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新規Ni酵素による水素活性化機構の解明とその利用

研究課題

研究課題/領域番号 22370061
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関兵庫県立大学

研究代表者

樋口 芳樹  兵庫県立大学, 大学院・生命理学研究科, 教授 (90183574)

連携研究者 庄村 康人  兵庫県立大学, 大学院・生命理学研究科, 助教 (50423900)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
18,330千円 (直接経費: 14,100千円、間接経費: 4,230千円)
2012年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
2011年度: 7,670千円 (直接経費: 5,900千円、間接経費: 1,770千円)
2010年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
キーワードヒドロゲナーゼ / X線結晶解析 / 反応機構 / Ni酵素 / 燃料電池
研究概要

本研究では,新規のNAD+還元4量体ヒドロゲナーゼをもつ水素酸化菌の培養法とそのヒドロゲナーゼ酵素の精製法および活性測定方法を開発し,また,酸素耐性をもつ膜結合性ヒドロゲナーゼ(MBH)については,その空気酸化型,水素還元型および酸化剤を用いた超酸化型のX線結晶解析に成功した.MBHの全体構造やNi-Fe活性部位の配位子構造は,いわゆる酸素耐性をもたない標準型の[NiFe]ヒドロゲナーゼとほとんど差異が無かった.しかし, Ni-Fe活性部位のもっとも近くに位置する鉄-硫黄クラスターが,従来まで知られていた[4Fe-4S]-4Cys型ではなく,新規の[4Fe-3S]-6Cys型の構造をもつことを見出した.また,MBHは,O_2にさらされたとき,この[4Fe-3S]-6Cys型の鉄-硫黄クラスターが特徴的な構造変化を起こすことを見出し,この構造変化こそが本酵素の酸素耐性の本質であることを提案し,それを2011年のNature誌に発表した.

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (110件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (48件) (うち査読あり 42件) 学会発表 (51件) (うち招待講演 6件) 図書 (11件)

  • [雑誌論文] Studies on hydrogenase2013

    • 著者名/発表者名
      T. Yagi, Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Proceedings of the Japan Academy. Ser. B: Physical and Biological Sciences

      巻: 89 号: 1 ページ: 16-33

    • DOI

      10.2183/pjab.89.16

    • NAID

      130003365103

    • ISSN
      0386-2208, 1349-2896
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photosensitivity of the Ni-A State of [NiFe] Hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F with Visible Light2013

    • 著者名/発表者名
      H. Osuka, Y. Shomura, H. Komori, N. Shibata, S. Nagao, Y. Higuchi, S. Hirota
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 430 号: 1 ページ: 284-288

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2012.10.136

    • NAID

      120005716864

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inhibitory activity of Filipendula ulmaria on recombinant histidine decarboxykase.2013

    • 著者名/発表者名
      Nitta Yoko
    • 雑誌名

      Food Chemistry

      巻: 138 号: 2-3 ページ: 1551-1556

    • DOI

      10.1016/j.foodchem.2012.10.074

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 膜結合型ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明2013

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 53 ページ: 82-85

    • NAID

      10031151786

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal Structure Analysis of the Translation Factor RF3 (release factor 3)2012

    • 著者名/発表者名
      K. Kihira, Y. Shimizu, Y. Shomura, N. Shibata, M. Kitamura, A. Nakagawa, T. Ueda, K. Ochi, Y.Higuchi
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 586 号: 20 ページ: 3705-3709

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2012.08.029

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Domain Swapping of the Heme and N-Terminal α-Helix in Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome c552 Dimer2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Hayashi, S. Nagao, H. Osuka, H. Komori, Y. Higuchi, S. Hirota
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 51 号: 43 ページ: 8608-8616

    • DOI

      10.1021/bi3011303

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural study reveals Ser354 determines substrate specificity on human histidine decarboxylase2012

    • 著者名/発表者名
      Komori Hirofumi
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 287 号: 34 ページ: 29175-29183

