S, Tokunaga K.
  • 雑誌名: J Allergy Clin Immunol 巻: 未定 ページ: 03744-0
  • DOI: 10.1016/j.jaci.2014.12.1916
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Domestication and cereal feeding developed domestic pig-type intestinal microbiota in animals of suidae. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ushida K, Tsuchida S, Ogura Y, Toyoda A, Maruyama F.
  • 雑誌名: Anim Sci J. 巻: Aug 27 ページ: 12492-12492
  • DOI: 10.1111/asj.12492
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Draft Genome Sequence of Lactobacillus gorillae Strain KZ01T, Isolated from a Western Lowland Gorilla. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsuchida S, Nezuo M, Tsukahara M, Ogura Y, Hayashi T, Ushida K.
  • 雑誌名: Genome Announc. 巻: 3 ページ: 1-1
  • DOI: 10.1128/genomea.01196-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Comparative genome and transcriptome analyses of the social amoeba Acytostelium subglobosum that accomplishes multicellular development without germ-soma differentiation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Urushihara H, Kuwayama H, Fukuhara K, Itoh T, Kagoshima H, Shin-I T, Toyoda A, Ohishi K, Taniguchi T, Noguchi H, Kuroki Y, Hata T, Uchi K, Mohri K, King JS, Insall RH, Kohara Y, Fujiyama A.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 16 ページ: 80-80
  • DOI: 10.1186/s12864-015-1278-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Dynamic transition of transcription and chromatin landscape during fission yeast adaptation to glucose starvation (2015)
  • 著者名/発表者名: Oda A, Takemata N, Hirata Y, Miyoshi T, Suzuki Y, Sugano S, and Ohta K
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 5 ページ: 392-407
  • DOI: 10.1111/gtc.12229
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genome analysis of a novel Bradyrhizobium sp. DOA9 carrying a symbiotic plasmid. (2015)
  • 著者名/発表者名: Okazaki S, Noisangiam R, Okubo T, Kaneko T, Oshima K, Hattori M, Teamtisong K, Songwattana P, Tittabutr P, Boonkerd N, Saeki K, Sato S, Uchiumi T, Minamisawa K, *Teaumroong N.
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 10(2) ページ: 1-18
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0117392
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Spatial interplay between Polycomb and Trithorax complexes controls transcriptional activity in T lymphocytes. (2015)
  • 著者名/発表者名: Onodera, A., Tumes, D. J., Watanabe, Y., Hirahara, K., Kaneda, A., Sugiyama, F., Suzuki, Y., and Nakayama, T.
  • 雑誌名: Mol Cell Biol 巻: 35 ページ: 3841-3853
  • DOI: 10.1128/mcb.00677-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Tepidicaulis marinus gen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium reducing nitrate to nitrous oxide strictly under microaerobic conditions. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mio Takeuchi, Takao Yamagishi, Yoichi Kamagata, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Taiki Katayama, Satoshi Hanada, Hideyuki Tamaki, Katsumi Marumo, Hiroto Maeda, Munetomo Nedachi, Wataru Iwasaki, Yuichi Suwa, and Susumu Sakata.
  • 雑誌名: Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 巻: in press ページ: 1749-1754
  • DOI: 10.1099/ijs.0.000167
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] RNA-seq transcriptional profiling of an arbuscular mycorrhiza provides insights into regulated and coordinated gene expression in Lotus japonicus and Rhizophagus irregularis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Handa, Y., Nishide, H., Takeda, N., Suzuki, Y., Kawaguchi, M., Saito, K.
  • 雑誌名: Plant and Cell Physiology 巻: 56 ページ: 1490-1511
  • NAID: 120006650838
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mapping the genetic diversity of HLA haplotypes in the Japanese populations. (2015)
  • 著者名/発表者名: W. Y. Saw, X. Liu, C. C. Khor, F. Takeuchi, T. Katsuya, R. Kimura, T. Nabika, T. Ohkubo, Y. Tabara, K. Yamamoto, M. Yokota, Japanese Genome Variation Consortium, Y. Y. Teo, and N. Kato
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 5 ページ: 17855-17855
  • DOI: 10.1038/srep17855
  • NAID: 120005820884
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Novel mitochondria-targeted heat-soluble proteins identified in the anhydrobiotic tardigrade improve osmotic tolerance of human cells. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, S., Tanaka, J., Miwa Y., Horikawa, D.D., Katayama, T., Arakawa, K., Toyoda, A., Kubo, T., Kunieda, T.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 10
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0118272
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Resequencing of the common marmoset genome improves genome assemblies and gene-coding sequence analysis (2015)
  • 著者名/発表者名: Sato, K., Kuroki, Y., Kumita, W., Fujiyama, A., Toyoda, A., Kawai, J., Iriki, A., Sasaki, E., Okano, H., Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 5 ページ: 16894-16894
  • DOI: 10.1038/srep16894
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification of a gene cluster responsible for hydrogen evolution in Vibrio tritonius strain AM2 with transcriptional analyses. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuta Matsumura, Hidayu Al-saari, Sayaka Mino, Satoshi Nakagawa, Fumito Maruyama, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Ken Kurokawa, Toko Sawabe, Tomoo Sawabe.
  • 雑誌名: Int. J. Hydrogen Energy 巻: 40 ページ: 9137-9146
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regnase-1 and Roquin Regulate
a Common Element in Inflammatory mRNAs by Spatiotemporally Distinct Mechanisms (2015)
  • 著者名/発表者名: Takashi Mino, Yasuhiro Murakawa, Akira Fukao, Alexis Vandenbon, Hans-Hermann Wessels, Daisuke Ori, Takuya Uehata, Sarang Tartey, Shizuo Akira, Yutaka Suzuki, Carola G. Vinuesa, Uwe Ohler,
Daron M. Standley, Markus Landthaler, Toshinobu Fujiwara, Osamu Takeuchi.
  • 雑誌名: Cell 巻: 161 ページ: 1058-1073
  • DOI: 10.1016/j.cell.2015.04.029
  • NAID: 120005608042
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete genome sequence of Methylobacterium aquaticum strain 22A, isolated from Racomitrium japonicum moss. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tani A., Ogura Y., Hayashi T., Kimbara K.
  • 雑誌名: Genome Announcements 巻: 3
  • DOI: 10.1128/genomea.00266-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Variants associated with Gaucher disease in multiple system atrophy. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Matsukawa T, Sasaki H, Yabe I, Nakahara Y, Momose Y, Takahashi Y, Hara K, Kakita A, Yamada M, Takahashi H, Onodera O, Nishizawa M, Watanabe H, Nakashima K, Ito H, Izumi Y, Kaji R, Kato T, Tsuji S, et al.
  • 雑誌名: Annals of Clinical and Translational Neurology 巻: 2 ページ: 417-26
  • DOI: 10.1002/acn3.185
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete genome sequence of a phenanthrene degrader, Mycobacterium sp. strain EPa45 (NBRC 110737), isolated from a phenanthrene-degrading consortium. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kato H, Ogawa N, Ohtsubo Y, Oshima K, Toyoda A, Mori H, Nagata Y, Kurokawa K, Hattori M, Fujiyama A, Tsuda M
  • 雑誌名: Genome Announc 巻: 3
  • DOI: 10.1128/genomea.00782-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Time-series metagenomic analysis reveals robustness of soil microbiome against chemical disturbance. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kato H, Mori H, Maruyama F, Toyoda A, Oshima K, Endo R, Fuchu G, Miyakoshi M, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Hattori M, Fujiyama A, Kurokawa K, Tsuda M
  • 雑誌名: DNA Res 巻: 22 ページ: 413-424
  • DOI: 10.1093/dnares/dsv023
  • NAID: 120005850199
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Draft genome sequence of the archiascomycetous yeast Saitoella complicata. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamauchi K, Kondo S, Hamamoto M, Takahashi Y, Ogura Y, Hayashi T, Nishida H
  • 雑誌名: Genome Announcements 巻: 3
  • DOI: 10.1128/genomea.00220-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Defining the Genome Features of Escherichia albertii, an Emerging Enteropathogen Closely Related to Escherichia coli (2015)
  • 著者名/発表者名: Ooka T, Ogura Y, Katsura K, Seto K, Kobayashi H, Kawano K, Tokuoka E, Furukawa M, Harada S, Yoshino S, Seto J, Ikeda T, Yamaguchi K, Murase K, Gotoh Y, Imuta N, Nishi J, Gomes TA, Beutin L, Hayashi T.
  • 雑誌名: Genome Biology and Evolution 巻: 7(12) ページ: 3170-3179
  • DOI: 10.1093/gbe/evv211
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ecophysiology of Thioploca ingrica as revealed by the complete genome sequence supplemented with proteomic evidence (2015)
  • 著者名/発表者名: Kojima H, Ogura Y, Yamamoto N, Togashi T, Mori H, Watanabe T, Nemoto F, Kurokawa K, Hayashi T, Fukui M.
  • 雑誌名: The ISME Journal 巻: in press ページ: 1166-1176
  • DOI: 10.1038/ismej.2014.209
  • NAID: 120005667717
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A genetic mechanism for female-limited Batesian mimicry in Papilio butterfly (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Nishikawa, T Iijima, R Kajitani, et. al.
  • 雑誌名: Nature Getetics 巻: 47 ページ: 405-409
  • DOI: 10.1038/ng.3241
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Aggregation of rare/low-frequency variants of the mitochondria respiratory chain-related proteins in rheumatoid arthritis patients. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mitsunaga S, Hosomichi K, Okudaira Y, Nakaoka H, Suzuki Y, Kuwana M, Sato S, Kaneko Y, Homma Y, Oka A, Shiina T, Inoko H, Inoue I.
  • 雑誌名: Journal of human genetics 巻: 60 ページ: 449-454
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.50
  • NAID: 40020561735
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Germline mutation rates and the long-term phenotypic effects of mutation accumulation in wild-type laboratory mice and mutator mice (2015)
  • 著者名/発表者名: Arikuni Uchimura, Mayumi Higuchi, Yohei Minakuchi, Mizuki Ohno, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Ikuo Miura, Shigeharu Wakana, Jo Nishino, Takeshi Yagi
  • 雑誌名: Genome Research 巻: 25 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1101/gr.186148.114
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] How should the legal framework for the protection of human genomic data be formulated?―Implications from the revision processes of the Act on the Protection of Personal Information (PPI Act). (2015)
  • 著者名/発表者名: Natsuko Yamamoto, Minae Kawashima, Takanori Fujita, Masatomo Suzuki and Kazuto Kato
  • 雑誌名: Journal of human genetics 巻: オンライン ページ: 225-226
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.121
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Epigenome-wide association study suggests that SNPs in the promoter region of RETN influence plasma resistin level via effects on DNA methylation at neighbouring sites. (2015)
  • 著者名/発表者名: M. Nakatochi, S. Ichihara, K. Yamamoto, K. Ohnaka, Y. Kato, S. Yokota, A. Hirashiki, K. Naruse, H, Asano, H. Izawa, T. Matsubara, and M. Yokota
  • 雑誌名: Diabetologia 巻: 58 ページ: 2781-2190
  • DOI: 10.1007/s00125-015-3763-9
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Trans-ethnic genome-wide association study identifies 12 genetic loci influencing blood pressure and implicates a role for DNA methylation. (2015)
  • 著者名/発表者名: N. Kato (他104名, 山本63番目)
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 47 ページ: 1282-1293
  • DOI: 10.1038/ng.3405
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Submicroscopic deletions at 13q32.1 cause congenital microcoria (2015)
  • 著者名/発表者名: Fares-Taie, L. Gerber, S. Tawara, A. Ramirez-Miranda, A. Douet, J. Y. Verdin, H. Guilloux, A. Zenteno, J. C. Kondo, H. Moisset, H. Passet, B. Yamamoto, K. Iwai, M. Tanaka, T. Nakamura, Y. Kimura, W. Bole-Feysot, C. Vilotte, M. Odent, S. Vilotte, J. L. Munnich, A. Regnier, A. Chassaing, N. et al.
  • 雑誌名: Am J Hum Genet. 巻: 96 ページ: 631-639
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2015.01.014
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A meta-analysis of genome-wide association studies for adiponectin level in East Asians identifies a novel locus near WDR11-FGFR2. (2015)
  • 著者名/発表者名: M.Yokota(他49 名、47番目）et al
  • 雑誌名: Hum Mol Genet. 巻: 23(4) ページ: 1108-1119
  • DOI: 10.1093/hmg/ddu583
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] DomSign: a top-down annotation pipeline to enlarge enzyme space in the protein universe. (2015)
  • 著者名/発表者名: Wang T, Mori H, Zhang C, Kurokawa K, Xing X, Yamada T
  • 雑誌名: BMC Bioinfo. 巻: 16 ページ: 96-96
  • DOI: 10.1186/s12859-015-0499-y
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] FuncTree: Functional Analysis and Visualization for Large-Scale Omics Data. (2015)
  • 著者名/発表者名: Uchiyama T, Irie M, Mori H, Kurokawa K, Yamada T.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 10
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0126967
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The naming of names: guidelines for gene nomenclature in Marchantia. (2015)
  • 著者名/発表者名: Bowman JL, Araki T, Arteaga-Vazquez MA, Berger F, Dolan L, Haseloff J, Ishizaki K, Kyozuka J, Lin SS, Nagasaki H, Nakagami H, Nakajima K, Nakamura Y, Ohashi-Ito K, Sawa S, Shimamura M, Solano R, Tsukaya H, Ueda T, Watanabe Y, Yamato KT, Zachgo S, Kohchi T.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol. 巻: pcv193
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] DNA data bank of Japan (DDBJ) progress report. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mashima J, Kodama Y, Kosuge T, Fujisawa T, Katayama T, Nagasaki H, Okuda Y, Kaminuma E, Ogasawara O, Okubo K, Nakamura Y, Takagi T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: gkv1105
  • DOI: 10.1093/nar/gkv1105
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] GMcloser: closing gaps in assemblies accurately with a likelihood-based selection of contig or long-read alignments. (2015)
  • 著者名/発表者名: Shunichi Kosugi, Hideki Hirakawa, and Satoshi Tabata
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 31 ページ: 3133-3141
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btv465
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Somatic Primary piRNA Biogenesis Driven by cis-Acting RNA Elements and trans-Acting Yb (2015)
  • 著者名/発表者名: Ishizu H, Iwasaki YW, Hirakata S, Ozaki H, Iwasaki W, Siomi H, Siomi MC
  • 雑誌名: Cell Reports. 巻: 12 ページ: 429-40
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2015.06.035
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] MiFish, a set of universal PCR primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of more than 230 subtropical marine species (2015)
  • 著者名/発表者名: Masaki Miya et al.
  • 雑誌名: Roy. Soc. Open Sci. 巻: 2 ページ: 150088-150088
  • DOI: 10.1098/rsos.150088
  • NAID: 120006220784
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Selection of orthologous genes for construction of a highly resolved phylogenetic tree and clarification of the phylogeny of Trichosporonales species. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takashima, M., Manabe, R., Iwasaki, W., Ohyama, A., Ohkuma, M., and Sugita, T.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0131217
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Associations between nucleosome phasing, sequence asymmetry, and tissue-specific expression in a set of inbred Medaka species. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakatani Y, Mello CC, Hashimoto S, Shimada A, Nakamura R, Tsukahara T, Qu W, Yoshimura J, Suzuki Y, Sugano S, Takeda H, Fire A, Morishita S.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 16(1) ページ: 978-978
  • DOI: 10.1186/s12864-015-2198-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] A linear time algorithm for detecting long genomic regions enriched with a specific combination of epigenetic states. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ichikawa, K., Morishita, S.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 16
  • DOI: 10.1186/1471-2164-16-s2-s8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Clinicopathological features of the first Asian family having vocal cord and pharyngeal weakness with distal myopathy due to a MATR3 mutation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamashita S, Mori A, Nishida Y, Kurisaki R, Tawara N, Nishikami T, Misumi Y, Ueyama H, Imamura S, Higuchi Y, Hashiguchi A, Higuchi I, Morishita S, Yoshimura J, Uchino M, Takashima H, Tsuji S, Ando Y.
  • 雑誌名: Neuropathology and Applied Neurobiology 巻: 41 ページ: 276-277
  • DOI: 10.1111/nan.12179
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Hybrid De Novo Genome Assembly Using MiSeq and SOLiD Short Read Data. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Ikegami, Toyohiro Inatsugi, Isao Kojima, Myco Umemura, Hiroko Hagiwara, Masayuki Machida, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 10(4)
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0126289
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Learning chromatin states with factorized information criteria (2015)
  • 著者名/発表者名: Michiaki Hamada, Yukiteru Ono, Ryohei Fujimaki, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 未定 ページ: 2426-2433
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btv163
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A semi-supervised learning approach for RNA secondary structure prediction (2015)
  • 著者名/発表者名: Haruka Yonemoto, Kiyoshi Asai, Michiaki Hamada
  • 雑誌名: Computational biology and chemistry 巻: 未定 ページ: 72-79
  • DOI: 10.1016/j.compbiolchem.2015.02.002
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Visualizing translocation dynamics and nascent transcript errors in paused RNA polymerases in vivo (2015)
  • 著者名/発表者名: Imashimizu M., Takahashi H., Oshima T., McIntosh C., Bubunenko M., Court DL., and Kashlev M.
  • 雑誌名: Genome Biol. 巻: 16 ページ: 98-98
  • DOI: 10.1186/s13059-015-0666-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Draft genome sequence of the pathogenic filamentous fungus Aspergillus udagawae strain IFM 46973T (2015)
  • 著者名/発表者名: Kusuya Y, Takahashi-Nakaguchi A, Takahashi H, Yaguchi T
  • 雑誌名: Genome Announc 巻: 3(4)
  • DOI: 10.1128/genomea.00834-15
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] High-speed Westfall-Young permutation procedure for genome-wide association studies. (2015)
  • 著者名/発表者名: Terada A, Kim H, Sese J.
  • 雑誌名: Proceedings of the 6th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Health Informatics 巻: 1 ページ: 17-26
  • DOI: 10.1145/2808719.2808721
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Colony Multiplex Quantitative PCR-Based 3S3DBC Method and Variations of It for Screening DNA Libraries (2015)
  • 著者名/発表者名: Yang An, Atsushi Toyoda, Chen Zhao, Asao Fujiyama, and Kiyokazu Agata
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0116997
  • NAID: 120005555486
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Gene activation-associated long noncoding RNAs function in mouse preimplantation development (2015)
  • 著者名/発表者名: Hamazaki N, Uesaka M, Nakashima K, Agata K, Imamura T
  • 雑誌名: Development 巻: 142 ページ: 910-920
  • DOI: 10.1242/dev.116996
  • NAID: 120005707874
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of long noncoding RNA turnover (2015)
  • 著者名/発表者名: Hidenori Tani, Naoto Imamachi, Rena Mizutani, Katsutoshi Imamura, Yoendae Kwon, Satoru Miyazaki, Sho Maekawa, Yutaka Suzuki, Nobuyoshi Akimitsu
  • 雑誌名: Nuclear Bodies and Noncoding RNAs: Methods and Protocols 巻: 1262 ページ: 305-20
  • DOI: 10.1007/978-1-4939-2253-6_19
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Draft genome sequence of the archiascomycetous yeast Saitoella complicata. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kenta Yamauchi, Shinji Kondo, Makiko Hamamoto, Yurika Takahashi, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Hiromi Nishida
  • 雑誌名: Genome Announc. 巻: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study identifies a PSMD3 variant associated with neutropenia in interferon-based therapy for chronic hepatitis C. (2015)
  • 著者名/発表者名: Iio E, Matsuura K, Nishida N, Maekawa S, Yatsuhashi H, Kurosaki M, Izumi N, Hiasa Y, Masaki N, Ide T, Hino K, Tamori A, Honda M, Kaneko S, Mochida S, Nomura H, Nishiguchi S, Okuse C, Itoh Y, Yoshiji H, Sakaida I, Yamamoto K, Watanabe H, Hige S, Matsumoto A, Tanaka E, Tokunaga K, and Tanaka Y.
