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次世代シークエンサーを用いた難聴遺伝子の網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 22249057
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 耳鼻咽喉科学
研究機関信州大学

研究代表者

宇佐美 真一  信州大学, 医学部, 教授 (10184996)

研究分担者 熊川 孝三  (財)冲中記念成人病研究所, 虎の門病院, 研究員 (40142252)
佐藤 宏昭  岩手医科大学, 医学部, 教授 (40215827)
東野 哲也  宮崎大学, 宮崎大学, 教授 (80145424)
古屋 信彦  群馬大学, 医学部, 教授 (80107606)
長井 今日子  群馬大学, 医学部, 助教 (50302469)
工 穣  信州大学, 医学部, 准教授 (70312501)
茂木 英明  信州大学, 医学部, 助教 (60422698)
連携研究者 宮川 麻衣子  信州大学, 医学部附属病院, 助教(特定雇用) (60467165)
内藤 武彦  信州大学, 医学部附属病院, 助教(特定雇用) (50467164)
西尾 信哉  信州大学, 医学部, 助教(特定雇用) (70467166)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
48,100千円 (直接経費: 37,000千円、間接経費: 11,100千円)
2012年度: 10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円)
2011年度: 16,900千円 (直接経費: 13,000千円、間接経費: 3,900千円)
2010年度: 21,060千円 (直接経費: 16,200千円、間接経費: 4,860千円)
キーワード耳科学 / 次世代シークエンサー / 遺伝子 / 難聴 / 内耳 / 感音難聴 / 細胞外マトリソクス
研究概要

難聴の原因遺伝子はおおよそ 100 種類ぐらい存在すると考えられているが、従来の直接シークエンス法ではスループットが低いため、数遺伝子を解析するのが限界であり、遺伝子変異を検出できない例が多く認められる状況であった。本研究では、次世代シークエンサーを用いることで、難聴の原因候補遺伝子の全塩基配列を決定し、網羅的に解析を行うことで、より診断率を向上させることを計画した。信州大学が従来より管理する日本人難聴遺伝子データベースに登録されている難聴患者 216 名を対象に、難聴との関連が報告されている 112 遺伝子のエクソン領域の網羅的解析を行った。その結果、効果的に遺伝子解析が実施され、複数の難聴の原因遺伝子変異を同定することができた。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (53件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (18件) (うち査読あり 14件) 学会発表 (34件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Comprehensive Genetic Screening of KCNQ4 in a Large Autosomal Dominant Nonsyndromic Hearing Loss Cohort: Genotype-Phenotype Correlations and a Founder Mutation2013

    • 著者名/発表者名
      aito T, Nishio SY, Iwasa Y, Yano T,Kumakawa K, Abe S, Ishikawa K, Kojima H, Namba A, Oshikawa C, Usami S
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8(5) 号: 5 ページ: e63231-e63231

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0063231

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prevalence and clinical features of hearing loss patients with CDH23 mutations: a large cohort study2012

    • 著者名/発表者名
      iyagawa M, Nishio SY, Usami S.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 7(8) 号: 8 ページ: e40366-e40366

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0040366

    • NAID

      120007108255

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] TECTA mutations in Japanese with mid-frequency hearing loss affected by zona pellucida domain protein secretion2012

    • 著者名/発表者名
      Moteki H, Nishio SY, Hashimoto S, Takumi Y, Iwasaki S, Takeichi N, Fukuda S, Usami S.
    • 雑誌名

      J Hum Genet

      巻: 57(9) 号: 9 ページ: 587-92

    • DOI

      10.1038/jhg.2012.73

    • NAID

      10031056980

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Patients with CDH23 mutation and the 1555A>G mitochondrial mutation are good candidates for electric acoustic stimulation (EAS)2012

    • 著者名/発表者名
      Usami S., Miyagawa M., Nishio S., Moteki H., Takumi Y., Suzuki M., Kitano Y., Iwasaki S.
    • 雑誌名

      Acta Otolaryngol

      巻: 132 号: 4 ページ: 377-384

    • DOI

      10.3109/00016489.2011.649493

    • NAID

      120007110630

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deafness Gene Study Consortium. Simultaneous screening of multiple mutations by invader assay improves molecular diagnosis of hereditary hearing loss: a multicenter study.2012