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.381897

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and Oxygen Binding Properties of Dimeric Horse Myoglobin2012

    • 著者名/発表者名
      S. Nagao, H. Osuka, T. Yamada, T. Uni, Y. Shomura, K. Imai, Y. Higuchi, S. Hirota
    • 雑誌名

      Dalton Transactions

      巻: 41 号: 37 ページ: 11378-11385

    • DOI

      10.1039/c2dt30893b

    • NAID

      120005716865

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification, Structural Basis for the Reaction Mechanism of S-carbamoylation of HypE by HypF in the Maturation of [NiFe]-hydrogenases2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Shomura, Y. Higuchi
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem

      巻: 287 号: 34 ページ: 28409-18419

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.387134

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification, crystallization, and preliminary X-ray analysis of human histidine decarboxylase2012

    • 著者名/発表者名
      Komori Hirofumi
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun

      巻: 68 号: 6 ページ: 675-677

    • DOI

      10.1107/s1744309112015692

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An O-Centered Structure of the Trinuclear Copper Center in the Cys500Ser/Glu506Gln Mutant of CueO and Structural Changes in Low to High X-Ray Dose Conditions2012

    • 著者名/発表者名
      H.Shomura, et al
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 21 号: 5 ページ: 707-716

    • DOI

      10.1002/pro.2058

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An O-Centered Structure of the Trinuclear Copper Center in the Cys500Ser/Glu506Gln Mutant of CueO and Structural Changes in Low to High X-Ray Dose Conditions2012

    • 著者名/発表者名
      H.Komori, et al
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie

      巻: 51 号: 8 ページ: 1861-1864

    • DOI

      10.1002/anie.201107739

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Three-dimensional Structure of Nylon Hydrolase and the Mechanism of Nylon-6 Hydrolysis2012

    • 著者名/発表者名
      S.Negoro, et al
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 287 号: 7 ページ: 5079-5090

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.321992

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ヒドロゲナーゼの新規酸素耐性機構 -膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼ2012

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 雑誌名

      化学

      巻: 67 ページ: 70-71

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] 酸素耐性ヒドロゲナーゼの構造化学的研究-酵素分子に見出された活性保護機構-2012

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 雑誌名

      燃料電池

      巻: 11 ページ: 67-72

    • NAID

      40019321797

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] [4Fe-3S]クラスターによる[NiFe]ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 雑誌名

      SPring-8利用者情報誌

      巻: 17 ページ: 105-110

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of O2-tolerant [NiFe] hydrogenase reveals the mechanism of O2-tolerance attributable to a redox-dependent conformational change of [4Fe-3S] cluster2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Shomura and Y. Higuchi
    • 雑誌名

      SPring-8 Research Frontier 2011

      巻: 2011 ページ: 5-6

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] シトクロムc ポリマー:水溶性球状タンパク質に見出された多量化機構2012

    • 著者名/発表者名
      廣田俊,樋口芳樹
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌

      巻: 54 ページ: 270-275

    • NAID

      10031129961

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural Basis for a[4Fe-3S] Cluster in the Oxygen-tolerant Membrane-bound[Ni-Fe]-hydrogenase2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Shomura, K. Yoon, H. Nishihara, Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 479 号: 7372 ページ: 253-257

    • DOI

      10.1038/nature10504

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of Membrane-bound Respiratory [NiFe] Hydrogenase from Hydrogenovibrio marinus2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Shomura, et al
    • 雑誌名

      Acta Crystallgor

      巻: 67 号: 7 ページ: 827-829

    • DOI

      10.1107/s1744309111019804

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Studies on Mutational Structures of a Nylon-6 Byproduct-degrading Enzyme2011

    • 著者名/発表者名
      T.Baba, et al
    • 雑誌名

      Chem.Phys.Lett.

