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逆遺伝学的変異導入の最適化と相同組換えの分子機構

研究課題

研究課題/領域番号 22370001
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 遺伝・ゲノム動態
研究機関静岡県立大学

研究代表者

飯田 滋  静岡県立大学, 大学院・食品栄養環境科学研究院, 客員教授 (30012777)

研究分担者 定塚 恵世 (久富 恵世 / 定塚 恵世(久富恵世))  静岡県立大学, 大学院・薬学研究科, 博士研究員 (60517887)
木下 哲  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 研究チーム長 (60342630)
石崎 公庸  京都大学, 大学院・生命科学研究科, 助教 (00452293)
連携研究者 小林 裕和  静岡県立大学, 大学院・食品栄養環境科学研究院, 教授 (80170348)
野口 博司  静岡県立大学, 薬学部, 教授 (60126141)
渡辺 賢二  静岡県立大学, 薬学部, 准教授 (50360938)
定塚 恵世 (久富 恵世)  静岡県立大学, 大学院・食品栄養環境科学研究院, 客員研究員 (60517887)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
18,850千円 (直接経費: 14,500千円、間接経費: 4,350千円)
2012年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2011年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2010年度: 10,010千円 (直接経費: 7,700千円、間接経費: 2,310千円)
キーワード植物 / 分子遺伝 / 逆遺伝学 / 遺伝子 / 突然変異 / バイオテクノロジー / ゲノム / 遺伝学 / 組換え機構
研究概要

逆遺伝学的変異導入には、相同組換えによる遺伝子ターゲティングやトランスポゾンを用いた遺伝子タギングなどが含まれる。我々が開発したポジティブ・ネガティブ選抜によるターゲティングや内在性の DNA トランスポゾンを利用したタギングの最適化をめざして、関連する組換え機構とその制御機構を解明し、さらに得られたターゲティングによるポジティブ選抜遺伝子の挿入やトランスポゾンの挿入に係わる遺伝子の機能解明も行った。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (53件)

すべて 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (21件) (うち査読あり 21件) 学会発表 (28件) (うち招待講演 1件) 図書 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Homologous recombination-mediated gene targeting in the liverwort Marchantia polymorpha2013

    • 著者名/発表者名
      K. Ishizaki, Y. Johzuka-Hisatomi, S. Ishida, S. Iida and T. Kohchi
    • 雑誌名

      L. Sci. Rep

      巻: 3 号: 1 ページ: 1532-1532

    • DOI

      10.1038/srep04532

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] TAWAWA1, a novel regulator of rice inflorescence architecture, functions through the suppression of meristem phase transition.2013

    • 著者名/発表者名
      Akiko Yoshida
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      巻: 110 号: 2 ページ: 767-772

    • DOI

      10.1073/pnas.1216151110

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Homologous recombination-mediated gene targeting in the liverwort Marchantia polymorpha L.2013

    • 著者名/発表者名
      K. Ishizaki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 3 号: 1 ページ: 1532-1532

    • DOI

      10.1038/srep01532

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A null mutation of ROS1a for DNA demethylation in rice is not transmittable to progeny2012

    • 著者名/発表者名
      A. Ono, K. Yamaguchi, S. Fukada-Tanaka, R. Terada, T. Mitsui and S. Iida
    • 雑誌名

      Plant J

      巻: 71 号: 4 ページ: 564-574

    • DOI

      10.1111/j.1365-313x.2012.05009.x

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Activation and epigenetic regulation of DNA transposon nDart1 in rice2012

    • 著者名/発表者名
      C.-H. Eun, K. Takagi, K.-I. Park, M. Maekawa, S. Iida and K. Tsugane
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol

      巻: 53 号: 5 ページ: 857-868

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs060

    • NAID

      10030654499

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of EST-SSR markers of <i>Ipomoea nil</i>2012

    • 著者名/発表者名
      T. Ly, H. Fukuoka, A. Otaka, A. Hoshino, S. Iida, E. Nitasaka, N. Watanabe and T. Kuboyama
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 62 号: 1 ページ: 99-104

    • DOI

      10.1270/jsbbs.62.99

    • NAID

      130004146342

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The molecular basis of incomplete dominance at the A locus of CHS-D in the common morning glory, Ipomoea purpurea2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Johzuka-Hisatomi, H. Noguchi and S. Iida
    • 雑誌名

