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核外輸送因子複合体との結晶構造解析によるtRNA核外輸送機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22370041
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関大阪大学

研究代表者

山下 栄樹  大阪大学, 蛋白質研究所, 助教 (00294132)

研究協力者 山澤 龍治  大阪大学, 蛋白質研究所, 博士研究員
小林 武  大阪大学, 大学院・理学研究科, 博士前期課程1 年
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
18,460千円 (直接経費: 14,200千円、間接経費: 4,260千円)
2012年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
2011年度: 5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2010年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
キーワード繊結晶解析 / 核-細胞質間物質輸送 / 構造生物学 / 核外輸送因子 / tRNA / X線結晶構造解析
研究概要

真核生物では、遺伝情報を保持する核と蛋白質合成の場である細胞質が、核膜によって隔てられているため、生命の維持や活動には輸送因子が関わる核-細胞質間の連携した物質輸送が必須である。本研究では、生命の維持に重要な働きを担うノンコーディングRNA を核外に輸送する機能として働く輸送因子について、各状態での輸送因子の構造解析を行い、得られた構造を基に構造変化を見出し、核外輸送因子がなぜ多種のノンコーディングRNAを認識でき、どのような機構で核外に輸送するのかを明らかにした

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (20件) (うち査読あり 20件) 学会発表 (14件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Cramer W. A., Quinone-dependent proton transfer pathways in the photosynthetic cytochrome b6f complex.2013

    • 著者名/発表者名
      HasanS.S.,YamashitaE.,BaniulisD.,CramerW.A.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 110 ページ: 4297-4302

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the C-terminal domain of Mu phage central spike and functions of bound calcium ion.2013

    • 著者名/発表者名
      HaradaK.,YamashitaE.,NakagawaA.,MiyafusaT.,TsumotoK.,UenoT.,ToyamaY.,TakedaS.
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta

      巻: 1834 ページ: 284-291

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the C-terminal domain of Mu phage central spike and functions of bound calcium ion.2013

    • 著者名/発表者名
      Harada K
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta.,

      巻: 1834 号: 1 ページ: 284-291

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2012.08.015

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of human importin β-Snail zinc finger domain complex.2013

    • 著者名/発表者名
      Choi S., Song J., Son S.Y., Park I.Y., Yamashita E., Lee S.J..
    • 雑誌名

      Acta Cryst. F

      巻: 69 号: 6 ページ: 1049-1051

    • DOI

      10.1042/bst20120211

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quinone-dependent proton transfer pathways in the photosynthetic cytochrome b6f complex.2013

    • 著者名/発表者名
      Hasan S. S.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      巻: 110 号: 11 ページ: 4297-4302

    • DOI

      10.1073/pnas.1222248110

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pathways of colicin import:utilization of BtuB,OmpF porin and the TolC drug-export protein.2012

    • 著者名/発表者名
      ZakharovS.D.,SharmaO.,ZhalninaM.V.,YamashitaE.,CramerW.A.
    • 雑誌名

      Biochem.Soc.Trans.

      巻: 40 ページ: 1463-1468

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural flexibility regulates phosphopeptide-binding activity of the tyrosine kinase binding domain of Cbl-c.2012

    • 著者名/発表者名
      Takesita K
    • 雑誌名

      J. Biochem.

      巻: 152 号: 5 ページ: 487-495

    • DOI

      10.1093/jb/mvs085

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of the human MST2 SARAH domain.2011

    • 著者名/発表者名
      SongJ.,HongH.,ChoiS.,LeeY.H.,YamashitaE.,BaeS.C.,ParkI.Y.,LeeS.J.
    • 雑誌名

      Acta Cryst.

      巻: F67 ページ: 1403-1405

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conservation of Lipid Functions in Cytochrome bc Complexes2011

    • 著者名/発表者名
      HasanS.S.,YamashitaE.,RyanC.M.,WhiteleggeJ.P.,CramerW.A.
    • 雑誌名

      J Mol.Biol.

      巻: 414 ページ: 145-162

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The host-binding domain of the P2 phage tail spike reveals a trimeric iron-binding structure.2011

    • 著者名/発表者名
      YamashitaE.,NakagawaA.,TakahashiJ.,TsunodaK.I.,YamadaS.,TakedaS.
    • 雑誌名

      Acta Cryst.

      巻: F67 ページ: 837-841

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distinguishing between Cl(-) and O(2)(2-) as the bridging element between Fe(3+) and Cu(2+) in resting-oxidized cytochrome c oxidase.2011

    • 著者名/発表者名
      Suga M., Yano N., Muramoto K., Shinzawa-Itoh K., Maeda T., Yamashita E., Tsukihara T., Yoshikawa S.
    • 雑誌名

      Acta Cryst.

