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人為起源物質分解能をモデルとした環境中での細菌の機能進化を司る分子基盤の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22380047
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関東北大学

研究代表者

永田 裕二  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 准教授 (30237531)

研究分担者 津田 雅孝  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 教授 (90172022)
大坪 嘉行  東北大学, 大学院・生命科学研究科, 助教 (40342761)
研究協力者 DAMBORSKY Jiri  マサリク大学(チェコ共和国), 理学部, 教授
千田 俊哉  産業技術総合研究所, バイオメディシナル情報研究センター, 主任研究員
田之倉 優  東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 教授
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
18,590千円 (直接経費: 14,300千円、間接経費: 4,290千円)
2012年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2011年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2010年度: 12,090千円 (直接経費: 9,300千円、間接経費: 2,790千円)
キーワード環境細菌 / 自然生態系 / 人為起源物質 / 細菌進化 / 微生物機能開発
研究概要

細菌の環境中での機能進化に関する知見を得ることを目的として、完全な人工合成化合物である有機塩素系殺虫剤γ-HCHを完全分解資化する細菌と、有機塩素系化合物分解の鍵酵素である脱ハロゲン酵素に関する詳細な解析を実施した。その結果、(1)いくつかの脱ハロゲン酵素の構造-機能相関を明らかにし、酵素の機能進化過程に関する知見を得た。また、(2)ゲノム構造の観点から、環境細菌が新規能力を獲得する過程に関する知見を得ると共に、その過程における特定の可動性遺伝因子の重要性を提示した。さらに、(3)得られた知見を利用して、細菌の環境中での機能進化を実験的に検証する系を構築した。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (168件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (33件) (うち査読あり 32件) 学会発表 (133件) (うち招待講演 4件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Coinetgrate-resolution of toluene-catabolic transposon Tn46512013

    • 著者名/発表者名
      Yano, H., H. Genka, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, E.M. Top, M. Tsuda
    • 雑誌名

      Plasmid

      巻: 69 号: 1 ページ: 24-35

    • DOI

      10.1016/j.plasmid.2012.07.004

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of Acidovorax sp. KKS102, a polychlorinated biphenyl-degrading strain2012

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo, Y., F. Maruyama, H. Mitsui, Y. Nagata, M. Tsuda
    • 雑誌名

      J Bacteriol

      巻: 194 号: 24 ページ: 6970-6971

    • DOI

      10.1128/jb.01848-12

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ParI, an orphan ParA family protein from Pseudomonas putida KT2440-specific genomic island, interferes with the partition system of IncP-7 plasmids2012

    • 著者名/発表者名
      Miyakoshi, M., M. Shintani, K. Inoue, T. Terabayashi, F. Sai, M. Ohkuma, H. Nojiri, Y. Nagata, M. Tsuda
    • 雑誌名

      Environ Microbiol

      巻: 14 号: 11 ページ: 2946-2959

    • DOI

      10.1111/j.1462-2920.2012.02861.x

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the haloalkane dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefaciens C582012

    • 著者名/発表者名
      Mase, T., H. Yabuki, M. Okai, J. Ohtsuka, F. L. Imai, Y. Nagata, and M. Tanokura
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F

      巻: F68 号: 6 ページ: 652-654

    • DOI

      10.1107/s1744309112013942

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. strain KKS102, which are located on an integrative and conjugative element2012

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y., Y. Ishibashi, H. Naganawa, S. Hirokawa, S. Atobe, Y. Nagata, M. Tsuda
    • 雑誌名

      J Bacteriol

      巻: 194 号: 16 ページ: 4237-4248

    • DOI

      10.1128/jb.00352-12

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cloning ofγ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase gene with its flanking regions from soil byactivity-based screening techniques2012

    • 著者名/発表者名
      Ito, M., A. Ono, Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • 雑誌名

      European J. Soil Biology

      巻: 52 ページ: 16-19

    • DOI

      10.1016/j.ejsobi.2012.05.001

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Povotal role of anthranilate dioxygenase genes in the adaptation of Burkholderia multivorans ATCC17616 in soil2012

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Yamamoto, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters

      巻: 330 号: 1 ページ: 46-55

    • DOI

      10.1111/j.1574-6968.2012.02532.x

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Suppression of pleiotrophic phenotypes of Burkholderia multivorans fur mutant by oxyR mutation2012