  • 雑誌名: Hum. Genet. 巻: 134
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Polymorphism in CCR1/CCR3 Is Associated with Narcolepsy (2015)
  • 著者名/発表者名: Toyoda H, Miyagawa T, Koike A, Kanbayashi T, Kawamura Y, Otowa T, Miyashita A, Kashiwase K, Khor SS, Yamasaki M, Kuwano R, Sasaki T, Ishigooka J, Kuroda K, Kume K, Chiba S, Yamada N, Okawa M, Hirata K, Mizuki N, Uchimura N, Shimizu T, Inoue Y, Honda Y, Mishima K, Honda M, Tokunaga K
  • 雑誌名: Brain Behav. Immun. 巻: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid detection of expanded short tandem repeats in personal genomics using hybrid sequencing. (2015)
  • 著者名/発表者名: Doi K, Monjo T, Hoang PH, Yoshimura J, Yurino H, Mitsui J, Ishiura H, Takahashi Y, Ichikawa Y, Goto J, Tsuji S, Morishita S.
  • 雑誌名: Bioinformatics. 巻: 30 ページ: 815-22
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btt647
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A machine learning based approach to de novo sequencing of glycans from tandem mass spectrometry spectrum. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kumozaki, S., Sato, K., and Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform, 巻: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] MetaVelvet-SL: An extension of the Velvet assembler to a de novo metagenomic assembler utilizing supervised learning (2015)
  • 著者名/発表者名: Afiahayati, Sato, K., and Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 22 ページ: 69-77
  • DOI: 10.1093/dnares/dsu041
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 医療情報の共有・利用における現状と課題―医療情報共有における一般市民の意識調査 (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋本泰成
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12
• [雑誌論文] 「全ゲノム解析研究に関する一般市民を対象とした意識調査」の結果報告 (2015)
  • 著者名/発表者名: 大橋範子・大北全俊
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12
• [雑誌論文] パーソナルゲノム時代の解析データの共有―データ公開・共有方針と倫理的対応 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三成寿作
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12
• [雑誌論文] 個人の遺伝情報の保護における国レベルでのルール形成に向けた試論―個人情報保護法とその改正法を中心に (2015)
  • 著者名/発表者名: 山本奈津子・鈴木正朝・川嶋実苗・藤田卓仙
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12
• [雑誌論文] 社会とともに進めるゲノム医学研究―国際ワークショップ開催報告 (2015)
  • 著者名/発表者名: 吉澤剛
  • 雑誌名: 医療・生命と倫理・社会 巻: 12
• [雑誌論文] Single-cell analysis of lung adenocarcinoma cell lines reveals diverse expression patterns of individual cells invoked by a molecular target drug treatment. (2015)
  • 著者名/発表者名: Suzuki A, Matsushima K, Makinoshima H, Sugano S, Kohno T, Tsuchihara K, Suzuki Y.
  • 雑誌名: Genome Biology 巻: 16 ページ: 66-66
  • DOI: 10.1186/s13059-015-0636-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] DBTSS as an integrative platform for transcriptome, epigenome and genome sequence variation data. (2015)
  • 著者名/発表者名: Suzuki A, Wakaguri H, Yamashita R, Kawano S, Tsuchihara K, Sugano S, Suzuki Y, Nakai K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 43 ページ: 1-5
  • DOI: 10.1093/nar/gku1080
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Regnase-1 and Roquin regulate common inflammation-related mRNAs in translation-dependent and independent manners. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takashi Mino, Yasuhiro Murakawa, Akira Fukao, Alexis Vandenbon, Hans-Hermann Wessels, Daisuke Ori, Takuya Uehata, Sarang Tartey, Shizuo Akira, Yutaka Suzuki, Carola G. Vinuesa, Uwe Ohler, Daron M. Standley, Markus Landthaler, Toshinobu Fujiwara, Osamu Takeuchi
  • 雑誌名: Cell 巻: in press
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• [雑誌論文] Discovery of osmotic sensitive transcription factors in fish intestine via a transcriptomic approach. (2014)
  • 著者名/発表者名: Marty Kwok-Shing Wong, Haruka Ozaki, Yutaka Suzuki, Wataru Iwasaki, and Yoshio Takei.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 ページ: 1134-1134
  • DOI: 10.1186/1471-2164-15-1134
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Light and pheromone-sensing neuron regulates cold habituation through insulin signaling in C. elegans (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohta, A., Ujisawa T., Sonoda S., Kuhara, A.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 5:4412 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1038/ncomms5412
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The newt reprograms mature RPE cells into a unique multipotent state for retinal regeneration (2014)
  • 著者名/発表者名: Islam, M.R., Nakamura, K., Casco-Robles, M.M., Kunahong, A., Inami, W., Toyama, F., Maruo, F. and Chiba, C.
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 4, 6043 ページ: 6043-6043
  • DOI: 10.1038/srep06043
  • NAID: 120005477902
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Sperm proteases that may be involved in the initiation of sperm motility in the newt, Cynops pyrrhogaster (2014)
  • 著者名/発表者名: Yokoe M., Sano M., Shibata H., Shibata D., Takayama-Watanabe E., Inaba, K. and Watanabe, A.
  • 雑誌名: Int. J. Mol. Sci. 巻: 15 ページ: 15210-15224
  • DOI: 10.3390/ijms150915210
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A transcriptome for the study of early processes of retinal regeneration in the adult newt, Cynops pyrrhogaster (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Nakamura, M. R. Islam, M. Takayanagi, H. Yasumuro, W. Inami, A. Kunahong, R. M. Casco-Robles, F. Toyama and C. Chiba
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 9
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0109831
  • NAID: 120005496692
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] HAP2/GCS1 is involved in the sexual reproduction system of the marine macroalga Ulva compressa. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamazaki, T., Endo, M., Ito, K., Suzuki, R., Ota, S., Kuwano, K., Miyamura, S., Toyoda, A. and Kawano, S.
  • 雑誌名: ＣＹＴＯＬＯＧＩＡ 巻: 79 号: 4 ページ: 575-584
  • DOI: 10.1508/cytologia.79.575
  • NAID: 130004801645
  • ISSN: 0011-4545, 1348-7019
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Transformation system using rbcS N-terminal region fused with GFP demonstrates pyrenoid targeting of the small subunit of RubisCO in Ulva compressa. (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, R., Yamazaki, T., Toyoda, A. and Kawano, S.:
  • 雑誌名: ＣＹＴＯＬＯＧＩＡ 巻: 79 号: 4 ページ: 427-428
  • DOI: 10.1508/cytologia.79.427
  • NAID: 130004801646
  • ISSN: 0011-4545, 1348-7019
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Long Noncoding RNA NEAT1-Dependent SFPQ Relocation from Promoter Region to Paraspeckle Mediates IL8 Expression upon Immune Stimuli (2014)
  • 著者名/発表者名: Imamura K, Imamachi N, Akizuki G, Kumakura M, Kawaguchi A, Nagata K, Kato A, Kawaguchi Y, Sato H, Yoneda M, Kai C, Yada T, Suzuki Y, Yamada T, Ozawa T, Kaneki K, Inoue T, Kobayashi M, Kodama T, Wada Y, Sekimizu K and Akimitsu N.
  • 雑誌名: Mol. Cell 巻: 53 ページ: 393-406
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2014.01.009
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification of the Carotenoid Modifying Gene PALE YELLOW PETAL 1 as an Essential Factor in Xanthophyll Esterification and Yellow Flower Pigmentation in Tomato (Solanum lycopersicum). (2014)
  • 著者名/発表者名: Ariizumi T, Kishimoto S, Kakami R, Maoka T, Hirakawa H, Suzuki Y, Ozeki Y, Shirasawa K, Bernillon S, Okabe Y, Moing A, Asamizu E, Rothan C, Ohmiya A & Ezura H
  • 雑誌名: The Plant Journal 巻: 79 ページ: 453-465
  • DOI: 10.1111/tpj.12570
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Intermediate form between alternating hemiplegia of childhood and rapid-onset dystonia-parkinsonism. (2014)
  • 著者名/発表者名: Sasaki M, Ishii A, Saito Y, Hirose S.
  • 雑誌名: Movement Disorders 巻: 29 ページ: 153-154
  • DOI: 10.1002/mds.25659
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Distinct neurological disorders with ATP1A3 mutations. (2014)
  • 著者名/発表者名: Heinzen, E.L.*, Arzimanoglou, A., Brashear, A., Clapcote, S.J., Gurrieri, F., Goldstein, D.B., Johannesson, S.H., Mikati, M.A., Neville, B., Nicole, S., Ozelius, L.J., Poulsen, H., Schyns, T., Sweadner, K.J., van den Maagdenberg, A., Vilsen, B., the ATP1A3 Working Group (included Ikeda, K.).
  • 雑誌名: Lancent Neurol. 巻: 13 ページ: 503-14
  • DOI: 10.1016/s1474-4422(14)70011-0
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genotype-Phenotype Correlations in Alternating Hemiplegia of Childhood (2014)
  • 著者名/発表者名: Sasaki M, Ishii A, Saito Y, (中略）, Tsuji S and Hirose S.
  • 雑誌名: NEUROLOGY 巻: 82 ページ: 482-490
  • DOI: 10.1212/wnl.0000000000000102
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Gene-content evolution in discobid mitochondria deduced from the phylogenetic position and complete mitochondrial genome of Tsukubamonas globosa. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kamikawa R, Kolisko M, Nishimura Y, Yabuki A, rown MW, Sohta A. Ishikawa, Ishida K, Roger AJ, Hashimoto T, Inagaki Y
  • 雑誌名: Genome Biol. Evol. 巻: 第6巻2号 ページ: 305-315
  • DOI: 10.1093/gbe/evu015
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A Bead-based Normalization for Uniform Sequencing depth (BeNUS) protocol for multi-samples sequencing exemplified by HLA-B (2014)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Mitsunaga S, Nagasaki H, Inoue Ituro.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 ページ: 645-645
  • DOI: 10.1186/1471-2164-15-645
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Bidirectional promoters are the major source of gene activation-associated non-coding RNAs in mammals. (2014)
  • 著者名/発表者名: Uesaka M, Nishimura O, Go Y, Nakashima K, Agata K, Imamura T.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 ページ: 35-35
  • DOI: 10.1186/1471-2164-15-35
  • NAID: 120005367807
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The TIF1β-HP1 System Maintains Transcriptional Integrity of Hematopoietic Stem Cells. (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyagi S, Koide S, Saraya A, Wendt GR, Oshima M, Konuma T, Yamazaki S, Mochizuki-Kashio M, Nakajima-Takagi Y, Wang C, Chiba T, Kitabayashi I, Nakauchi H, Iwama A.
  • 雑誌名: Stem cell reports 巻: 2 ページ: 145-52
  • DOI: 10.1016/j.stemcr.2013.12.008
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] An evolutionarily conserved protein CHORD regulates scaling of dendritic arbors with body size. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kohei Shimono, Kazuto Fujishima, Takafumi Nomura, Masayoshi Ohashi, Tadao Usui, Mineko Kengaku, Atsushi Toyoda, and Tadashi Uemura.
  • 雑誌名: Scientific Report 巻: 4 ページ: 16-21
  • DOI: 10.1038/srep04415
  • NAID: 120005399036
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Defects in the synthetic pathway prevent DIF-1 mediated stalk lineage specification cascade in the non-differentiating social amoeba, Acytostelium subglobosum. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kurato Mohri, Takashi Hata, Haruhisa Kikuchi, Yoshiteru Oshima and Hideko Urushihara
  • 雑誌名: Biol Open 巻: 3
  • DOI: 10.1242/bio.20148359
  • NAID: 120005555602
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular evidence that the genes for dioecism and monoecism in Spinacia oleracea L. are located at different loci in a chromosomal region. (2014)
  • 著者名/発表者名: K Yamamoto, Y Oda, A Haseda, S Fujito, T Mikami and Y Onodera
  • 雑誌名: Heredity 巻: 112(3)
  • DOI: 10.1038/hdy.2013.112
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Methyloceanibacter caenitepidi gen. nov., sp. nov., a novel facultatively methylotrophic bacterium isolated from marine sediments near the hydrothermal vent area (2014)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi, M., Katayama, T., Yamagishi, T., Hanada, S., Tamaki, H., Kamagata, Y., Oshima, K., Hattori, M., Marumo, K., Nedachi, M., Maeda, H., Suwa, Y., and Sakata, S.
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 巻: 64 ページ: 462-468
  • DOI: 10.1099/ijs.0.053397-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Direct binding of Ataxin-2 to distinct elements in 3' UTRs promotes mRNA stability and protein expression. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yokoshi, M., Li, Q., Yamamoto, M., Okada, H., Suzuki, Y., and Kawahara, Y.
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 55 ページ: 186-198
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2014.05.022
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Evolutionary renovation of L/M opsin polymorphism confers a fruit discrimination advantage to ateline New World monkeys (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto, Y., Hiramatsu, C., Matsushita, Y., Ozawa, N., Ashino, R., Nakata, M., Kasagi, S., Di Fiore, A. Schaffner, C. M., Aureli, F., Melin, A. D. and Kawamura, S.
  • 雑誌名: Molecular Ecology 巻: 23 ページ: 1799-1812
  • DOI: 10.1111/mec.12703
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The heterozygote superiority hypothesis for polymorphic color vision is not supported by long-term fitness data from wild Neotropical monkeys (2014)
  • 著者名/発表者名: Fedigan, L.M., Melin, A.D., Addicott, J.F. and Kawamura, S.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0084872
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The behavioral ecology of color vision : considering fruit conspicuity, detection distance and dietary importance (2014)
  • 著者名/発表者名: Melin, A. D., Hiramatsu, C., Parr, N. A., Matsushita, Y., Kawamura, S. and Fedigan, L. M.
  • 雑誌名: International Journal of Primatology 巻: 35 ページ: 258-287
  • DOI: 10.1007/s10764-013-9730-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Color vision variation as evidenced by hybrid L/M opsin genes in wild populations of trichromatic Alouatta New World monkeys. (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsushita, Y., Oota, H., Welker, B. J., Pavelka, M. S. and Kawamura, S.
  • 雑誌名: International Journal of Primatology, 巻: 35 ページ: 71-87
  • DOI: 10.1007/s10764-013-9705-9
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genome-wide SNP analysis reveals population structure and demographic history of the Ryukyu Islanders in the southern part of the Japanese Archipelago (2014)
  • 著者名/発表者名: Sato T., Nakagome S., Watanabe C., Yamaguchi K., Kawaguchi A., Koganebuchi K., Haneji K., Yamaguchi T., Hanihara T., Yamamoto K., Ishida H., Mano S., Kimura R., Oota H.
  • 雑誌名: Mol Biol Evol. 巻: 31(11) ページ: 2929-2940
  • DOI: 10.1093/molbev/msu230
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Epigenetics as a basis for diagnosis of neurodevelopmental disorders: challenges and opportunities. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kubota T, Miyake K, Hariya M, Mochizuki K.
  • 雑誌名: Expert Rev Mol Diagn 巻: 14 ページ: 685-697
  • DOI: 10.1586/14737159.2014.925805
  • 査読あり
• [雑誌論文] Breakpoint analysis of the recurrent constitutional t(8;22)(q24.13;q11.21) translocation (2014)
  • 著者名/発表者名: Mishra D, Kato T, Inagaki H, Kosho T, Wakui K, Kido Y, Sakazume S, Taniguchi-Ikeda M, Morisada N, Iijima K, Fukushima Y, Emanuel BS, Kurahashi H
  • 雑誌名: Mol Cytogenet, 巻: 7 ページ: 55-55
  • DOI: 10.1186/s13039-014-0055-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Co-option of a photoperiodic growth-phase transition system during land plant evolution. (2014)
  • 著者名/発表者名: Akane Kubota, Shogo Kita, Kimitsune Ishizaki, Ryuichi Nishihama, Katsuyuki T. Yamato, Takayuki Kohchi
  • 雑誌名: Nature Communication 巻: 5 : 3668 ページ: 3668-3668
  • DOI: 10.1038/ncomms4668
  • NAID: 120005466589
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• [雑誌論文] Phototropin encoded by a single-copy gene mediates chloroplast photorelocation movements in the liverwort Marchantia polymorpha (2014)
  • 著者名/発表者名: Komatsu, A., Terai, M., Ishizaki, K., Suetsugu, N., Tsuboi, H., Nishihama, R., Yamato, K.T., Wada, M., and Kohchi, T.
  • 雑誌名: Plant Physiology 巻: 166 ページ: 411-427
  • DOI: 10.1104/pp.114.245100
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The polycomb component Ring 1B regulates the timed termination of subcerebral projection neuron production during neocortical development. (2014)
  • 著者名/発表者名: Morimoto-Suzuki,N., Hirabayashi,Y.,Tyssowski, K., Shinga,J., Vidal, M., Koseki, H., and Gotoh, Y
  • 雑誌名: Development. 巻: 141
  • DOI: 10.1242/dev.112276
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Study of MHC class II region polymorphism in the Filipino cynomolgus macaque population (2014)
  • 著者名/発表者名: Blancher A, Aarnink A, Yamada Y, Tanaka K, Yamanaka H, Shiina T
  • 雑誌名: Immunogenetics 巻: 66 ページ: 219-230
  • DOI: 10.1007/s00251-014-0764-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Massive gene transfer and extensive RNA editing of a symbiotic dinoflagellate plastid genome. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mungpakdee, S., Shinzato, C., Takeuchi, T., Kawashima, T., Koyanagi, R., Hisata, K., Tanaka, M., Goto, H., Fujie, M., Lin, S., Satoh, N., and Shoguchi, E.
  • 雑誌名: Genome Biol. Evol. 巻: 6 ページ: 1408-1422
  • DOI: 10.1093/gbe/evu109
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Occupancy of tissue-specific cis-regulatory modules by Otx2 and TLE/Groucho for embryonic head specification. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yasuoka Y, Suzuki Y, Takahashi S, Someya H, Sudou N, Haramoto Y, Cho KW, Asashima M, Sugano S, Taira M.
  • 雑誌名: Nat. Commun 巻: 5 ページ: 4322-4322
  • DOI: 10.1038/ncomms5322
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Large hypomethylated domains serve as strong repressive machinery for key developmental genes in vertebrates (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, R., Tsukahara, T., Qu, W., Ichikawa, K., Otsuka, T., Ogoshi, K., Saito, T.L., Matsushima, K., Sugano, S., Hashimoto, S., Suzuki, Y., Morishita, S. & Takeda, H.