    • 著者名/発表者名
      Usami S, Nishio SY, Nagano M, Abe S, Yamaguchi T
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 7(2) 号: 2 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0031276

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutations in the NOG gene are commonly found in congenital stapes ankylosis with symphalangism, but not in otosclerosis2012

    • 著者名/発表者名
      Usami S, Abe S, Nishio S, Sakurai Y, Kojima H, Tono T, Suzuki N
    • 雑誌名

      Clin Genet.

      巻: 82(6) 号: 6 ページ: 514-20

    • DOI

      10.1111/j.1399-0004.2011.01831.x

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 残存聴力活用型人工内耳(EAS:electric acoustic stimulation)~低侵襲手術、聴力保存成績、術後聴取能、遺伝的背景について~2012

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 雑誌名

      耳鼻臨床

      巻: 133 ページ: 312-312

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 両側性特発性感音難聴2012

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 雑誌名

      JOHNS

      巻: 28(5) ページ: 775-778

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 難聴遺伝子はどこまで解明されたのか2012

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 雑誌名

      JOHNS.

      巻: 28(3) ページ: 292-293

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 難聴と遺伝子2012

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 雑誌名

      耳喉頭頸

      巻: 84 ページ: 883-890

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] 人工内耳埋め込み術を行ったCDH23遺伝子変異による難聴症例2012

    • 著者名/発表者名
      宮川麻衣子、茂木英明、工穣、宇佐美真一
    • 雑誌名

      耳喉頭頸

      巻: 84 ページ: 59-63

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Different cortical metabolic activation by visual stimuli possibly due to different time courses of hearing loss in patients with GJB2 and SLC26A4 mutations2011

    • 著者名/発表者名
      Moteki H, Naito Y, Fujiwara K, Kitoh R, Nishio S Y, Oguchi K, Takumi Y, Usami SI
    • 雑誌名

      Acta Oto-Laryngol

      巻: 131 号: 11 ページ: 1232-1236

    • DOI

      10.3109/00016489.2011.593719

    • NAID

      120007110633

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 残存聴力活用型人工内耳(electric acoustic stimulation) ~手術法と聴力保存成績について~2011

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一、茂木英明、宮川麻衣子、内藤武彦、西尾信哉、工 穣、岩崎聡
    • 雑誌名

      Otol Jpn

      巻: 21(5) ページ: 763-770

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 補聴器と人工内耳の融合残存聴力活用型人工内耳について2011

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 雑誌名

      耳鼻咽喉科・頭頸部外科

      巻: 83(6) ページ: 393-401

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 難聴の遺伝子診断2011

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 雑誌名

      Audiology Japan

      巻: 54 ページ: 44-55

    • NAID

      10029001688

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 難聴の遺伝子診断2011

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 雑誌名

      日本臨牀

      巻: 69(2) ページ: 357-367

    • NAID

      10029001688

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clinical profile of hearing loss in children with congenital cytomegalovirus (CMV) infection : CMV DNA diagnosis using preserved umbilical cord2011

    • 著者名/発表者名
      Furutate S, Iwasaki s, Nishio S, Moteki H, Usami S
    • 雑誌名

      Acta Oto-Laryngol

      巻: 131 号: 9 ページ: 976-782

    • DOI

      10.3109/00016489.2011.583268

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deafness Gene Study Consortium. A large cohort study of GJB2 mutations in Japanese hearing loss patients.2010

    • 著者名/発表者名
      Tsukada K, Nishio S, Usami S
    • 雑誌名

      Clin Genet

      巻: 78(5) 号: 5 ページ: 464-70

    • DOI

      10.1111/j.1399-0004.2010.01407.x

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 次世代シーケンサーによる難聴の遺伝子解析(1)~方法論および変異検出アルゴリズムについて~2012

    • 著者名/発表者名
      西尾信哉、宮川麻衣子、内藤武彦、宇佐美真一
    • 学会等名
      第22回日本耳科学会総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーによる難聴の遺伝子解析(2)~見出された原因遺伝子および表現型について~2012