    • 著者名/発表者名
      Kimura, A., S. Yuhara, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 158 号: 5 ページ: 1284-1293

    • DOI

      10.1099/mic.0.057372-0

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ハロアルカン脱ハロゲン酵素DbjAの鏡像異性体選択性機構の解明2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤優花里、夏目亮、Zbynek Prokop, Jan Brezovsky, Radka Chaloupkova, Jiri Damborsky、 永田裕二、千田俊哉
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌

      巻: 53 号: 2 ページ: 124-129

    • DOI

      10.5940/jcrsj.53.124

    • NAID

      10028253974

    • ISSN
      0369-4585, 1884-5576
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • 著者名/発表者名
      Nagata, Y., S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      Enzyme and Microbial Technology

      巻: 49 号: 6-7 ページ: 499-508

    • DOI

      10.1016/j.enzmictec.2011.10.005

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Stereoselectivity and conformational stability of haloalkane dehalogenase DbjA from Bardyrhizobium japonicum USDA110: the effect of pH and temperature2011

    • 著者名/発表者名
      Chaloupkova, R., Z. Prokop, Y. Sato, Y. Nagata, and J. Damborsky
    • 雑誌名

      FEBS J

      巻: 278 号: 15 ページ: 2728-2738

    • DOI

      10.1111/j.1742-4658.2011.08203.x

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of a crystallization protocol for the DbeA1 variant of novel haloalkane dehalogenase from Bradyrhizobium elkanii USDA942011

    • 著者名/発表者名
      Prudnikova, T., R. Chalouplova, Y. Sato, Y. Nagata, O. Degtjarik, M. Kuty, P. Rezacova, J. Damborsky, and I. Kuta Smatanova
    • 雑誌名

      Crysta Growth & Design

      巻: 11 号: 2 ページ: 516-519

    • DOI

      10.1021/cg1013363

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biochemical characteristics of the novel haloalkane dehalogenase DatA isolated from the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens C582011

    • 著者名/発表者名
      Hasan, K., A. Fortova, T. Koudelakova, R. Chalooupkova, M. Ishitsuka, Y. Nagata, J. Damborsky, and Z. Prokop
    • 雑誌名

      Appl. Environ. Microbial

      巻: 77 (5) 号: 5 ページ: 1881-1884

    • DOI

      10.1128/aem.02109-10

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The <I>lin</I> Genes for &gamma;-Hexachlorocyclohexane Degradation in <I>Sphingomonas</I> sp. MM-1 Proved to Be Dispersed across Multiple Plasmids2011

    • 著者名/発表者名
      Tabata, M., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 75 号: 3 ページ: 466-472

    • DOI

      10.1271/bbb.100652

    • NAID

      10028201533

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The lin genes for γ-hexachlorocyclohexane degradation in Sphingomonas sp.MM-1 proved to be dispersed across multiple plasmids2011

    • 著者名/発表者名
      Tabata, M., et al
    • 雑誌名

      Biosci.Biotechnol.Biochem.

      巻: 75 ページ: 466-472

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biochemical characteristics of the novel haloalkane dehalogenase DatAisolated from the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens C582011

    • 著者名/発表者名
      Hasan, K., et al
    • 雑誌名

      Appl.Environ.Microbial.

      巻: 77 ページ: 1881-1884

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010

    • 著者名/発表者名
      加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 雑誌名

      環境バイオテクノロジー学会誌

      巻: 10(2) ページ: 63-70

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 特集「生態機能と環境保全」に寄せて2010

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 雑誌名

      環境バイオテクノロジー学会誌

      巻: 10(2) ページ: 52-52

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 環境バイオテクノロジー学会シンポジウム2010

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 雑誌名

      「生態機能と環境保全」微生物生態学会誌

      巻: 25(2) ページ: 77-78

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行、大坪和香子、永田裕二、津田雅孝
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 48(5) ページ: 313-319

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of the representativeγ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteriumSphingobium japonicum UT262010

    • 著者名/発表者名
      Nagata, Y., Y. Ohtsubo, R. Endo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      J. Bacteriology