      J. Plant Res

      巻: 124 ページ: 299-304

    • NAID

      10027868379

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Examination of transpositional activity of nDart1 at different stages of rice development2011

    • 著者名/発表者名
      M. Hayashi-Tsugane, M. Maekawa, H. Kobayashi, S. Iida and K. Tsugane
    • 雑誌名

      Genes Genet, Syst

      巻: 86 ページ: 215-219

    • NAID

      10029679006

    • URL

      https://www.jstage.jst.go.jp/article/ggs/86/3/86_3_215/_article

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A bHLH transcription factor, DvIVS, is involved in regulation of anthocyanin synthesis in dahlia (Dahlia variabilis2011

    • 著者名/発表者名
      S. Ohno, M. Hosokawa, A. Hoshino, Y. Kitamura, Y. Morita, K.-I. Park, A.Nakashima, A. Deguchi, F. Tatsuzawa, M. Doi, S, Iida and S. Yazawa
    • 雑誌名

      J. Exp. Bot

      巻: 62 号: 14 ページ: 5105-5116

    • DOI

      10.1093/jxb/err216

    • NAID

      120005477211

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Anthocyanin pigmentation controlled by speckled and c-1 mutations of Japanese morning glory2011

    • 著者名/発表者名
      N. Saito, F. Tatsuzawa, A. Hoshino, Y. Abe, M. Ichimura, M. Yokoi, K. Toki, Y. Morita, S. Iida and T. Honda
    • 雑誌名

      J. Japan Soc. Hort. Sci

      巻: 80 ページ: 452-460

    • NAID

      130004951646

    • URL

      https://www.jstage.jst.go.jp/article/jjshs1/80/4/80_4_452/_article

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Constitutive expression of the GIGANTEA ortholog affects circadian rhythms and suppresses one-shot induction of flowering in Pharbitis nil, a typical short-day plant2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Higuchi, K. Sage-Ono, R. Sasaki, N. Ohtsuki, A. Hoshino, S. Iida, H. Kamada and M. Ono
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol

      巻: 52 号: 4 ページ: 638-650

    • DOI

      10.1093/pcp/pcr023

    • NAID

      10029710157

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A rice mutant displaying a heterochronically elongated internode carries a 100 kb deletion2011

    • 著者名/発表者名
      M. Hayashi-Tsugane, M. Maekawa, Q. Qian, H. Kobayashi, S. Iida and K. Tsugane
    • 雑誌名

      J. Genet. Genomics

      巻: 38 ページ: 123-128

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] メンデルの法則における不完全優性と植物の遺伝子量効果2011

    • 著者名/発表者名
      定塚(久富) 恵世、山内卓樹、飯田滋
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 83 ページ: 638-642

    • NAID

      10029322323

    • URL

      http://www.jbsoc.or.jp/event/magazine/pdf/83-07-09.pdf

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Examination of transpositional activity of nDart1 at different stages of rice development.2011

    • 著者名/発表者名
      M. Hayashi-Tsugane
    • 雑誌名

      Genes Genet. Syst.

      巻: 86 ページ: 215-219

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A rice mutant displaying a heterochronically elongated internode carries a 100 kb deletion.2011

    • 著者名/発表者名
      M. Hayashi-Tsugane
    • 雑誌名

      J. Genet. Genomics

      巻: 38 号: 3 ページ: 123-128

    • DOI

      10.1016/j.jgg.2011.02.004

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A rice mutant displaying a heterochronically elongated internode carries a 100 kb deletion.2011

    • 著者名/発表者名
      Hayashi-Tsugane, M.
    • 雑誌名

      J.Genet.Genomics

      巻: (印刷中)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] メンデルの法則における不完全優性と植物の遺伝子量効果2011

    • 著者名/発表者名
      定塚(久富)恵世
    • 雑誌名

      生化学

      巻: (印刷中)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transposition and target preferences of an active nonautonomous DNA transposon nDart1 and its relatives belonging to the hAT superfamily in rice2010

    • 著者名/発表者名
      K. Takagi, M. Maekawa, K. Tsugane and S. Iida
    • 雑誌名

      Mol. Genet. Genomics

      巻: 284 号: 5 ページ: 343-355

    • DOI

      10.1007/s00438-010-0569-9

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cre-loxP mediated marker elimination and gene reactivation at the waxy locus created in rice genome based on strong positive-negative selection2010