  • 雑誌名: Development 巻: 141 ページ: 2568-2580
  • DOI: 10.1242/dev.108548
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Occurence of the endangered species Nitellopsis obtusa (Charales, Charophyceae) in western Japan and the genetic differences within and among Japanese populations (2014)
  • 著者名/発表者名: Kato, S., Kawai, H., Takimoto, M., Suga, H., Yohda, K., Horiya, K., Higuchi, S., & Sakayama, H.
  • 雑誌名: Phycological Research 巻: 62 ページ: 222-227
  • DOI: 10.1111/pre.12057
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Characterization of sexual reproductive processes in Chara braunii (Charales, Charophyceae). (2014)
  • 著者名/発表者名: Sato, M., Sakayama, H., Sato, M., Ito, M., Sekimoto, H.
  • 雑誌名: Phycological Research 巻: 62 ページ: 214-221
  • DOI: 10.1111/pre.12056
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Heterotrimeric G proteins control stem cell proliferation through CLAVATA signaling in Arabidopsis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ishida, T., Tabata, R., Yamada, M., Aida, M., Mitsumasu, K., Fujiwara, M., Yamaguchi, K., Shigenobu, S., Higuchi, M., Tsuji, H., Shimamoto, K., Hasebe, M., Fukuda, H., Sawa, S.
  • 雑誌名: EMBO reports 巻: 15 ページ: 1202-1209
  • DOI: 10.15252/embr.201438660
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Maturation processes and structures of secreted peptides in plants. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tabata, R. Sawa, S.
  • 雑誌名: Frontiers in Plant Science 巻: 5 ページ: 1-1
  • DOI: 10.3389/fpls.2014.00311
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CLE6 expression recovers gibberellin deficiency to promote shoot growth in Arabidopsis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Bidadi, H.,et al.
  • 雑誌名: Plant Journal 巻: In press ページ: 241-252
  • DOI: 10.1111/tpj.12475
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CLE-CLAVATA1 peptide-receptor signaling module regulates the expansion of plant root systems in a nitrogen-dependent manner. (2014)
  • 著者名/発表者名: Araya, T.,et al.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. 巻: In press
  • DOI: 10.1073/pnas.1319953111
  • 査読あり
• [雑誌論文] Light-dependent green gall formation induced by Meloidogyne incognita. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nishiyama, H., Nakagami, S., Todaka, A., Arita, T., Ishida, T., Sawa, S.
  • 雑誌名: Nematology 巻: 16 ページ: 889-893
  • DOI: 10.1163/15685411-00002814
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genomic Aspects of Sporadic Neurodegenerative Diseases. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J and Tsuji S.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 巻: 452 ページ: 221-225
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2014.07.098
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Design and experimental application of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes (2014)
  • 著者名/発表者名: Mori H, Maruyama F, Kato H, Toyoda A, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Fujiyama A, Tsuda M Kurokawa K
  • 雑誌名: DNA Res. 巻: 21 ページ: 217-227
  • DOI: 10.1093/dnares/dst052
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Nuclear dynamics of topoisomerase IIβ reflects its catalytic activity that is regulated by binding of RNA to the C-terminal domain. (2014)
  • 著者名/発表者名: Onoda A, Hosoya O, Sano K, Kiyama K, Kimura H, Kawano S, Furuta R, Miyaji M, Tsutsui K, Tsutsui KM.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 42 ページ: 9005-20
  • DOI: 10.1093/nar/gku640
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Pseudomonas sp. Strain TKP, Isolated from a gamma-Hexachlorocyclohexane-Degrading Mixed Culture (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohtsubo Y, Kishida K, Sato T, Tabata M, Kawasumi T, Ogura Y, Hayashi T, Tsuda M, Nagata Y
  • 雑誌名: Genome Announc. 巻: 2
  • DOI: 10.1128/genomea.01241-13
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa MTB-1 isolated from a microbial community enriched by the technical formulation of hexachlorocyclohexane. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohtsubo, Y., T. Sato, K. Kishida, M. Tabata, Y. Ogura, T. Hayashi, M. Tsuda, and Y. Nagata
  • 雑誌名: Genome Announc. 巻: 2
  • DOI: 10.1128/genomea.01130-13
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Sall1 maintains nephron progenitors and nascent nephrons by acting as both an activator and a repressor (2014)
  • 著者名/発表者名: S. Kanda, T. Ohmori, A. Taguchi, K. Kudo, T. Horiuchi, Y. Sato, S. Hino, Y. Suzuki, M. Sander, S. Sugano, M. Nakao, and R. Nishinakamura.
  • 雑誌名: J Am Soc Nephrol 巻: 25 ページ: 2584-2595
  • DOI: 10.1681/asn.2013080896
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Sex-specific post-translational regulation of the gamete fusogen GCSI in the isogamous volvocine alga Gonium pectorale. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kawai-Toyooka H, Mori T, Hamaji T, Suzuki M, Olson BJ, Uemura T, Ueda T, Nakano A, Toyoda A, Fujiyama A, Nozaki H
  • 雑誌名: Eukaryot Cell 巻: (in press) ページ: 548-556
  • DOI: 10.1128/ec.00330-13
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Induction of Virulence Gene Expression in Staphylococcus aureus by Pulmonary Surfactant. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ishii K, Adachi T, Yasukawa J, Suzuki Y, Hamamoto H, Sekimizu K.
  • 雑誌名: Infect. Immun. 巻: 82(4) ページ: 1500-10
  • DOI: 10.1128/iai.01635-13
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CLOCK-controlled polyphonic regulations of circadian rhythms through canonical and non-canonical E-boxes. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hikari Yoshitane, Haruka Ozaki, Hideki Terajima, Ngoc-Hien Du, Yutaka Suzuki, Taihei Fujimori, Naoki Kosaka, Shigeki Shimba, Sumio Sugano, Toshihisa Takagi, Wataru Iwasaki, and Yoshitaka Fukada.
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol. 巻: 34 ページ: 1776-1787
  • DOI: 10.1128/mcb.01465-13
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Methylome diversification through changes in DNA methyltransferase sequence specificity. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshikazu Furuta, Hiroe Namba-Fukuyo, Tomoko F. Shibata, Tomoaki Nishiyama, Shuji Shigenobu, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Mitsuyasu Hasebe, Ichizo Kobayashi
  • 雑誌名: PLoS genetics 巻: 10(4)
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1004272
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• [雑誌論文] Novel calmodulin mutations associated with congenital arrhythmia susceptibility. (2014)
  • 著者名/発表者名: Makita N, Tsuji Y（39人中21番目）et al
  • 雑誌名: Circ Cardiovasc Genet 巻: 7 ページ: 466-474
  • DOI: 10.1161/circgenetics.113.000459
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• [雑誌論文] Phytochrome controls alternative splicing to mediate light responses in Arabidopsis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shikata, H., Hanada, K., Ushijima, T., Nakashima, M., Suzuki, Y. and Matsushita, T.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 111 ページ: 18781-18786
  • DOI: 10.1073/pnas.1407147112
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• [雑誌論文] ABCG2 dysfunction causes hyperuricemia due to both renal urate underexcretion and renal urate overload (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsuo, H. Nakayama, A. Sakiyama, M. et al.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 4：3755 ページ: 3755-3755
  • DOI: 10.1038/srep03755
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Common dysfunctional variants of ABCG2 have stronger impact on hyperuricemia progression than typical environmental risk factors. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakayama A, et al.
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 4 ページ: 5227-5227
  • DOI: 10.1038/srep05227
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• [雑誌論文] Ethnic Differences in ATP-binding Cassette Transporter, Sub-Family G, Member 2 (ABCG2/BCRP): Genotype Combinations and Estimated Functions. (2014)
  • 著者名/発表者名: Sakiyama M, et al.
  • 雑誌名: Ｄｒｕｇ Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ ａｎｄ Ｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓ 巻: 29(6) 号: 6 ページ: 490-2
  • DOI: 10.2133/dmpk.dmpk-14-sc-041 10.2133/dmpk.DMPK-14-SC-041
  • NAID: 130004463408
  • ISSN: 1347-4367, 1880-0920
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Efficient de novo assembly of highly heterozygous genomes from whole-genome shotgun short reads. (2014)
  • 著者名/発表者名: R. Kajitani, K. Toshimoto, H. Noguchi, A. Toyoda, Y. Ogura, M. Okuno, M. Yabana, M. Harada, E. Nagayasu, H. Maruyama, Y. Kohara, A. Fujiyama, T. Hayashi and T.Itoh
  • 雑誌名: Genome Res. 巻: 24 ページ: 1384-1384
  • DOI: 10.1101/gr.170720.113
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Assessment of Helminth Biodiversity in Wild Rats Using 18S rDNA Based Metagenomics (2014)
  • 著者名/発表者名: Ryusei Tanaka, Akina Hino, Isheng J. Tsai, Juan Emilio Palomares-Rius1, Ayako Yoshida,Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Haruhiko Maruyama, Taisei Kikuchi
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 9
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0110769
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Karyotype and reproduction mode of the rodent parasite Strongyloides venezuelensis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hino A, Tanaka T, Takaishi M, Fujii Y, Palomares-Rius JE, Hasegawa K, Maruyama H, Kikuchi T
  • 雑誌名: Parasitology 巻: 141 ページ: 1736-1745
  • DOI: 10.1017/s0031182014001036
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study of degenerative bony changes of the temporomandibular joint (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, (10名省略), Kimura R, Inoue I
  • 雑誌名: Oral Dis. 巻: 20 ページ: 409-15
  • DOI: 10.1111/odi.12141
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional characterization of flavobacteria rhodopsins reveals a unique class of light-driven chloride pump in bacteria. (2014)
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Yohei Kumagai, Hana Kim, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Wataru Iwasaki, Edward F. DeLong, and Kazuhiro Kogure.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 巻: 111 ページ: 6732-6737
  • DOI: 10.1073/pnas.1403051111
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 遺伝子から見た根寄生植物の生存戦略 (2014)
  • 著者名/発表者名: 吉田聡子、若竹崇雅、白須賢
  • 雑誌名: 植物の生長調節 巻: 49(1)
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of CNV (copy number variation) and their associations with narcolepsy in a Japanese population. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamasaki M, Miyagawa T, Toyoda H, Khor SS, Koike A, Nitta A, Akiyama K, Sasaki T, Honda M, Tokunaga K.
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 59 ページ: 235-240
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.13
  • NAID: 40020066447
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genome-wide association study for diabetic retinopathy in a Japanese population: potential association with a long intergenic non-coding RNA. (2014)
  • 著者名/発表者名: Awata T, Yamashita H, Kurihara S, Morita-Ohkubo T, Miyashita Y, Katayama S, Mori K, Yoneya S, Kohda M, Okazaki Y, Maruyama T, Shimada A, Yasuda K, Nishida N, Tokunaga K, and Koike A.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0111715
  • 査読あり
• [雑誌論文] CLAST: CUDA implemented large-scale alignment search tool. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yano M, Mori H, Akiyama Y, Yamada T, Kurokawa K
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 15 ページ: 406-406
  • DOI: 10.1186/s12859-014-0406-y
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Mutations in ERBB4 That Disrupt The NRG-ErbB4 Pathway Cause Autosomal Dominant Familial ALS Type 19 (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuji Takahashi, Yoko Fukuda, Jun Yoshimura, Atsushi Toyoda, Kari Kurppa, Hiroyoko Moritoyo, Veronique Belzil, Klaus Elenius, Guy Rouleau, Asao Fujiyama, Shinichi Morishita, Jun Goto, Shoji Tsuji
  • 雑誌名: Neurology 巻: 82
  • 査読あり
• [雑誌論文] A simple but powerful heuristic method for accelerating k-means clustering of large-scale data in life science (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuki Ichikawa and Shinichi Morishita
  • 雑誌名: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (TCBB) 巻: (印刷中)
  • DOI: 10.1109/tcbb.2014.2306200
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole genome complete resequencing of Bacillus subtilis natto by combining long reads with high-quality short reads (2014)
  • 著者名/発表者名: Kamada, M., Hase, S., Sato, K., Toyoda, A., Fujiyama, A., Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: PLOS ONE, 巻: 9
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0109999
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Efficient calculation of exact probability distributions of integer features on RNA secondary structures. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mori R, Hamada M, Asai K
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15
  • DOI: 10.1186/1471-2164-15-s10-s6
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Reference-free prediction of rearrangement breakpoint reads (2014)
  • 著者名/発表者名: Edward Wijaya, Kana Shimizu, Kiyoshi Asai, Michiaki Hamada
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 30(18) ページ: 2559-2567
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btu360
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Performance comparison of second- and third-generation sequencers using a bacterial genome with two chromosomes. (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyamoto M, Motooka D, Gotoh K, Imai T, Yoshitake K, Goto N, Iida T, Yasunaga T, Horii T, Arakawa K, Kasahara M, Nakamura S.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 15 ページ: 699-699
  • DOI: 10.1186/1471-2164-15-699
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] ELSI practices in genomic research in East Asia: implications for research collaboration and public participation (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshizawa G., Ho C. W., Zhu W., Hu C., Syukriani Y., Lee I., Kim H., Tsai D. F., Minari J. and Kato K.
  • 雑誌名: Genome Medicine. 巻: 6 ページ: 39-39
  • DOI: 10.1186/gm556
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Ethical considerations of research policy for personal genome analysis: the approach of the Genome Science Project in Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Minari J, Shirai T and Kato K
  • 雑誌名: Life Sciences, Society and Policy 巻: 10 ページ: 4-4
  • DOI: 10.1186/s40504-014-0004-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Return of genetic research results: the Japanese experience and its implications for the international debate (2014)
  • 著者名/発表者名: Minari J, Chalmers D. and Kato K.
  • 雑誌名: SCRIPTed 巻: 11 ページ: 180-192
  • DOI: 10.2966/scrip.110214.180
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The emerging need for family-centric initiatives for obtaining consent in personal genome research (2014)
  • 著者名/発表者名: Minari J., Teare H., Mitchell C., Kaye J. and Kato K.
  • 雑誌名: Genome Medicine 巻: 6 ページ: 118-118
  • DOI: 10.1186/s13073-014-0118-y
  • NAID: 120005537856
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] パーソナルゲノム時代の研究ガバナンス (2014)
  • 著者名/発表者名: 三成寿作, 加藤和人
  • 雑誌名: 医薬ジャーナル 巻: 50
• [雑誌論文] 医療情報の利用に関する政策の20年 (2014)
  • 著者名/発表者名: 吉澤剛
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 251(3)
• [雑誌論文] ヒトゲノム情報は２１世紀の新しい石油となるか？―パーソナルゲノム時代の倫理的・法的・社会的課題 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山本奈津子
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 251(3)
• [雑誌論文] Aberrant transcriptional regulations in cancers: genome, transcriptome and epigenome analysis of lung adenocarcinoma cell lines. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ayako Suzuki , Hideki Makinoshima, Hiroyuki Wakaguri, Hiroyasu Esumi, Sumio Sugano, Takashi Kohno, Katsuya Tsuchihara, Yutaka Suzuki
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 42(22) ページ: 13557-13572
  • DOI: 10.1093/nar/gku885
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] パーソナルゲノム時代の研究ガバナンス (2014)
  • 著者名/発表者名: 三成寿作,加藤和人
  • 雑誌名: 医薬ジャーナル 巻: 50 ページ: 55-58
• [雑誌論文] Sex-specific Post-translational Regulation of the Gamete Fusogen GCS1 in the Isogamous Volvocine Alga Gonium pectorale. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kawai-Toyooka H, Mori T, Hamaji T, Suzuki M, Olson BJ, Uemura T, Ueda T, Nakano A, Toyoda A, Fujiyama A, Nozaki H.
  • 雑誌名: Eukaryot Cell. 巻: In Press, Mar 14.
  • 査読あり
• [雑誌論文] A biochemical landscape of A-to-I RNA editing in the human brain transcriptome (2014)
  • 著者名/発表者名: Sakurai, M., Ueda, H., Yano, T., Okada, S., Terajima, H., Mitsuyama, T., Toyoda, A., Fujiyama, A., Kawabata, H. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: Genome Res. 巻: 24 ページ: 522-534
  • DOI: 10.1101/gr.162537.113
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Molecular epidemiology and clinical spectrum of hereditary spastic paraplegia in the Japanese population based on comprehensive mutational analyses. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H, Takahashi Y, Hayashi T, Saito K, Furuya H, Watanabe M, Murata M, Suzuki M, Sugiura A, Sawai S, Shibuya K, Ueda N, Ichikawa Y, Kanazawa I, Goto J and Tsuji S
  • 雑誌名: J. Hum. Genet. 巻: 59 ページ: 163-172
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.139
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Lessons from genome-wide search for disease-related genes with special reference to HLA-disease associations. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga K
  • 雑誌名: Genes (Basel) 巻: 5 ページ: 84-96
  • DOI: 10.3390/genes5010084
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome-wide association study of HPV-associated cervical cancer in Japanese women. (2014)
  • 著者名/発表者名: Miura K, Mishima H, Kinoshita A, Hayashida C, Abe S, Tokunaga K, Masuzaki H, Yoshiura KI.
  • 雑誌名: J. Med. Virol. 巻: 86 (7) ページ: 1153-1158
  • DOI: 10.1002/jmv.23943
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Lack of genetic association between TREM2 and late-onset Alzheimer’s disease in a Japanese population. (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyashita A, et al.
  • 雑誌名: J Alzheimers Dis 巻: 印刷中
  • 査読あり
• [雑誌論文] Origin of methane in serpentinite-hosted hydrothermal systems: The CH4-H2-H2O hydrogen isotope systematics of the Hakuba Happo hot spring (2014)
  • 著者名/発表者名: Suda, K., Ueno, Y., Yoshizaki, M., Nakamura, H., Kurokawa, K., Nishiyama, E., Yoshino, K., Hongoh, Y., Kawachi, K., Omori, S., Yamada, K., Yoshida, N., Maruyama, S.
  • 雑誌名: Earth Planetary Sci. Lett. 巻: 386 ページ: 112-125
  • DOI: 10.1016/j.epsl.2013.11.001
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A novel small regulatory RNA accelerates cell motility in enterohemorrhagic Escherichia coli (2014)
  • 著者名/発表者名: Sudo N, Soma A, Muto A, Iyoda S, Suh M, Kurihara N, Abe H, Tobe T, Ogura Y, Hayashi T, Kurokawa K,Ohinishi M, Sekine Y
  • 雑誌名: J. Gen. Appl. Microbiol. 巻: 60(1) 号: 1 ページ: 44-50
  • DOI: 10.2323/jgam.60.44
  • NAID: 130004802264
  • ISSN: 0022-1260, 1349-8037
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of the complete plastid genome of the unicellular red alga Porphyridium purpureum (2014)
  • 著者名/発表者名: Tajima N, Sato S,Maruyama F,Kurokawa K,Ohta H, Tabata S, Sekine K, Moriyama T, Sato N
  • 雑誌名: J Plant Res. 巻: 127 ページ: 389-397
  • DOI: 10.1007/s10265-014-0627-1
  • NAID: 40020051727
  • 査読あり
• [雑誌論文] A recurrent de novo FAM111A mutation causes Kenny–Caffey syndrome type 2. (2014)
  • 著者名/発表者名: Isojima T, Doi K, Mitsui J, Oda Y, Tokuhiro E, Yasoda A, Yorifuji T, Horikawa R, Yoshimura J, Ishiura H, Morishita S, Tsuji S, and Kitanaka S.