      巻: 192 号: 21 ページ: 5852-5853

    • DOI

      10.1128/jb.00961-10

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA from Sphingobium japonicum UT262010

    • 著者名/発表者名
      Okai, M., K. Kubota, M. Fukuda, Y. Nagata, K. Nagata, and M. Tanokura
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol

      巻: 403 号: 2 ページ: 260-269

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2010.08.043

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete nucleotide sequence of TOL plasmid pDK1 provides evidence for evolutionary history of IncP-7 catabolic plasmids2010

    • 著者名/発表者名
      Yano, H., M. Miyakoshi, K. Ohshima, M. Tabata, Y. Nagata, M. Hattori, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      J.Bacteriol

      巻: 192 号: 17 ページ: 4337-4347

    • DOI

      10.1128/jb.00359-10

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering2010

    • 著者名/発表者名
      Prokop, Z., Y. Sato, J. Brezovsky, T. Mozga, R. Chalooupkova, T. Koudelakova, P. Jerabek, V. Stepankova, R. Natsume, J. G.E. van Leeuwen, D. B. Janssen, J. Florian, Y. Nagata, T. Senda, and J. Damborsky
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie

      巻: 49 号: 35 ページ: 6111-6115

    • DOI

      10.1002/ange.201001753

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced in soil environment by in vivo expression technology2010

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      Environmental Microbiology

      巻: 12(9) 号: 9 ページ: 2539-2558

    • DOI

      10.1111/j.1462-2920.2010.02227.x

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of extracellular alginate lyase and its gene from a marine bacterial strain, Pseudoalteromonas atlantica AR062010

    • 著者名/発表者名
      Matsushima, R., H. Danno, M. Uchida, K. Ishihara, T. Suzuki, M. Kaneniwa, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      Appl Microbiol Biotechnol

      巻: 86 ページ: 567-576

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced in soil environment by in vivo expression technology2010

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, E., et al
    • 雑誌名

      Environmental Microbiology

      巻: 12 ページ: 2539-2558

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete nucleotide sequence of TOL plasmid pDK1 provides evidence for evolutionary history of IncP-7 catabolic plasmids2010

    • 著者名/発表者名
      Yano, H., et al
    • 雑誌名

      J.Bacteriol.

      巻: 192 ページ: 4337-4347

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA from Sphingobium japonicum UT262010

    • 著者名/発表者名
      Okai, M., et al
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol.

      巻: 403 ページ: 260-269

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT262010

    • 著者名/発表者名
      Nagata, Y., et al
    • 雑誌名

      J.Bacteriol.

      巻: 192 ページ: 5852-5853

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, ら
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 48 ページ: 313-319

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 環境バイオテクノロジー学会シンポジウム「生態機能と環境保全」2010

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 雑誌名

      微生物生態学会誌

      巻: 25 ページ: 77-78

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [雑誌論文] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, ら
    • 雑誌名

      環境バイオテクノロジー学会誌

      巻: 10 ページ: 63-70

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会第20回記念フロンティアシンポジウム
    • 発表場所
      日仙台(招待講演)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、田端理朗、大畑智史、大坪嘉行、津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      東北大学(仙台)(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、大畑智史、田端理朗、大坪嘉行、津田雅孝
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      長浜バイオ大学(長浜)(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] リダクターゼ機能相補による新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の芳香族化合物複合汚染土壌メタゲノムからの探索2013

    • 著者名/発表者名
      永山浩史ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株におけるFurの機能及び発現制御機構の解析2013

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] gamma-HCH分解能を示すSphingobium属細菌のTKS株とMI1205株の全ゲノム配列決定とgamma-HCH分解関与遺伝子群周辺領域の解析2013

    • 著者名/発表者名
      大畑智史ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Finishing関連の3つのツール: GenoFinisher、AceFileViewer、ShortReadManager2013

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] IncP-9群プラスミドNAH7の接合伝達開始配列の解析2013

    • 著者名/発表者名
      岸田康平ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーによる土壌細菌の環境適応遺伝子の新規探索手法の開発2013

    • 著者名/発表者名
      石橋蓉子ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 撹乱に対する土壌微生物のレジリエンス2013

    • 著者名/発表者名
      加藤広海ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 細菌群集動態のモデリング2013