    • 著者名/発表者名
      R. Terada, M. Nagahara, K. Furukawa, M. Shimamoto, K. Yamaguchi and S. Iida
    • 雑誌名

      Plant Biotechnol

      巻: 27 ページ: 29-37

    • NAID

      10026411331

    • URL

      http://www.wdc-jp.biz/pdf_store/jspcmb/pdf/pb27_1/27_29.pdf

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cre-lox mediated marker elimination and gene reactivation at waxy locus created in the rice genome based on strong positive-negative selection.2010

    • 著者名/発表者名
      Terada, R.
    • 雑誌名

      Plant Biotechnol.

      巻: 27 ページ: 29-37

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transposition and target preferences of an active nonautonomous DNA transposon nDart1 and its relatives belonging to the hAT superfamily in rice.2010

    • 著者名/発表者名
      Takagi, K.
    • 雑誌名

      Mol.Gen.Genomics

      巻: 284 ページ: 343-355

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] A transposon suppressor Dart-canceller in the wild rice2013

    • 著者名/発表者名
      K. Tsugane, H. Nishimura, Mhayashi-Tsugane, S. Iida and M. Maekawa
    • 学会等名
      第54回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岡山
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Identification of the transposon-tagged gene essential for chloloplast biogenesis in rice2013

    • 著者名/発表者名
      M. Hayashi-Tsugane, H. Takahara, N. Ahmed, E. Himi, K. Takagi, S. Iida, M.Maekawa and K. Tsugane
    • 学会等名
      第54回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岡山
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] EST-SSR と EST-SNP を用いたアサガオ連鎖地図の作成2013

    • 著者名/発表者名
      伊東拓朗、奥野菫、勝山弘章、森山拳斗、仁田坂英二、星野敦、飯田滋、福岡浩之、磯部祥子、佐藤修正、渡部信義、久保山勉
    • 学会等名
      日本育種学会第123回講演会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] A transposon suppressor Dart-canceller in the wild rice.2013

    • 著者名/発表者名
      K. Tsugane
    • 学会等名
      第54回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岡山
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] イネ内在性 DNA トランスポゾン nDart1 のエピジェネティックな転移活性の制御2012

    • 著者名/発表者名
      栂根一夫、Eun Chang-Ho、高木恭子、栂根美佳、飯田滋
    • 学会等名
      日本育種学会第122回講演会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] コシヒカリ nDart1-0 タグラインの育成2012

    • 著者名/発表者名
      西村秀希、氷見英子、 飯田滋、栂根一夫、前川雅彦
    • 学会等名
      日本育種学会第122回講演会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 野生イネゲノム中の栽培イネトランスポゾンを抑制する新規因子2012

    • 著者名/発表者名
      栂根一夫、栂根美佳、 飯田滋、前川雅彦
    • 学会等名
      日本遺伝学会第84回大会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] アサガオの模様にみるエピジェネティックな遺伝子発現制御の獲得機構2012

    • 著者名/発表者名
      星野敦、朴慶一、飯田滋
    • 学会等名
      日本進化学会第14回東京大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Epigenetic regulation of flower variegation in Ipomoea tricolor2012

    • 著者名/発表者名
      A. Hoshino, K.-I. Park and S. Iida
    • 学会等名
      第8回生物学国際高等コンファレンス(OBC8)
    • 発表場所
      岡崎
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] アサガオの模様を生み出す small RNA の機能と制御2012

    • 著者名/発表者名
      森田裕将、星野敦、飯田滋
    • 学会等名
      第53回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] イネ内在性DNAトランスポゾンnDartのエピゲネティックな転移活性の制御2012

    • 著者名/発表者名
      栂根一夫
    • 学会等名
      日本育種学会第122回講演会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] コシヒカリnDart1-0タグラインの育成2012

    • 著者名/発表者名
      西村秀希
    • 学会等名
      日本育種学会第122回講演会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 野生イネゲノム中の栽培イネトランスポゾを抑制する新規因子2012

    • 著者名/発表者名
      栂根一夫
    • 学会等名
      日本遺伝学会第84回大会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] DNA トランスポゾン nDart1 挿入により生じたイネ半優性矮化多分げつ変異体の解析2011