  • 雑誌名: J Bone Miner Res. 巻: 29 ページ: 992-8
  • DOI: 10.1002/jbmr.2091
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Dissection of the Octoploid Strawberry Genome by Deep Sequencing of the Genomes of Fragaria Species (2014)
  • 著者名/発表者名: Hideki Hirakawa, et al.
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 21 ページ: 169-181
  • DOI: 10.1093/dnares/dst049
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tetrahedral gray code for visualization of genome information (2014)
  • 著者名/発表者名: Ichinose N, Yada T, Gotoh O
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9(1)
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0086133
  • 査読あり
• [雑誌論文] ヒトメタゲノムの大規模コホート研究 (2014)
  • 著者名/発表者名: 森宙史，山田拓司，黒川顕
  • 雑誌名: 生物の科学「遺伝」 巻: 67(3) ページ: 279-282
• [雑誌論文] Reflections on the Cost of "Low-Cost" Whole Genome Sequencing: Framing the Health Policy Debate. (2013)
  • 著者名/発表者名: Timothy Caulfield, et al.
  • 雑誌名: PLoS Biology 巻: 11(11)
  • DOI: 10.1371/journal.pbio.1001699
  • 査読あり
• [雑誌論文] ERBB4 Mutations that Disrupt the Neuregulin-ErbB4 Pathway Cause Amyotrophic Lateral Sclerosis Type 19. (2013)
  • 著者名/発表者名: Takahashi Y, Fukuda Y, Yoshimura J, Toyoda A, (33名省略）, Morishita S, Goto J and Tsuji S.
  • 雑誌名: Am J Hum Genet. 巻: 93 ページ: 900-5
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2013.09.008
  • 査読あり
• [雑誌論文] Coelacanth genomes reveal a variety of signatures for evolutionary transition from water to land (2013)
  • 著者名/発表者名: Nikaido M, Noguchi, H, Nishihara H, Toyoda A, Suzuki Y, Kajitani R, Suzuki H, Okuno M, Aibara M, Ngatunga BP, Mzighani SI, Kalombo HW, Masengi KW, Tuda J, Nogami S, Maeda R, Iwata M, Abe Y, Fujimura K, Okabe M, Amano T, Maeno A, Shiroishi T, Itoh T, Sugano S, Kohara Y, Fujiyama A, Okada N.
  • 雑誌名: Genome research 巻: 23巻10号 ページ: 1740-1748
  • DOI: 10.1101/gr.158105.113
  • 査読あり
• [雑誌論文] Draft assembly of the Symbiodinium minutum nuclear genome reveals dinoflagellate gene structure (2013)
  • 著者名/発表者名: Shoguchi1, E., Shinzato, C., Kawashima, T., Gyoja, F., et al.
  • 雑誌名: Curr Biol. 巻: 23 ページ: 1399-1408
  • DOI: 10.1016/j.cub.2013.05.062
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of Genomic and Epigenomic Expression in Monozygotic Twins Discordant for Rett Syndrome. (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyake K, Yang C, Minakuchi Y, Ohori K, Soutome M, Hirasawa T, Kazuki Y, Adachi N, Suzuki S, Itoh M, Goto YI, Andoh T, Kurosawa H, Oshimura M, Sasaki M, Toyoda A, Kubota T.
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 8(6)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Lineage specifice xpansion of V2R receptor (OlfC) genes in cichlids may contribute to diversification in amino acid detection (2013)
  • 著者名/発表者名: Nikaido M, Suzuki H, Toyoda A, FujiyamaA, Hagino-Yamagishi K, Kocher TD, Carleton KL, Okada N
  • 雑誌名: Genome Biol Evol. 巻: Evol.5 ページ: 711-722
  • DOI: 10.1093/gbe/evt041
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functionally distinct Gata3/Chd4 complexes coordinately establish T helper 2 (Th2) cell identity. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hosokawa H
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 巻: - ページ: 4691-4696
  • DOI: 10.1073/pnas.1220865110
  • 査読あり
• [雑誌論文] The comprehensive epigenome map of piRNA clusters. (2013)
  • 著者名/発表者名: .Kawaoka S, Hara K, Shoji K, Kobavashi M、Shimada T, Sugano S, Tomari Y, Suzuki Y, *Katsuma S
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 41(3) ページ: 1581-1590
  • DOI: 10.1093/nar/gks1275
  • 査読あり
• [雑誌論文] Treg induction by a rationally selected mixture of Clostridia strains from the human microbiota (2013)
  • 著者名/発表者名: Koji Atarashi, Takeshi Tanoue, et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 500 ページ: 232-236
  • DOI: 10.1038/nature12331
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of ATP1A3 mutations by exome sequencing as the cause of alternating hemiplegia of childhood in Japanese patients. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ishii A, Saito Y, Mitsui J, Ishiura H, Yoshimura J, Arai H, Yamashita S, Kimura S, Oguni H, Morishita S, Tsuji S, Sasaki M, Hirose S.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 8
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0056120
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in COQ2 in familial and sporadic multiple-system atrophy. (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, et. al.
  • 雑誌名: New Engl J Med 巻: 369 ページ: 233-244
  • DOI: 10.1056/nejmoa1212115
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hereditary spastic paraplegia type 43 (SPG43) is caused by mutation in C19ORF12. (2013)
  • 著者名/発表者名: Landouré G, et al
  • 雑誌名: Human Mutation 巻: 34 ページ: 1357-1360
  • DOI: 10.1002/humu.22378
  • 査読あり
• [雑誌論文] 東大病院ゲノム医学センターにおける取り組み． (2013)
  • 著者名/発表者名: 三井 純，石浦 浩之，辻 省次．
  • 雑誌名: Brain and Nerve 巻: 65 ページ: 247-255
• [雑誌論文] SORL1 is genetically associated with late-onset Alzheimer's disease in Japanese, Koreans and Caucasians (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyashita A, Shoji M, Ikeda M, Alzheimer Disease Genetics Consortium
  • 雑誌名: PLoS One. 巻: 8
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0058618
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study of atypical psychosis (2013)
  • 著者名/発表者名: 金沢 徹文 他
  • 雑誌名: Am. J. Med. Genet. 巻: 162 ページ: 679-686
  • DOI: 10.1002/ajmg.b.32164
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evidence for shared genetic risk between methamphetamine-induced psychosis and schizophrenia (2013)
  • 著者名/発表者名: 池田 匡志 他
  • 雑誌名: Neuropsychopharmacology, 巻: 38 ページ: 1864-1870
  • DOI: 10.1038/npp.2013.94
  • 査読あり
• [雑誌論文] SORL1 is genetically associated with neuropathologically characterized late-onset Alzheimer's disease (2013)
  • 著者名/発表者名: Wen Y, Miyashita A, Kitamura N, Tsukie T, Saito Y, Hatsuta H, Murayama S, et al.
  • 雑誌名: Journal of Alzheimer's Disease 巻: 35(2) ページ: 387-387
  • DOI: 10.3233/jad-122395
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole-genome sequence of the purple photosynthetic bacterium Rhodovulum sulfidophilum strainW4 (2013)
  • 著者名/発表者名: Masuda M, Hori K, Maruyama F, Ren S, Sugimoto S, Yamamoto N, Mori H, Yamada T, Sato S, Tabata S, Ohta H, Kurokawa K
  • 雑誌名: Genome Announc. 巻: 1(4)
  • DOI: 10.1128/genomea.00577-13
  • 査読あり
• [雑誌論文] Updating the Vibrio clades defined by multilocus sequence phylogeny: Proposal of eight new clades, and the description of Vibrio tritonius sp. nov. (2013)
  • 著者名/発表者名: Sawabe T, Ogura Y, Matsumura Y, Gao F, Amin A, Mino S, Nakagawa S, Sawabe T, Kumar R, Fukui Y, Satomi M, Matsushima R, Thompson F, Gomez-Gil B, Christen R, Maruyama F, Kurokawa K, Hayashi T
  • 雑誌名: Frontiers in Aquatic Microbiol. 巻: 4 ページ: 1-14
  • 査読あり
• [雑誌論文] Segmental duplications in the silkworm genome. (2013)
  • 著者名/発表者名: Zhao Q, Zhu Z, Kasahara M, Morishita S, Zhang Z.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 14(1) ページ: 521-521
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exome analysis reveals a Japanese family with spinocerebellar ataxia, autosomal recessive 1. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ichikawa Y, Ishiura H, Mitsui J, Takahashi Y, Kobayashi S, Takuma H, Kanazawa I, Doi K, Yoshimura J, Morishita S, Goto J, Tsuji S
  • 雑誌名: J Neurological Sciences 巻: 331 ページ: 158-160
  • DOI: 10.1016/j.jns.2013.05.018
  • 査読あり
• [雑誌論文] Coordinated changes in DNA methylation in antigen-specific memory CD4 T cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hashimoto S, Ogoshi K, Sasaki A, Abe J, Qu W, Nakatani Y, Ahsan B, Oshima K, Shand FH, Ametani A, Suzuki Y, Kaneko S, Wada T, Hattori M, Sugano S, Morishita S, Matsushima K.
  • 雑誌名: J Immunol. 巻: 190(8) ページ: 4076-4091
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of base-pairing probabilities of RNA molecules involved in protein-RNA interactions (2013)
  • 著者名/発表者名: Junichi Iwakiri, Tomoshi Kameda, Kiyoshi Asai, Michiaki Hamada
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 29 ページ: 2524-2528
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btt453
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CentroidAlign-Web : A Fast and Accurate Multiple Aligner for Long Non-Coding RNAs (2013)
  • 著者名/発表者名: Haruka Yonemoto, Kiyoshi Asai, Michiaki Hamada
  • 雑誌名: Int. J. Mol. Sci. 巻: 14 ページ: 6144-6156
  • DOI: 10.3390/ijms14036144
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] PBSIM: PacBio reads simulator--toward accurate genome assembly (2013)
  • 著者名/発表者名: Yukiteru Ono, Kiyoshi Asai, Michiaki Hamada
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 29 ページ: 119-121
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts649
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sequence Analysis of the Genome of Carnation (Dianthus caryophyllus L.) (2013)
  • 著者名/発表者名: Masafumi Yagi, Shunichi Kosugi, Hideki Hirakawa et al.(他24名)
  • 雑誌名: DNA Res 巻: (Epub ahead of print)
  • DOI: 10.1093/dnares/dst053
  • 査読あり
• [雑誌論文] DDBJ Read Annotation Pipeline: a cloud computing-based pipeline for high-throughput analysis of new-generation sequencing data. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki, H., Mochizuki, T., Kodama, Y., Saruhashi, S., Morizaki, S., Sugawara, H., Ohyanagi, H., Kurata, N., Okubo, K., Takagi, T., Kaminuma, E., Nakamura, Y.
  • 雑誌名: DNA Res. 巻: 20 ページ: 383-390
  • DOI: 10.1093/dnares/dst017
  • NAID: 130006998625
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] An extended genovo metagenomic assembler by incorporating paired-end information (2013)
  • 著者名/発表者名: Afiahayati, Sato K., Sakakibara Y.
  • 雑誌名: PeerJ 巻: 1
  • DOI: 10.7717/peerj.196
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of a rifampicin-resistant Bacillus subtilis strain for natto-fermentation showing enhanced exoenzyme production. (2013)
  • 著者名/発表者名: Yuji Kubo
  • 雑誌名: Journal of Bioscience and Bioengineering 巻: 115 号: 6 ページ: 654-657
  • DOI: 10.1016/j.jbiosc.2012.12.012
  • NAID: 110009614950
  • ISSN: 1389-1723
  • 査読あり
• [雑誌論文] Screening for candidate genes involved in the production of mouse subventricular zone proliferative cells and an estimation of their changes in evolutionary pressure during primate evolution (2013)
  • 著者名/発表者名: Tabata H, Hachiya T, Nagata K, Sakakibara Y, Nakajima K
  • 雑誌名: Front. Neuroanat 巻: 7 ページ: 24-24
  • DOI: 10.3389/fnana.2013.00024
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identical genomic organization of two hemichordate hox clusters. (2013)
  • 著者名/発表者名: Freeman R, Ikuta T, Wu M, Koyanagi R, Kawashima T, Tagawa K, Humphreys T, Fang GC, Fujiyama A, Saiga H, Lowe C, Worley K, Jenkins J, Schmutz J, Kirschner M, Rokhsar D, Satoh N, Gerhart J.
  • 雑誌名: Curr. Biol. 巻: 22 ページ: 129-129
  • DOI: 10.1016/j.cub.2012.08.052
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exome sequencing identifies novel rheumatoid arthritis-susceptible variants in the BTNL2. (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsunaga S, Hosomichi K, Okudaira Y, Nakaoka H, Kunii N, Suzuki Y, Kuwana M, Sato S, Kaneko Y, Homma Y, Kashiwase K, Azuma F, Kulski JK, Inoue I, Inoko H.
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 58 ページ: 210-215
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.2
  • NAID: 40019642228
  • 査読あり
• [雑誌論文] ATF6α/β-mediated Adjustment of ER Chaperone Levels Is Essential for Development of the Notochord in Medaka Fish. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa T
  • 雑誌名: Mol Biol Cell. 巻: 8.2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functionally distinct Gata3/Chd4 complexes coordinately establish T helper 2 (Th2) cell identity. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hosokawa H
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. 巻: 110(12) ページ: 4691-4696
  • DOI: 10.1073/pnas
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondrial and plastid genomes of the colonial green alga Gonium pectorale give insights into the origins DNA architecture within the Volvocales. (2013)
  • 著者名/発表者名: Takashi Hamaji
  • 雑誌名: PLoS ON 巻: 8
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0057177
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complete genome sequence of a Propionibacterium acnes isolate from a sarcoidosis patient. (2013)
  • 著者名/発表者名: Minegishi K, Aikawa C, Furukawa A, Watanabe T, Nakano T, Ogura Y, Ohtsubo Y, Kurokawa K, Hayashi T, Maruyama F, Nakagawa I, Eishi Y
  • 雑誌名: Genome Announcment 巻: 1 ページ: 1-1
  • DOI: 10.1128/genomea.00016-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-Resolution Mapping of In vivo Genomic Transcription Factor Binding Sites Using In situ DNase I Footprinting and ChIP-seq (2013)
  • 著者名/発表者名: Onuma Chumsakul
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 20
  • DOI: 10.1093/dnares/dst013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcriptomic analysis of four developmental stages of Strongyloides venezuelensis (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagayasu E, Ogura Y, Itoh T, Yoshida A, Chakraborty G, Hayashi T, Maruyama H
  • 雑誌名: Parasitol Int. 巻: 62(1) ページ: 57-65
  • DOI: 10.1016/j.parint.2012.09.006
  • 査読あり
• [雑誌論文] miRNA-target prediction based on transcriptional regulation (2013)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara,T., Yada,T.
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 14(Suppl.2)
  • DOI: 10.1186/1471-2164-14-s2-s3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Finding Protein-Coding Genes through Human Polymorphisms. (2013)
  • 著者名/発表者名: Wijaya E
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 8(1)
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0054210
  • 査読あり
• [雑誌論文] パーソナルゲノム研究の倫理的課題 (2013)
  • 著者名/発表者名: 加藤和人
  • 雑誌名: BRAIN and NERVE 巻: 65 ページ: 267-272
• [雑誌論文] 「ヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する倫理指針」の改定をめぐる批判的談話分析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 野村安以
  • 雑誌名: 年報科学・技術・社会 巻: 22
  • 査読あり
• [雑誌論文] CSF1R mutations identified in three families with autosomal dominantly inherited leukoencephalopathy. (2012)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Matsukawa T, Ishiura H, Higasa K, Yoshimura J, Saito TL, Ahsan B, Takahashi Y, Goto J, Iwata A, Niimi Y, Riku Y, Goto Y, Mano K, Yoshida M, Morishita S, Tsuji S.
  • 雑誌名: Amer. J. Med. Genet. Neuropsych. Genet. 巻: 159B(8) ページ: 951-7
  • DOI: 10.1002/ajmg.b.32100
  • 査読あり
• [雑誌論文] Associations between six classical HLA loci and rheumatoid arthritis: a comprehensive analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: S. Mitsunaga, Y. Suzuki, M. Kuwana, S. Sato, Y. Kaneko, Y. Homma, A. Narita, K. Kashiwase, Y. Okudaira, I. Inoue, J. K. Kulski and H. Inoko
  • 雑誌名: Tissue Antigen 巻: Vol.80 ページ: 16-25
  • DOI: 10.1111/j.1399-0039.2012.01872.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Next-generation sequencing: impact of exome sequencing in characterizing Mendelian disorders. (2012)
  • 著者名/発表者名: Rabbani B, et al.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57 ページ: 621-632
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.91
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meta-analysis identifies common variants associated with body mass index in east Asians (2012)
  • 著者名/発表者名: Wen W, et al
  • 雑誌名: Nat. Genet. 巻: 44 ページ: 1007-1015
  • DOI: 10.1038/ng.1087
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ezh2 augments leukemogenecity by reinforcing differentiation blockage in acute myeloid leukemia (2012)
  • 著者名/発表者名: Tanaka S
  • 雑誌名: Blood. 巻: 120 ページ: 1107-1117
  • DOI: 10.1182/blood-2011-11-394932
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association studies of tuberculosis in Asians (2012)
  • 著者名/発表者名: Mahasirimongkol S, Yanai H, Mushiroda T, Promphittayarat W, Wattanapokayakit S, Promjai J, Yuliwulandari R, Wichukchinda N, Yowang A, Yamada N, Kantipong P, Takahashi A, Kubo M, Sawanpanyalert P, Kamatani N, Nakamura Y, Tokunaga K
  • 雑誌名: J. Hum. Genet. 巻: 57巻(6) ページ: 363-367
  • DOI: 10.1038/jhg.2012.35
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study confirming association of HLA-DP with protection against chronic hepatitis B and viral clearance in Japanese and Korean. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishida N, Asahina Y, Mizokami M et al
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 7
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0039175
  • 査読あり
• [雑誌論文] Common variants on chromosome 9p21 are associated with normal tension glaucoma (2012)
  • 著者名/発表者名: Takamoto M
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 7
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0040107
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study identifies TNFSF15 and POU2AF1 as susceptibility loci for primary biliary cirrhosis in the Japanese population. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakamura M
  • 雑誌名: Am. J. Hum. Genet. 巻: 91 ページ: 721-728
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2012.08.010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meta-analysis of genome-wide association studies for panic disorder in Japanese population. (2012)
  • 著者名/発表者名: Otowa T 1/32, Umekage T 17/32, Sasaki T 32/32
  • 雑誌名: Psychiatry 巻: 13;2 ページ: 1-8
  • DOI: 10.1038/tp.2012.89
  • 査読あり
• [雑誌論文] A homozygous mutation of C12orf65 causes spastic paraplegia with optic atrophy and neuropathy (SPG55) (2012)
  • 著者名/発表者名: Shimazaki H, Takiyama Y, Ishiura H, Sakai C, Matsushima Y, Hatakeyama H, Honda J, Sakoe K, Naoi T, Namekawa M, Fukuda Y, Takahashi Y, Goto J, Tsuji S, Goto Y, Nakano I
  • 雑誌名: Journal of medical genetics 巻: 49(12) ページ: 777-784
  • DOI: 10.1136/jmedgenet-2012-101212
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide genetic variations are highly correlated with proximal DNA methylation patterns (2012)
  • 著者名/発表者名: Qu W, Hashimoto S, Shimada A, Nakatani Y, Ichikawa K, Saito TL, Ogoshi K, Matsushima K, Suzuki Y, Sugano S, Takeda H, Morishita S.