      巻: 507 号: 1-3 ページ: 157-161

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2011.03.046

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] How Coenzyme B12-dependent Ethanolamine Ammonialyase Deals with Both Enantiomers of 2-Amino-1-propanol as Substrates: Structure-based Rationalization2011

    • 著者名/発表者名
      N. Shibata, Y. Higuchi and T. Toraya
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 50 号: 4 ページ: 591-598

    • DOI

      10.1021/bi101696h

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and X-ray Diffraction Analysis of Nylon Oligomer Hydrolase (NylC) from Agromyces sp.KY5R2011

    • 著者名/発表者名
      K.Yasuhira, et al
    • 雑誌名

      Acta Crystallgor

      巻: 67 号: 8 ページ: 892-895

    • DOI

      10.1107/s1744309111022858

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic Characterization of the DIX Domain of the Wnt Signalling Positive Regulator Ccd12011

    • 著者名/発表者名
      S.Terawaki, et al
    • 雑誌名

      Acta Crystallgor

      巻: F67 号: 7 ページ: 758-761

    • DOI

      10.1107/s1744309111016526

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Positively Charged Domain Located Downstream of PIP Box, Together with TD Amino Acids within PIP Box, is Important for CRL4^-mediated Proteolysis2011

    • 著者名/発表者名
      M. Michishita, A. Morimoto, T. Ishii, H. Komori, Y. Shiomi, Y. Higuchi and H. Nishitani
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 16 ページ: 12-22

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hiraki Localization of chondromodulin-I at the feto-maternal interface and its inhibitory actions on trophoblast invasion in vitro2011

    • 著者名/発表者名
      Miura, C. Shukunami, K. Mitsui, J. Kondo, Y
    • 雑誌名

      BMC Cell Biol

      巻: 12 号: 1 ページ: 34-34

    • DOI

      10.1007/s00774-010-0193-0

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role of π-Electron Systems in Stabilization of the Oxidized Tetraheme Architecture in Cytochrome c_32011

    • 著者名/発表者名
      Y.Takayama, et al
    • 雑誌名

      Bull.Chem.Soc.Jpn.

      巻: 84 号: 10 ページ: 1096-1101

    • DOI

      10.1246/bcsj.20110039

    • NAID

      130004152811

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Functional Role of the Glycosylated N-terminal Domain of Chondromodulin-I2011

    • 著者名/発表者名
      J.Kondo, et al.
    • 雑誌名

      J.Bone Miner.Metab.

      巻: 29 ページ: 23-30

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Positively Charged Domain Located Downstream of PIP Box, Together with TD Amino Acids within PIP Box, is Important for CRL4^<Cdt2> -mediated Proteolysis2011

    • 著者名/発表者名
      M.Michishita, et al.
    • 雑誌名

      Gene to Cells

      巻: 16 ページ: 12-22

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] How Coenzyme B12-dependent Ethanolamine Ammonialyase Deals with Both Enantiomers of 2-Amino-1-propanol as Substrates : Structure-based Rationalization2011

    • 著者名/発表者名
      N.Shibata, et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 50 ページ: 591-598

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Concerto Catalysis. Harmonising [NiFe] Hydrogenase and NiRu Model Catalysts2010

    • 著者名/発表者名
      K. Ichikawa, K. Nonaka, T. Matsumoto,B. Kure, K-S. Yoon, Y. Higuchi, T. Yagi, S. Ogo
    • 雑誌名

      Concerto Catalysis. Harmonising [NiFe] Hydrogenase and NiRu Model Catalysts

      巻: 39 号: 12 ページ: 2993-2994

    • DOI

      10.1039/b926061g

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structure Analysis of Bacillus subtilis Ferredoxin-NADP+ Oxidoreductase and the Structural Basis for Its Substrate Selectivity2010

    • 著者名/発表者名
      H. Komori, D. Seo, T. Sakurai and Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 19(12) 号: 12 ページ: 2279-2290

    • DOI

      10.1002/pro.508

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cytochrome c polymerization by successive domain swapping at the C-terminal helix2010

