• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

複雑損傷の分子構造と修復に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 22310038
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 放射線・化学物質影響科学
研究機関独立行政法人日本原子力研究開発機構

研究代表者

鹿園 直哉  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 量子ビーム応用研究センター, 研究主幹 (10354961)

研究分担者 赤松 憲  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 量子ビーム応用研究センター, 研究副主幹 (70360401)
樋口 真理子  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 原子力基礎工学研究センター, 任期付研究員 (90370460)
村上 洋  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 量子ビーム応用研究センター, 研究職 (50291092)
連携研究者 横谷 明徳  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 先端基礎研究センター, 研究主席 (10354987)
藤井 健太郎  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 先端基礎研究センター, 研究副主幹 (00360404)
漆原 あゆみ  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 先端基礎研究センター, 任期付研究員 (80391275)
研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2014年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2013年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2012年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2011年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2010年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
キーワード複雑損傷 / 分子構造 / 分子動力学 / 蛍光共鳴エネルギー移動 / 突然変異 / 難修復性 / FRET / DNA分子構造 / 分子動力学計算 / テラヘルツ分光 / 生物影響
研究成果の概要

電離放射線によって複数の損傷が局所的に近接して生じると考えられている「複雑損傷」を検出するために、蛍光共鳴エネルギー移動現象を利用した新たな手法を確立し、複雑損傷の分子構造に関する研究を進めた。また、複雑損傷の修復が難しい原因をDNA分子構造に基づいて理解することを目指し、損傷DNA分子構造と修復酵素の結合能を分子動力学計算によって明らかにするとともに生体内の突然変異誘発頻度を詳細に調べることで、複雑損傷の修復に関する知見を得た。

報告書

(6件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (48件)

すべて 2015 2014 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 14件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (32件) (うち招待講演 1件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Chemical repair activity of free radical scavenger, edaravone: Reduction reactions with dGMP hydroxyl radical adducts and suppression of base lesions and AP sites on irradiated plasmid DNA.2015

    • 著者名/発表者名
      Hata K, Urushibara A, Yamashita S, Lin M, Muroya Y, Shikazono N, Yokoya A, Fu H, Katsumura Y
    • 雑誌名

      Journal of Radiation Research

      巻: 56 号: 1 ページ: 59-66

    • DOI

      10.1093/jrr/rru079

    • NAID

      120006502225

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Localization estimation of ionizing radiation-induced abasic sites in DNA in the solid state using fluorescence resonance energy transfer.2015

    • 著者名/発表者名
      Akamatsu K, Shikazono N, Saito T
    • 雑誌名

      Radiation Research

      巻: 183 号: 1 ページ: 105-113

    • DOI

      10.1667/rr13780.1

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Terahertz dynamics of water before and after water shedding from reverse micelles.2015

    • 著者名/発表者名
      Murakami H
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Liquids

      巻: 未定 ページ: 37-43

    • DOI

      10.1016/j.molliq.2015.03.015

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Towards Laser Driven Hadron Cancer Radiotherapy: A Review of Progress.2014

    • 著者名/発表者名
      Ledingham KWD, Bolton PR, Shikazono N, Ma CM
    • 雑誌名

      Applied Sciences

      巻: 4 号: 3 ページ: 402-443

    • DOI

      10.3390/app4030402

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Significance of DNA Polymerase I in in vivo processing of clustered DNA damage2013

    • 著者名/発表者名
      Shikazono, N., Akamatsu, K., Takahashi, M., Noguchi, M., Urushibara, A., O’Neill, P. and Yokoya, A.
    • 雑誌名

      Mutatation Research

      巻: 749 号: 1-2 ページ: 9-15

    • DOI

      10.1016/j.mrfmmm.2013.07.010

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chemical repair of base lesions, AP-sites, and strand breaks on plasmid DNA in dilute aqueous solution by ascorbic acid2013