  • 雑誌名: Genome Research 巻: 22 ページ: 1419-1425
  • DOI: 10.1101/gr.140236.112
  • 査読あり
• [雑誌論文] Altered expression of testis-specific genes, piRNAs, and transposons in the silkworm ovary masculinized by a W chromosome mutation (2012)
  • 著者名/発表者名: Hara Kahori
  • 雑誌名: BMC Genomics. 巻: (in press) ページ: 119-119
  • DOI: 10.1186/1471-2164-13-119
  • 査読あり
• [雑誌論文] A role for transcription from a piRNA cluster in de novo piRNA production (2012)
  • 著者名/発表者名: Kawaoka S
  • 雑誌名: RNA. 巻: 18(2) ページ: 265-273
  • DOI: 10.1261/rna.029777.111
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide determination of RNA stability reveals hundreds of short-lived non-coding transcripts in mammals (2012)
  • 著者名/発表者名: Tani, H.
  • 雑誌名: Genome Res. 巻: (in press) ページ: 947-956
  • DOI: 10.1101/gr.130559.111
  • 査読あり
• [雑誌論文] A central coupler for recombination initiation linking chromosome architecture to S phase checkpoint. (2012)
  • 著者名/発表者名: 三好知一郎
  • 雑誌名: Mol. Cell 巻: 14 ページ: 722-733
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2012.06.023
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of hundreds of novel UPF1 target transcripts by direct determining whole transcriptome stability in mammalian cells (2012)
  • 著者名/発表者名: H.Tani
  • 雑誌名: RNA Biol. 巻: 9 ページ: 1370-1379
  • DOI: 10.4161/rna.22360
  • 査読あり
• [雑誌論文] 同じ病原菌種内での菌株の違いをゲノムからみる：病原性大腸菌を例として (2012)
  • 著者名/発表者名: 林哲也
  • 雑誌名: Neuroinfection 巻: 17(1) ページ: 26-34
• [雑誌論文] 腸管出血性大腸菌における病原性のゲノム進化. (2012)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊
  • 雑誌名: 感染・炎症・免疫 巻: 42 ページ: 182-195
• [雑誌論文] MetaVelvet: an extension of Velvet assembler to de novo metagenome assembly from short sequence reads (2012)
  • 著者名/発表者名: Namiki, T., Hachiya, T., Tanaka, H., and Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 40
  • DOI: 10.1093/nar/gks678
  • 査読あり
• [雑誌論文] An efficient algorithm for de novo predictions of biochemical pathways between chemical compounds (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, M., Hachiya, T., Saito, Y., Sato, K., and Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 13
  • DOI: 10.1186/1471-2105-13-s17-s8
  • 査読あり
• [雑誌論文] DAFS: simultaneous aligning and folding of RNA sequences via dual decomposition (2012)
  • 著者名/発表者名: Kengo Sato, Yuki Kato, Tatsuya Akutsu, Kiyoshi Asai, Yasubumi Sakakibara
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 28 ページ: 3218-3224
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts612
  • 査読あり
• [雑誌論文] GHOSTM: A GPU-Accelerated Homology Search Tool for Metagenomics (2012)
  • 著者名/発表者名: Suzuki S, Ishida T, Kurokawa K, Akiyama Y
  • 雑誌名: PLoS one 巻: 7 ページ: 1-8
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0036060
  • 査読あり
• [雑誌論文] A classification of bioinformatics algorithms from the viewpoint of maximizing expected accuracy (MEA) (2012)
  • 著者名/発表者名: Michiaki Hamada, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: J. Comput Biol 巻: 19 ページ: 532-549
  • DOI: 10.1089/cmb.2011.0197
  • 査読あり
• [雑誌論文] A mostly traditional approach improves alignment of bisulfite-converted DNA. (2012)
  • 著者名/発表者名: Martin C Frith
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40(13)
  • DOI: 10.1093/nar/gks275
  • 査読あり
• [雑誌論文] Shape-based alignment of genomic landscapes in multi-scale resolution. (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Ashida
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40(14) ページ: 6435-6448
  • DOI: 10.1093/nar/gks354
  • 査読あり
• [雑誌論文] ELSI 2.0 for Genomics and Society (2012)
  • 著者名/発表者名: Jane Kaye
  • 雑誌名: SCIENCE 巻: 336 ページ: 673-674
  • DOI: 10.1126/science.1218015
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epigenetic regulation of monoallelic gene expression (2012)
  • 著者名/発表者名: Shiba,H.
  • 雑誌名: Development Growth and Differentiation 巻: 54 ページ: 120-128
  • DOI: 10.1111/j.1440-169x.2011.01317.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Imprinted DNA methylation reprogramming during early mouse embryogenesis at the Gpr1-Zdbf2 locus is linked to long cis-intergenic transcription (2012)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi H, Sakurai T, Sato S, Nakabayashi K, Hata K, Kono T
  • 雑誌名: FEBS Lett. 巻: 23;586(6) ページ: 827-833
  • DOI: 10.1016/j.febslet.2012.01.059
  • 査読あり
• [雑誌論文] Contribution of intragenic DNA methylation in mouse gametic DNA methylomes to establish oocyte-specific heritable marks (2012)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi H, Sakurai T, Imai M, Takahashi N, Fukuda A, Yayoi O, Sato S, Nakabayashi K, Hata K, Sotomaru Y, Suzuki Y, Kono T
  • 雑誌名: PLoS Genet. 巻: 8(1)
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1002440
  • NAID: 120005300482
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association between six classical HLA loci and rheumatoid arthritis : a comprehensive analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: Mitsunaga S, et al.
  • 雑誌名: Tissue Antigens 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meta-analysis identifies nine new loci associated with rheumatoid arthritis in the Japanese population (2012)
  • 著者名/発表者名: Okada Y, Terao C, Ikari K, Kochi Y, Ohmura K, Suzuki A, Kawaguchi T, Stahl EA, Kurreeman FA, Nishida N, Ohmiya H, Myouzen K, Takahashi M, Sawada T, Nishioka Y, Yukioka M, Matsubara T, Wakitani S, Teshima R, Tohma S, Takasugi K, Shimada K, Murasawa A, Honjo S, Matsuo K, Tanaka H, Tajima K, Suzuki T, Iwamoto T, Kawamura Y, Tanii H, Okazaki Y, Sasaki T, Gregersen PK, Padyukov L, Worthington J, Siminovitch KA, Lathrop M, Taniguchi A, Takahashi A, Tokunaga K, Kubo M, Nakamura Y, Kamatani N, Mimori T, Plenge RM, Yamanaka H, Momohara S, Yamada R, Matsuda F, Yamamoto K.
  • 雑誌名: Nat. Genet. 巻: (in press) ページ: 511-516
  • DOI: 10.1038/ng.2231
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transformations for the compression of FASTQ quality scores of next-generation sequencing data (2012)
  • 著者名/発表者名: Raymond Wan, Vo Ngoc Anh, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 28 ページ: 628-635
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btr689
  • 査読あり
• [雑誌論文] RecountDB : a database of mapped and count corrected transcribed sequences (2012)
  • 著者名/発表者名: Edward Wijaya, Martin C Frith, Kiyoshi Asai, Paul Horton
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 40
  • DOI: 10.1093/nar/gkr1172
  • 査読あり
• [雑誌論文] SAMSCOPE: An OpenGL based real-time interactive scale-free SAM viewer (2012)
  • 著者名/発表者名: Popendorf, K. and Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 28 ページ: 1276-1277
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts122
  • 査読あり
• [雑誌論文] COPICAT : A software system for predicting interactions between proteins and chemical compounds (2012)
  • 著者名/発表者名: Sakakibara, Y., Hachiya, T., Uchida, M., Nagamine, N., Sugawara, Y., Yokota, M., Nakamura, M., Popendorf, K., Komori, T., Sato, K.
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 28 ページ: 745-746
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts031
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large-scale motif discovery using DNA Gray code and equiprobable oligomers (2012)
  • 著者名/発表者名: Ichinose,N., Yada,T.,Gotoh,O.
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 28 ページ: 25-31
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btr606
  • NAID: 120004873969
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of tammar wallaby SIRH12, derived from a marsupial-specific retrotransposition event (2011)
  • 著者名/発表者名: Ono R., et.al.
  • 雑誌名: DNA Res. 巻: 18(4) ページ: 211-219
  • DOI: 10.1093/dnares/dsr012
  • 査読あり
• [雑誌論文] Linear regression models predicting strength of transcriptional activity of promoters (2011)
  • 著者名/発表者名: Yada T, Yoshida K, Morita M, Taniguchi T, Irie T, Suzuki Y
  • 雑誌名: Genome Inform. 巻: 25 ページ: 53-60
  • NAID: 130004567843
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis reveals unique regulation of transcription of Th2-specific genes by GATA3 (2011)
  • 著者名/発表者名: Horiuchi, S., Onodera, A., Hosokawa, H., Watanabe, Y., Tanaka, T., Sugano, S., SuzukiY. Nakayama, T
  • 雑誌名: J.Immunol 巻: 186 ページ: 6378-6389
  • DOI: 10.4049/jimmunol.1100179
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Systems Genetics Approach Provides a Bridge from Discovered Genetic Variants to Biological Pathways in Rheumatoid Arthritis (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakaoka Hirofumi; Cui Tailin; Tajima Atsushi, et al
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6:9
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0025389
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exact break point of a 50 kb deletion 8 kb centromeric of the HLA-A locus with HLA-A*24:02 : the same deletion observed in other A*24 alleles and A*23:01 allele (2011)
  • 著者名/発表者名: Mitsunaga Shigeki; Okudaira Yuko; Kunii Nanae, et al
  • 雑誌名: Immunogenetics. 巻: 63:8 ページ: 467-474
  • DOI: 10.1007/s00251-011-0521-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study identified ITPA/DDRGK1 variants reflecting thrombocytopenia in pegylated interferon and ribavirin therapy for chronic hepatitis C (2011)
  • 著者名/発表者名: Tanaka Y, et al.
  • 雑誌名: Hum.Mol.Genet. 巻: 20 ページ: 3507-3516
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genome-wide CNV association study on panic disorder in a Japanese population (2011)
  • 著者名/発表者名: Kawamura Y., et al
  • 雑誌名: J.Hum.Genet. 巻: 56 ページ: 852-6
  • DOI: 10.1038/jhg.2011.117
  • NAID: 10030661967
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide profiling of DNA methylation in human cancer cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Ogoshi K, et al.
  • 雑誌名: Genomics 巻: 98 ページ: 280-287
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sequence-specific error profile of Illumina sequencers (2011)
  • 著者名/発表者名: Kensuke Nakamura, 他
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 39
  • DOI: 10.1093/nar/gkr344
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enterotypes of the human gut microbiome (2011)
  • 著者名/発表者名: Arumugam, M., et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 473 ページ: 174-180
  • DOI: 10.1038/nature09944
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Lifestyle of the Segmented Filamentous Bacterium : A Non-Culturable Gut-Associated Immunostimulating Microbe Inferred by Whole-Genome Sequencing (2011)
  • 著者名/発表者名: Kuwahara T, et al
  • 雑誌名: DNA Res. 巻: 18 ページ: 291-303
  • DOI: 10.1093/dnares/dsr022
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcription factor GreA contributes to resolve promoter proximal pausing of RNA polymerase in B.subtilis cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Kusuya, Y., et al.
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 巻: 193 ページ: 3090-3099
  • DOI: 10.1128/jb.00086-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Probabilistic alignments with quality scores : an application to short-read mapping toward accurate SNP/indel detection (2011)
  • 著者名/発表者名: Michiaki Hamada, Edward Wijaya, Martin C Frith, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 27 ページ: 3085-3092
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btr537
  • 査読あり
• [雑誌論文] A detailed investigation of accessibilities around target sites of siRNAs and miRNAs (2011)
  • 著者名/発表者名: Hisanori Kiryu, Goro Terai, Osamu Imamura, Hiroyuki Yoneyama, Kenji Suzuki, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 27 ページ: 1788-1797
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btr276
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improved measurements of RNA structure conservation with generalized centroid estimators (2011)
  • 著者名/発表者名: Okada, Y., Saito, Y., Sato, K., Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: Frontiers in Genetics 巻: 2 ページ: 54-54
  • 査読あり
• [雑誌論文] Predicting promoter activities of primary human DNA sequences (2011)
  • 著者名/発表者名: Irie,T., Park,S.-J., Yamashita,R., Seki,M., Yada,T., Sugano,S., Nakai,K., Suzuki,Y.
  • 雑誌名: Nucl.Acids Res. 巻: 39
  • DOI: 10.1093/nar/gkr173
  • 査読あり
• [雑誌論文] Predicting promoter activities of primary human DNA sequences (2011)
  • 著者名/発表者名: Irie T, Park SJ, Yamashita R, Seki M, Yada T, Sugano S, Nakai K, Suzuki Y
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 39(11)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Particular human leukocyte antigen alleles are associated with biochemical traits in the Japanese population (2011)
  • 著者名/発表者名: Mitsunaga S, et al
  • 雑誌名: Human Immunology 巻: 72 ページ: 566-570
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exome resequencing combined with linkage analysis identifies novel PTH1R variants in a primary failure of tooth eruption in Japanese (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, et al
  • 雑誌名: Journal of Bone and Mineral Research 巻: 26 ページ: 1655-1661
  • 査読あり
• [雑誌論文] Generalized centroid estimators in bioinformatics (2011)
  • 著者名/発表者名: Michiaki Hamada, Hisanori Kiryu, Wataru Iwasaki, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Improving the accuracy of predicting secondary structure for aligned RNA sequences (2011)
  • 著者名/発表者名: Michiaki Hamada, Kengo Sato, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 39 ページ: 393-402
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fast and accurate clustering of noncoding RNAs using ensembles of sequence alignments and secondary structures (2011)
  • 著者名/発表者名: Saito, Y., Sato, K., Sakakibara, Y.
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Science Communication : Significance for Genome-Based Personalized Medicine-A View from the Asia-Pacific (2010)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato, Kei Kano, Tetsuya Shirai
  • 雑誌名: Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine 巻: 8 ページ: 92-96
  • 査読あり
• [雑誌論文] STAT6-mediated displacement of polycomb by trithorax complex establishes long-term maintenance of GATA3 expression in T helper type 2 cells (2010)
  • 著者名/発表者名: Onodera A, Yamashita M, Endo Y, Kuwahara M, Tofukuji S, Hosokawa H, Kanai A, Suzuki Y, Nakayama T
  • 雑誌名: J.Exp.Med. 巻: 207 ページ: 2493-2506
  • 査読あり
• [雑誌論文] Common variants in the ATP2B1 gene are associated with susceptibility to hypertension : The Japanese Millennium Genome Project (2010)
  • 著者名/発表者名: Tabara Y, et al
  • 雑誌名: Hypertension 巻: 56 ページ: 973-980
  • 査読あり
• [雑誌論文] ITPA gene variant protects against anemia induced by pegylated interferon-α andribavirin therapy for Japanese patients with chronic hepatitis C (2010)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto N, et al
  • 雑誌名: Hepatol.Res. 巻: 40 ページ: 1063-1071
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meta-analysis of genome-wide association scans for genetic susceptibility to endometriosis in Japanese population (2010)
  • 著者名/発表者名: Adachi S, et al
  • 雑誌名: J.Hum.Genet. 巻: 55 ページ: 816-821
  • 査読あり
• [雑誌論文] TRPM7 is not associated with amyotrophic lateral sclerosis-parkinsonism dementiacomplex in the Kii peninsula of Japan (2010)
  • 著者名/発表者名: Hara K., et al
  • 雑誌名: Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet 巻: 153B ページ: 310-313
  • 査読あり
• [雑誌論文] Accelerating Path-free XML Queries in RDBMS (2010)
  • 著者名/発表者名: Wu H, Saito TL, Morishita S
  • 雑誌名: IPSJ Online Transaction 巻: 3 ページ: 206-217
  • NAID: 130000649560
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cost-effective sequencing of full-length cDNA clones powered by a de novo-reference hybrid assembly (2010)
  • 著者名/発表者名: Kuroshu RM, et al
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7
  • 査読あり
• [雑誌論文] VITCOMIC : visualization tool for taxonomic compositions of microbial communities based on 16S rRNA gene sequences (2010)
  • 著者名/発表者名: Mori, H., Maruyama, F., Kurokawa, K.
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 11 ページ: 332-332
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome comparison and phylogenetic analysis of Orientia tsutsugamushi strains (2010)
  • 著者名/発表者名: Nakayama, K., et al
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 17 ページ: 281-291
  • 査読あり
• [雑誌論文] RNA polymerase trafficking in Bacillus subtilis cells (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa, S., et al
  • 雑誌名: Journal of Bacteriology 巻: 192 ページ: 5778-5787
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prediction of RNA secondary structure by maximizing pseudo-expected accuracy (2010)
  • 著者名/発表者名: Michiaki Hamada, Kengo Sato, Kiyoshi Asai
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 11 ページ: 586-586
  • 査読あり
• [学会発表] Enhancer landscape dynamics and the role of IRF8 in mononuclear phagocyte development. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kurotaki D, Nakabayashi J, Nishiyama A, Sasaki H, Kaneko N, Koizumi S, Ozato K, Suzuki Y, Tamura T
  • 学会等名: 55th American Society of Hematology Annual Meeting and Exposition
  • 発表場所: Orlando, USA
  • 年月日: 2015-12-06
• [学会発表] R-Spondin1 promotes Paneth cell growth, maintains intestinal microbial ecology, and ameliorates graft-versus-host disease (2015)
  • 著者名/発表者名: Hayase E, Hashimoto D, Nakamura K, Ogura Y, Hayashi T, Kurokawa K, Ayabe T, and Teshima T.
  • 学会等名: 57th ASH Annual Meeting
  • 発表場所: Orlando, FL, USA
  • 年月日: 2015-12-06
• [学会発表] The identification of pistil-specific genes by global transcriptome analyses in tomato (Solanum lycopersicum). (2015)
  • 著者名/発表者名: Ezura K, Ji-Seong K, Mori K, Kuhara S, Suzuki Y, Ariizumi T and Ezura H.
  • 学会等名: The 12th Solanaceae Conference
  • 発表場所: Bordeaux, France
  • 年月日: 2015-10-25
• [学会発表] LAMPLINK: An additional function for PLINK to detect statistically significant genetic interactions (2015)
  • 著者名/発表者名: Terada A, Tsuda K, Sese J
  • 学会等名: American Society of Human Genetics
  • 発表場所: 米国ボルチモア
  • 年月日: 2015-10-06
• [学会発表] A novel causative gene for permanent tooth agenesis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, Hosomichim K, Kim YI, Yano K, Haga S, Katayama K, Park SB, Inoue I, Maki K.
  • 学会等名: 8th International Orthodontic Congress
  • 発表場所: London, UK
  • 年月日: 2015-09-27
  • 国際学会
• [学会発表] A highly resolved phylogenetic tree of Trichosporonales species based on multiple gene sequence analysis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Masako Takashima, Ri-ichiroh Manabe, Wataru Iwasaki, Akira Ohyama, Moriya Ohkuma, and Takashi Sugita.