    • 著者名/発表者名
      S. Hirota, Y. Hattori, S. Nagao, M. Taketa, H. Komori, H. Kamikubo, Z. Wang, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Pro. Natl. Acad. Sci

      巻: 107(29) 号: 29 ページ: 12854-12859

    • DOI

      10.1073/pnas.1001839107

    • NAID

      120005716875

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structures of Ethanolamine Ammonia-lyase complexed with Coenzyme B_12 Analogs and Substrates2010

    • 著者名/発表者名
      N. Shibata, H. Tamagaki, N. Hieda, K. Akita, H. Komori, Y. Shomura, S. Terawaki, K. Mori, N. Yasuoka, Y. Higuchi, and T. Toraya
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem

      巻: 285 (34) 号: 34 ページ: 26484-26493

    • DOI

      10.1074/jbc.m110.125112

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and Molecular Evolution of Multicopper Blue Proteins2010

    • 著者名/発表者名
      H. Komori and Y. Higuchi
    • 雑誌名

      BIOMOLECULAR CONCEPTS

      巻: 1 号: 1 ページ: 31-40

    • DOI

      10.1515/bmc.2010.004

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enzymatic Synthesis of Nylon-6 units in Organic Solvent Contained Low-water: Structural Requirement of 6-aminohexanoate-dimer Hydrolase for Efficient Amide Synthesis2010

    • 著者名/発表者名
      Y. Kawashima, K. Yasuhira, N. Shibata,Y Matsuura, Y. Tanaka, M. Taniguchi, Y. Miyoshi, M. Takeo, D. Kato, Y. Higuchi and S. Negoro
    • 雑誌名

      J. Mol. Cat

      巻: B64 号: 1-2 ページ: 81-88

    • DOI

      10.1016/j.molcatb.2010.02.006

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The PHCCEx Domain of Tiam1/2 is a Novel Protein- and Membrane-binding Module2010

    • 著者名/発表者名
      S. Terawaki, K. Kitano, T. Mori, Y. Zhai, Y. Higuchi, N. Itoh, T. Watanabe, K. Kaibuchi and T. Hakoshima
    • 雑誌名

      EMBO J

      巻: 29 号: 1 ページ: 236-250

    • DOI

      10.1038/emboj.2009.323

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] X-ray Crystallographic Analysis of the 6-aminohexanoate Cyclic Dimer Hydrolase: Catalytic Mechanism and Evolution of an Enzyme Responsible for Nylon-6 Byproduct Degradation2010

    • 著者名/発表者名
      K. Yasuhira, N. Shibata, G. Mongami, Y. Uedo, Y. Atsumi, Y. Kawashima, A. Hibino, Y. Tanaka, Y-H. Lee, D. Kato, M. Takeo, Y. Higuchi, and S. Negoro
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem

      巻: 285 号: 2 ページ: 1239-1248

    • DOI

      10.1074/jbc.m109.041285

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification, Crystallization and Preliminary X-ray Analysis of the Dissimilatory Sulfite Reductase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F2010

    • 著者名/発表者名
      H. Ogata, Y. Shomura, A.G. Agrawal, A.P. Kaur, W. Gartner, Y. Higuchi and W. Lubitz
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.

      巻: F66 号: 11 ページ: 1470-1472

    • DOI

      10.1107/s1744309110033191

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and Preliminary X-ray Analysis of Dimeric and Trimeric Cytochromes c from Horse Heart2010

    • 著者名/発表者名
      M. Taketa, H. Komori, Y. Hattori, S. Nagao, S. Hirota and Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.

      巻: F66 号: 11 ページ: 1477-1479

    • DOI

      10.1107/s1744309110034913

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expression, Crystallization and Preliminary X-ray Crystallographic Study of Ethanolamine Ammonia-lyase from Escherichia coli2010

    • 著者名/発表者名
      N. Shibata, H. Tamagaki, S. Ohtsuki, N. Hieda, K. Akita, H. Komori, Y. Shomura, S. Terawaki, T. Toraya, N. Yasuoka and Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.

