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コナガのゲノム解析とその殺虫剤抵抗性機構解明への利用

研究課題

研究課題/領域番号 22380041
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用昆虫学
研究機関独立行政法人農業生物資源研究所

研究代表者

山本 公子  独立行政法人農業生物資源研究所, 昆虫ゲノム研究ユニット, ユニット長 (40370689)

研究分担者 宮本 和久  農業生物資源研究所, 昆虫微生物機能研究ユニット, 上級研究員 (10370686)
上樂 明也  農業生物資源研究所, 昆虫ゲノム研究ユニット, 任期付研究員 (60542115)
末次 克行  農業生物資源研究所, 昆虫ゲノム研究ユニット, 主任研究員 (80533471)
野田 博明  農業生物資源研究所, 昆虫科学研究領域, 特任上級研究員 (40343991)
三田 和英  農業生物資源研究所, 昆虫科学研究領域, 恃任上級研究員 (30159165)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
18,980千円 (直接経費: 14,600千円、間接経費: 4,380千円)
2012年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2011年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
2010年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円)
キーワード昆虫分子生物学 / コナガゲノム / Bt菌毒素抵抗性 / コナガ / cDNA / ゲノム / Bt抵抗性
研究概要

EST解析及びRNAseqを行い、約3万個の遺伝子候補配列を取得した。また、次世代シーケンサーを利用してコナガのゲノム概要塩基配列を獲得し、ゲノムおよび発現遺伝子情報について自動アノテーション情報を付加したゲノムデータベースKONAGAbaseを構築し一般に公開した。Bt菌毒素抵抗性形質とリンクする連鎖群を見いだし、有望な候補遺伝子を得た。また、Bt菌処理時及び非処理時の発現量比較解析から、コナガのBt菌毒素に対する抵抗性と薬剤代謝関連遺伝子の関連性が低いことを見いだした。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (14件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] チョウ目害虫におけるBT剤およびBt毒素抵抗性の現状と原因遺伝子の同定2013

    • 著者名/発表者名
      宮本和久、渥美省吾、山本公子、瀬筒秀樹、野田博明
    • 雑誌名

      植物防疫

      巻: 67(1) ページ: 27-34

    • NAID

      40019543574

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] チョウ目害虫におけるBT剤およびBt毒素抵抗性の現状と原因遺伝子の同定2013

    • 著者名/発表者名
      宮本和久
    • 雑誌名

      植物防疫

      巻: 67 ページ: 27-34

    • NAID

      40019543574

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The development of the genomic database of the diamondback moth (Plutella xylostella) and genomic analysis using it 6th Annual Arthropod Genomics Symposium: Arthropod Genomics2013

    • 著者名/発表者名
      Jouraku A, Yamamoto K, Kuwazaki S, Urio M, Suetsugu Y, Narukawa J, Miyamoto K, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Matsumoto T, Noda H
    • 学会等名
      Taking Center Stage and i5k Community Workshop
    • 発表場所
      Kansas City, USA
    • 年月日
      2013-06-01
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] KONAGAbase:agenomic database of the diamondback moth2012

    • 著者名/発表者名
      Jouraku A, Yamamoto K, Kuwazaki S, Urio M, Suetsugu Y, Narukawa J, Miyamoto K, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Matsumoto T,Noda H
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2012-12-12
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 殺虫剤抵抗性問題の最前線2012

    • 著者名/発表者名
      上樂明也
    • 学会等名
      殺虫剤抵抗性問題におけるゲノム情報基盤の活用シンポジウム「ポストゲノム時代の害虫防除研究のあり方第5回」
    • 発表場所
      秋葉原
    • 年月日
      2012-11-15
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Genome analysis of agricultural pests 2:Development of a genomic database of the diamondback moth and its application to genome analysis2011

    • 著者名/発表者名
      Jouraku A, Yamamoto K, Kuwazaki S, Urio M, Suetsugu Y, Narukawa J, Miyamoto K, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Matsumoto T,Noda H
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Genome analysis of agricultural pests 2 : Development of a genomic database of the diamondback moth and its application to genome analysis2011

    • 著者名/発表者名
      Jouraku A, Yamamoto K, Kuwazaki S, Urio M, Suetsugu Y, Narukawa J, Miyamoto K, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Matsumoto T, Noda H
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川)
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Current status of the development of the diamondback moth database2011

    • 著者名/発表者名
      Jouraku A, Yamamoto K, Kuwazaki S, Urio M, Suetsugu Y, Narukawa J, Miyamoto K, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Matsumoto T, Noda H
    • 学会等名
      Sixth International Symposium on Molecular lnsect Science
    • 発表場所
      アムステルダム、オランダ
    • 年月日
      2011-10-04
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Current status of the development of the diamondback moth database2011

    • 著者名/発表者名
      Jouraku A, Yamamoto K, Kuwazaki S, Urio M, Suetsugu Y, Narukawa J, Miyamoto K, Kurita K, Kanamori H, Katayose Y, Matsumoto T, Noda H
    • 学会等名
      Sixth International Symposium on Molecular Insect Science
    • 発表場所
      NH Grand Krasnapolsky(アムステルダム オランダ)
    • 年月日
      2011-10-04
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 農業害虫ゲノム解析-1.コナガゲノム塩基配列および発現遺伝子解析2010

    • 著者名/発表者名
      山本公子,上樂明也,桑崎誠剛,瓜尾政博,末次克行,生川潤子,宮本和久,野田博明
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-09
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Development of a genomic database of the diamondback moth2010

    • 著者名/発表者名
      Jouraku A, Yamamoto K, Kuwazaki S, Urio M, Suetsugu Y, Narukawa J, Miyamoto K, Noda H
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-09
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Development of a genomic database of the diamondback moth2010

    • 著者名/発表者名
      Jouraku A, Yamamoto K, Kuwazaki S, Urio M, Suetsugu Y, Narukawa J, Miyamoto K, Noda H
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-08
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 農業害虫ゲノム解析-1.コナガゲノム塩基配列および発現遺伝子解析2010

    • 著者名/発表者名
      山本公子, 上樂明也, 桑崎誠剛, 瓜尾政博, 末次克行, 生川潤子, 宮本和久, 野田博明
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-08
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] KONAGAbase: a genomic database of the diamondback moth

    • 著者名/発表者名
      上樂明也
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 殺虫剤抵抗性問題におけるゲノム情報基盤の活用

    • 著者名/発表者名
      上樂明也
    • 学会等名
      NIASシンポジウム「ポストゲノム時代の害虫防除研究のあり方 第5回」-殺虫剤抵抗性問題の最前線
    • 発表場所
      秋葉原コンベンションホール
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The development of the genomic database of the diamondback moth (Plutella xylostella) and genomic analysis using it.

    • 著者名/発表者名
      上樂明也
    • 学会等名
      6th Annual Arthropod Genomics Symposium: Arthropod Genomics 2012
    • 発表場所
      Kansas City, USA
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [備考]

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [備考] KONAGAbase

    • URL

      http://dbm.dna.affrc.go.jp/px/

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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