発現パターンに基づく線虫遺伝子制御ネットワーク研究

• 研究課題/領域番号: 22241047
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 小原 雄治 国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 特任教員 (70135292)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 38,610千円 (直接経費: 29,700千円、間接経費: 8,910千円); 2012年度: 12,220千円 (直接経費: 9,400千円、間接経費: 2,820千円); 2011年度: 12,220千円 (直接経費: 9,400千円、間接経費: 2,820千円); 2010年度: 14,170千円 (直接経費: 10,900千円、間接経費: 3,270千円)
• キーワード: 遺伝子 / 発現調節 / ゲノム / 発生分化 / mRNA / 3'-UTR / 局在化 / シグナル伝達

研究概要

初期胚におけるmRNA局在機構について、線虫C.elegans2細胞期にそれぞれ後極側、前極側に局在するpos-1 mRNA、mex-3 mRNAの局在に必要なシス配列とトランス因子を見出し、局在機構とその意義の手掛かりを得た。2)線虫初期胚において、β-catenin HMP-2がSrcの下流でWntパスウェイと並行して内胚葉誘導とABar紡錘体方向決定にシグナル伝達で機能していることを見出した。3)細胞特異的転写制御ネットワークについて、温度感受性神経細胞AFDの分化に必須であるgcy-8とgcy-18遺伝子のプロモータ活性領域を同定し、この発現に必要な転写因子CEH-11とTTX-1が協調的に働いていることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Convey and H. Niki: Multi-Decadal Survival of an Antarctic Nematode, Plectus Murrayi, in a -20°C Stored Moss Sample. (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Kagoshima, K. Kito, T. Aizu, T. Shin-i, H. Kanda, S. Kobayashi, A. Toyoda, A. Fujiyama,Y. Kohara.P
  • 雑誌名: CryoLetters 巻: Volume 33, No 4
  • 査読あり
• [雑誌論文] Kampkotter A, Bossinger O.: C. elegans VANG-1 Modulates Life Span via Insulin/IGF-1-Like Signaling (2012)
  • 著者名/発表者名: Honnen SJ, Buchter C, Schroder V, Hoffmann M, Kohara Y
  • 雑誌名: PLoS One
  • 査読あり
• [雑誌論文] MULTI-DECADAL SURVIVAL OF AN ANTARCTIC NEMATODE, Plectus murrayi, IN A -20°C STORED MOSS SAMPLE. (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Kagoshima
  • 雑誌名: CryoLetters 巻: 33, No 4 ページ: 280-288
  • 査読あり
• [雑誌論文] C.elegans VANG-1 modulates life span via insulin/IGF-1-like signaling (2012)
  • 著者名/発表者名: Honnen SJ, Buchter C, Schroder V, Hoffmann M, Kohara Y, Kampkotter A, Bossinger O
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7(2) 号: 2 ページ: e32183-e32183
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0032183
  • 査読あり
• [雑誌論文] The beta-catenin HMP-2 functions downstream of Src in parallel with the Wnt pathway in early embryogenesis of C. elegans (2011)
  • 著者名/発表者名: E. Sumiyoshi, S. Takahashi, H. Obata, A. Sugimoto and Y. Kohara
  • 雑誌名: Developmental Biology 巻: 355 ページ: 302-312
  • 査読あり
• [雑誌論文] The beta-catenin HMP-2 functions downstream of Src in parallel with the Wnt pathway in early embryogenesis of C.elegans. (2011)
  • 著者名/発表者名: Eisuke Sumiyoshi
  • 雑誌名: Developmental Biology 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] K. C. Gunsalus, J. K. Kim: The Landscape of C. elegans 3'UTRs (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Mangone, A. P. Manoharan, D. Thierry-Mieg, J. Thierry-Mieg, T. Han, S. Mackowiak, E. Mis, C. Zegar, M. R. Gutwein, V. Khivansara, O. Attie, K. Chen, K. Salehi-Ashtiani, M. Vidal, T. T. Harkins, P. Bouffard, Y. Suzuki, S. Sugano, Y. Kohara, N. Rajewsky, F. Piano,
  • 雑誌名: Science 巻: 329 号: 5990 ページ: 432-435
  • DOI: 10.1126/science.1191244
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Landscape of C.elegans 3'UTRs (2010)
  • 著者名/発表者名: Marco Mangone
  • 雑誌名: Science 巻: 329 ページ: 432-435
  • 査読あり
• [学会発表] The homeobox transcription factors, CEH-14 and TTX-1, regulate AFD thermosensory neuron-specific expression of gcy-8 and gcy-18 in C.elegans (2012)
  • 著者名/発表者名: 鹿児島浩、小原雄治
  • 学会等名: 日本分子生物学会第35回年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-12
• [学会発表] In situ hybridization analysis of let-7 microRNA. 18th International C.elegans Meeting (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Andachi, Y. Kohara
  • 学会等名: UCLA, Los Angeles
  • 発表場所: USA
  • 年月日: 2011-06-25
• [学会発表] In situ hybridization analysis of let-7 microRNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshiki Andachi, Yuji Kohara
  • 学会等名: 18th International C.elegans Meeting
  • 発表場所: UCLA, Los Angeles, USA
  • 年月日: 2011-06-25
• [学会発表] The homeobox transcription factors, CEH-14 and TTX-1, regulate expression of gcy-8 and gcy-18 in C. elegans (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Kagoshima, Y. Kohara
  • 学会等名: 18th International C.elegans Meeting
  • 発表場所: UCLA, Los Angeles, USA
  • 年月日: 2011-06-24
• [学会発表] The homeobox transcription factors, CEH-14 and TTX-1, regulate expression of gcy-8 and gcy-18 in C.elegans (2011)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Kagoshima, Yuji Kohara
  • 学会等名: 18th International C.elegans Meeting
  • 発表場所: UCLA, Los Angeles, USA
  • 年月日: 2011-06-24
• [学会発表] Study on localization mechanisms of maternal mex-3 mRNA. (2011)
  • 著者名/発表者名: Konno, H., Noguchi, K., & Kohara, Y
  • 学会等名: 18th International C.elegans Meeting
  • 発表場所: UCLA, Los Angeles, USA
  • 年月日: 2011-06-23
• [学会発表] Study on localization mechanisms of maternal mex-3 mRNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Konno, H., Noguchi, K., Kohara, Y.
  • 学会等名: 18th International C.elegans Meeting
  • 発表場所: UCLA, Los Angeles, USA
  • 年月日: 2011-06-23
• [学会発表] Studies on localization mechanisms of the maternal pos-1 mRNA in C (2010)
  • 著者名/発表者名: K. Noguchi, Y. Kohara
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] 線虫C. elegansの温度感受神経AFDでの発現を制御する調節配列の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鹿児島浩、小原雄治
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] Studies on localization mechanisms of the maternal pos-1 mRNA in C.elegans embryos. (2010)
  • 著者名/発表者名: Koki Noguchi
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] 線虫C.elegansの温度感受神経AFDでの発現を制御する調節配列の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 鹿児島浩
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] The homeobox transcription factors, CEH-14 and TTX-1, regulate AFD thermosensory neuron-specific expression of gcy-8 and gcy-18 in C.elegans
  • 著者名/発表者名: 鹿児島浩
  • 学会等名: 日本分子生物学会第35回年会
  • 発表場所: 福岡
• [備考] NEXTDB:線虫遺伝子発現データベース
  • URL: http://nematode.lab.nig.ac.jp/
• [備考] NEXTDB
  • URL: http://nematode.lab.nig.ac.jp/