研究課題
基盤研究(S)
本プロジェクトは、RNAの転写後修飾による遺伝子発現調節機構の探究と様々な生命現象との関係について理解を深めることを目的とした。私たちはイノシン化部位を生化学的に検出するため、I特異的な化学修飾と逆転写反応を組み合わせたICE法を開発し、次世代シーケンサーを組み合わせる(ICE-seq)ことにより、ヒト成人脳において約2万箇所の新規I修飾部位を同定した。またイノシン修飾がAlu配列のエキソン化を防ぐ役割があることを明らかにした。また、tRNAから新規RNA修飾である2-アグマチニルシチジン(agm2C)およびサイクリックt6A(ct6A)を発見し、その機能及び生合成を明らかにした。
A
A+: 当初目標を超える研究の進捗があり、期待以上の成果が見込まれる
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すべて 雑誌論文 (38件) (うち査読あり 38件、 オープンアクセス 7件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (31件) (うち招待講演 20件) 図書 (1件) 備考 (6件)
Nucleic Acids Research
巻: 42 号: 14 ページ: 9350-9365
10.1093/nar/gku618
巻: (in press) 号: 11 ページ: 7346-7357
10.1093/nar/gku390
Biochemistry
巻: 53(a) 号: 9 ページ: 1456-1465
10.1021/bi401449z
Genome Res
巻: 24 号: 3 ページ: 522-534
10.1101/gr.162537.113
Methods Mol. Biol
巻: 1093 ページ: 59-72
10.1007/978-1-62703-694-8_6
Cell Report
巻: 5 号: 3 ページ: 715-726
10.1016/j.celrep.2013.09.029
FEBS Lett
巻: 587 号: 21 ページ: 3575-3580
10.1016/j.febslet.2013.09.021
Clinical Chemistry
巻: 59 号: 11 ページ: 1604-1612
10.1373/clinchem.2013.210401
Protein & Peptide Letters
巻: 20 号: 5 ページ: 530-537
10.2174/0929866511320050006
Nature Chemical Biology
巻: 9 号: 2 ページ: 105-11
10.1038/nchembio.1137
巻: 41 号: 4 ページ: 2621-2631
10.1093/nar/gks1344
J . Biol. Chem
巻: 288 号: 11 ページ: 7645-7652
10.1074/jbc.m112.439554
PLoS ONE
巻: 7 号: 6 ページ: e39297-e39297
10.1371/journal.pone.0039297
Nucleic Acids Res.
巻: 40 号: 16 ページ: 8033-8047
10.1093/nar/gks506
RNA
巻: 22 号: 12 ページ: 2269-2276
10.1261/rna.035600.112
巻: (掲載確定)(印刷中) 号: 9 ページ: 4071-4085
10.1093/nar/gkr1287
巻: 17 号: 6 ページ: 1111-1119
10.1261/rna.2653411
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
巻: 108 号: 26 ページ: 10502-10507
10.1073/pnas.1105645108
Nature Structural & Molecular Biology
巻: 18 号: 11 ページ: 1268-1274
10.1038/nsmb.2121
Nature Structural & Molcular Biology
巻: 18 号: 11 ページ: 1275-1280
10.1038/nsmb.2144
The Journal of Clinical Investigation
巻: 121 号: 9 ページ: 3598-3608
10.1172/jci58056
Annu. Rev. Genet
巻: 45 号: 1 ページ: 299-329
10.1146/annurev-genet-110410-132531
J. Biol. Chem
巻: 286 号: 41 ページ: 35494-35498
10.1074/jbc.m111.279810
Proc Natl Acad Sci U S A
巻: 108 号: 49 ページ: 19593-19598
10.1073/pnas.1112352108
巻: 40 号: 1 ページ: 391-398
10.1093/nar/gkr700
WIREs RNA
巻: 2 ページ: 376-386
Proc.Natl.Acad.Sci.USA
巻: 108 ページ: 3912-3917
Nucleic Acids Res
巻: 39 ページ: 1576-1585
Methods in Mol Biol
巻: 718 ページ: 89-99
巻: 108 ページ: 10502-10507
J.Biol.Chem.
巻: (印刷中)(掲載確定)
Acta Crystallograph Sect F Struct Biol Cryst Commun
Annu Rev Genet
J.Clin.Invest.
Nature Struct Mol Biol
Genetics
巻: 186 ページ: 1175-1185
http://www.t.u-tokyo.ac.jp/epage/release/2012/12122001.html
http://release.nikkei.co.jp/detail.cfm?relID=326829&lindID=5
http://first.lifesciencedb.jp/archives/6418
http://59.106.161.11/en/todai-research/research-news/essential-trna-modification-stands-in-the-spotlight/
http://www.u-tokyo.ac.jp/public/public01_231017_j.html
http://first.lifesciencedb.jp/archives/3819