      巻: D67 ページ: 742-744

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the cytoplasmic PTEN-like region of Ci-VSP provides insight into substrate specificity and redox regulation of the phosphoinositide phosphatase activity.2011

    • 著者名/発表者名
      Matsuda M., Takeshita K., Kurokawa T., Sakata S., Suzuki M., Yamashita E., Okamura Y., Nakagawa A.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 286 ページ: 23368-23377

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] tructural insight into maintenance methylation by mouse DNA methyltransferase 1 (Dnmt1).2011

    • 著者名/発表者名
      Takeshita K., Suetake I., Yamashita E., Suga M., Narita H., Nakagawa A., Tajima S.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A.

      巻: 108 ページ: 9055-9059

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selective nuclear export mechanism of small RNAs.2011

    • 著者名/発表者名
      Lee S. J., Jiko C., Yamashita E., Tsukihara T.
    • 雑誌名

      Curr. Opin, Struc. Biol.

      巻: 21 ページ: 101-108

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insight into maintenance methylation by mouse DNA methyltransferase 1 (Dnmt1)2011

    • 著者名/発表者名
      Takeshita K., Yamashita E.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 108 ページ: 9055-9059

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the cytoplasmic PTEN-like region of Ci-VSP provides insight into substrate specificity and redox regulation of the phosphoinositide phosphatase activity2011

    • 著者名/発表者名
      Matsuda M.Yamashita E.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 286 ページ: 23368-23377

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distinguishing between Cl(-) and O(2)(2-) as the bridging element between Fe(3+) and Cu(2+) in resting-oxidized cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      Suga M., Yamashita E.
    • 雑誌名

      Acta Cryst

      巻: D67 ページ: 742-744

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The host-binding domain of the P2 phage tail spike reveals a trimeric iron-binding structure2011

    • 著者名/発表者名
      Yamashita E.
    • 雑誌名

      Ada Cryst

      巻: F67 ページ: 837-841

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of the human MST2 SARAH domain2011

    • 著者名/発表者名
      Song J., Yamashita E.
    • 雑誌名

      Acta Cryst

      巻: F67 ページ: 1403-1405

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selective nuclear export mechanism of small RNAs2011

    • 著者名/発表者名
      Lee S.J., Yamashita E.
    • 雑誌名

      Curre.Opin.Strcut.Biol.

      巻: 21 ページ: 101-108

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Spring-8 生体超分子複合体構造解析ビームライン(大阪大学蛋白質研究所)BL44XU の現状2013

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      日本放射光学会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2013-01-12
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] SPring-8生体超分子複合体構造解析ビームライン(大阪大学蛋白質研究所)BL44XUの現状2013

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      第26回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 異物排出タンパク質のX線結晶構造解析2013

    • 著者名/発表者名
      板倉勇太
    • 学会等名
      第26回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Exportin-5 によるRNAsの核外輸送メカニズムの解明2012

    • 著者名/発表者名
      山澤龍治、山下栄樹
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2012-06-22
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Spring-8 生体超分子複合体構造解析ビームライン(大阪大学蛋白質研究所)BL44XU の現状2012

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      日本放射光学会
    • 発表場所
      鳥栖市民文化会館
    • 年月日
      2012-01-08
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] SPring-8生体超分子複合体構造解析ビームライン(大阪大学蛋白質研究所)BL44XUの現状2012

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      第25回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      鳥栖市民文化会館・中央公民館
    • 年月日
      2012-01-08
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Exportin-5による RNAs の核外輸送メカニズムの解明 / The structural basis of RNAs nuclear export by Exportin-5.2012

    • 著者名/発表者名
      山澤龍治
    • 学会等名
      第12回 日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] pre-microRNA 核外輸送複合体のX 線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      BMB2010
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 年月日
      2010-12-10
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] pre-microRNA核外輸送複合体のX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      BMB2010
    • 発表場所
      神戸ポートピアランド
    • 年月日
      2010-12-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質合成を抑制する小さなRNA を輸送する仕組みの解明2010

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      SPring-8合同コンファレンス
    • 発表場所
      東京ステーションコンファレンス
    • 年月日
      2010-11-04
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] タンパク質合成を抑制する小さなRNAを輸送する仕組みの解明2010

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      第2回SPring-8合同コンファレンス
    • 発表場所
      東京ステーションコンファレンス(招待講演)
    • 年月日
      2010-11-04
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Nuclear translocation machinery of pre-microRNA.2010

    • 著者名/発表者名
      SooJaeLee、EikiYamashita
    • 学会等名
      AsCA2010
    • 発表場所
      プサン(韓国)
    • 年月日
      2010-11-01
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] microRNA核外輸送複合体のX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      慈幸千真理、山下栄樹
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2010-06-18
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Spring-8 阪大蛋白研ビームラインBL44XU の現状2010

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 学会等名
      日本結晶学会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] X線結晶構造解析のためのタンパク質調製法、タンパク質実験ノート(上)改訂第4 版2011

    • 著者名/発表者名
      山下栄樹
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.protein.osaka-u.ac.jp/rcsfp/supracryst/jp/

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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