  • 学会等名: 32nd International Specialized Symposium on Yeasts
  • 発表場所: Hotel Gio Centro Congressi, Perugia, Italy
  • 年月日: 2015-09-13
  • 国際学会
• [学会発表] The CpMinus1 gene, specifically localized on the mating-type minus genome, is responsible for the sex determination of heterothallic Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex (2015)
  • 著者名/発表者名: Komiya, A., Abe, J., Kawai, J., Suzuki, Y., Ootsuki, R., Tsuchikane, Y., Nishiyama, T., Sekimoto, H.
  • 学会等名: 6th European Phycological Congress
  • 発表場所: London, England
  • 年月日: 2015-08-25
• [学会発表] Adaptive evolution and ever metamorphosing DNA methylation systems (2015)
  • 著者名/発表者名: Hirokazu Yano, Yoshikazu Furuta, Zobaidul M. Alam, Emiko Rimbara, Hiroe Namba-Fukuyo, Tomoko Shibata, Tomoaki Nishiyama, Shuji Shigenobu, Mitsuyasu Hasebe, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Keigo Shibayama, Ichizo Kobayashi
  • 学会等名: 7th NEB Meeting on DNA Restriction and Modification
  • 発表場所: グダンスク、ポーランド
  • 年月日: 2015-08-24
• [学会発表] MiFish, a set of universal primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: Detection of >230 species from aquarium tanks and coral reefs in the subtropical western North Pacific. (2015)
  • 著者名/発表者名: Masaki Miya, Yukuto Sato, Tsukasa Fukunaga, Tetsuya Sado, Jan Yde Poulsen, Keiichi Sato, Toshifumi Minamoto, Satoshi Yamamoto, Hiroki Yamanaka, Hitoshi Araki, Michio Kondoh, and Wataru Iwasaki.
  • 学会等名: 6th International Barcode of Life Conference
  • 発表場所: University of Guelph, Canada
  • 年月日: 2015-08-19
  • 国際学会
• [学会発表] Network of DNA methyltransferase behind the adaptive phenotype in Helicobacteri pylori. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hirokazu Yano, Zobaidul M. Alam, Emiko Rimbara, Yoshikazu Furuta, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Keigo Shibayama, Ichizo Kobayashi
  • 学会等名: Gordon Research Conference, Microbial Population Biology
  • 発表場所: Andover, NH, USA
  • 年月日: 2015-07-19
• [学会発表] Genetic analysis of natural variations for cold habituation in C. elegans (2015)
  • 著者名/発表者名: Misaki Okahata, Akane Ohta, Yohei Minakuchi, Atsushi Toyoda, Atsushi Kuhara
  • 学会等名: 20th C. elegans International meeting
  • 発表場所: Los Angels, USA
  • 年月日: 2015-06-24
  • 国際学会
• [学会発表] The mechanisms of Copper acquisition and detoxification in Aspergillus fumigatus. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kusuya Y, Kurokawa K, Takahashi H.
  • 学会等名: ISHAM 2015
  • 発表場所: Melbourne, Australia
  • 年月日: 2015-05-04
  • 国際学会
• [学会発表] Methylome analysis of the 14q32.2 imprinted region in patients with imprinting defects on human chromosome 14. (2015)
  • 著者名/発表者名: Masayo Kagami, Takahide Hayano, Kazuyoshi Hosomichi, Kazuhiko Nakabayashi, Maki Fukami, Tsutomu Ogata, Ituro Inoue.
  • 学会等名: 2nd EUROPEAN IMPRINTING DISORDER SCHOOL COST Action BM1208
  • 発表場所: Paris, France
  • 年月日: 2015-05-04
• [学会発表] HLA解析ツール (2015)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹
  • 学会等名: Galaxy Workshop Tokyo 2015
  • 発表場所: 東京大学 先端科学技術研究センター
  • 年月日: 2015-04-28
  • 招待講演
• [学会発表] Visualizing translocation dynamics and nascent 1 transcript errors in paused RNA polymerases in vivo. (2015)
  • 著者名/発表者名: Imashimizu M, Takahashi H, Oshima T, McIntosh C, Bubunenko M, Court DL, Kashlev M.
  • 学会等名: NCI Symposium on Chromosome Biology
  • 発表場所: Bethesda, USA
  • 年月日: 2015-04-16
• [学会発表] アオサ藻綱ヒラアオノリのゲノム解読と雌雄ゲノムの比較による性決定領域の探索 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山﨑誠和, 鈴木亮吾, 市原健介, 豊田敦, 桑野和可, 鈴木穣, 河野重行
  • 学会等名: 日本藻類学会第39回大会
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 2015-03-20 – 2015-03-25
• [学会発表] 全ゲノム変異解析のためのパイプラインの構築 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石井 公太郎，平野 智也，風間 裕介，浜田 道昭，小野 幸輝，阿部 知子
  • 学会等名: 日本育種学会 第127回講演会
  • 発表場所: 玉川大学
  • 年月日: 2015-03-20
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for Liverwort Marchantia polymorpha (2015)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹、石崎公庸、大和勝幸、河内孝之、中村保一
  • 学会等名: 第56回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 2015-03-16 – 2015-03-18
• [学会発表] 納豆菌ゲノムのPacBioシークエンシングと高精度配列の再決定． (2015)
  • 著者名/発表者名: 鎌田真由美，長谷純崇，木村啓太郎，佐藤健吾，豊田敦，藤山秋佐夫，榊原康文
  • 学会等名: 第８回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 2015-03-07
• [学会発表] 「Gef-seqに対応したマッピングプログラムおよびGUIの開発」 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本秀太・中村建介
  • 学会等名: 第９回 日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 神戸大学
  • 年月日: 2015-03-06
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for Liverwort Marchantia polymorpha (2015)
  • 著者名/発表者名: Yasukazu Nakamura, Hideki Nagasaki, Naoko Iida
  • 学会等名: Expanding Frontiers of Genome Science II
  • 発表場所: 一橋講堂
  • 年月日: 2015-01-20 – 2015-01-21
• [学会発表] Pipeline for whole-genome analysis of heavy-ion-induced mutants (2015)
  • 著者名/発表者名: Kotaro Ishii, Tomonari Hirano, Yusuke Kazama, Michiaki Hamada, Yukiteru Ono, Tomoko Abe
  • 学会等名: International Symposium on Genome Science
  • 発表場所: 東京 一橋講堂
  • 年月日: 2015-01-20 – 2015-01-21
• [学会発表] Next generation sequencing data and its bioinformatics analysis dissect genomic regulatory elements (2015)
  • 著者名/発表者名: Tetsushi Yada, Takuma Irie, Takeaki Taniguchi, Yutaka Suzuki
  • 学会等名: International Symposium on Genome Science
  • 発表場所: 東京 一橋講堂
  • 年月日: 2015-01-20 – 2015-01-21
• [学会発表] 定量生物学と情報生物学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 定量生物学の会第七回年会
  • 発表場所: 九州大学筑紫キャンパス（春日）
  • 年月日: 2015-01-11
  • 招待講演
• [学会発表] The Chara braunii Genome (2015)
  • 著者名/発表者名: Tomoaki Nishiyama, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Asao Fujiyama, Stefan A. Rensing, Hidetoshi Sakayama
  • 学会等名: Plant and Animal Genome XXIII Conference, 2015
  • 発表場所: San Diego, CA
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-14
• [学会発表] The Chara braunii Genome Sheds Light on the Origin of Land Plants (2015)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Sakayama, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Asao Fujiyama, Stefan A. Rensing, Tomoaki Nishiyama
  • 学会等名: Plant and Animal Genome XXIII Conference, 2015
  • 発表場所: San Diego, CA
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-14
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for Liverwort Marchantia polymorpha (2015)
  • 著者名/発表者名: Hideki Nagasaki Kimitsune Ishizaki Katsuyuki T. Yamato Takayuki Kohchi Yasukazu Nakamura
  • 学会等名: International Plant & Animal Genome XXIII
  • 発表場所: San Diego, CA, USA
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-14
• [学会発表] DDBJ Read Annotation Pipeline の紹介と実習 (2014)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹
  • 学会等名: 第30回 DDBJing 講習会 in 東京
  • 発表場所: 独立行政法人 科学技術振興機構 東京本部
  • 年月日: 2014-12-18
  • 招待講演
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for the Liverwort Marchantia polymorpha (2014)
  • 著者名/発表者名: Hideki Nagasaki, Naoko Iida, Yasukazu Nakamura
  • 学会等名: Marchantia Workshop 2014
  • 発表場所: 神戸大学
  • 年月日: 2014-12-08 – 2014-12-10
  • 招待講演
• [学会発表] Asian Microbiome Project: 次世代シーケンサーを用いたアジア人腸内細菌叢のプロファイル化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 東佳那子、百田理恵、山本麻寿紗、林 哲也、小椋義俊、黒川 顕、豊田敦、加藤和人、AMP study group、園元謙二、渡辺幸一、Lee Yuan Kun、中山二郎
  • 学会等名: 日本生物工学会 第21回九州支部熊本大会
  • 発表場所: 熊本大学
  • 年月日: 2014-12-06
• [学会発表] マウス長期継代系統を用いた生殖系列突然変異率の閾値とその影響 (2014)
  • 著者名/発表者名: 内村有邦, 樋口真弓, 水口洋平, 西野穣, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 八木健
  • 学会等名: 日本環境変異原学会第43回大会
  • 発表場所: 一橋大学一橋講堂
  • 年月日: 2014-12-04 – 2014-12-05
• [学会発表] 放射線耐性を示すクマムシの新規タンパク質S261によるDNA損傷の抑制 (2014)
  • 著者名/発表者名: 橋本 拓磨, 斎藤 裕樹, 尾山 大明, 秦 裕子, 榎本 敦, 宮川 清, 桑原 宏和, 堀川 大樹, 豊田 敦, 片山 俊明, 荒川 和晴, 藤山 秋佐夫, 久保 健雄, 國枝 武和
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 有殻アメーバ Paulinella chromatophora のゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松尾 充啓, 潟端 篤, 水口 洋平, 野口 英樹, 豊田 敦, 藤山 秋佐夫, 鈴木 穣, 佐藤 壮一郎, 松崎 素道, 中山 卓郎, 神川 龍馬, 野村 真未, 壁谷 如洋, 宮城島 進也, 稲垣 祐司, 石田 健一郎, 小保方 潤一
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] The Construction of Genome Annotation Database for Liverwort ゼニゴケゲノムアノテーションデータベースの構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹、石崎公庸、大和勝幸、河内孝之、中村保一
  • 学会等名: 第37回 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 次世代シークエンサーによる変異プロモーターの網羅的解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 入江拓磨, 門城拓, 劉エイ, 関真秀, 菅野純夫, 矢田哲士, 鈴木穰
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜, 日本
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] ゲノムおよび健康関連データの責任ある共有のためのフレームワークの作成 (2014)
  • 著者名/発表者名: 加藤和人
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第59回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-11-21
• [学会発表] 個人ゲノム情報の取り扱いに関する倫理的、法的課題 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山本奈津子、川嶋実苗、藤田卓仙、鈴木正朝
  • 学会等名: 第59回日本人類遺伝学会 第21回日本遺伝子診療学会 合同大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-11-19 – 2014-11-22
• [学会発表] Roles of bacteriophages in the emergence and evolution of enterohemorrhagic Escherichia coli. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T.
  • 学会等名: 第62回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 横浜市
  • 年月日: 2014-11-10
  • 招待講演
• [学会発表] ビッグデータ時代における医療等情報の取り扱い方針に関する検討 (2014)
  • 著者名/発表者名: 藤田卓仙、山本奈津子、川嶋実苗、鈴木正朝
  • 学会等名: 第34回医療情報学連合大会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2014-11-06 – 2014-11-08
• [学会発表] クリニカルシーケンス応用を目指したHLA領域のゲノム解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 細道一善
  • 学会等名: Roche Scientific Symposium 2014 先端医療研究におけるターゲットゲノム解析
  • 発表場所: JPタワー ホール＆カンファレンス(東京)
  • 年月日: 2014-11-05
  • 招待講演
• [学会発表] 生殖補助医療規制の構築における「子どもを持ちたいという欲望」 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小門穂
  • 学会等名: 日本生命倫理学会
  • 発表場所: 浜松
  • 年月日: 2014-10-26
• [学会発表] PCR-based method for complete HLA gene sequencing and capture-based method for entire HLA region sequencing (2014)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Inoue I.
  • 学会等名: 64th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics (ASHG 2014)
  • 発表場所: an Diego Convention Center (San Diego, California)
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] Analysis of ethical and social issues of large scale genome cohort/biobanking projects in Japan. (2014)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari, Yoshikazu Hanabusa, Soichiro Toda, Fuji Nagami and Kazuto Kato.
  • 学会等名: The 64th American Society of Human Genetics (ASHG) Annual Meeting.
  • 発表場所: サンディエゴ（アメリカ）
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] 病原細菌のゲノム解析. (2014)
  • 著者名/発表者名: 林哲也
  • 学会等名: Infection and Immunity Research Symposium V
  • 発表場所: 福岡市
  • 年月日: 2014-10-17
  • 招待講演
• [学会発表] CLOCKによる古典的・非古典的E-boxを介した概日時計の"多声的"制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: Hikari Yoshitane, Haruka Ozaki, Hideki Terajima, Ngoc-Hien Du, Yutaka Suzuki, Taihei Fujimori, Naoki Kosaka, Shigeki Shimba, Sumio Sugano, Toshihisa Takagi, Wataru Iwasaki, and Yoshitaka Fukada.
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会2014年年会・第3回生命医薬情報学連合大会
  • 発表場所: 仙台国際センター（仙台）
  • 年月日: 2014-10-03
• [学会発表] 微生物ゲノム研究、この13年間を振り返る（未来開拓、ゲノム特定、ゲノム支援を経験して） (2014)
  • 著者名/発表者名: 小椋義俊
  • 学会等名: 第8回日本ゲノム微生物学会若手の会研究会
  • 発表場所: 静岡市
  • 年月日: 2014-09-28
  • 招待講演
• [学会発表] Fundamental bottlenecks in big-data biology (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（札幌）
  • 年月日: 2014-09-27
  • 招待講演
• [学会発表] Local Package Manager―Database of genome analysis tools with installation procedures (2014)
  • 著者名/発表者名: Masahiro Kasahara
  • 学会等名: Genome Informatics
  • 発表場所: Churchill College, Cambridge, UK
  • 年月日: 2014-09-21
• [学会発表] 長期継代マウス系統を用いた突然変異率の推定と新しい遺伝学 (2014)
  • 著者名/発表者名: 内村有邦, 樋口真弓, 水口洋平, 西野穣, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 三浦郁生, 若菜茂晴, 八木健
  • 学会等名: 日本遺伝学会第86回大会
  • 発表場所: 長浜バイオ大学
  • 年月日: 2014-09-17 – 2014-09-19
• [学会発表] ゲノム大規模データを解析する－転写制御領域の解読と設計－ (2014)
  • 著者名/発表者名: 矢田哲士
  • 学会等名: 新生命科学分野開拓とスーパーコンピューター「京」
  • 発表場所: 福岡, 日本
  • 年月日: 2014-09-16
  • 招待講演
• [学会発表] シャジクモゲノムにみる陸上植物の制御因子ホモログ (2014)
  • 著者名/発表者名: 西山智明, 豊田敦, 鈴木穣, 藤山秋佐夫, 坂山英俊
  • 学会等名: 日本植物学会第78回大会
  • 発表場所: 明治大学
  • 年月日: 2014-09-12 – 2014-09-14
• [学会発表] DDBJ Read Annotation Pipeline の紹介と実習(RNA-Seq配列のde novoアセンブリを中心に) (2014)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹
  • 学会等名: AJACS十勝
  • 発表場所: 帯広畜産大学
  • 年月日: 2014-09-12
  • 招待講演
• [学会発表] People's opinion toward informed consent/assent of children participating birth cohort study in Japan. (2014)
  • 著者名/発表者名: Izumi Ishiyama, Zentaro Yamagata, Jusaku Minari, Go Yoshizawa, Kaori Muto and Kazuto Kato
  • 学会等名: British Sociological Association Medical Sociology Group 46th Annual Conference 2014
  • 発表場所: バーミンガム (イギリス)
  • 年月日: 2014-09-10 – 2014-09-12
• [学会発表] バイオインフォマティクスから時空間解析へ (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩崎渉
  • 学会等名: 日本学術会議学術フォーラム「生命情報ビッグデータ時代における新しい生命科学」
  • 発表場所: 日本学術会議講堂（東京）
  • 年月日: 2014-08-29
  • 招待講演
• [学会発表] Ethical, legal and social issues of genetic and genomic medicine: a focus on East Asian situations (2014)
  • 著者名/発表者名: Go Yoshizawa
  • 学会等名: Seminar on Biobanking and Ethical, Legal & Social Issues in Genetic and Genomic Medicine,
  • 発表場所: University Sains Malaysia
  • 年月日: 2014-08-27
  • 招待講演
• [学会発表] Initiating a biobank infrastructures and regulations: Japan experiences (2014)
  • 著者名/発表者名: Go Yoshizawa
  • 学会等名: Seminar on Biobanking and Ethical, Legal & Social Issues in Genetic and Genomic Medicine
  • 発表場所: University Sains Malaysia
  • 年月日: 2014-08-26
  • 招待講演
• [学会発表] （円卓会議で議論に参加） (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: Workshop on Data Sharing Between International Consortia
  • 発表場所: ジュネーブ（スイス）
  • 年月日: 2014-06-03 – 2014-06-05
  • 招待講演
• [学会発表] The research policy regarding disclosure of genetic research results: a historical perspective in Japan. (2014)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari and Kazuto Kato.
