転写因子とシス調節ＤＮＡの核内動態に基づく細胞特異的転写調節ロジックの解明

• 研究課題/領域番号: 22310120
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 甲南大学
• 研究代表者: 日下部 岳広 甲南大学, 理工学部, 教授 (40280862)
• 研究分担者: 中井 謙太 東京大学, 医科学研究所, 教授 (60217643) ; 鈴木 穣 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40323646) ; 將口 栄一 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, ユニットリーダー (90378563)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2013-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 20,020千円 (直接経費: 15,400千円、間接経費: 4,620千円); 2012年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円); 2011年度: 6,760千円 (直接経費: 5,200千円、間接経費: 1,560千円); 2010年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
• キーワード: 遺伝子 / ゲノム / 転写調節 / 発生・分化 / ホヤ / メダカ

研究概要

次世代型DNAシークエンサーによりmRNAの５'端配列を大量に決定し、ゲノム上にマッピングすることによりホヤゲノム中の転写開始点と遺伝子発現プロファイルを決定した。これらのデータを用いて、組織特異的または発生段階特異的プロモーターの発見、トランススプライシングされる遺伝子の転写開始点の同定、miRNA遺伝子の転写制御領域の同定等の成果が得られた。ホヤとメダカを用いた発生遺伝学的実験解析により、細胞特異的な転写制御に関わる転写因子を同定し、転写因子とシス調節領域の相互作用およびクロマチン構造の変化による、ホヤと脊椎動物で共通の遺伝子発現調節機構を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Characterization of the compact bicistronic microRNA precursor, miR-1/miR-133, expressed specifically in Ciona muscle tissues. (2013)
  • 著者名/発表者名: Rie Kusakabe, Saori Tani, Koki Nishitsuji, Miyuki Shindo, Kohji Okamura, Yuki Miyamoto, Kenta Nakai, Yutaka Suzuki, Takehiro G Kusakabe, Kunio Inoue
  • 雑誌名: Gene Expression Patterns 巻: 13 号: 1-2 ページ: 43-50
  • DOI: 10.1016/j.gep.2012.11.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cis-acting transcriptional repression establishes a sharp boundary in chordate embrvos (2012)
  • 著者名/発表者名: Imai KS, DaidoY, Kusakabe TG, Satou Y
  • 雑誌名: Science 巻: 337 号: 6097 ページ: 964-967
  • DOI: 10.1126/science.1222488
  • 査読あり
• [雑誌論文] A conserved non-reproductive GnRH system in chordates (2012)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G. Kusakabe, Tsubasa Sakai, Masato Aoyama, Yuka Kitajima, Yuki Miyamoto, Toru Takigawa, Yutaka Daido, Kentaro Fujiwara, Yasuko Terashima, Yoko Sugiuchi, Giorgio Matassi, Hitoshi Yagisawa, Min Kyun Park, Honoo Satake, and Motoyuki Tsuda
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7 (7) 号: 7 ページ: e41955-e41955
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0041955
  • 査読あり
• [雑誌論文] Monoaminergic modulation of photoreception in ascidian : Evidence for a proto-hypothalamo-retinal territory (2012)
  • 著者名/発表者名: Florian Razy-Krajka, Euan R. Brown, Takeo Horie, Jacques Callebert, Yasunori Sasakura, Jean-Stéphane Joly, Takehiro G. Kusakabe, and Philippe Vernier
  • 雑誌名: BMC Biology 巻: 10 号: 1 ページ: 45-45
  • DOI: 10.1186/1741-7007-10-45
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cell lineage and cis-regulation for a unique GABAergic/glycinergic neuron type in the larval nerve cord of the ascidian Ciona intestinalis (2012)
  • 著者名/発表者名: K.Nishitsuii
  • 雑誌名: Development, Growth and Differentiation 巻: 54 号: 2 ページ: 177-186
  • DOI: 10.1111/j.1440-169x.2011.01319.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Profiling ascidian promoters as the primordial type of vertebrate promoter (2011)
  • 著者名/発表者名: Kohji Okamura, Riu Yamashita, Noriko Takimoto, Koki Nishitsuji, Yutaka Suzuki, Takehiro G. Kusakabe, and Kenta Nakai
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 12 (Suppl. 3) 号: S3
  • DOI: 10.1186/1471-2164-12-s3-s7
  • 査読あり
• [雑誌論文] COQ6 mutations in human patients produce nephrotic syndrome with sensorineural deafness (2011)
  • 著者名/発表者名: Saskia F. Heeringa他56名
  • 雑誌名: J. Clin. Invest 巻: 121 (5) 号: 5 ページ: 2013-2024
  • DOI: 10.1172/jci45693
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cross-validated methods for promoter/transcription start site mapping in SL trans-spliced genes, established using the Ciona intestinalis troponin I gene (2011)
  • 著者名/発表者名: Parul Khare, Sandra I. Mortimer, Cynthia L. Cleto, Kohji Okamura, Yutaka Suzuki, Takehiro Kusakabe, Kenta Nakai, Thomas H. Meedel, and Kenneth E. M. Hastings
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 39 (7) 号: 7 ページ: 2638-2648
  • DOI: 10.1093/nar/gkq1151
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ependymal cells of chordate larvae are stem-like cells from the adult nervous system (2011)
  • 著者名/発表者名: Horie, T., Shinki, R., Ogura, Y., Kusakabe, T.G., Satoh, N., and Sasakura, Y.
  • 雑誌名: Nature 巻: 469 号: 7331 ページ: 525-528
  • DOI: 10.1038/nature09631
  • 査読あり
• [雑誌論文] 動物の発生と進化の遺伝子発現調節ネットワーク-ゲノムからの挑戦 (2011)
  • 著者名/発表者名: 將口栄一
  • 雑誌名: 生物の科学遺伝65.28-34 巻: 65 ページ: 28-34
• [雑誌論文] Ependymal cells of chordate larvae are stem-like cells that form the adult nervous system (2011)
  • 著者名/発表者名: Takeo Horie
  • 雑誌名: Nature 巻: 469 ページ: 525-528
  • 査読あり
• [雑誌論文] The ANISEED database : digital representation, formalization, and elucidation of a chordate developmental program (2010)
  • 著者名/発表者名: O. Tassy, D. Dauga, F. Daian, D. Sobral, F. Robin, P. Khoueiry, D. Salgado, V Fox, D. Caillol, R. Schiappa, B. Laporte, A. Rios, G. Luxardi, T. Kusakabe, J. S. Joly, S. Darras, L. Christiaen, M. Contensin, H. Auger, C. Lamy, C. Hudson, U. Rothbacher, M. J. Gilchrist, K. W. Makabe, K. Hotta, S. Fujiwara, N. Satoh, Y Satou and P Lemaire
  • 雑誌名: Genome Res 巻: 20 号: 10 ページ: 1459-1468
  • DOI: 10.1101/gr.108175.110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic cis-regulatory networks in the early Ciona intestinalis embryo (2010)
  • 著者名/発表者名: A. Kubo, N. Suzuki, X. Yuan, K. Nakai, N. Satoh, K. S. Imai and Y Satou
  • 雑誌名: Development 巻: 137 号: 10 ページ: 1613-1623
  • DOI: 10.1242/dev.046789
  • 査読あり
• [雑誌論文] Positional variations among heterogeneous nucleosome maps give dynamical information on chromatin (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Tanaka, Itsuki Yoshimura, and Kenta Nakai
  • 雑誌名: Chromosoma. 巻: 119 (4) 号: 4 ページ: 391-404
  • DOI: 10.1007/s00412-010-0264-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] The ANISEED database : Digital representation, formalization, and elucidation of a chordate developmental program (2010)
  • 著者名/発表者名: Olivier Tassy
  • 雑誌名: Genome Research 巻: 20 ページ: 1459-1468
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic cis-regulatory networks in the Ciona intestinalis embryo (2010)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Kubo
  • 雑誌名: Develogmemt 巻: 137 ページ: 1613-1623
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gradual transition from mosaic to global DNA methylation patterns during deuterostome evolution (2010)
  • 著者名/発表者名: Kohji Okamura
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 11(Suppl 7)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Positional variations among heterogeneous nucleosome maps give dynamical information on chromatin (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Tanaka
  • 雑誌名: Chromosoma 巻: 119 ページ: 391-404
  • 査読あり
• [学会発表] ホヤのメチローム解析から探る組織特異的メチル化の起源 (2013)
  • 著者名/発表者名: 横山貴央
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2013-12-05
• [学会発表] カタユウレイボヤにおける転写開始点およびプロモーターの網羅的解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 横森類
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2013-12-03
• [学会発表] Development and function of the sensory and motor systems in the simple chordate Ciona intestinalis (2013)
  • 著者名/発表者名: Také Kusakabe
  • 学会等名: OIST Winter Course"Evolution of Complex Systems"
  • 発表場所: Onna, Okinawa, Japan
  • 年月日: 2013-12-03
• [学会発表] 錐体オプシン遺伝子と共発現するマイクロRNAの役割 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大道裕
  • 学会等名: 日本動物学会第84回大会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2013-09-27
• [学会発表] カタユウレイボヤの運動を制御する神経回路の微細構造解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 柏木洋貴
  • 学会等名: 日本動物学会第84回大会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2013-09-27
• [学会発表] カタユウレイボヤ幼生の遊泳運動制御回路の機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 島井光太郎
  • 学会等名: 日本動物学会第84回大会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 2013-09-27
• [学会発表] Functional and structural evidence for a central pattern generator controlling swimming locomotion of the Ciona intestinalis larva (2013)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: 7th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Naples, Italy
  • 年月日: 2013-07-25
• [学会発表] Identification and transcriptional regulation of a gene encoding a novel BMP-antagonist Pinhead (2013)
  • 著者名/発表者名: Kaoru S. Imai
  • 学会等名: 7th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Naples, Italy
• [学会発表] Cell-lineage analysis of the larval photoreceptor cells in Ciona intestinalis (2013)
  • 著者名/発表者名: Moeko Tanaka
  • 学会等名: 7th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Naples, Italy
• [学会発表] Tracking cells expressing Hedgehog signaling molecules during postembryonic development of Ciona intestinalis (2013)
  • 著者名/発表者名: Megumi Mukai
  • 学会等名: 7th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Naples, Italy
• [学会発表] Molecular characterization of Piwi in the central nervous system of the Ciona larva (2013)
  • 著者名/発表者名: Kotaro Shimai
  • 学会等名: 7th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Naples, Italy
• [学会発表] Ultrastructural analysis of the neural circuit for swimming locomotion of the Ciona intestinalis larva (2013)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Kashiwagi
  • 学会等名: 7th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Naples, Italy
• [学会発表] Genome-wide analysis of transcription start sites and promoters in Ciona intestinalis (2013)
  • 著者名/発表者名: Rui Yokomori
  • 学会等名: 7th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Naples, Italy
• [学会発表] Shared cis-regulatory modules regulate transcription of evolutionarily conserved and bidirectionally transcribed miRNA-opsin gene pairs in the medaka retina (2013)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Daido
  • 学会等名: 17th International Congress of Developmental Biology
  • 発表場所: Cancún, Mexico
• [学会発表] Cis-acting transcriptional repression establishes a sharp boundary in chordate embryos (2013)
  • 著者名/発表者名: Kaoru Imai
  • 学会等名: 17th International Congress of Developmental Biology
  • 発表場所: Cancún, Mexico
• [学会発表] A novel somatic role of Piwi in the central nervous system of the ascidian Ciona intestinalis (2013)
  • 著者名/発表者名: Kotaro Shimai
  • 学会等名: 17th International Congress of Developmental Biology
  • 発表場所: Cancún, Mexico
• [学会発表] Cis-acting transcriptional repression establishes a sharp boundary in chordate embryos(Admp遺伝子はPinhead遺伝子によりタンパク質レベルおよび転写レベルで二重の抑制をうけ動物胚の腹側の領域を決定する) (2013)
  • 著者名/発表者名: Kaoru Imai
  • 学会等名: 第46回日本発生生物学会大会
  • 発表場所: 松江
• [学会発表] Cone subtype-specific microRNAs as putative regulators for photoreceptor subtypes : evidence from primary transcripts localization and target prediction in medaka (2013)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Daido
  • 学会等名: 第19回小型魚類研究会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Cone subtype-specific microRNAs as putative regulators for photoreceptor subtypes: evidence from primary transcripts localization and target prediction in medaka (2013)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Daido, Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: 19th Japanese Medaka and Zebrafish Meeting
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Shared cis-regulatory modules regulate transcription of evolutionarily conserved and bidirectionally transcribed miRNA-opsin gene pairs in the medaka retina (2013)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Daido, Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: 17th International Congress of Developmental Biology
  • 発表場所: Cancun, Mexico
• [学会発表] A novel somatic role of Piwi in the central nervous system of the ascidian Ciona intestinalis (2013)
  • 著者名/発表者名: Kotaro Shimai, Takeo Horie, Koki Nishitsuji, Maki Shirae-Kurabayashi, Akira Nakamura, Rie Kusakabe, Kenta Nakai, Kunio Inoue, Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: 17th International Congress of Developmental Biology
  • 発表場所: Cancun, Mexico
• [学会発表] Development and function of the sensory and motor systems in the simple chordate Ciona intestinalis (2013)
  • 著者名/発表者名: Take Kusakabe
  • 学会等名: OIST Winter Course “Evolution of Complex Systems”
  • 発表場所: Onna, Okinawa, Japan
• [学会発表] Cis-acting transcriptional repression establishes a sharp boundary in chordate embryos (2013)
  • 著者名/発表者名: Kaoru Imai, Yutaka Daido, Takehiro Kusakabe, Yutaka Satou
  • 学会等名: 第46回日本発生生物学会大会
  • 発表場所: 松江
• [学会発表] otxモルファントの光応答から見出されたホヤ幼生の眼外光受容細胞 (2012)
  • 著者名/発表者名: 石本慎一郎
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] カタユウレイボヤ幼生の中枢パターン発生器を構成するGABA/グリシン作動性神経細胞のSoxB1による発生制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森口大輔
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] 共通のシス調節モジュールによる進化的に保存されたmiRNA-オプシン遺伝子対の錐体サブタイプ特異的な転写制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大道裕
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] カタユウレイボヤ中枢神経系におけるPiwiのはたらき (2012)
  • 著者名/発表者名: 島井光太郎
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-12
• [学会発表] ホヤ器官形成過程におけるhedgehogおよびGli発現細胞の挙動とヘッジホッグシグナルの役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 向恵実
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-12
• [学会発表] Deep sequencing analysis of transcription start sites (TSSs) in Ciona intestinalis (2012)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: 2nd International Workshop on Tunicate Information System
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-11-26
• [学会発表] Medaka as a model system to extend novel findings in ascidians to vertebrates (2012)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: 第18回小型魚類研究会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-09-23
• [学会発表] Transcriptional co-regulation of the bidirectionally transcribed cone opsin-miRNA gene pairs in the medaka Oryzias latipes (2012)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Daido
  • 学会等名: 第18回小型魚類研究会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-09-23
• [学会発表] カタユウレイボヤの器官形成過程におけるhedgehogおよびGli発現細胞の追跡 (2012)
  • 著者名/発表者名: 向恵実
  • 学会等名: 日本動物学会第83回大会
  • 発表場所: 豊中
  • 年月日: 2012-09-15
• [学会発表] カタユウレイボヤ幼生のGABA/グリシン作動性神経細胞の発生におけるSoxB1の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森口大輔
  • 学会等名: 日本動物学会第83回大会
  • 発表場所: 豊中
  • 年月日: 2012-09-15
• [学会発表] 同一シス転写調節領域によるメダカ錐体オプシン-miRNA遺伝子対の共発現機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大道裕
  • 学会等名: 日本動物学会第83回大会
  • 発表場所: 豊中
  • 年月日: 2012-09-13
• [学会発表] メダカ視細胞特異的シス転写調節配列のin silico解析と実験検証 (2012)
  • 著者名/発表者名: 浜西桜子
  • 学会等名: 日本動物学会第83回大会
  • 発表場所: 豊中
  • 年月日: 2012-09-13
• [学会発表] メダカの後脳および脊髄に存在する新奇GnRHシステム (2012)
  • 著者名/発表者名: 横田裕子
  • 学会等名: 日本動物学会第83回大会
  • 発表場所: 豊中
  • 年月日: 2012-09-13
• [学会発表] ホヤ中枢神経系におけるPiwiのはたらき (2012)
  • 著者名/発表者名: 島井光太郎
  • 学会等名: ホヤ研究会2012 in京都
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-06-02
• [学会発表] カタユウレイボヤ幼生の眼外光受容細胞 (2012)
  • 著者名/発表者名: 日下部岳広
  • 学会等名: ホヤ研究会2012 in京都
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2012-06-02
• [学会発表] The miRNA-processing enzyme Dicer is required for morphogenesis of the Ciona intestinalis embryo (2012)
  • 著者名/発表者名: Kana Waki
  • 学会等名: Joint Meeting of the 45th Annual Meeting of the Japanese society of Developmental Biologists & the 64th Annual Meeting of the Japanese Society for Cell Biology
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2012-05-31
• [学会発表] A putative role of a Piwi protein in the central nervous system of Ciona intestinalis (2012)
  • 著者名/発表者名: Kotaro Shimai
  • 学会等名: Joint Meeting of the 45th Annual Meeting of the Japanese society of Developmental Biologists & the 64th Annual Meeting of the Japanese Society for Cell Biology
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2012-05-30
• [学会発表] Role of Hh signaling in tunicate development and chordate evolution (2012)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: Hedgehog 2012: Hedgehog Signaling in Development, Evolution and Disease
  • 発表場所: Singapore
  • 年月日: 2012-03-20
• [学会発表] Role of Hh signaling in tunicate development and chordate evolution (2012)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G.Kusakabe
  • 学会等名: Hedgehog 2012 : Hedgehog Signaling in Development, Evolution and Disease
  • 発表場所: BIOPOLIS, Singapore(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-20
• [学会発表] A novel GnRH system in the hindbrain and spinal cord of medaka Oryzias latipes (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuko Yokota
  • 学会等名: 第18回小型魚類研究会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] カタユウレイボヤ幼生のGABA/グリシン作動性神経細胞の発生におけるSoxB1 の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森口大輔、西辻光希、島井光太郎、大道裕、一瀬葵、久原篤、安尾仁良、堀江健生、日下部岳広
  • 学会等名: 日本動物学会第83回大会
  • 発表場所: 豊中
• [学会発表] ホヤ中枢神経系におけるPiwiのはたらき (2012)
  • 著者名/発表者名: 島井光太郎、堀江健生、白江-倉林麻貴、中村輝、日下部岳広
  • 学会等名: ホヤ研究会2012 in Kyoto
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] カタユウレイボヤ幼生の眼外光受容細胞 (2012)
  • 著者名/発表者名: 日下部岳広、原真弓、杉内葉子、前田翔馬、中川将司
  • 学会等名: ホヤ研究会2012 in Kyoto
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] カタユウレイボヤにおける転写開始パターンとプロモーター構造および機能の網羅的解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 横森類
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] ホヤのメチローム解析から探る組織特異的プロモーターメチル化の起源 (2011)
  • 著者名/発表者名: 横山貴央
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] カタユウレイボヤにおける転写開始パターンとプロモーター構造および機能の網羅的解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 横森類
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] ホヤのメチローム解析から探る組織特異的プロモーターメチル化の起源 (2011)
  • 著者名/発表者名: 横山貴央
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Regulation and specification mechanisms of glutamatergic neurons during development of the larval nervous system of the ascidian Ciona intestinalis (2011)
  • 著者名/発表者名: Koki Nishitsuji
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] カタユウレイボヤ幼生のGABA/グリシン作動性神経細胞の細胞系譜と特異的転写調節機構の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 一瀬葵
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] Novel GnRH-producing cells in the hindbrain and the spinal cord of vertebrates (2011)
  • 著者名/発表者名: 瀧川徹
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] Regulation and specification mechanisms of glutamatergic neurons during development of the larval nervous system of the ascidian Ciona intestinalis (2011)
  • 著者名/発表者名: Koki Nishitsuji
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] カタユウレイボヤ幼生のGABA/グリシン作動性神経細胞の細胞系譜と特異的転写調節機構の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 一瀬葵
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] Novel GnRH-producing cells in the hindbrain and the spinal cord of vertebrates (2011)
  • 著者名/発表者名: 瀧川徹
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] カタユウレイボヤ中枢神経系のPiwiの働き (2011)
  • 著者名/発表者名: 島井光太郎
  • 学会等名: 日本動物学会第82回大会
  • 発表場所: 旭川
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] ホヤ幼生のGABA/グリシン作動性神経細胞の細胞系譜と細胞特異的転写制御機構の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 西辻光希
  • 学会等名: 日本動物学会第82回大会
  • 発表場所: 旭川
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] ホヤ幼生のGABA/グリシン作動性神経細胞の細胞系譜と細胞特異的転写制御機構の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 西辻光希
  • 学会等名: 日本動物学会第82回大会
  • 発表場所: 旭川市大雪アリーナ
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] カタユウレイボヤ中枢神経系のPiwiの働き (2011)
  • 著者名/発表者名: 島井光太郎
  • 学会等名: 日本動物学会第82回大会
  • 発表場所: 旭川市大雪アリーナ
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] ホヤ幼生のGABA/グリシン作動性神経細胞形成における転写因子SoxB1の役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 一瀬葵
  • 学会等名: 日本動物学会第82回大会
  • 発表場所: 旭川
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] ホヤ幼生のGABA/グリシン作動性神経細胞形成における転写因子SoxB1の役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 一瀬葵
  • 学会等名: 日本動物学会第82回大会
  • 発表場所: 旭川市大雪アリーナ
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] Are there GnRH-producing cells in the hindbrain and the spinal cord of vertebrates (2011)
  • 著者名/発表者名: Toru Takigawa
  • 学会等名: 第17回小型魚類研究会
  • 発表場所: 静岡県三島市
  • 年月日: 2011-09-08
• [学会発表] Bidirectionally transcribed cone opsin-miRNA gene pairs in the medaka Oryzias latipes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Daido
  • 学会等名: 第17回小型魚類研究会
  • 発表場所: 静岡県三島市
  • 年月日: 2011-09-08
• [学会発表] Bidirectionally transcribed cone opsin-miRNA gene pairs in the medaka Oryzias latipes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Daido
  • 学会等名: 第17回小型魚類研究会
  • 発表場所: 東レ総合研修センター
  • 年月日: 2011-09-08
• [学会発表] 脊索動物に脊椎動物の起源を探る (2011)
  • 著者名/発表者名: 日下部岳広
  • 学会等名: 日本進化学会第13回大会・シンポジウム「脳はどうやってうまれ,どうやって複雑化していったのか」
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-07-31
• [学会発表] 脊索動物に脊椎動物の起源を探る (2011)
  • 著者名/発表者名: 日下部岳広
  • 学会等名: 日本進化学会第13回大会
  • 発表場所: 京都大学百年記念ホール(招待講演)
  • 年月日: 2011-07-31
• [学会発表] Deep evolutionary origin of non-reproductive GnRH in chordates (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G.Kusakabe
  • 学会等名: 6th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Montreal, Canada
  • 年月日: 2011-07-07
• [学会発表] A putative somatic role of the germline-specific gene piwi in the central nervous system of Ciona intestinalis (2011)
  • 著者名/発表者名: Kotaro Shimai
  • 学会等名: 6th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Montreal, Canada
  • 年月日: 2011-07-07
• [学会発表] Specification and differentiation of a GABAergic/glycinergic neuron subtype in the Ciona intestinalis larva (2011)
  • 著者名/発表者名: Koki Nishitsuji
  • 学会等名: 6th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Montreal, Canada
  • 年月日: 2011-07-07
• [学会発表] The tunicate nervous system : insights into the origin of vertebrate-specific traits (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: 第8回国際比較生理生化学会議(ICCPB2011) Symposium S31"Evolving shapes and development - viewed from changes in gene regulations"
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2011-06-05
• [学会発表] The tunicate nervous system : insights into the origin of vertebrate-specific traits (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G.Kusakabe
  • 学会等名: 第8回国際比較生理生化学会議
  • 発表場所: 名古屋国際会議場(招待講演)
  • 年月日: 2011-06-05
• [学会発表] Towards understanding the role of cis-regulatory regions in evolution? (2011)
  • 著者名/発表者名: Kenta Nakai
  • 学会等名: 日本発生生物学会第44回大会
  • 発表場所: 沖縄コンベンションセンター(招待講演)
  • 年月日: 2011-05-21
• [学会発表] 神経系の発生と多様性:脊索動物モデル・ホヤから脊椎動物モデル・メダカへの展開 (2011)
  • 著者名/発表者名: 日下部岳広
  • 学会等名: 第9回関西小型魚類勉強会
  • 発表場所: 独立行政法人産業総合技術研究所尼崎支所
  • 年月日: 2011-05-12
• [学会発表] 神経系の発生と多様性:脊索動物モデル・ホヤから脊椎動物モデル・メダカへの展開 (2011)
  • 著者名/発表者名: 日下部岳広
  • 学会等名: 第9回関西小型魚類勉強会
  • 発表場所: 産業総合技術研究所、尼崎(招待講演)
  • 年月日: 2011-05-12
• [学会発表] Sequence analyses of genetic and epigenetic information for transcriptional regulation (2011)
  • 著者名/発表者名: Kenta Nakai
  • 学会等名: The 9th Asia Pacific Bioinformatics Conference
  • 発表場所: Incheon, Korea
  • 年月日: 2011-01-14
• [学会発表] Sequence Analyses of genetic and epigenetic information for transcriptional regulation (2011)
  • 著者名/発表者名: Kenta Nakai
  • 学会等名: The 9th Asia Pacific Bioinformatics Conference
  • 発表場所: Incheon, Korea(招待講演)
  • 年月日: 2011-01-14
• [学会発表] Transcriptional regulation underlying the differentiation of glutamatergic neurons in the Ciona intestinalis larva (2011)
  • 著者名/発表者名: Koki Nishitsuji
  • 学会等名: International Symposium Genetic Regulation of Development : Commemorative of 27th International Prize for Biology
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Cell lineage and transcriptional regulation for a GABAergic/glycinergic neuron subtype in the ascidian larva (2011)
  • 著者名/発表者名: Aoi Ichinose
  • 学会等名: International Symposium Genetic Regulation of Development : Commemorative of 27th International Prize for Biology
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Bidirectionally transcribed cone opsin-miRNA gene pairs in the medaka Oryzias latipes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Daido
  • 学会等名: International Symposium Genetic Regulation of Development : Commemorative of 27th International Prize for Biology
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Deep evolutionary origin of non-reproductive GnRH in chordates (2011)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: 6th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Montréal, Canada
• [学会発表] A putative somatic role of the germline-specific gene piwi in the central nervous system of Ciona intestinalis (2011)
  • 著者名/発表者名: Kotaro Shimai
  • 学会等名: 6th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Montréal, Canada
• [学会発表] Specification and differentiation of a GABAergic/glycinergic neuron subtype in the Ciona intestinalis larva (2011)
  • 著者名/発表者名: Koki Nishitsuji
  • 学会等名: 6th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Montréal, Canada
• [学会発表] Transcriptional regulation underlying the differentiation of glutamatergic neurons in the Ciona intestinalis larva (2011)
  • 著者名/発表者名: Koki Nishitsuji
  • 学会等名: International Symposium Genetic Regulation of Development
  • 発表場所: 京都ガーデンパレス
• [学会発表] Bidirectionally transcribed cone opsin-miRNA gene pairs in the medaka Oryzias latipes (2011)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Daido
  • 学会等名: International Symposium Genetic Regulation of Development
  • 発表場所: 京都ガーデンパレス
• [学会発表] bHLH型転写因子Ptf1aはホヤ幼生においてドーパミン作動性ニューロンの分化に必須である (2010)
  • 著者名/発表者名: 堀江健生
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] bHLH型転写因子Ptflaはホヤ幼生においてドーパミン作動性ニューロンの分化に必須である (2010)
  • 著者名/発表者名: 堀江健生
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] Current status of tunicate databases : DBTGR (2010)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G.Kusakabe
  • 学会等名: 1st Tunicate Information System Meeting
  • 発表場所: Nice, France(招待講演)
  • 年月日: 2010-11-12
• [学会発表] 転写因子SoxB1はホヤ幼生の尾部前端部抑制性ニューロンの発生に必要である (2010)
  • 著者名/発表者名: 一瀬葵
  • 学会等名: 日本動物学会第81回東京大会
  • 発表場所: 東京大学教養学部(駒場キャンパス)
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] 転写因子SoxB1はホヤ幼生の尾部前端部抑制性ニューロンの発生に必要である (2010)
  • 著者名/発表者名: 一瀬葵
  • 学会等名: 日本動物学会第81回東京大会
  • 発表場所: 東京大学駒場キャンパス
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] Transcriptional mechanisms underlying specification of neuron subtypes in the Ciona intestinalis larva (2010)
  • 著者名/発表者名: Koki Nishitsuji
  • 学会等名: 2nd Joint Meeting of The SFBD and JSDB 2010
  • 発表場所: Paris, France
  • 年月日: 2010-05-26
• [学会発表] Current status of tunicate databases : DBTGR (2010)
  • 著者名/発表者名: Takehiro G. Kusakabe
  • 学会等名: 1st Tunicate Information System Meeting
  • 発表場所: Nice, France
• [学会発表] Transcriptional mechanisms underlying specification of neuron subtypes in the Ciona intestinalis larva (2010)
  • 著者名/発表者名: Koki Nishitsuji
  • 学会等名: 2nd Joint Meeting of The SFBD and JSDB 2010 - From Cells to Organs
  • 発表場所: Institut Pasteur–Paris, France
• [図書] Genome Structure, Functional Genomics, and Proteomics in Ascidians. Paul Denny, Chittaranjan Kole (Eds) Genome Mapping and Genomics in Laboratory Animals : Genome Mapping and Genomics in Animals (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasunori Sasakura, Nicolas Sierro, Kenta Nakai, Kazuo Inaba, and Takehiro G. Kusakabe
  • 総ページ数: 261
  • 出版者: Springer-Verlag, Berlin Heidelberg
• [図書] Genome Structure, Functional Genomics, and Proteomics in Ascidians. In: Paul Denny, Chittaranjan Kole (Eds) Genome Mapping and Genomics in Laboratory Animals: Genome Mapping and Genomics in Animals, Vol. 4. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasunori Sasakura, Nicolas Sierro, Kenta Nakai, Kazuo Inaba, Takehiro G. Kusakabe
  • 総ページ数: 261
  • 出版者: Springer-Verlag, Berlin Heidelberg
• [備考] ホヤ遺伝子制御データベース(DBTGR)
  • URL: http://dbtgr.hgc.jp/
• [備考] ホヤ統合データベース(Aniseed)
  • URL: http://crfb.univ-mrs.fr/aniseed/
• [備考] DBTGR: Database of Tunicate Gene Regulation
  • URL: http://dbtgr.hgc.jp/
• [備考]
  • URL: http://dbtgr.hgc.jp/
• [備考]
  • URL: http://dbtgr.hgc.jp/