    • 著者名/発表者名
      伊藤貴広ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物複合汚染土壌における新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の機能相補に基づく探索2013

    • 著者名/発表者名
      永山浩史ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ハロアルカンデハロゲナーゼ DatAの立体構造解析2013

    • 著者名/発表者名
      管 立軍ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 多様な細菌のゲノム上に存在するハロアルカンデハロゲナーゼの 機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      田中裕興ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] IncP-9群 NAH7接合伝達系のoriTを中心とした解析2013

    • 著者名/発表者名
      岸田康平ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] フィニッシング支援ツールGenoFinisherとAceFileViewer2013

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] γ-HCH分解細菌Sphingomonas sp. MM-1株が有する多重プラスミドに 関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      田端理朗ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会 第20回記念フロンティアシンポジウム
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      永田裕二,田端理朗,大畑智史,大坪嘉行,津田雅孝
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Nagata, M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • 学会等名
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2012) Daegu
    • 発表場所
      Korea(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を 支える ABC トランスポーター2012

    • 著者名/発表者名
      永田裕二 、遠藤諒、 大坪嘉行 、 津田雅孝
    • 学会等名
      第7回トランスポーター研究会年会
    • 発表場所
      京都(招待講演)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Metagenomic Analysis of Microbial Community in Soil Contaminated with Aromatic Pollutants2012

    • 著者名/発表者名
      M. Tsudaら
    • 学会等名
      Japan-Finland Biotechnology Symposium 2012
    • 発表場所
      Sendai, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を支えるABCトランスポーター2012

    • 著者名/発表者名
      永田裕二ら
    • 学会等名
      第7回トランスポーター研究会年会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 環境汚染物質gamma-hexachlorocyclohexaneの分解能を有するSphingobium sp. TKS株のゲノム構造の解明2012

    • 著者名/発表者名
      大畑智史ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2012年度大会
    • 発表場所
      宇治
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 培養非依存的手法を用いた芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の探索2012

    • 著者名/発表者名
      永山浩史ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2012年度大会
    • 発表場所
      宇治
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 細菌由来のβ-ヘキサクロロシクロヘキサン (β-HCH) 分解酵素linB_MIを導入したカボチャ毛状根のβ-HCH分解能の解析2012

    • 著者名/発表者名
      七里吉彦ら
    • 学会等名
      第30回 日本植物細胞分子生物学会 (生駒) 大会・シンポジウム
    • 発表場所
      奈良県生駒市
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Response of soil microbial community against pulse perturbation by aromatic pollutants2012

    • 著者名/発表者名
      H. Kato et al.
    • 学会等名
      14th International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      Copenhagen, Denmark
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Multiple plasmids of γ-hexachlorocylohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp. MM-12012

    • 著者名/発表者名
      M. Tabata et al.
    • 学会等名
      International Plasmid Biology Conference 2012
    • 発表場所
      Santander, Spain
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Relationship between intergeneric conjugative transfer of plasmid NAH7 and nitrogen-related phosphotransferase system2012

    • 著者名/発表者名
      K. Inoue et al.
    • 学会等名
      International Plasmid Biology Conference 2012
    • 発表場所
      Santander, Spain
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Nagata et al.
    • 学会等名
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
    • 発表場所
      Daegu, Korea
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Isolation of aromatic ring-hydroxylating oxygenase genes by cultivation-independent functional screening of metagenome from soil artificially contaminated with aromatic hydrocarbons2012

    • 著者名/発表者名
      H. Nagayama et al.
    • 学会等名
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
    • 発表場所
      Daegu, Korea
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      永田裕二ら
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 細菌ゲノムに存在する多様なハロアルカンデハロゲナーゼ遺伝子の機能解析2012

    • 著者名/発表者名
      田中裕興ら
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌が突然変異により炭素源非添加無機寒天培地上で生育可能となる機構の解析2012

    • 著者名/発表者名
      平野丈ら
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] ハロアルカンデハロゲナーセLinBのbeta-HCH分解活性に関する機能進化2012

    • 著者名/発表者名
      田中裕興ら
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会・第35回日本分子生物学会年会合同大会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Genetic analysis of multiple plasmids in γ-hexachlorocylohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp. MM-12012