    • 著者名/発表者名
      宮川麻衣子、内藤武彦、西尾信哉、宇佐美真一
    • 学会等名
      第22回日本耳科学会総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ミトコンドリア遺伝子全領域シーケンスによる難聴の遺伝子解析2012

    • 著者名/発表者名
      矢野卓也、西尾信哉、宇佐美真一
    • 学会等名
      第22回日本耳科学会総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] MYO15A 遺伝子変異を認めた両側高度感音難聴の1症例2012

    • 著者名/発表者名
      矢野卓也、小林有美子、佐藤宏明、宇佐美真一
    • 学会等名
      第74回耳鼻咽喉科臨床学会
    • 発表場所
      東京ドームホテル
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Mutation spectrum and clinical characteristics of hearing loss patients caused by SLC26A4 mutations: a large cohort study.2012

    • 著者名/発表者名
      iyagawa M,Nishio S,Fukuoka H, Tsukada K, Usami S
    • 学会等名
      27th Barany Society Meeting
    • 発表場所
      Uppsala,Sweden
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 難聴のパーソナル医療:遺伝子診断から人工内耳まで2012

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 学会等名
      第36回 日本遺伝カウンセリング学会
    • 発表場所
      信大附属病院外来棟 4F
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本人高度感音難聴患者における OTOF 遺伝子変異の頻度の検討2012

    • 著者名/発表者名
      岩佐陽一郎、宇佐美真一
    • 学会等名
      第113回日本耳鼻咽喉科学会総会・学術講演会
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 難聴の遺伝子診断の進歩と臨床応用2012

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 学会等名
      第116回日本眼科学会総会
    • 発表場所
      東京国際フォーラム
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Genetics and presbycusis2012

    • 著者名/発表者名
      Usami S
    • 学会等名
      Presbycusis Reseach Meetings 2012
    • 発表場所
      ミュンヘン/ドイツ
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本人高度感音難聴患者におけるOTOF遺伝子変異の頻度の検討2012

    • 著者名/発表者名
      岩佐陽一郎
    • 学会等名
      第113回日本耳鼻咽喉科学会総会・学術講演会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ(新潟市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 先天性高度感音難聴小児例におけるMYO7A遺伝子解析2012

    • 著者名/発表者名
      吉村豪兼
    • 学会等名
      第113回日本耳鼻咽喉科学会総会・学術講演会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ(新潟市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 難聴のパーソナル医療:遺伝子診断から人工内耳まで2012

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 学会等名
      第36回 日本遺伝カウンセリング学会
    • 発表場所
      信州大学(松本市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Mutation spectrum and clinical characteristics of hearing loss patients caused by SLC26A4 mutations: a large cohort study2012

    • 著者名/発表者名
      Miyagawa M,Nishio S,Fukuoka H, Tsukada K, Usami S.
    • 学会等名
      27th Barany Society Meeting
    • 発表場所
      Uppsala,Sweden
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーによる難聴の遺伝子解析(1)~方法論および変異検出アルゴリズムについて~2012

    • 著者名/発表者名
      西尾信哉、宮川麻衣子、内藤武彦、宇佐美真一
    • 学会等名
      第22回日本耳科学会総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーによる難聴の遺伝子解析(2)~見出された原因遺伝子および表現型について~2012

    • 著者名/発表者名
      宮川麻衣子、内藤武彦、西尾信哉、宇佐美真一
    • 学会等名
      第22回日本耳科学会総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Genetic diagnosis of Japanese congenital deafness using Invader assay2011

    • 著者名/発表者名
      Yutaka Takumi, Shinichi Usami
    • 学会等名
      11^<th> Japan-Taiwan Conference on Otolaryngology-Head and Neck Surgery
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2011-12-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 日本人難聴患者に見出されたSLC26A4遺伝子変異のスペクトラム2011

    • 著者名/発表者名
      宮川麻衣子、西尾信哉、鈴木宏明、宇佐美真一
    • 学会等名
      第21回日本耳科学会総会
    • 発表場所
      沖縄
    • 年月日
      2011-11-25
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 先進医療「先天性難聴の遺伝子診断」の現状2011