  • 学会等名: Europian Society of Human Genetics (ESHG) 2014 Annual Meeting
  • 発表場所: ミラノ（イタリア）
  • 年月日: 2014-05-31 – 2014-06-04
• [学会発表] Recent situation about rules of sharing, reuse and circulation of personal genome data in Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Natsuko Yamamoto
  • 学会等名: Europian Society of Human Genetics (ESHG) 2014 Annual Meeting
  • 発表場所: ミラノ（イタリア）
  • 年月日: 2014-05-31 – 2014-06-04
• [学会発表] Incorporation of Long-Read Technologies into Hybrid-de novo Genome Sequencing Strategy: An Assessment on PacBio and Moleculo Read (2014)
  • 著者名/発表者名: Asao Fujiyama, Masahiro Kasahara, Atsushi Toyoda
  • 学会等名: PLANT & ANIMAL GENOME ASIA 2014
  • 発表場所: SINGAPORE
  • 年月日: 2014-05-19 – 2014-05-21
• [学会発表] Comments for Panel#3: Big Data, Small Data, Shared Data (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: Ethics at the Crossroads: Where Public Health, Genomics, Data and Translational Science Meet
  • 発表場所: インディアナポリス（アメリカ）
  • 年月日: 2014-05-07
  • 招待講演
• [学会発表] （円卓会議で議論に参加） (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: The Indianapolis ELSI 2.0 Meeting
  • 発表場所: インディアナポリス（アメリカ）
  • 年月日: 2014-05-06
  • 招待講演
• [学会発表] （円卓会議で議論に参加） (2014)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: International Code of Conduct for Genomic and Clinical Date Sharing
  • 発表場所: リ(フランス)
  • 年月日: 2014-04-02
  • 招待講演
• [学会発表] “New Developments of Bioethics Governance System in Japan – An Overview” (2014)
  • 著者名/発表者名: 位田隆一
  • 学会等名: Kyoto International Workshop on Bioethics Governance 2014
  • 発表場所: 京都市（同志社大学)
• [学会発表] Genome Sequencing of the Charophycean Green Alga, Chara braunii (2014)
  • 著者名/発表者名: Tomoaki Nishiyama, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Asao Fujiyama, Hidetoshi Sakayama
  • 学会等名: Plant and Animal Genome XXII Conference, 2014
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] DNA replication errors that fuel genetic and phenotypic diversities in mammals (2014)
  • 著者名/発表者名: Arikuni Uchimura, Mayumi Higuchi, Yohei Minakuchi, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Ikuo Miura, Shigeharu Wakana, Takeshi Yagi
  • 学会等名: 国際シンポジウム "Germline Mutagenesis and Biodiversification”
  • 発表場所: 九州大学(病院キャンパス) 総合研究棟1階 セミナー室105
• [学会発表] シャジクモのゲノム解読 (2014)
  • 著者名/発表者名: 西山智明, 豊田敦, 鈴木穣, 藤山秋佐夫, 坂山英俊
  • 学会等名: 植物分類学会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] ヒラアオノリ配偶子の一過的形質転換系による葉緑体とミトコンドリアの可視化とその動態 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木亮吾，伊藤寛，尾関海，余哲，山崎誠和，豊田敦，桑野和可，河野重行
  • 学会等名: 日本藻類学会第38回大会
  • 発表場所: 東邦大学理学部
• [学会発表] 陸上植物に近縁な緑色藻類シャジクモのゲノム解読 (2014)
  • 著者名/発表者名: 西山智明, 豊田敦, 鈴木穣, 藤山秋佐夫, 坂山英俊
  • 学会等名: 第55回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 富山大学 五福キャンパス
• [学会発表] ヒメミカヅキモの－型細胞特異的遺伝子CpMinus1の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小宮あゆみ、阿部淳、川井絢子、鈴木穣、豊田敦、藤山秋佐夫、大槻涼、土金勇樹、西山智明、関本弘之
  • 学会等名: 第55回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 富山大学 五福キャンパス
• [学会発表] 土壌微生物の移植メタゲノム (2014)
  • 著者名/発表者名: 加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
  • 学会等名: 第8回 日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学 世田谷キャンパス
• [学会発表] Extensive phylogenomics revealed a clonal expansion of EHEC O26 in Japan. (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Ogura, T. Hayashi
  • 学会等名: 第８７回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 東京
  • 招待講演
• [学会発表] On the OBDD Representation of deBruijn Graphs (2014)
  • 著者名/発表者名: Guochen Zhao, Yosuke Aizawa,Anish M. S. Shrestha, Satoshi Tayu, Shuichi Ueno
  • 学会等名: 2014年電子情報通信学会総合大会
  • 発表場所: 新潟大学
• [学会発表] Liverwort Genome Analysis Using DDBJ Pipeline and Construction of the Database Annotated by the Research Communities (ポスター) (2014)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki H, Ishizaki K, Yamato K T, Kohchi T, Nakamura Y.
  • 学会等名: International Plant & Animal Genome XXII
  • 発表場所: サンディエゴ、米国
• [学会発表] Liverwort Genome Analysis and Construction of the Genome Annotation Database: ゼニゴケゲノム解析とゲノムアノテーションデータベースの構築 (ポスター) (2014)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki H, Ishizaki K, Yamato K T, Kohchi T, Nakamura Y.
  • 学会等名: 第55回 日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 富山大学
• [学会発表] Deciphering Regulatory Code Underlying Promoter Sequences (2014)
  • 著者名/発表者名: Yada T
  • 学会等名: The 2nd BMIRC International Symposium on Advances in Bioinformatics and Medical Engineering
  • 発表場所: Center of Iizuka Research and Development, Fukuoka
• [学会発表] プロモーター配列の合理的な設計に挑む (2014)
  • 著者名/発表者名: 矢田哲士
  • 学会等名: 情報処理学会第37回バイオ情報学研究会
  • 発表場所: 九州工業大学, 福岡
  • 招待講演
• [学会発表] 転写因子の結合と転写の関係を明らかにする試み (2014)
  • 著者名/発表者名: 矢田哲士
  • 学会等名: 新学術領域研究「転写サイクル」第2回トレーニングワークショップ
  • 発表場所: 九州工業大学, 福岡
  • 招待講演
• [学会発表] 大規模比較ゲノム解析が明らかにするプロテオロドプシンを持つ海洋細菌のゲノム進化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 熊谷洋平，吉澤晋，木暮一啓，岩崎渉
  • 学会等名: 第8回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京農業大学世田谷キャンパス（東京）
• [学会発表] 包括的同意について (2013)
  • 著者名/発表者名: 位田隆一
  • 学会等名: 日本医師会 生命倫理懇談会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2013-03-21
  • 招待講演
• [学会発表] 第二・第三世代の配列決定技術の現状 (2013)
  • 著者名/発表者名: 豊田敦
  • 学会等名: 第86回日本細菌学会ワークショップ「使ってみよう次世代シーケンサー」
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2013-03-19
  • 招待講演
• [学会発表] 歯周病原菌Prevotella intermedia臨床分離株OMA14の全ゲノム配列決定 (2013)
  • 著者名/発表者名: 内藤真理子
  • 学会等名: 第86回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2013-03-18
• [学会発表] ウシ趾乳頭腫症由来株Treponema phagedenisとヒト由来株の比較ゲノム解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 後藤恭宏
  • 学会等名: 第86回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2013-03-18
• [学会発表] 新規下痢原性病原菌Escherichia albertiiのゲノム解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大岡唯祐
  • 学会等名: 第86回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2013-03-18
• [学会発表] PSC meets NGS -examining ELSI of “conventional” genomics research in the context of the PSC research (2013)
  • 著者名/発表者名: Ken Okada
  • 学会等名: CiRA Int'l Symposium 2013
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2013-03-11
• [学会発表] ウシ趾乳頭腫症病変部から分離されたTreponema phagedenisのゲノム解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 後藤恭宏
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜市
  • 年月日: 2013-03-08
• [学会発表] Escherichia属の新菌種E. albertiiのゲノム解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大岡唯祐
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜市
  • 年月日: 2013-03-08
• [学会発表] 細胞内DNase I footprinting：次世代シーケンサによる高解像度の転写因子結合部位決定 (2013)
  • 著者名/発表者名: Onuma Chumsakul
  • 学会等名: 第7回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 長浜市
  • 年月日: 2013-03-08
• [学会発表] Issues for sharing cells and data in stem cell research- Lessons from human genome research - (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: UK-Japan Workshop on Stem Cells: Building a Better Environment for Application
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2013-03-06
  • 招待講演
• [学会発表] Basic Structure of Ethics Governance of Biobank (2013)
  • 著者名/発表者名: Ryuichi Ida
  • 学会等名: World Medical Association Expert Conference on the Revision of the Declaration of Helsinki
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2013-02-28
  • 招待講演
• [学会発表] 疾患感受性と薬剤応答性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 徳永勝士
  • 学会等名: 平成24年度 次世代医学セミナー・シンポジウム「ダイナミックなゲノム - 遺伝子解析の最前線 - 」
  • 発表場所: 福島
  • 年月日: 2013-02-28
  • 招待講演
• [学会発表] Detecting Significant Short Tandem Repeats in Personal Genomes (2013)
  • 著者名/発表者名: Koichiro Doi
  • 学会等名: AGBT 2013
  • 発表場所: Florida, USA
  • 年月日: 2013-02-21
• [学会発表] Liverwort Genome Analysis using DDBJ Pipeline and Construction of the Genome Annotation Database (2013)
  • 著者名/発表者名: 長崎 英樹
  • 学会等名: International Plant Animal Genome XXI
  • 発表場所: San Diego, CA, USA
  • 年月日: 2013-01-12
• [学会発表] Genome Analysis of Vibrio harveyi Strain S20: Detection and genome feature of the 3rd replicon. (2013)
  • 著者名/発表者名: Amin A.K.M.R.
  • 学会等名: International Symposium on Genome Sciene “Expanding Frontiers of Genome Science”
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2013-01-09
• [学会発表] Toward the creating marine microbial cell factory for biofuel production. (2013)
  • 著者名/発表者名: Sawabe T
  • 学会等名: International Symposium on Genome Sciene “Expanding Frontiers of Genome Science”
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2013-01-09
• [学会発表] Comments, Society Section (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: International Workshop: Exploring the unique social/ethical and health systems challenges of low cost whole genome sequencing
  • 発表場所: モントリオール（カナダ）
  • 招待講演
• [学会発表] A brief introduction of Japanese genome research projects and ways to facilitate ELSI 2.0 accelerator activities (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: P3G/CGP/ELSI 2.0 Workshop
  • 発表場所: モントリオール（カナダ）
  • 招待講演
• [学会発表] Return of genetic research results in Japan: Policy and practice (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato and Jusaku Minari
  • 学会等名: Returning Genetic Results in Biobanks: Opening an International Dialogue
  • 発表場所: Brocher Foundation（スイス）
  • 招待講演
• [学会発表] Ethical issues of sharing personal genome data through public databases (2013)
  • 著者名/発表者名: 三成寿作, 加藤和人
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第58回大会
  • 発表場所: 宮城県仙台市
  • 招待講演
• [学会発表] Research policy of the Genome Science Project in Japan (2013)
  • 著者名/発表者名: Minari J and Kato K
  • 学会等名: The 63rd American Society of Human Genetics (ASHG) Annual Meeting
  • 発表場所: Boston, US
• [学会発表] A historical overview and a reflection on bioethical and ELSI activities for basic researches in human genetics and genomics in Japan (2013)
  • 著者名/発表者名: N. Yamamoto, K. Kato
  • 学会等名: American Society of Human Genetics (ASHG) 2013 Annual Meeting
  • 発表場所: ボストン（米国）
• [学会発表] Personalised Medicine and Human Rights in Asian Context (2013)
  • 著者名/発表者名: 位田隆一
  • 学会等名: International Bioethics Committee (IBC) 20th Session, UNESCO.
  • 発表場所: 韓国・ソウル市(Yonsei University)
  • 招待講演
• [学会発表] 「ゲノム指針改正と疫学研究・臨床研究両指針の見直し―検討作業の動向―」 (2013)
  • 著者名/発表者名: 位田隆一
  • 学会等名: 第20回日本遺伝子診療学会大会イブニングセミナー
  • 発表場所: 浜松市（アクトシティ浜松コングレスセンター
  • 招待講演
• [学会発表] ヨコヅナクマムシにおける新規ミトコンドリアタンパク質の同定 (2013)
  • 著者名/発表者名: 田中冴、秦裕子、尾山大明、豊田敦、片山俊明、荒川和晴、藤山秋佐夫、久保健雄、國枝武和
  • 学会等名: 極限環境生物学会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス
• [学会発表] ヨコヅナクマムシにおける新規ミトコンドリアタンパク質の同定 (2013)
  • 著者名/発表者名: 田中冴、秦裕子、尾山大明、豊田敦、片山俊明、荒川和晴、藤山秋佐夫、久保健雄、國枝武和
  • 学会等名: 細胞を創る研究会
  • 発表場所: 鶴岡メタボロームキャンパス レクチャーホール 鶴岡市先端研究産業支援センター
• [学会発表] ヨコヅナクマムシの新規クロマチンタンパク質S261による DNA 断片化の抑制 (2013)
  • 著者名/発表者名: 橋本拓磨、斎藤裕樹、尾山大明、秦裕子、桑原宏和、堀川大樹、豊田敦、片山俊明、荒川和晴、藤山秋佐夫、久保健雄、國枝武和
  • 学会等名: 極限環境生物学会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス
• [学会発表] 乾眠能力をもつヨコヅナクマムシにおける新規ミトコンドリアタンパク質の同定 (2013)
  • 著者名/発表者名: S. Tanaka, H. Kozuka-Hata, A. Toyoda, T. Katayama, K. Arakawa, A. Fujiyama, M.Oyama, T. Kubo and T. Kunieda
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 高い放射線耐性を示すヨコヅナクマムシの新規クロマチンタンパク質S261の同定と解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 橋本拓磨、斎藤裕樹、尾山大明、秦裕子、桑原宏和、堀川大樹、豊田敦、片山俊明、荒川和晴、藤山秋佐夫、久保健雄、國枝武和
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] ポリプテルスにおける補体C4,B因子遺伝子ゲノム領域の構造解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 呉谷文、藤戸尚子、豊田敦、藤山秋佐夫、野中勝
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] Molecular mechanisms controlling size of neuronal dendritic arbors (2013)
  • 著者名/発表者名: K. Shimono, T. Nomura, T. Usui, H. Komai, A. Toyoda, T. Uemura
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] Identification of novel mitochondrial proteins from an anhydrobiotic tardigrade (2013)
  • 著者名/発表者名: S. Tanaka, A. Toyoda, T. Katayama, K. Arakawa, A. Fujiyama, T. Kubo and T. Kunieda
  • 学会等名: DynaMito2013, the 4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria
  • 発表場所: Okinawa
• [学会発表] ゼブラフィッシュ近交系IM系統の遺伝的評価 (2013)
  • 著者名/発表者名: 新屋みのり、中谷明弘、豊田敦、藤山秋佐夫、酒井則良
  • 学会等名: 日本遺伝学会第85回大会
  • 発表場所: 慶應義塾大学 日吉キャンパス
• [学会発表] 高い突然変異率が後世代の哺乳類集団に及ぼす影響 (2013)
  • 著者名/発表者名: 内村有邦、樋口真弓、豊田敦、藤山秋佐夫、三浦郁生、若菜茂晴、八木健
  • 学会等名: 日本遺伝学会第85回大会
  • 発表場所: 慶應義塾大学 日吉キャンパス
• [学会発表] 陸上植物に近縁な藻類シャジクモのゲノム解読 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西山智明，豊田敦, 鈴木穣, 藤山秋佐夫, 坂山英俊
  • 学会等名: 植物学会
  • 発表場所: 札幌
• [学会発表] 陸上植物に近縁な藻類シャジクモのゲノム解読 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西山智明，豊田敦, 鈴木穣, 藤山秋佐夫, 坂山英俊
  • 学会等名: 北陸植物学会
  • 発表場所: 金沢
• [学会発表] Linking Body Size to Morphology of Neuronal Dendritic Arbors in Adults (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Uemura, K. Shimono, T. Nomura, T. Usui, H. Komai, A. Toyoda
  • 学会等名: 2013 American Society for Cell Biology (ASCB) Annual Meeting
  • 発表場所: New Orleans, USA
• [学会発表] 重症度の差異を認めたレット症候群の一卵性双生児のゲノム・エピゲノム比較解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 久保田健夫、三宅邦夫、水口洋平、伊藤雅之、後藤雄一、豊田敦
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第58回大会
  • 発表場所: 宮城県仙台市 江陽グランドホテル
• [学会発表] 近位筋優位運動感覚ニューロパチー(HMSN-P)の病因遺伝子 (2013)
  • 著者名/発表者名: 石浦 浩之, 辻 省次
  • 学会等名: 第54回神経学会学術大会シンポジウム
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Exome解析による孤発性疾患の疾患関連遺伝子の探索． (2013)
  • 著者名/発表者名: 三井 純
  • 学会等名: 第54回神経学会学術大会シンポジウム
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] エクソーム解析による遺伝的異質性の高い疾患に対する遺伝子検査 (2013)
  • 著者名/発表者名: 三井 純，後藤 順，辻 省次
  • 学会等名: 第20回日本遺伝子診療学会大会
  • 発表場所: 浜松
• [学会発表] パーソナルゲノム解析が医療を変貌させる (2013)
  • 著者名/発表者名: 三井 純，辻 省次
  • 学会等名: 第85回日本遺伝学会市民公開講座
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] COQ2変異は家族性・孤発性多系統萎縮症と関連する (2013)
  • 著者名/発表者名: 三井 純，松川 敬志，石浦 浩之，福田 陽子，市川 弥生子，伊達 英俊，Budrul Ahsan，中原 康雄，百瀬 義雄，高橋 祐二，岩田 淳，後藤 順，The MSA Research Collaboration，辻 省次
  • 学会等名: 第58回日本人類遺伝学会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] JASPAC. 常染色体劣性遺伝が疑われた遺伝性痙性対麻痺症例のexome解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 石浦 浩之，高 紀信，嶋崎 晴雄，三井 純，高橋 祐二，後藤 順，吉村 淳，土井 晃一郎，森下 真一，佐々木 秀直，瀧山 嘉久，辻省次
  • 学会等名: 第58回日本人類遺伝学会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Molecular genetics of multiple system atrophy: results from the Japan Multiple System Atrophy Research Consortium. (2013)
  • 著者名/発表者名: JAMSAC (Japan Multiple System Atrophy Research Consortium), Jun Mitsui, Yaeko Ichikawa, Jun Goto, Shoji Tsuji
  • 学会等名: 17th International Congress of Parkinson’s Disease and Movement Disorder
  • 発表場所: Sydney, Australia
• [学会発表] Mutations of COQ2 in Familial and Sporadic Multiple System Atrophy (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Matsukawa T, Ishiura H, Fukuda Y, Ichikawa Y, Date H, Ahsan B, Nakahara Y, Momose Y, Takahashi Y, Goto J, Yamamoto Y, Shirahige K, Takahashi H, Onodera O, Nishizawa M, Kondo T, Murayama S,
  • 学会等名: American Society of Human Genetics 63rd Annual Meeting
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] ゲノム・遺伝子解析研究がもたらす革新（教育講演） (2013)
  • 著者名/発表者名: 徳永勝士
  • 学会等名: 第62回日本医学検査学会
  • 発表場所: 高松
  • 招待講演
• [学会発表] SORL1 is Genetically Associated With Late-Onset Alzheimer's Disease in Japanese, Koreans and Caucasians. (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyashita A, Kuwano R, Schellenberg G, Ihara Y, Kanazawa I, Tsuji S, Yamamoto K, Tokunaga K, Nishida N, Yoshida M, Pericak-Vance M, Haines J, Mayeux R, St. George-Hyslop P, Kim JW, Takahashi S, Wang LS, Jun G, Koike A, Farrer L
  • 学会等名: AAIC
  • 発表場所: 米国ボストン
• [学会発表] タンパク質-RNA相互作用におけるRNA2次構造認識機構:塩基対確率に基づく解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 岩切 淳一，亀田 倫史，浅井 潔，浜田 道昭
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 愛媛県・県民文化会館・ひめぎんホール
• [学会発表] ゲノムアセンブリのギャップを高精度で埋めるツール GMcloser の開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小杉 俊一、平川 英樹、田畑 哲之
  • 学会等名: NGS現場の会 第３回研究会
  • 発表場所: 神戸国際会議場
• [学会発表] Liverwort Genome Analysis and Construction of the Genome Annotation Database (ポスター) (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki H, Ishizaki K, Yamato K T, Kohchi T, Nakamura Y.
  • 学会等名: JSBi2013
  • 発表場所: タワーホール船堀(東京)
• [学会発表] Liverwort Genome Analysis and Construction of the Genome Annotation Database: ゼニゴケゲノム解析とゲノムアノテーションデータベースの構築 (ポスター) (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki H, Ishizaki K, Yamato K T, Kohchi T, Nakamura Y.