    • 著者名/発表者名
      栂根(林)美佳、前川雅彦、 飯田滋、栂根一夫
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] イオンビーム処理によるイネのDNA トランスポゾン Dart の活性化2011

    • 著者名/発表者名
      前川雅彦、西村秀希、氷見英子、 飯田滋、栂根一夫
    • 学会等名
      日本育種学会第122回講演会
    • 発表場所
      福井
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] アザシチジン処理で活性化した自律性因子 Dart の特定2011

    • 著者名/発表者名
      西村秀希、氷見英子、 飯田滋、栂根一夫、前川雅彦
    • 学会等名
      第122回日本育種学会講演会
    • 発表場所
      福井
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] アサガオの模様から RNA サイレンシングの制御と機能を探る2011

    • 著者名/発表者名
      森田裕将、星野敦、飯田滋
    • 学会等名
      日本遺伝学会第83回大会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ソライロアサガオの模様に係わるエピジェネティクス2011

    • 著者名/発表者名
      星野敦、朴慶一、崔丁斗、飯田滋
    • 学会等名
      第52回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] イネ DNA トランスポゾン nDart1 の挿入領域の特徴と利用2011

    • 著者名/発表者名
      栂根一夫、高木恭子、栂根(林)美佳、前川雅彦、飯田滋
    • 学会等名
      日本育種学会第121回講演会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Modification of an endogenous rice gene by homologous recombination and its applications.2011

    • 著者名/発表者名
      Iida, S.
    • 学会等名
      GCOE国際拠点形成シンポジウム
    • 発表場所
      静岡
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Rice functional genomics: Homologous recombination-promoted gene targeting of endogenous genes.2011

    • 著者名/発表者名
      Iida, S.
    • 学会等名
      The 4th International Conference on Health and Longevity Science
    • 発表場所
      静岡
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] アザシチジン処理で活性化した自律性因子Dartの特定2011

    • 著者名/発表者名
      西村秀希
    • 学会等名
      日本育種学会 第120回講演会
    • 発表場所
      福井
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] イオンビーム処理によるイネのDNAトランスポゾンDartの活性化2011

    • 著者名/発表者名
      前川雅彦
    • 学会等名
      日本育種学会第122回講演会
    • 発表場所
      福井
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Functional analysis of Os ROS1a by homologous recombination-promoted gene targeting.2010

    • 著者名/発表者名
      Ono, A.
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会及び第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-04
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Functional analysis of OsROS1aby homologous recombination-promoted gene targeting2010

    • 著者名/発表者名
      A. Ono, K. Yamaguchi, Y. JohtsukaHisatomi, T. Mitsui, R. Terada and S. Iida
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会及び第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 大規模欠失によるイネ節間伸張異常変異体の遺伝学的解析2010

    • 著者名/発表者名
      栂根美佳、前川雅彦、Qian Qian、小林裕和、飯田滋、栂根一夫
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会及び第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] mRNA の網羅的塩基配列解読によるアサガオ SNP マーカーの作出2010

    • 著者名/発表者名
      リートン、福岡浩之、星野敦、飯田滋、仁田坂英二、久保山勉
    • 学会等名
      日本育種学会第118回講演会
    • 発表場所
      秋田
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] イネ内在性 DNA トランスポゾン nDart の挿入部位指向性と遺伝子タギングへの応用2010

    • 著者名/発表者名
      栂根一夫、高木恭子、前川雅彦、 飯田滋
    • 学会等名
      イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2010
    • 発表場所
      つくば
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] Effective contribution of the nDart transposon-tagging system to rice functional genomics. K. V. Urbano ed2011

    • 著者名/発表者名
      M. Maekawa, K. Tsugane and S. Iida
    • 出版者
      Advances in Genetics Research rice functional genomics. K. V. Urbano ed
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] Adv. Genetics Res. Vol. 42011

    • 著者名/発表者名
      Maekawa, M.
    • 出版者
      Nova Sci. Pub. Inc.
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [図書] Adv.Genetics Res.Vol.42011

    • 著者名/発表者名
      Maekawa, M.
    • 出版者
      Nova Sci.Pub.Inc.(印刷中)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://sfns.u-shizuoka-ken.ac.jp/molgen/

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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