    • 著者名/発表者名
      Hata K, Urushibara A, Yamashita S, Shikazono N, Yokoya A, Katsumura Y
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 434 号: 2 ページ: 341-345

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2013.03.075

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nanometer-scale water droplet free from the constraint of reverse micelles at low temperatures2013

    • 著者名/発表者名
      Murakami H, Sada T, Yamada M, Harada M
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 88 号: 5 ページ: 52304-52304

    • DOI

      10.1103/physreve.88.052304

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The mutagenic potential of 8-oxoG/single strand break-containing clusters depends on their relative positions2012

    • 著者名/発表者名
      Miho Noguchi
    • 雑誌名

      Mutation Research

      巻: 732 号: 1-2 ページ: 34-42

    • DOI

      10.1016/j.mrfmmm.2011.12.009

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Yield of single- and double-strand breaks and nucleobase lesions in fully hydrated plasmid DNA films irradiated with high-LET charged particles2012

    • 著者名/発表者名
      Ushigome Takeshi
    • 雑誌名

      Radiation Research

      巻: (In press) 号: 5 ページ: 914-627

    • DOI

      10.1667/rr2701.1

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A methodology for estimating localization of apurinic/apyrimidinic sites in DNA using fluorescence resonance energy transfer.2012

    • 著者名/発表者名
      Akamatsu, K.
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry

      巻: 433 号: 2 ページ: 171-180

    • DOI

      10.1016/j.ab.2012.10.004

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A possible overestimation of the effect of acetylation on lysine residues in KQ mutant analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Fujimoto, Mariko Higuchi, Manabu Koike, Hirotaka Ode, Miroslav Pinak, Juraj Kotulic Bunta, Toshiyuki Nemoto, Takashi Sakudoh, Naoko Honda, Hideaki Maekawa, Kimiaki Saito, Kozo Tsuchida
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem

      巻: 33 号: 3 ページ: 239-246

    • DOI

      10.1002/jcc.21956

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Terahertz absorption spectroscopy of protein-containing reverse micellar solution2012

    • 著者名/発表者名
      Murakami H, Toyota Y, Nishi T, Nashima S
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 519-520 ページ: 105-109

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2011.11.029

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A model for analysis of the yield and the level of clustering of radiation-induced DNA-strand breaks in hydrated plasmids2011

    • 著者名/発表者名
      Shikazono N, Yokoya A, Urushibara A., Noguchi M, Fujii K
    • 雑誌名

      Radiation Protection Dosimetry

      巻: 143 ページ: 181-185

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhanced resolution of molecular recognition to distinguish structure similar molecules by different conformational responses of a protein upon ligand binding2011

    • 著者名/発表者名
      Higuchi M, Fujii J, Yonetani Y, Kitao A, Go N
    • 雑誌名

      Journal of Structural Biology

      巻: 173 ページ: 20-28

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Water and biomolecules confined in nanometer-scale reverse micelles studied using spectroscopic techniques in wide frequency and temperature ranges2015

    • 著者名/発表者名
      Murakami, H
    • 学会等名
      Energy, Materials,Nanotechnology Meeting on Droplets
    • 発表場所
      プーケット(タイ)
    • 年月日
      2015-05-08 – 2015-05-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] クラスターDNA損傷による変異誘発におけるDNAポリメラーゼの関与2014

    • 著者名/発表者名
      鹿園直哉、赤松憲
    • 学会等名
      第57回日本放射線影響学会
    • 発表場所
      かごしま県民交流センター(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2014-10-01 – 2014-10-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] FRETを用いた放射線DNA損傷の局在性評価2014

    • 著者名/発表者名
      赤松憲、鹿園直哉
    • 学会等名
      第57回日本放射線影響学会
    • 発表場所
      かごしま県民交流センター(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2014-10-01 – 2014-10-03
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Slowing-down of Terahertz water motions and water shedding from reverse micelles2014