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] Our Informatics Approaches for Marchantia Genome (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki H, Iida N, Nakamura Y.
  • 学会等名: Marchantia IV
  • 発表場所: メルボルン、オーストラリア
  • 招待講演
• [学会発表] 発がんゲノムにおける非コードRNA の網羅的発現解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 天野浩司郎，青戸良賢，若林雄一，榊原康文
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] デジタルクラスタリングを用いた発がん過程の経時的トランスクリプトーム解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 青戸良賢，若林雄一，榊原康文
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] ヒト膵臓がんにおける臓器内真正細菌のゲノム解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 榊原康文，鈴木秀和
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] Identifying Mutations Bringing de novo Gene Birth to Saccharomyces sensu stricto Genomes (2013)
  • 著者名/発表者名: Zhang W, Ichinose N, Kumada T, Yada T
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会年会
  • 発表場所: タワーホール船堀
• [学会発表] Co-regulatory relation between cancer genes and miRNAs (2013)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi H, Ichinose N, Kumada T, Yada T
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会年会
  • 発表場所: タワーホール船堀
• [学会発表] Motif identification based on the idea of Gibbs Sampling and Genetic Algorithm (2013)
  • 著者名/発表者名: Zheng P, Ichinose N, Kumada T, Yada T
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会年会
  • 発表場所: タワーホール船堀
• [学会発表] Methylation Structure of Honey Bee Genome (2013)
  • 著者名/発表者名: Ichinose N, Yada T, Gotoh O
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会年会
  • 発表場所: タワーホール船堀
• [学会発表] Deciphering Regulatory Code from Transcription Activity Data of Mutagenesis Promoters (2013)
  • 著者名/発表者名: Liu Y, Irie T, Suzuki Y, Ichinose N, Kumada T, Yada T
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会年会
  • 発表場所: タワーホール船堀, 東京
• [学会発表] 転写制御コードの多様性に挑む (2013)
  • 著者名/発表者名: 矢田哲士
  • 学会等名: ゲノム多様性のデータ利用
  • 発表場所: 統計数理研究所, 東京
  • 招待講演
• [学会発表] miRNA-target prediction based on transcriptional regulation (2012)
  • 著者名/発表者名: T.Fujiwara
  • 学会等名: ISCB-Asia/SCCG
  • 発表場所: Shenzhen, China
  • 年月日: 2012-12-17
• [学会発表] DDBJパイプラインによるゼニゴケゲノム解析とゲノムアノテーションデータベースの構築 (2012)
  • 著者名/発表者名: 長崎 英樹
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Detection of Splice Junctions from Mid-to-Long RNA-seq Reads by Spaln (2012)
  • 著者名/発表者名: C.Zeng
  • 学会等名: 23rd Int. Conf. on Genome Inform.
  • 発表場所: Tainan, Taiwan
  • 年月日: 2012-12-12
• [学会発表] パーソナルゲノム時代の生命倫理 (2012)
  • 著者名/発表者名: 加藤和人
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-11
  • 招待講演
• [学会発表] Domestic systems for Ethical, Legal and Social implications (ELSI) of human genome researches in Japan (2012)
  • 著者名/発表者名: 山本奈津子
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] Relations between personal information and personal genetic information: revision of Japanese Ethical Guidelines for Human Genome Research (2012)
  • 著者名/発表者名: 野村安以
  • 学会等名: 第35回分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] 「ヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する倫理指針」の改定をめぐる批判的談話分析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 野村安以
  • 学会等名: 科学社会学会設立総会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-12-02
• [学会発表] Genomic approaches to the etiology of autoimmune diseases (2012)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga K
  • 学会等名: Centennial of Hashimoto Disease International Symposium Ⅱ - Autoimmune Diseases - Etiology and Therapeutics
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-02
  • 招待講演
• [学会発表] Towards System-level Understandings of Transcriptional Regulations (2012)
  • 著者名/発表者名: Sumio Sugano
  • 学会等名: The 7th International Conference on Genomics Bio-IT APAC 2012
  • 発表場所: Hong Kong
  • 年月日: 2012-11-30
  • 招待講演
• [学会発表] Genome-wide search for disease genes and drug response genes: Implications and perspectives (2012)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga K
  • 学会等名: The 39th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2012
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2012-11-17
  • 招待講演
• [学会発表] 個人情報と遺伝情報の関係-ゲノム指針の見直しを巡る議論から- (2012)
  • 著者名/発表者名: 野村安以
  • 学会等名: 第11回科学技術社会論学会年次研究大会
  • 発表場所: 神奈川
  • 年月日: 2012-11-16
• [学会発表] ゲノム解析技術の急速な進化がもたらすゲノム研究の新たな展開 (2012)
  • 著者名/発表者名: 林哲也
  • 学会等名: 日本科学哲学会第45回（2012年）大会
  • 発表場所: 宮崎市
  • 年月日: 2012-11-10
  • 招待講演
• [学会発表] メタゲノミクスの現状と未来 (2012)
  • 著者名/発表者名: 黒川顕
  • 学会等名: 情報・システム研究機構シンポジウム2012「生命科学のビッグデータ革命」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-11-09
  • 招待講演
• [学会発表] Research Policy of the “Genome Science” Project in Japan. (2012)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari
  • 学会等名: The 62nd American Society of Human Genetics (ASHG) Annual Meeting,
  • 発表場所: San Francisco, USA
  • 年月日: 2012-11-06
• [学会発表] 日本人の起源・形成と疾患体質 (2012)
  • 著者名/発表者名: 徳永勝士
  • 学会等名: 第62回日本体質医学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2012-11-03
  • 招待講演
• [学会発表] A clustering method for cancer microarray data from mathematical and biological viewpoints (2012)
  • 著者名/発表者名: S.Yue
  • 学会等名: 日本バイオインフォマティクス学会年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-10-14
• [学会発表] Governance of Biobank (2012)
  • 著者名/発表者名: Ryuichi Ida
  • 学会等名: 9th Global Summit of National Bioethics Advisory Bodies
  • 発表場所: Carthage, Tunisia
  • 年月日: 2012-09-26
  • 招待講演
• [学会発表] パーソナルゲノム解読の倫理的法的社会的課題 (2012)
  • 著者名/発表者名: 加藤和人
  • 学会等名: 第35回日本神経科学大会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2012-09-18
  • 招待講演
• [学会発表] トマト果実分化機構解明に向けた新規遺伝資源開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 有泉 亨
  • 学会等名: 2012年日本育種学会秋季大会（第122回講演会）
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-09-15
• [学会発表] 新型シークエンサのアーカイブ配列と解析パイプライン：系統間SNP解析を事例として (2012)
  • 著者名/発表者名: 神沼英里
  • 学会等名: 第122回日本育種学会講演会ワークショップ06 "育種のための情報解析ツール使い倒し塾"
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-09-14
  • 招待講演
• [学会発表] ELSI 2.0: View from Japan (ELSI of genomics and importance of networking researchers in Asia) (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Kato
  • 学会等名: International Symposium: Developing Frameworks for ELSI research on Personalized Medicine
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 年月日: 2012-08-07
  • 招待講演
• [学会発表] 遺伝子診療における次世代シーケンサー (2012)
  • 著者名/発表者名: 井ノ上 逸朗
  • 学会等名: 日本遺伝子診療学会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2012-07-28
  • 招待講演
• [学会発表] 新興病原体Escherichia albertiiのゲノム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大岡唯祐
  • 学会等名: 第16回腸管出血性大腸菌感染症研究会
  • 発表場所: 秋田市
  • 年月日: 2012-07-19
• [学会発表] 個別化医療時代の生命倫理―ゲノム情報に基づく医療を社会の理解と支持を得て進めるために― (2012)
  • 著者名/発表者名: Ryuichi Ida
  • 学会等名: 第39回日本小児栄養消化器肝臓学会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2012-07-14
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular Characterization of Gene Cluster Responsible for Hydrogen Evolution in Vibrio tritonius AM2T. (2012)
  • 著者名/発表者名: Matsumura Y.
  • 学会等名: The 9th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference (APMBC2012)
  • 発表場所: 高知
  • 年月日: 2012-07-13
• [学会発表] A Research Policy of the “Genome Science” Project in Japan. (2012)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari
  • 学会等名: The 11th Conference of the International Association of Bioethics
  • 発表場所: Rotterdam, Netherlands.
  • 年月日: 2012-06-26
• [学会発表] 疾患関連遺伝子のゲノム全域探索の現状と展望 (2012)
  • 著者名/発表者名: 徳永勝士
  • 学会等名: 「ワークショップ：最近の遺伝子研究からみた肝臓病の現状と個別化医療への展望」第48回日本肝臓学会総会
  • 発表場所: 金沢
  • 年月日: 2012-06-07
  • 招待講演
• [学会発表] DDBJ Pipeline, a cloud computing based annotation tool for new-generation sequencing data (2012)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹
  • 学会等名: NGS現場の会 第2回研究会
  • 発表場所: 吹田
  • 年月日: 2012-05-24
• [学会発表] Genome-wide approaches to complex disease: Advances and perspectives (2012)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga K
  • 学会等名: Genomic Analysis of Diseases Workshop, Nature Conference
  • 発表場所: Hangzhou, China
  • 年月日: 2012-05-18
  • 招待講演
• [学会発表] NGS由来大量データレポジトリDRAと解析支援パイプラインの提供 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中村保一
  • 学会等名: 理研シンポジウム・データ駆動型生命情報科学の挑戦
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2012-05-09
  • 招待講演
• [学会発表] Significant prevalence of Escherichia albertii among the strains identified as enteropathogenic and enterohemorrhagic E. coli and the presence of Shiga toxin-producing E. albertii strains. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ooka T.
  • 学会等名: VTEC 2012: 8th International Symposium on Shiga Toxin (Verocytotoxin) producing Escherichia coli infections
  • 発表場所: Amsterdam, The Netherlands.
  • 年月日: 2012-05-06
• [学会発表] 環境メタゲノミクス (2012)
  • 著者名/発表者名: 黒川顕
  • 学会等名: 日本農芸化学会2012年度大会シンポジウム
  • 発表場所: 京都(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] Integrative Transcriptome Analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Suzuki
  • 学会等名: FIRST symposium
  • 発表場所: Osaka, Japan
  • 年月日: 2012-03-13
• [学会発表] Development of an integrated analysis system for metagenomics and its applications for soil metagenome analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa, K.
  • 学会等名: BiWO2011
  • 発表場所: 東京(招待講演)
  • 年月日: 2012-01-26
• [学会発表] 新型シーケンサ・アーカイブ配列のクラウド型解析パイプラインDDBJ Pipeline進捗:de novoアセンブル配列注釈ワークフロー (2011)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹、望月孝子、児玉悠一、猿橋智、高木利久、大久保公策、神沼英里、中村保一
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] 新型シーケンサ・アーカイブ配列からのDNA多型注釈データベース構築系統識別ワークフローの開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 猿橋智、長崎英樹、望月孝子、神沼英里、中村保一
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Sequence specific error profile of Illumina sequencers (2011)
  • 著者名/発表者名: Kensuke Nakamura
  • 学会等名: Functional Genomics and Systems Biology 2011 Wellcome Trust Scientific Conferences
  • 発表場所: Hinxton, Cambridge, UK
  • 年月日: 2011-11-30
• [学会発表] DDBJ Sequence Read Archive and a cloud-computing based analytical pipeline for next-generation sequencing reads (2011)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Saruhashi, Takako Mochizuki, Hideki Nagasaki, Yuichi Kodama, Asami Nozaki, Kyung-Bum Lee, Toshihisa Okido, Emi Yokoyama, Eli Kaminuma, Hideaki Sugawara, Kousaku Okubo, Toshihisa Takagi, Yasukazu Nakamura
  • 学会等名: 8th Solanaceae and 2nd Cucurbitaceae Joint Conference
  • 発表場所: 神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2011-11-28
• [学会発表] ゲノムからメタゲノムへ (2011)
  • 著者名/発表者名: 黒川顕
  • 学会等名: CBI/JSBi2011合同大会
  • 発表場所: 神戸(招待講演)
  • 年月日: 2011-11-09
• [学会発表] 日本DNAデータバンク(DDBJ)での新規電算機システムによる超並列型シーケンサ由来の大規模塩基配列情報解析支援の試み (2011)
  • 著者名/発表者名: 望月孝子, 児玉悠一, 猿橋智, 長崎英樹, 神沼英里, 菅原秀明, 大久保公策, 高木利久, 中村保一
  • 学会等名: 「生命情報科学若手の会」第2回研究会
  • 発表場所: 国立遺伝学研究所(静岡県三島市)
  • 年月日: 2011-10-09
• [学会発表] 新型シーケンサーによるメタゲノム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 黒川顕
  • 学会等名: 第63回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 東京(招待講演)
  • 年月日: 2011-09-27
• [学会発表] Lessons from genome-wide search for disease-related genes (2011)
  • 著者名/発表者名: Tokunaga K
  • 学会等名: The 20^<th> Annual Conference of Korean Genome Organization
  • 発表場所: Gangoe-myeon, Korea
  • 年月日: 2011-09-01
• [学会発表] 次世代シーケンサーのアーカイブDBとクラウド型データ解析システムの紹介 (2011)
  • 著者名/発表者名: 神沼英里、児玉悠一、猿橋智、望月孝子、長崎英樹、高木利久、大久保公策、中村保一
  • 学会等名: 第154回農林交流センターワークショップ「次世代シーケンサーを利用したゲノム解析の実際」
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2011-08-19
• [学会発表] イルミナシーケンサーの配列特異的エラーについて (2011)
  • 著者名/発表者名: 中村建介
  • 学会等名: 日本進化学会第13回大会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2011-07-31
• [学会発表] Sequence specific error profile of Illumina sequencers (2011)
  • 著者名/発表者名: Kensuke Nakamura
  • 学会等名: SMBE2011 (Society of Molecular Biology and Evolution)
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2011-07-27
• [学会発表] DDBJ Sequence Read Archive and a cloud-computing based annotation tool for next-generation sequencing data (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki, H., Mochizuki, T., Kodama, Y., Saruhashi, S., Takagi, T., Okubo, K., Kaminuma, E., Nakamura, Y.
  • 学会等名: The 2nd International Conference on the Progress of "1000 Plant & Animal Reference Genomes Project"
  • 発表場所: Shenzhen, China
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] DDBJ Read Annotation Pipeline : 新型シーケンサ由来配列のクラウト型解析パイプライン (2011)
  • 著者名/発表者名: 猿橋智, 児玉悠一, 李慶範, 大城戸利久, 横山会美, 長崎英樹, 望月孝子, 神沼英里, 菅原秀明, 高木利久, 大久保公策, 中村保一
  • 学会等名: NGS現場の会第1回研究会
  • 発表場所: 熱海ニューフジヤホテル(静岡県熱海市)
  • 年月日: 2011-05-28
• [学会発表] パーソナルゲノム研究の倫理的課題 (2011)
  • 著者名/発表者名: 加藤和人
  • 学会等名: 第52回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場(招待講演)
  • 年月日: 2011-05-19
• [学会発表] DDBJ Read Annotation Pipeline:新型シーケンサ由来配列のクラウド型パイプライン (2011)
  • 著者名/発表者名: 長崎英樹, 望月孝子, 神沼英里, 渡邊成樹, 児玉悠一, 猿橋智, 菅原秀明, 高木利久, 大久保公策, 中村保一
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 東北大学(宮城県仙台市)
  • 年月日: 2011-03-20
• [学会発表] Genetic Variation Associated with Nucleosome Structure and DNA Methylation (2011)
  • 著者名/発表者名: Shinichi Morishita
  • 学会等名: Fish Genome Meeting
  • 発表場所: Sanger Center, Cambridge, UK
  • 年月日: 2011-03-11
• [学会発表] Searching Massive Epigenome Data for Evolutionarily Conserved Sequence Motifs (2011)
  • 著者名/発表者名: Shinichi Morishita
  • 学会等名: IEEE International Conference on Computational Advances in Bio and medical Sciences
  • 発表場所: Orland, Florida, USA
  • 年月日: 2011-02-03
• [学会発表] DDBJ Read Annotation Pipeline : A cloud based pipeline for high-throughput analysis of next generation sequencing data (2011)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki, H., Mochizuki, T., Watanabe S., Morizaki, S., Kodama Y., Saruhashi, S., Takagi T., Okubo K., Kaminuma E., Nakamura, Y.
  • 学会等名: Plant and Animal Genome XIX Conference
  • 発表場所: San Diego, USA
  • 年月日: 2011-01-15
• [学会発表] A research activity for ethical, legal and social implications of personal genomics in Japan (2011)
  • 著者名/発表者名: Jusaku Minari, Tetsuya Shirai, Kazuto Kato
  • 学会等名: The 9^<th> International Workshop on Advanced Genomics, Tokyo, Japan
  • 発表場所: 学術総合センター(一橋記念講堂)
• [学会発表] A research activity for ethical, legal, and social implications of personal genomics in Japan (2011)
  • 著者名/発表者名: T.Shirai, J.Minrai, A.Nomura, K.Kato
  • 学会等名: The 12^<th> International Congress of Human Genetics (ICHG)/The 61^<th> ASHG Annual Meeting, Montreal, Canada
  • 発表場所: Montreal Convention Centre
• [学会発表] ヒトゲノム研究における「研究ガバナンス」の構築 (2011)
  • 著者名/発表者名: 白井哲哉, 三成寿作, 加藤和人
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第56回大会第11回東アジア人類遺伝学会
  • 発表場所: 千葉県千葉市幕張メッセ
• [学会発表] ヒト試料を扱ったゲノム研究における「研究ガバナンス」の構築 (2011)
  • 著者名/発表者名: 白井哲哉, 三成寿作, 加藤和人
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] パーソナルゲノム時代の公的なデータ共有に伴う倫理的・法的・社会的課題 (2011)
  • 著者名/発表者名: 三成寿作, 白井哲哉, 加藤和人
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] Transcriptome Analysis of Human Genes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Suzuki
  • 学会等名: Multilevel Systems Biology : Genomes, Structures, and Networks
  • 発表場所: Osaka, Japan
• [学会発表] enome-wide analysis reveals unique regulation of transcription of Th2-specific genes by GATA3 (2011)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Onodera, Shu Horiuchi, Hiroyuki Hosokawa, Yukiko Watanabe, Yutaka Suzuki, Toshinori Nakayama
  • 学会等名: NCI Symposium on Chromosome Structure and Function
  • 発表場所: Bethesda, MD, USA
• [学会発表] GATA3 ChIP-sequence解析を用いたTh2特異的遺伝子の転写調節機構の解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 堀内周、小野寺淳、細川裕之、渡邊友紀子、鈴木穣、中山俊憲
  • 学会等名: 第5回日本エピジェネティックス研究会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] Contribution of Intragenic DNA Methylation in Mouse Gametic DNA Methylomes to Establish Oocyte-Specific Heritable Markss (2011)
  • 著者名/発表者名: Hisato Kobayashi, Takayuki Sakurai, Nozomi Takahashi, Yayoi Obata, Kazuhiko Nakabayashi, Kenichiro Hata, Yusuke Sotoamru, Yutaka Suzuki, Tomohiro Kono
  • 学会等名: World Congress on Reproductive Biology
  • 発表場所: Cairns, Australia