      巻: F66 号: 6 ページ: 709-711

    • DOI

      10.1107/s1744309110014478

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and Preliminary X-ray Analysis of NADH:rubredoxin Oxidoreductase from Clostridium acetobutylicum2010

    • 著者名/発表者名
      K. Nishikawa, Y. Shomura, S. Kawasaki, Y. Niimura and Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr

      巻: F66 号: 1 ページ: 23-25

    • DOI

      10.1107/s1744309109047162

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and Preliminary X-ray Studies of Ferredoxin-NADP+ Oxidoreductase Encoded by Bacillus subtilis yumC2010

    • 著者名/発表者名
      H. Komori, D. Seo, T. Sakurai, and Y. Higuchi
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr

      巻: F66 号: 3 ページ: 301-303

    • DOI

      10.1107/s1744309110000151

    • NAID

      120002086442

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enzymatic Synthesis of Nylon-6 units in Organic Solvent Contained Low-water : Structural Requirement of 6-aminohexanoate-dimer Hydrolase for Efficient Amide Synthesis2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Kawashima, et al.
    • 雑誌名

      J Mol.Cat.B

      巻: 64 ページ: 81-88

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structures of Ethanolamine Ammonia-lyase complexed with Coenzyme B_<12> Analogs and Substrates2010

    • 著者名/発表者名
      N.Shibata, et al.
    • 雑誌名

      J Biol.Chem.

      巻: 285 ページ: 26484-26493

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cytochrome c polymerization by successive domain swapping at the C-terminal helix2010

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.

      巻: 107 ページ: 12854-12859

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and Preliminary X-ray Analysis of Dimeric and Trimeris Cytochromes c from Horse Heart2010

    • 著者名/発表者名
      M.Taketa, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.

      巻: F66 ページ: 1477-1479

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structure Analysis of Bacillus subtilis Ferredoxin-NADP^+ Oxid oreductase and the Structural Basis for Its Substrate Selectivity2010

    • 著者名/発表者名
      H.Komori, et al.
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 19 ページ: 2279-2290

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Structural Study of O2-Tolerant [NiFe] Hydrogenase2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Higuchi
    • 学会等名
      The 2nd International Conference on MEXT Project of Integrated Research on Chemical Synthesis
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知)
    • 年月日
      2012-12-11
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明 -放射光X線利用による精密構造化学-2012

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹
    • 学会等名
      日本農芸化学会関西支部 第477回講演会
    • 発表場所
      神戸大学(兵庫)
    • 年月日
      2012-12-01
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼ成熟化因子HypE,HypFのX線結晶構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知)
    • 年月日
      2012-09-24
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 酸素耐性[ NiFe]ヒドロゲナーゼの結晶構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,尹基石,西原宏史,樋口芳樹
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 年月日
      2012-06-22
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Computer-simulations Based Design of Nylonoligomer Hydrolase2012

    • 著者名/発表者名
      Y.Shigeta, K. Kamiya, T. Baba, T. Matsui, M. Boero , N. Shibata,Y. Higuchi and S. Negoro
    • 学会等名
      3rd Symposium on Enzymes & Biocatalysis
    • 発表場所
      Xian (China)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Polymerization and Peroxidase Activity Enhancement of Cytochrome c by Successive Domain Swapping at the C-Terminal Helix2012

    • 著者名/発表者名
      S. Hirota, Y. Hattori, Z. Wang, S. Nagao, M. Taketa, H. Komori, H. Kamikubo, T. Matsuo, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi
    • 学会等名
      IEEE International Conference on Computational Photography
    • 発表場所
      Seattle (USA)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 好熱菌由来シトクロムc-552 2量体の構造と熱安定性2012

    • 著者名/発表者名
      林有吾,長尾聡,大須賀久織,小森博文,樋口芳樹,廣田俊
    • 学会等名
      第39回生体分子科学討論会
    • 発表場所
      東北大学(宮城)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ドメインスワッピングによるミオグロビン二量体の形成2012

