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シングルセル解析を目指したゲノムDNA単分子操作・解析マイクロデバイス開発

研究課題

研究課題/領域番号 22310080
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 マイクロ・ナノデバイス
研究機関東京大学

研究代表者

小穴 英廣  東京大学, 大学院・工学系研究科, 准教授 (20314172)

連携研究者 鷲津 正夫  東京大学, 大学院・工学系研究科, 教授 (10201162)
ゲル ムラト  東京大学, 大学院・工学系研究科, 助教 (90456153)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
19,370千円 (直接経費: 14,900千円、間接経費: 4,470千円)
2012年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2011年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2010年度: 10,270千円 (直接経費: 7,900千円、間接経費: 2,370千円)
キーワードDNA / ゲノム / ナノバイオ / マイクロ / ナノデバイス / バイオテクノロジー / マイクロ・ナノデバイス / マイクロ・ナノテバイス
研究概要

本研究において、我々は個々の細胞からクロマチンファイバーを単離し、解析するための新たな手法を開発した。即ち、上記を実現するため、マイクロ流体デバイスおよびクロマチンファイバー操作技術を新たに開発した。ここで開発した手法は、個々の細胞中のクロマチンファイバーの後天的修飾について直接調べる手法への応用が期待される。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (13件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Direct Formation of Giant Unilamellar Vesicles from Microparticles of Polyion Complexes and Investigation of Their Properties Using a Microfluidic Chamber2013

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana
    • 雑誌名

      Soft Matter

      巻: in press 号: 22 ページ: 696-704

    • DOI

      10.1039/c3sm00089c

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Optical Sequence Probingwith the Homologous Recombination Protein RecA2012

    • 著者名/発表者名
      Yuji Kimura, Yuya Goto, Hidehiro Oana,Masao Washizu
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology

      巻: 164 ページ: 254-259

    • URL

      http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2012.08.006

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Optical Sequence Probing with the Homologous Recombination Protein RecA2012

    • 著者名/発表者名
      Yuji Kimura, Yuya Goto, Hidehiro Oana,Masao Washizu
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology

      巻: 164, ページ: 254-259

    • URL

      http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2012.08.006

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] EXTENSION, IMMOBILIZATION AND CHEMICAL MODIFICATION OF DOUBLE-STRANDED DNA ON A SOLID SURFACE-TOWARD DIRECT SEQUENCING WITH MICROSCOPY-2010

    • 著者名/発表者名
      K.Nishikawa, et al.
    • 雑誌名

      Proc.of MicroTAS2010

      巻: 1 ページ: 82-84

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] REAL-TIME FISH USING OPTICALLY-DRIVEN MICROSPHERES FUNCTIONALIZED BY THE HOMOLOGOUS RECOMBINATION PROTEIN, RecA2012

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana, Tatsuya Shino, Kaori Nishikawa, Masao Washizu
    • 学会等名
      16th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences(MicroTAS 2012)
    • 発表場所
      宜野湾市
    • 年月日
      2012-10-29
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 相同組換えタンパクを用いた特定塩基配列探索技術の開発2012

    • 著者名/発表者名
      小穴英廣,志野達弥,西川香里,鷲津正夫
    • 学会等名
      第25回化学とマイクロ・ナノシステム研究会
    • 発表場所
      熊本市
    • 年月日
      2012-05-18
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Formation of Polymer Vesicles from Microdroplets of Polyion Complex in a Microfluidic Chamber2011

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana, Mutsuki Morinaga,Akihiro Kishimura, Murat Gel, Kazunori Kataoka, and Masao Washizu
    • 学会等名
      MicRO Alliance Meeting 2011
    • 発表場所
      アナーバー、アメリカ合衆国
    • 年月日
      2011-10-09
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Formation of Polymer Vesicles from Microdroplets of Polyion Complex in a Microfluidic Chamber2011

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana, et al.
    • 学会等名
      MicRO Alliance Meeting 2011
    • 発表場所
      アメリカ合衆国アナーバー
    • 年月日
      2011-10-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Formation of Polymer Vesicles from Microdroplets of Polyion Complex and Examination of Their Physicochemical Properties in Microfluidic Chamber2011

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana, Mutsuki Morinaga,Akihiro Kishimura, Murat Gel, Kazunori Kataoka, and Masao Washizu
    • 学会等名
      15th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (MicroTAS 2011)
    • 発表場所
      シアトル、アメリカ合衆国
    • 年月日
      2011-10-05
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Formation of Polymer Vesicles from Microdroplets of Polyion Complex and Examination of Their Physicochemical Properties in Microfluidic Chamber2011

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana, et al.
    • 学会等名
      15th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (MicroTAS 2011)
    • 発表場所
      アメリカ合衆国シアトル
    • 年月日
      2011-10-05
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] EXTENSION, IMMOBILIZATION AND CHEMICAL MODIFICATION OF DOUBLE-STRANDED DNA ON A SOLID SURFACE -TOWARD DIRECT SEQUENCING WITH MICROSCOPY-2010

    • 著者名/発表者名
      K. Nishikawa, M. Kataoka, R. Nagata, A.Kitayama, R. Tero, M. Washizu and H. Oana:
    • 学会等名
      14th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (MicroTAS 2010)
    • 発表場所
      フローニンゲン、オランダ
    • 年月日
      2010-10-04
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Folding Dynamics of Large DNA Molecules under Steady Strong Flow2010

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana, Takuya Saito, Takahiro Sakaue, Daiji Kaneko, Masao Washizu:
    • 学会等名
      The fifth Pacific Rim Conference on Rheology(PRCR5)
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2010-08-05
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Folding Dynamics of Large DNA Molecules under Steady Strong Flow2010

    • 著者名/発表者名
      H.Oana, et al.
    • 学会等名
      the fifth Pacific Rim Conference on Rheology (PRCRS)
    • 発表場所
      北海道大学(札幌市)
    • 年月日
      2010-08-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 基板上に伸長固定した DNA の塩基修飾反応とその検出2010

    • 著者名/発表者名
      西川香里, 片岡正典, 永田麗子, 喜多山篤, 手老龍吾, 鷲津正夫, 小穴英廣
    • 学会等名
      第21回化学とマイクロ・ナノシステム研究会
    • 発表場所
      東京都文京区
    • 年月日
      2010-06-10
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 基板上に伸長固定したDNAの塩基修飾反応とその検出2010

    • 著者名/発表者名
      西川香里, 他
    • 学会等名
      第21回化学とマイクロ・ナノシステム研究会
    • 発表場所
      東京大学(東京都)
    • 年月日
      2010-06-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 相同組換えタンパクを用いた特定塩基配列探索技術の開発

    • 著者名/発表者名
      小穴英廣
    • 学会等名
      第25回化学とマイクロ・ナノシステム研究会
    • 発表場所
      熊本県 熊本市 崇城大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] REAL-TIME FISH USING OPTICALLY-DRIVEN MICROSPHERES FUNCTIONALIZED BY THE HOMOLOGOUS RECOMBINATION PROTEIN, RecA

    • 著者名/発表者名
      Hidehiro Oana
    • 学会等名
      16th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • 発表場所
      沖縄県 宜野湾市 沖縄コンベンションセンター
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.bntl.t.u-tokyo.ac.jp

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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