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適応放散的種分化の進化ゲノム遺伝学的研究:小笠原固有植物の進化解析

研究課題

研究課題/領域番号 22370031
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物多様性・分類
研究機関東京大学

研究代表者

伊藤 元己  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 教授 (00193524)

研究分担者 森長 真一  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教 (80568262)
上原 浩一  千葉大学, 園芸学部, 准教授 (20221799)
青木 誠志郎  東京大学, 総合文化研究科, 研究員 (10334301)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円)
2012年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円)
2011年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2010年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円)
キーワード適応放散 / 種分化 / アゼトウナ属 / ゲノム / 固有種
研究概要

本研究では、適応放散的種分化がおきている小笠原固有植物を最新ゲノム解析技術を使用することにより、従来の研究手法では困難であった適応放散的種分化をもたらした遺伝的変異の特定を試みた。ヘラナレン、コヘナラレン、アゼトウナ、ヤクシソウについてRNAseq法により解析を行った。その結果得られた遺伝子配列を対象にして、ヘラナレンとコヘラナレンで有意に発現量の異なる遺伝子の相互比較を行った結果、1つのフラボノイド合成系の遺伝子候補に挙がった。また、1年生草本のヤクシソウと比較して、発現が有意に異なる遺伝子を探索した結果、2個が維管束形成に関与する遺伝子であった。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 3件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] AP2-type transcription factors determine stem cell identity in the moss Physcomitrella patens.2012

    • 著者名/発表者名
      Aoyama T, Hiwatashi Y, Shigyo M, Kofuji R, Kubo M, Ito M, Hasebe M.
    • 雑誌名

      Development

      巻: 139 ページ: 3120-3129

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Current progress in DNA barcoding and future implications for entomology2011

    • 著者名/発表者名
      Jinbo, U., Kato, T. and Ito, M
    • 雑誌名

      Entomological Science

      巻: 14(2) ページ: 107-124

    • NAID

      10030579458

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Reticulate evolution in the Crepidomanes minutum species complex (Hymenophyllaceae)2011

    • 著者名/発表者名
      Nitta, J., Ebihara, A., Ito, M
    • 雑誌名

      Amer. J. Bot

      巻: 98 ページ: 1782-1800

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Reticulate evolution in the Crepidomanes minutum species complex (Hymenophyllaceae)2011

    • 著者名/発表者名
      Nitta,J., Ebihara, A., Ito, M.
    • 雑誌名

      Amer.J.Bot.

      巻: 98 ページ: 1782-1800

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular Species Identification with Rich Floristic Sampling : DNA Barcoding the Pteridophyte Flora of Japan2010

    • 著者名/発表者名
      Ebihara, A., J.H.Nitta, M.Ito
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 5

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [図書] Eco-evolutionary genomic observation for local and global environmental changes2013

    • 著者名/発表者名
      Morinaga, S.-I., T. Iwasaki, and Y. Suyama
    • 出版者
      Springer(in press)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] A Novel Tool for Observation of Biodiversity2012

    • 著者名/発表者名
      Kato, T., Jinbo, U., Ito, M
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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