    • 著者名/発表者名
      長尾 聡,宇仁武史,山田卓矢,大須賀久織,庄村康人,今井清博,樋口芳樹,廣田 俊
    • 学会等名
      第39回生体分子科学討論会
    • 発表場所
      東北大学(宮城)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 微小重力環境下でのナイロン分解酵素の高品質結晶生成の実例と今後の取り組みについて2012

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹,柴田直樹,根来誠司
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(愛知)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 酸素耐性[ NiFe]ヒドロゲナーゼの結晶構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      庄村 康人,尹 基石,西原 宏史,樋口 芳樹
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(愛知)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Polymerization and Peroxidase Activity Enhancement of Cytochrome c by Successive Domain Swapping at the C-Terminal Helix2012

    • 著者名/発表者名
      S. Hirota, Y. Hattori, Z. Wang, S. Nagao, M. Taketa, H. Komori, H. Kamikubo, T. Matsuo, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi
    • 学会等名
      International Conference on Porphyrins and Phthalocyanins
    • 発表場所
      Pusan (Korea)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒト由来ヒスチジンデカルボキシラーゼの基質特異性と触媒機構の研究2012

    • 著者名/発表者名
      新田陽子,小森博文,樋口芳樹,植野洋志
    • 学会等名
      日本生物高分子学会2012年度年会
    • 発表場所
      カレッジプラザ(秋田)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼ成熟化因子HypE,HypFのX線結晶構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      庄村 康人,尹 基石,西原 宏史,樋口 芳樹
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] An attempt to solve the ultra-high resolution crystal structures of nylon-oligomer hydrol ases using the crystals grown in space2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Higuchi, N. Shibata, K. Nagai, Y. Kawashima and S. Negoro
    • 学会等名
      14th International Conference on the Crystallization of Biological Macromolecules
    • 発表場所
      Huntsville (USA)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] X 線照射によるマルチ銅活性中心の構造変化2012

    • 著者名/発表者名
      小森博文,片岡邦重,櫻井武,宮崎健太郎,樋口芳樹
    • 学会等名
      平成24年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      東北大学(宮城)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Wnt シグナル伝達経路で機能するDIX ドメインを介した相互作用の構造生物学2012

    • 著者名/発表者名
      勝谷拓也,寺脇慎一,柴田直樹,山本英樹,Marc Fiedler ,Mariann Bienz,菊池 章,樋口芳樹
    • 学会等名
      平成24年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      東北大学(宮城)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明 -放射光X線利用による精密構造化学-2012

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹
    • 学会等名
      日本農芸化学会関西支部 第477回講演会
    • 発表場所
      神戸大学(兵庫)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural Study of O2-Tolerant [NiFe] Hydrogenase2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Higuchi
    • 学会等名
      The 2nd International Conference on MEXT Project of Integrated Research on Chemical Synthesis
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Catalytic cycle of cytochrome-c3 hydrogenase, a [NiFe]-hydrogenase2012

    • 著者名/発表者名
      八木達彦,樋口芳樹
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 酸素耐性膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析-水素エネルギー利用に向けた基礎科学的研究 -2011

    • 著者名/発表者名
      八木達彦,樋口芳樹
    • 学会等名
      関西サイエンスフォーラム
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡)
    • 年月日
      2011-11-29
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 酸素耐性膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析-水素エネルギー利用に向けた基礎科学的研究 -2011

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹
    • 学会等名
      関西サイエンスフォーラム
    • 発表場所
      リーガロイヤルNCB(大阪)
    • 年月日
      2011-11-29
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 酸素耐性膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析-水素エネルギー利用に向けた基礎科学的研究-2011

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹
    • 学会等名
      関西サイエンスフォーラム
    • 発表場所
      リーガロイヤルNCB(大阪府)(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-29
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 翻訳終結因子RF3のX線結晶解析2011