    • 著者名/発表者名
      工穣、岩佐陽一郎、吉村豪兼、矢野卓也、内藤武彦、宮川麻衣子、茂木英明、西尾信哉、宇佐美真一
    • 学会等名
      第56回日本聴覚医学会総会・学術講演会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2011-10-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] The genetic background of the patients with cochlear implantation2011

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Usami
    • 学会等名
      The 8th Asia Pacific Symposium on Cochlear Implant and Related science (APSCI 2011)
    • 発表場所
      韓国
    • 年月日
      2011-10-26
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Genetics markers and hearing preservation2011

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Usami
    • 学会等名
      Collegium Oto-Rhino-laryngologium Amicitiae Sacrum
    • 発表場所
      ベルギー
    • 年月日
      2011-09-05
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 難聴の遺伝子解析と臨床応用に関する研究2011

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Usami
    • 学会等名
      北京国際耳科学会
    • 発表場所
      北京(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-04
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Genetics markers and hearing preservation with Japanese children2011

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Usami
    • 学会等名
      13th Symposium on Cochlear Implants Children
    • 発表場所
      シカゴ
    • 年月日
      2011-07-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 信州大学における難聴医療の現況2011

    • 著者名/発表者名
      宮川麻衣子、茂木英明、工穣、宇佐美真一
    • 学会等名
      第73回耳鼻咽喉科臨床学会
    • 発表場所
      松本
    • 年月日
      2011-06-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 人工内耳の新しい流れ: EAS と低侵襲手術2011

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 学会等名
      第21回日本耳科学会総会
    • 発表場所
      沖縄コンベンションセンター
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] The genetic background of the patients with cochlear implantation2011

    • 著者名/発表者名
      Usami S
    • 学会等名
      The 8th Asia Pacific Symposium on Cochlear Implant and Related science(APSCI 2011)
    • 発表場所
      Korea
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Achievement of hearing preservation in the presence of an electrode covering the residual hearing region.2011

    • 著者名/発表者名
      Usami S
    • 学会等名
      The 8th Asia Pacific Symposium on Cochlear Implant and Related science(APSCI 2011)
    • 発表場所
      Korea
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Genetic markers and hearing preservation Collegium2011

    • 著者名/発表者名
      Usami S
    • 学会等名
      Oto-Rhino-laryngologium Amicitiae Sacrum
    • 発表場所
      ベルギー
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 難聴の遺伝子解析と臨床応用に関する研究2011

    • 著者名/発表者名
      Usami S
    • 学会等名
      北京国際耳科学会
    • 発表場所
      北京/中国
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Genetics markers and hearing preservation with Japanese children.13th Symposium on Cochlear2011

    • 著者名/発表者名
      Usami S
    • 学会等名
      Implants Children
    • 発表場所
      シカゴ/アメリカ
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] The responsible genes for Japanese deafness patients and clinical application using Invader assay2010

    • 著者名/発表者名
      Usami S
    • 学会等名
      2nd East Asian Symposium in Otology
    • 発表場所
      国立台湾大学/台湾
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 遺伝性難聴2010

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会
    • 発表場所
      大宮
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Gene expression pattern after insertion of dexamethasone eluting electrode2010

    • 著者名/発表者名
      Usami S
    • 学会等名
      HEARING PRESERVATION WORKSHOP IX
    • 発表場所
      MIAMI,FLORIDA/アメリカ
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 福島邦博先進医療(先天性難聴の遺伝子診断)の現況2010

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一、熊川孝三、東野哲也
    • 学会等名
      第111回日本耳鼻咽喉科科学会総会・学術講演会
    • 発表場所
      仙台国際センター
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Gene-related hearing loss and cochlear implantation in Japan2010

    • 著者名/発表者名
      Usami S
    • 学会等名
      シーボルト記念シンポジウム
    • 発表場所
      長崎大学
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] きこえと遺伝子22012

    • 著者名/発表者名
      宇佐美真一
    • 総ページ数
      126
    • 出版者
      金原出版
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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