    • 著者名/発表者名
      Murakami, H
    • 学会等名
      Open Questions on the Origin of Life 2014
    • 発表場所
      International Institute for Advanced Studies(Kizugawashi, Kyoto)
    • 年月日
      2014-09-06 – 2014-09-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Terahertz dynamics of water confined in reverse micelles2014

    • 著者名/発表者名
      Murakami, H
    • 学会等名
      20th International Symposium on Surfactants in Solution
    • 発表場所
      University of Coimbra(Portugal)
    • 年月日
      2014-06-22 – 2014-06-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Construction of plasmid containing clustered DNA damage to analyze its in vivo repair2013

    • 著者名/発表者名
      Takahashi M, Shikazono N
    • 学会等名
      Heavy ion in therapy and space radiation symposium 2013
    • 発表場所
      京葉銀行文化プラザ(千葉県千葉市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] DNA脱塩基部位の局在性評価法の開発と放射線照射DNAへの適用2013

    • 著者名/発表者名
      赤松憲、鹿園直哉
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] DNA鎖に生じた損傷の分布様式を調べるための実験と理論2013

    • 著者名/発表者名
      赤松憲、鹿園直哉
    • 学会等名
      第23回日本数理生物学会
    • 発表場所
      静岡大学浜松キャンパス(静岡県静岡市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 逆ミセル拘束水のテラヘルツダイナミクスの温度変化の異常性2013

    • 著者名/発表者名
      村上洋
    • 学会等名
      日本物理学会 2013年秋期大会
    • 発表場所
      徳島大学常三島キャンパス(徳島県徳島市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Terahertz spectroscopy of nanometer water droplet in a wide temperature range2013

    • 著者名/発表者名
      Murakami H
    • 学会等名
      7th International Discussion Meeting on Relaxation in Complex Systems
    • 発表場所
      Universitat Politecnica de Catalunya(Spain Barcelona)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] The repair of a clustered damage site is influenced by the surrounding DNA lesions2011

    • 著者名/発表者名
      高橋桃子、鹿園直哉
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜(日本)
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Inhibition of binding of Fpg to multiple damaged DNA2011

    • 著者名/発表者名
      樋口真理子、M.Pinak
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜(日本)
    • 年月日
      2011-12-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] FRETを利用した放射線誘発DNA損傷の損傷位置ばらつき評価法の開発2011

    • 著者名/発表者名
      赤松憲、鹿園直哉
    • 学会等名
      第54回日本放射線影響学会
    • 発表場所
      京都(日本)
    • 年月日
      2011-11-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] クラスターDNA損傷の修復におけるPolIの役割2011

    • 著者名/発表者名
      鹿園直哉、野口実穂、漆原あゆみ、横谷明徳
    • 学会等名
      第54回日本放射線影響学会
    • 発表場所
      京都(日本)
    • 年月日
      2011-11-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 修復酵素hOgg1と二つの損傷が近くにあるDNAの結合に関する研究2011

    • 著者名/発表者名
      樋口真理子、M.Pinak
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      姫路(日本)
    • 年月日
      2011-09-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ナノ拘束空間中水の揺らぎの温度変化2011

    • 著者名/発表者名
      村上洋、佐田幸子、山田真紗子、原田雅史
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      姫路(日本)
    • 年月日
      2011-09-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Significance of the repair synthesis in determining the biological consequences of clustered DNA damage2011

    • 著者名/発表者名
      Shikazono N, Noguchi M, Urushibara A, O'Neill P, Yokoya A
    • 学会等名
      14^<th> International Congress of Radiation Research
    • 発表場所
      ワルシャワ(ポーランド)
    • 年月日
      2011-08-30
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Ion beam-induced DNA damage and its biological effects2010