    • 著者名/発表者名
      木平清人,樋口芳樹等
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • 年月日
      2011-11-24
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ゼータサイザーでタンパク質のオリゴマー化を解析する2011

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • 年月日
      2011-11-24
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ゼータサイザーでタンパク質のオリゴマー化を解析する2011

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] マルチ銅酸化酵素の構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      小森博文, 等
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都国際会議場(京都府)
    • 年月日
      2011-09-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Structural study of the O2-tolerant [NiFe] hydrogenase2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Shomura, Y. Higuchi et al.
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-17
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural study ofthe O_2-tolerant [NiFe] hydrogenase2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Shomura, et al
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] シトクロムc-552の多量体生成と二量体構造2011

    • 著者名/発表者名
      林有吾, 等
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県)
    • 年月日
      2011-09-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Crystal structure analysis of release factor 32011

    • 著者名/発表者名
      K. Kihira, Y. Higuchi et al.
    • 学会等名
      XXII Congress and General Assembly of International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Madrid(Spain)
    • 年月日
      2011-08-28
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystal structure analysis of release factor 32011

    • 著者名/発表者名
      K.Kihira, et al
    • 学会等名
      XXII Congress and General Assembly of International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Madrid (Spain)
    • 年月日
      2011-08-28
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Primer design for cDNA synthesis based on the crystal structure2011

    • 著者名/発表者名
      N.Shibata, Y.Higuchi
    • 学会等名
      XXII Congress and General Assembly of Intemational Union of Crystallography
    • 発表場所
      Madrid (Spain)
    • 年月日
      2011-08-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ウマシトクロムcおよび緑膿菌シトクロムc_<551>の多量体形成2011

    • 著者名/発表者名
      廣田俊, 等
    • 学会等名
      第38回生体分子科学討論会
    • 発表場所
      茨城大学(茨城県)
    • 年月日
      2011-06-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Can we elucidate the reaction mechanism of [NiFe] hydrogenase by neutron diffraction study? Neutron Structural Biology -Hydration Structure in Proteins-2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Higuchi
    • 発表場所
      日本原子力開発研究機構(茨城県)
    • 年月日
      2011-03-04
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 中性子構造化学でヒドロゲナーゼの水素分子活性化機構は理解できるか?2011

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹
    • 学会等名
      中性子構造生物学およびタンパク質水和構造に関するシンポジウム
    • 発表場所
      水戸
    • 年月日
      2011-03-04
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Structural Basis for the Reaction Mechanism of Dissimilatory Sulfite Reductase2011

    • 著者名/発表者名
      Shomura Y. Higuchi et al.
    • 学会等名
      International Symposium on Chemistry of Reductases IV
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Crystallization and X-ray Analysis of ATP-sulfurylase from Sulfate-reducing Bacteria2011

    • 著者名/発表者名
      M. Taketa, Y. Shomura and Y. Higuchi
    • 学会等名
      International Symposium on Chemistry of Reductases IV
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural Basis for the Reaction Mechanism of Dissimilatory Sulfite Reductase2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Shomura, et al.
    • 学会等名
      International Symposium on Chemistry of Reductases IV
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Crystallization and X-ray Analysis of ATP-sulfurylase from Sulfate-reducing Bacteria2011

    • 著者名/発表者名
      M.Taketa, et al.
    • 学会等名
      International Symposium on Chemistry of Reductases IV
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Enzymatic Degradation and Synthesis of Nylon-6 Related Compounds.2010

    • 著者名/発表者名
      S.Negoro, et al.
    • 学会等名
      International Symposium on BioPolymers 2010
    • 発表場所
      Stuttgart
    • 年月日
      2010-10-04
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Strusctural Analysis of Releasae Factor 32010

    • 著者名/発表者名
      K. Kihira, Y. Higuchi et al.
    • 学会等名
      日本生物物理学会第48回年会
    • 発表場所
      日本生物物理学会第48回年会
    • 年月日
      2010-09-22
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Cytochrome c Polymerization by Successive Domain Swapping at the C-terminal Helix2010