    • 著者名/発表者名
      M. Tabata et al.
    • 学会等名
      International Forum for Ecosystem Adaptability Science IV: Interface Between Policy and Science
    • 発表場所
      Sendai, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of nitrogen-related phosphotransferase system in recipient cells involved in regulation of conjugative transfer2012

    • 著者名/発表者名
      K. Inoue et al.
    • 学会等名
      International Forum for Ecosystem Adaptability Science IV: Interface Between Policy and Science
    • 発表場所
      Sendai, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 土壌攪乱に対し同調して動く遺伝子群の解析2012

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, ら
    • 学会等名
      第6回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京・立教大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌群集団の移植と芳香族化合物による汚染化の変動解析2012

    • 著者名/発表者名
      永山浩史, ら
    • 学会等名
      第6回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京・立教大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] GenoFinisherを用いたPseudomonas sp.CF600ゲノムの完全配列決定2012

    • 著者名/発表者名
      奥野周, ら
    • 学会等名
      第6回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京・立教大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するSphingobium sp.TKS株のゲノム解析2012

    • 著者名/発表者名
      大畑智史, ら
    • 学会等名
      第6回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京・立教大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivorans ATCC 17616株ゲノムからSTM法で選抜した土壌環境下での生残関与候補遺伝子の解析2012

    • 著者名/発表者名
      石橋蓉子, ら
    • 学会等名
      第6回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京・立教大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium sp.MI1205株由来のハロアルカンデハロゲナーゼLinBの立体構造解析2012

    • 著者名/発表者名
      岡井公彦, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] フィニッシング用のツールGenoFinisherの開発2012

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物汚染土壌における経時的メタゲノムによって明らかになった土壌微生物の適応反応2012

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄応答転写因子Furと過酸化水素応答転写因子OxyRの各種表現型への関与2012

    • 著者名/発表者名
      木村明音, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子群のsingle cellレベルでの発現解析2012

    • 著者名/発表者名
      井上慧, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 培養非依存的手法による土壌からの新規芳香族化合物分解遺伝子の探索2012

    • 著者名/発表者名
      永山浩史, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium sp.MI1205株由来のハロアルカンデハロゲナーゼLinB_MIにおけるbeta-HCH分解活性に重要なアミノ酸残基の同定2012

    • 著者名/発表者名
      森内良太, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] IncP-7群プラスミドの接合伝達宿主域を規定する因子の探索2012

    • 著者名/発表者名
      瀬谷学人, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム情報を利用した多様な細菌由来のハロアルカンデハロゲナーゼの解析2012

    • 著者名/発表者名
      田中裕興, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌Sphingobium japonicum UT26株の炭素源非添加無機寒天培地上で生育する突然変異株の遺伝学的解析2012

    • 著者名/発表者名
      平野丈, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] STM法で同定した土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の土壌環境下での生残に重要な遺伝子の解析2012

    • 著者名/発表者名
      石橋蓉子, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 環境汚染物質分解能を担うプラスミドの水平伝達2012

    • 著者名/発表者名
      津田雅孝, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会シンポジウム
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 微生物ドラフトゲノム配列のフィニッシング用ツール2012

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, ら
    • 学会等名
      第85回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      長崎
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 微生物遺伝子資源の活用技術2011

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • 学会等名
      東北大学-産総研連携公開講演会
    • 発表場所
      東京・アキバホール
    • 年月日
      2011-07-28
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 「人為起源の環境汚染物質分解能を有する細菌ゲノムのダイナミズム」理研シンポジウム「微生物研究の潮流とそれを支えるリソース基盤」2011

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      理研和光キャンパス
    • 発表場所
      鈴木梅太郎ホール(招待講演)
    • 年月日
      2011-03-11
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 人為起源の環境汚染物質分解能を有する細菌ゲノムのダイナミズム2011

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      理研シンポジウム「微生物研究の潮流とそれを支えるリソース基盤」
    • 発表場所
      和光・理研
    • 年月日
      2011-03-11
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane) in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis"Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Nagata, Y. Ohtsubo, and M.Tsuda
    • 学会等名
      University of Delhi
    • 発表場所
      Delhi, India(基調講演)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium. "Indo-Swiss-Collaboration inBiotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Nagata ,S. Natsui, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguch, N. Fujita, and M. Tsuda
    • 学会等名
      University of Delhi
    • 発表場所
      Delhi, India(招待講演)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural insight into the catalytic mechanism of enzyme for bioremediation2011