    • 著者名/発表者名
      Shikazono N
    • 学会等名
      第20回日本MRS学術シンポジウム
    • 発表場所
      横浜(日本)
    • 年月日
      2010-12-21
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 蛍光消光現象を活用した放射線誘発DNA損傷の損傷位置ばらつき評価法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      赤松憲、鹿園直哉
    • 学会等名
      第53回日本放射線影響学会
    • 発表場所
      京都(日本)
    • 年月日
      2010-10-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Processing and biological consequences of clustered DNA damage containing a single strand break and an AP site2010

    • 著者名/発表者名
      Shikazono N, Noguchi M, Urushibara A, O'Neill P, Yokoya A
    • 学会等名
      56^<th> Annual Meeting of the Radiation Research Society
    • 発表場所
      ハワイ(米国)
    • 年月日
      2010-09-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] DNA鎖上に生じた損傷位置のばらつき評価法の開発とその放射線照射DNAへの適用2010

    • 著者名/発表者名
      赤松憲、鹿園直哉
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      仙台(日本)
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] クラスターDNA損傷が修復酵素hOGG1の結合に関する分子動力学シミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      樋口真理子, Pinak M.
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      仙台(日本)
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] クラスターDNA損傷が修復酵素hOGG1の基質認識に及ぼす影響2010

    • 著者名/発表者名
      樋口真理子, Pinak M.
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌(日本)
    • 年月日
      2010-06-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Molecular dynamics simulation of cluster damaged DNA and hOGG12010

    • 著者名/発表者名
      Higuchi M, Pinak M
    • 学会等名
      11th International Workshop on Radiation Damage to DNA
    • 発表場所
      アトランタ(米国)
    • 年月日
      2010-05-19
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Significance of strand break repair in determining the mutagenic potential of clustered DNA damage.

    • 著者名/発表者名
      Shikazono, N.
    • 学会等名
      The 12th International Workshop on Radiation Damage to DNA
    • 発表場所
      Courtyard Prague Flora, Prague, Czech Republic
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Development of a methodology for estimating the degree of localization of AP-sites on DNA with an application of Forster resonance energy transfer.

    • 著者名/発表者名
      Akamatsu, K.
    • 学会等名
      The 12th International Workshop on Radiation Damage to DNA
    • 発表場所
      Courtyard Prague Flora, Prague, Czech Republic
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] クラスターDNA損傷とその周辺のDNA損傷の突然変異の発生頻度に関する解析

    • 著者名/発表者名
      高橋桃子
    • 学会等名
      日本放射線影響学会 第55回大会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 脱塩基部位の局在性評価法の開発と放射線照射DNAへの適用

    • 著者名/発表者名
      赤松憲
    • 学会等名
      日本放射線影響学会 第55回大会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] クラスターDNA損傷を含むプラスミドの合成法の開発

    • 著者名/発表者名
      高橋桃子
    • 学会等名
      第35回 日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ナノ拘束水のテラヘルツ分光の温度変化測定

    • 著者名/発表者名
      村上洋
    • 学会等名
      日本物理学会 第68回大会
    • 発表場所
      広島大学(広島県東広島市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Terahertz absorption spectra of nanometer-confined water at low temperatures

    • 著者名/発表者名
      Murakami, H.
    • 学会等名
      The 37th International Conference on Infrared, Millimeter and Terahertz Waves
    • 発表場所
      University of Wollongong, Wollongong, Australia
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Ku binds to complex damaged double strand break DNA

    • 著者名/発表者名
      Higuchi, M.
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] Proteins and water confined in nanometer-scale reverse micelles studied by near infrared, terahertz, and ultrafast visible spectroscopies. In Advances in Protein Chemistry and Structural Biology vol.932013

    • 著者名/発表者名
      Murakami H
    • 総ページ数
      28
    • 出版者
      Elsevier Oxford
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 医療・バイオ応用量子ビーム技術解析ユニット/照射細胞解析研究グループ

    • URL

      http://www.taka.jaea.go.jp/rab_div/dna/index_j.html

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi