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乳癌の個別化医療実現のための遺伝子異常の探索

研究課題

研究課題/領域番号 22310123
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 ゲノム医科学
研究機関独立行政法人国立がん研究センター

研究代表者

細田 文恵  独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (30219191)

連携研究者 柴田 龍弘  独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (90311414)
十時 泰  独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (10373333)
津田 均  防衛医科大学校, 病態病理学講座, 教授 (70217321)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 13,200千円、間接経費: 3,960千円)
2012年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2011年度: 6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円)
2010年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
キーワード乳癌 / リンパ節転移 / エクソンシークエンス / 個別化医療 / 遺伝子変異 / ゲノム構造異常解析
研究概要

次世代シークエンス技術を用いて乳癌の遺伝子異常を探索し、個別化医療実現のための新規治療標的分子または診断マーカーの開発を目指す目的で研究を行なった。乳癌6 症例のペア12 サンプル(原発腫瘍、非癌乳腺組織)と14 症例のトリオ42 サンプル(原発腫瘍、転移リンパ節腫瘍、非癌リンパ節)の全エクソンシークエンスを解析し、アミノ酸置換やスプライシング異常を生じる一塩基配列変異を抽出した。乳癌においてリンパ節転移の有無は予後不良とよく相関する。特にリンパ節転移を解析対象に含めたトリオ比較解析に重点を置き、原発腫瘍、転移リンパ節腫瘍それぞれにおける遺伝子変異の特徴を調べた。各症例における突然変異数(原発腫瘍+転移リンパ節腫瘍)は多いもの(1710 個)から少ないもの(34 個)まで様々であった。原発腫瘍と転移リンパ節腫瘍間で突然変異の多く(89%)を共有する症例は1 症例のみで、他症例では30%以下であった。統計学的解析から、乳癌原発腫瘍の発生に重要と考えられる遺伝子 132 個、リンパ節転移に重要と考えられる遺伝子189 個をそれぞれ絞り込んだ。これらの遺伝子は乳癌の治療標的候補であるとともに、早期に乳癌の悪性度を予測または悪性化を予防する医薬品開発に繋がる可能性がある。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (7件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Mouse Model for ROS1-Rearranged Lung Cancer.2013

    • 著者名/発表者名
      Arai Y, Totoki Y, Takahashi H, Nakamura H, Hama N, Kohno T, Tsuta K, Yoshida A, Asamura H, Mutoh M, Hosoda F, Tsuda H, Shibata T
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8(2) 号: 2 ページ: e56010-e56010

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0056010

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Whole-genome sequencing of liver cancers identifies etiological influences on mutation patterns and recurrent mutations in chromatin regulators.2012

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto A, Totoki Y, Abe T, Boroevich KA, Hosoda F, Nguyen HH, Aoki M, Hosono N, Kubo M, Miya F, Arai Y, Takahashi H, Shirakihara T, Nagasaki M, Shibuya T, Nakano K, Watanabe-Makino K, Tanaka H, Nakamura H, Kusuda J, Ojima H, Shimada K, Okusaka T, Ueno M, Shigekawa Y, Kawakami Y, Arihiro K, Ohdan H, Gotoh K, Ishikawa O, Ariizumi S, Yamamoto M, Yamada T, Chayama K, Kosuge T, Yamaue H, Kamatani N, Miyano S, Nakagama H, Nakamura Y, Tsunoda T, Shibata T, Nakagawa H
    • 雑誌名

      Nature Genetic

      巻: 44 号: 7 ページ: 760-764

    • DOI

      10.1038/ng.2291

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-resolution characterization of a hepatocellular carcinoma genome2011

    • 著者名/発表者名
      Totoki Y, Tatsuno K, Yamamoto S, Arai Y, Hosoda F, Ishikawa S, Tsutsumi S,Sonoda K, Totsuka H, Shirakihara T,Sakamoto H, Wang L, Ojima H, Shimada K, Kosuge T, Okusaka T, Kato K, Kusuda J, Yoshida T, Aburatani H & S h i b a t a T
    • 雑誌名

      Nat Genet

      巻: 43(5) 号: 5 ページ: 464-9

    • DOI

      10.1038/ng.804

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DEK oncoprotein regulates transcriptional modifiers and sustains tumor initiation activity in high-grade neuroendocrine carcinoma of the lung.2010

    • 著者名/発表者名
      Shibata T, Kokubu A, Miyamoto M, Hosoda F, Gotoh M, Tsuta K, Asamura H, Matsuno Y, Kondo T, Imoto I, Inazawa J, Hirohashi S
    • 雑誌名

      Oncogene

      巻: 29 ページ: 4671-4681

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 乳がん原発巣とリンパ節転移巣における遺伝的変異の解析2012

    • 著者名/発表者名
      細田文恵、十時 泰、新井康仁、津田 均、 井本逸勢、稲澤譲治、大木 操、柴田龍弘
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      ロイトン札幌(札幌市)
    • 年月日
      2012-09-21
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Genetic variations in primary breast cancer and its metastatic tumor.2012

    • 著者名/発表者名
      Fumie Hosoda
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      ロイトン札幌(札幌市)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Comparison of genetic alterations in primary breast cancer and its metastatic tumor.2011

    • 著者名/発表者名
      Hosoda F, Totoki Y, Arai Y, Tsuda H, Imoto I, Inazawa J, Ohki M, Shibata T
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Comparison of genetic alterations in primary breast cancer and its metastatic tumor2011

    • 著者名/発表者名
      Hosoda F, Totoki Y, et al
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] F-box and leucine-repeat protein 17 (FBXL17)は新規のがん抑制遺伝子である2010

    • 著者名/発表者名
      新井康仁、細田文恵、島 豊、中西幸浩、 柳原五吉、北林一生、大木 操、広橋説雄、 柴田龍弘
    • 学会等名
      第69回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      大阪国際会議場(大阪市)
    • 年月日
      2010-09-23
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 全ゲノムシークエンスによる肝癌のゲノム構造異常解析2010

    • 著者名/発表者名
      山本尚吾、十時 泰、薗田幸太郎、細田 文恵、白木原琢哉、辰野健二、柴田龍弘、油 谷浩幸
    • 学会等名
      第69回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      大阪国際会議場(大阪市)
    • 年月日
      2010-09-23
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] F-box and leucine-repeat protein 17(FBXL17)は新規のがん抑制遺伝子である2010

    • 著者名/発表者名
      新井康仁、細田文恵, ら
    • 学会等名
      第69回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      大阪国際会議場(大阪市)
    • 年月日
      2010-09-23
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.ncc.go.jp/jp/nccri/divisions/19genom/index.html

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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