    • 著者名/発表者名
      Masaru Tanokura, et al
    • 学会等名
      BIT Life Sciences' 2^<nd> Symposium on Enzymes and Biocatalysis
    • 発表場所
      Dalian, China
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Molecular bases of enatioselectivity of haloalkane dehalogenase DbjA2011

    • 著者名/発表者名
      Yukari Sato, et al
    • 学会等名
      BIT Life Sciences' 2^<nd> Symposium on Enzymes and Biocatalysis
    • 発表場所
      Dalian, China
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium sp.MI1205株由来のハロアルカンデハロゲナーゼLinB_MI特異的なbeta-HCH分解活性に重要なアミノ酸残基の同定2011

    • 著者名/発表者名
      森内良太, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2011年度大会
    • 発表場所
      東京・東京大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の土壌特異的発現遺伝子の解析2011

    • 著者名/発表者名
      三浦那智, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2011年度大会
    • 発表場所
      東京・東京大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium sp.MI1205株由来の脱ハロゲン酵素LinB_MI特異的なbeta-HCH分解活性に重要なアミノ酸残基の同定2011

    • 著者名/発表者名
      森内良太, ら
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会ワークショップ
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達制御に関与する受容菌のリン酸基転移系2011

    • 著者名/発表者名
      井上慧, ら
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会ワークショップ
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株のfur破壊株のROS/NOS高感受性とoxyR欠失による表現型回復機構2011

    • 著者名/発表者名
      木村明音, ら
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会ワークショップ
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解細菌Sphingomonas sp.MM-1株が保持する分解関連プラスミドの塩基配列解析と機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      田端理朗, ら
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会ワークショップ
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の土壌環境特異的発現遺伝子の解析2011

    • 著者名/発表者名
      三浦那智, ら
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会ワークショップ
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 土壌メタゲノムから見る,芳香族化合物汚染により誘導される微生物群集の反応2011

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, ら
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会ワークショップ
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物複合汚染土壌由来のメタゲノムライブラリからの機能相補による新規リダクターゼ遺伝子の探索2011

    • 著者名/発表者名
      永山浩史, ら
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会ワークショップ
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 残留性有機汚染物質(POPs)分解酵素遺伝子を導入したカボチャ毛状根によるヘキサクロロシクロヘキサン分解能の解析2011

    • 著者名/発表者名
      七里吉彦, ら
    • 学会等名
      第29回日本植物細胞分子生物学会大会
    • 発表場所
      福岡・九州大学
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Fluctuation pattern of gene pools of microbiota in aromatic hydrocarbon-contaminated soil by sequential metagenomic analysis2011

    • 著者名/発表者名
      Hiromi Kato, et al
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      Sapporo, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Nitrogen-related phosphotransferase system of Pseudomonas putida KT2440 exerts negative effect on conjugative acquisition of naphthalene-catabolic plasmid NAH72011

    • 著者名/発表者名
      Kei Inoue, et al
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      Sapporo, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Alleviation of nitric oxide sensitivity of Burkholderia multivorans ATCC 17616 fur mutant by additional mutation in oxyR gene2011

    • 著者名/発表者名
      Akane Kimura, et al
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      Sapporo, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Structural analysis of plasmids for gamma-hexachlorocyclohexane degradation in Sphingomonas sp.MM-12011

    • 著者名/発表者名
      Michiro Tabata, et al
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      Sapporo, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Development of a computational tool for finishing of draft genomic sequence2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshiyuki Ohtsubo, et al
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • 発表場所
      Sapporo, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Direct isolation and characterization of genes for degradation of aromatic compounds from soils that were artificially contaminated with aromatic pollutants2011

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Nagayama, ら
    • 学会等名
      International Forum for Ecosystem Adaptability Science III-Adaptability of Human Societies to Perturbation
    • 発表場所
      Sendai, Japan
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • 著者名/発表者名
      Nagata, Y., et al
    • 学会等名
      "Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexaehlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"
    • 発表場所
      Delhi, India
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane) in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis2011

    • 著者名/発表者名
      Nagata, Y., et al
    • 学会等名
      "Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"
    • 発表場所
      Delhi, India
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌Sphingobium japohicum UT26株内にて転移する挿入配列検出系の構築2011

    • 著者名/発表者名
      西岡ましほ, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 受容菌のリン酸基転移系によるIncP-9プラスミドNAH7の接合伝達制御機構2011

    • 著者名/発表者名
      井上慧, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium sp.MI1205株由来の脱ハロゲン酵素LinB_MIのbeta-HCH分解活性に重要なアミノ酸残基の同定2011

    • 著者名/発表者名
      森内良太, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 機能ベースのメタゲノム的手法で取得した芳香族化合物代謝関連遺伝子群の解析2011

    • 著者名/発表者名
      菅原智詞, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解細菌Sphingomonas sp.MM-1株が有する分解関連プラスミドの機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      田端理朗, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株の土壌環境中における特異的発現遺伝子の解析2011

    • 著者名/発表者名
      三浦那智, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株のFurとOxyRの遺伝学的関連とメカニズムの解明2011

    • 著者名/発表者名
      木村明音, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の土壌環境下で生育に重要な遺伝子の探索・解析2011

    • 著者名/発表者名
      千本木淳子, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] gamma-HCH分解細菌Sphingobium japonicum UT26株由来の有機炭素源非添加無機培地で生育する変異株の解析2011

    • 著者名/発表者名
      宇井博紀, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 液体集積培養系における有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を担う細菌株群に関する研究2011

    • 著者名/発表者名
      川角徹, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物汚染により誘導される土壌遺伝子プールの変動解析2011

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌汚染により優先したBurkholderia群集の系統と代謝能力の遷移2011

    • 著者名/発表者名
      熊野知拡, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 微生物ゲノム完全長決定支援ソフトウエア454Finisher(仮)2011

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Acidovorax sp.KKS102におけるカタボライト抑制メカニズムの研究2011

    • 著者名/発表者名
      小沼かおり, ら
    • 学会等名
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      仙台・東北学院大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ドラフトゲノム配列のFinishing支援ツール:454Finisher2011

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Sphingobium sp.MI1205株由来のハロアルカンデハロゲナーゼLinB_MIのbeta-HCH分解活性に重要なアミノ酸残基の同定2011

    • 著者名/発表者名
      森内良太, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Sphingomonas sp.MM-1株が有する有機塩素系殺虫剤gamma-hexachloro cyclohexane分解関連プラスミドの構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      田端理朗, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌Sphingobium japonicum UT26株内で転移する挿入配列検出系の構築2011

    • 著者名/発表者名
      西岡ましほ, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解細菌の有機炭素源非添加無機培地での生育に関する研究2011

    • 著者名/発表者名
      宇井博紀, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤γ?hexachlorocyclohexane (HCH)分解機能を担う集積培養細菌叢に関する研究2011

    • 著者名/発表者名
      川角徹, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄応答転写因子Furと過酸化水素応答転写因子OxyRの遺伝学的関連性の解明2011

    • 著者名/発表者名
      木村明音, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株の土壌環境下で生育に重要な遺伝子の同定2011

    • 著者名/発表者名
      千本木淳子, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株の土壌特異的発現遺伝子の解析2011

    • 著者名/発表者名
      三浦那智, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌の汚染化によって起こる微生物遺伝子プールの変動2011

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌汚染によって優先したBurkholderia群集の系統および代謝能力の遷移2011

    • 著者名/発表者名
      熊野知拡, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 培養非依存的手法で取得した芳香族化合物代謝関連遺伝子群の解析2011

    • 著者名/発表者名
      菅原智詞, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達に関与するプラスミド因子ど受容菌因子の解析2011

    • 著者名/発表者名
      井上慧, ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      京都・京都女子大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Genetic interaction of global transcriptional regulators, Fur and OxyR, in Burkholderia multivorans2010

    • 著者名/発表者名
      Kimura, A., et al
    • 学会等名
      International Forum for Adaptability Science II : Technologies for a Sustainable Society
    • 発表場所
      Sendai, Japan
    • 年月日
      2010-12-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 微生物遺伝子資源の活用技術2010