    • 著者名/発表者名
      S.Hirota, et al.
    • 学会等名
      日本生物物理学会第48回年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2010-09-22
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ナイロンオリゴマ-分解酵素の精密構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2010-06-18
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹等
    • 学会等名
      2010 年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      大阪大学(大阪府)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Improved Technologies for High-resolution X-ray Crystallography2010

    • 著者名/発表者名
      H. Tanaka, Y. Higuchi et al.
    • 学会等名
      The 10th Conference of the Asian Crystallographic Association
    • 発表場所
      Pusan(Korea)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Basis for the Lack of Stereospecificity in Coenzyme B_<12>-dependent Ethanolamine ammonia-lyase2010

    • 著者名/発表者名
      N.Shibata, et al.
    • 学会等名
      The 10th Conference of the Asian Crystallographic Association
    • 発表場所
      Pusan
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] The Role of the π-electron System in Regulation of Reduction Potentials of Tetraheme Cytochrome c_32010

    • 著者名/発表者名
      H.Akutsu, et al.
    • 学会等名
      The 10th Conference of the Asian Crystallographic Association
    • 発表場所
      Pusan
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Improved Technologies for High-resolution X-ray Crystallography2010

    • 著者名/発表者名
      H.Tanaka, et al.
    • 学会等名
      The 10th Conference of the Asian Crystallographic Association
    • 発表場所
      Pusan
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌由来フェレドキシン-NADPH還元酵素のX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      小森博文, et al.
    • 学会等名
      2010年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      吹田
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      庄村康人, et al.
    • 学会等名
      2010年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      吹田
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] B12-補酵素関与エタノールアミアンモニアリアーゼの立体構造に基づく立体化学経路の解明2010

    • 著者名/発表者名
      柴田直樹, et al.
    • 学会等名
      2010年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      吹田
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] 膜結合型ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明,生物物理2013

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] ヒドロゲナーゼの新規酸素耐性機構-膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼ,化学2012

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] 酸素耐性ヒドロゲナーゼの構造化学的研究-酵素分子に見出された活性保護機構-,燃料電池2012

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] Spring-8利用者情報誌[4Fe-3S]クラスターによる[NiFe]ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の構造基盤2012

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] SPring-8 Research Frontier Crystal structure of O2-tolerant [NiFe] hydrogenase reveals the mechanism of O2-tolerance attributable to a redox-dependent conformational change of [4Fe-3S] cluster2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Shomura and Y. Higuchi
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] シトクロムc ポリマー:水溶性球状タンパク質に見出された多量化機構2012

    • 著者名/発表者名
      廣田俊, 樋口芳樹
    • 出版者
      日本結晶学会誌
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] Pring-8 Research Frontiers2010 Structures of Dimeric and Trimeric Cytochrome c and Its Polymerization Mechanism2011

    • 著者名/発表者名
      S. Hirota and Y. Higuchi
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] Structural and Functional Features of Hydrogenase Enzymes, Molecular Solar Biofuels2011

    • 著者名/発表者名
      W. Lubitz, H. Ogata, E. Reijerse and Y. Higuchi
    • 出版者
      published by Royal Society Chemistry
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] 新規の鉄-硫黄クラスターが生み出すヒドロゲナーゼの酸素耐性機構2011

    • 著者名/発表者名
      庄村康人,樋口芳樹
    • 出版者
      ライフサイエンス新着レビュー
    • URL

      http://first.lifesciencedb.jp/archives/3775

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] 構造生物学2010

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹,中川敦史
    • 総ページ数
      253
    • 出版者
      共立出版
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] 構造生物学-原子構造からみた生命現象の営み2010

    • 著者名/発表者名
      樋口芳樹, 中川敦史
    • 総ページ数
      253
    • 出版者
      共立出版株式会社
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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