    • 著者名/発表者名
      永田裕二, ら
    • 学会等名
      東北大学-産総研連携公開講演会
    • 発表場所
      東京・アキバホール
    • 年月日
      2010-07-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌汚染に対する微生物遺伝子プールの変動解析2010

    • 著者名/発表者名
      津田雅孝, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会シンポジウム
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 年月日
      2010-06-22
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010

    • 著者名/発表者名
      Y. Nagata, S. Natsui, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, N. Fujita, and M. Tsuda
    • 学会等名
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability ofHuman Society
    • 発表場所
      Rimini, Italy. (口頭発表)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] ハロアルカン脱ハロゲン酵素DbjA特有のループによるエナンチオ選択性機構の解明2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤優花里, ら
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌・札幌コンベンションセンター
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      2010 実績報告書
  • [学会発表] 第二世代シークエンサを用いた、土壌汚染に伴う微生物の適応反応の解析2010

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivorans ATCC 17616株の土壌特異的発現遺伝子の同定と解析2010

    • 著者名/発表者名
      西山依里, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤γ-hexachlorocyclohexane(γ-HCH)分解細菌Sphingomonas sp.MM-1株が有するγ-HCH分解関連プラスミドの解析2010

    • 著者名/発表者名
      田端理朗, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 受容菌のリン酸基転移系によるナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達の制御機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      井上慧, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおける鉄応答転写因子と過酸化水素応答転写因子の関連2010

    • 著者名/発表者名
      木村明音, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] メタゲノムアプローチにより多重汚染土壌から取得した芳香族化合物初発酸化酵素遺伝子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      菅原智詞, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤γ-HCH分解細菌Sphingobium japonicum UT26株における挿入配列IS6100を介したゲノムの動態2010

    • 著者名/発表者名
      夏井俊介, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Hexachlorocyclohexane (HCH)異性体汚染土壌由来の有機塩素系殺虫剤γ-HCH分解細菌叢の解析2010

    • 著者名/発表者名
      川角徹, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] STM法による土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の土壌環境下で生育に重要な遺伝子の探索2010

    • 著者名/発表者名
      千本木淳子, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 解析ソフトウエアGenomeMatcherのドラフトゲノムシーケンスのコンプリート支援機能2010

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物分解系プラスミドの安定的維持を阻害する宿主因子2010

    • 著者名/発表者名
      宮腰昌利, ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • 発表場所
      仙台・東北大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Fluctuation of gene pools of soil microbiota induced by contamination with aromatic hydrocarbons2010

    • 著者名/発表者名
      Kato, H., et al
    • 学会等名
      13th International Society for Microbial Ecology Conference
    • 発表場所
      Seattle, USA
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010

    • 著者名/発表者名
      Nagata, Y., et al
    • 学会等名
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • 発表場所
      Rimini, Italy
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Genetic interaction of global transcriptional regulators, Fur and OxyR, in Burkholderia multivorans2010

    • 著者名/発表者名
      Kimura, A., et al
    • 学会等名
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • 発表場所
      Rimini, Italy
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] PCB/biphenyl degradation operon repressed by different compounds in Acidovorax sp.KKS102 and Burkholderia multivorans ATCC 176162010

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo, Y., et al
    • 学会等名
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • 発表場所
      Rimini, Italy
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Conjugative transfer of naphthalene-catabolic plasmid NAH7 regulated by nitrogen-related phosphotransferase system of recipient cells2010

    • 著者名/発表者名
      Inoue, K., et al
    • 学会等名
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • 発表場所
      Rimini, Italy
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物汚染により誘導される土壌メタゲノムの変動様式とそのメカニズム2010

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, ら
    • 学会等名
      第26回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      つくば・筑波大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Gamma-HCH分解細菌Sphingobium japonicum UT26株由来の極貧炭素源条件下で生育する変異株の解析2010

    • 著者名/発表者名
      宇井博紀, ら
    • 学会等名
      第26回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      つくば・筑波大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ハロアルカン脱ハロゲン酵素DbjAの鏡像異性体選択性機構の解明2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤優花里, ら
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸・神戸ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] 「酵素利用技術体系」(部分執筆pp939-948:「脱ハロゲン酵素」)2010

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、津田雅孝
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] 「難培養性微生物研究の最新技術II」(部分執筆pp211-219:「環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス」)2010

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、津田雅孝
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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