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真核生物におけるDーアミノ酸バイオシステムの機能と制御

研究課題

研究課題/領域番号 22380058
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用生物化学
研究機関名古屋大学

研究代表者

吉村 徹  名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (70182821)

研究分担者 邊見 久  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 准教授 (60302189)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2012年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2011年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2010年度: 9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
キーワードD-アミノ酸 / D-セリン / D-アスパラギン酸 / Dictyostelium discoidium / D-セリンデヒドラターゼ / セリンラセマーゼ / D-セリン / アスパラギン酸ラセマーゼ / D-セリンデヒドラターゼ / 細胞性粘菌 / ピリドキサルリン酸 / ALS / D-Ser / D-セリンデヒドロターゼ
研究概要

本研究では、Saccharomyces cerevisiae のD-セリンデヒドラターゼおよび、細胞性粘菌、Dictyostelium discoidiumのセリンラセマーゼの反応機構について検討し、前者についてはその亜鉛の役割、後者については二塩基機構による反応機序を明らかにした。また哺乳動物におけるD-アスパラギン酸の生理機能を明らかにすることを目的に、アスパラギン酸ラセマーゼの可能性が指摘されているマウスのGOT1L1 遺伝子のクローニングと同タンパク質の取得を試みた。一方D-アミノ酸と発生の関係を明らかにするため、単細胞から多細胞へと生活環を変化させる細胞性粘菌、Dictyostellium discoidium をとりあげ、同菌においてD-セリン分解にかかわるD-セリンデヒドラターゼの遺伝子破壊を行った。その結果、多細胞期の変異型粘菌体内にD-セリンが蓄積するとともに、胞子形成にかかわる細胞分化に関して異常が起こる事が認められた。本研究ではさらに、生体内D-セリンを分解するためのツールを構築する目的で、酵母のD-セリンデヒドラターゼのポリエチレングリコール修飾を行い、免疫原性が低減した酵素を得る事に成功した。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (44件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (31件) (うち招待講演 4件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Catalyticmechanism of serine racemase fromDictyostelium discoideum.2013

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Maekawa M, Hayashi S, Goto M,Hemmi H, Yoshimura T
    • 雑誌名

      Amino Acids

      巻: 44 号: 3 ページ: 1073-1084

    • DOI

      10.1007/s00726-012-1442-4

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role of Zinc Ion for CatalyticActivity in D-Serine Dehydratase fromSaccharomyces cerevisiae2013

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Koga K, Hemmi H, YoshimuraT.
    • 雑誌名

      FEBS Journal

      巻: 279 号: 4 ページ: 612-624

    • DOI

      10.1111/j.1742-4658.2011.08451.x

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Metal ion dependency ofserine racemase from Dictyosteliumdiscoideum2012

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Murase H, Maekawa M, Goto M,Hayashi S, Saito H, Maki M, Hemmi H,Yoshimura T
    • 雑誌名

      Amino acids

      巻: 879 ページ: 3190-3195

    • URL

      http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00726-012-1232-z

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lysine racemase from a lactic acid bacterium, Oenococcus oeni: Structuralbasis of substrate specificity2012

    • 著者名/発表者名
      Kato S, Hemmi H, Yoshimura T
    • 雑誌名

      J. Biochem.

      巻: 152 ページ: 505-508

    • URL

      http://jb.oxfordjournals.org/content/152/6/505.long

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simultaneous determination ofD-amino acids by the coupling method ofD-amino acid oxidase withhigh-performance liquid chromatography2012

    • 著者名/発表者名
      Kato S, Kito Y, Hemmi H, Yoshimura T
    • 雑誌名

      J.Chromat

      巻: B 879 号: 29 ページ: 3190-3195

    • DOI

      10.1016/j.jchromb.2010.12.005

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enzymatic assay for D-aspartic acid using D-aspartate oxidase and oxaloacetate decarboxylase.2012

    • 著者名/発表者名
      Kato S, Ikuta T, Hemmi H, Takahashi S, Kera Y, Yoshimura T.
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      巻: 76 ページ: 2150-2152

    • NAID

      10031126525

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lysine racemase from a lactic acid bacterium, Oenococcus oeni: structural basis of substrate specificity.2012

    • 著者名/発表者名
      Kato S, Hemmi H, Yoshimura T.
    • 雑誌名

      J Biochem.

      巻: 152 号: 6 ページ: 505-508

    • DOI

      10.1093/jb/mvs120

    • NAID

      10031166168

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Metal ion dependency of serine racemase from Dictyostelium discoideum2012

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Murase H, Maekawa M, Goto M, Hayashi S, Saito H, Maki M, Hemmi H, Yoshimura T
    • 雑誌名

      Amino Acids

      巻: (印刷中) 号: 4 ページ: 1567-1576

    • DOI

      10.1007/s00726-012-1232-z

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 哺乳類のアスパラギン酸ラセマーゼ2011

    • 著者名/発表者名
      伊藤智和、吉村徹
    • 雑誌名

      ビタミン

      巻: 85 ページ: 661-665

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [雑誌論文] Alteration in D-amino acid concentrations and microbial community structures during the fermentation of red and white wines2011

    • 著者名/発表者名
      Shiro Kato, Tatsuya Ishihara, Hisashi Hemmi, Hironori Kobayashi, Tohru Yoshimura
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 111 ページ: 104-108

    • NAID

      110008440358

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] サプリメントとしてのD-アスパラギン酸2011

    • 著者名/発表者名
      加藤志郎、吉村徹
    • 雑誌名

      ビタミン

      巻: 85 ページ: 29-30

    • NAID

      110008440796

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [雑誌論文] A highly sensitive enzymatic assay for D- and total serine detection using D-serine dehydratase from Saccharomyces cerevisiae2010

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Naka, Tomokazu Ito, Hisashi Hemmi, Tohru Yoshimura
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Catalysis B : Enzymatic

      巻: 67 ページ: 150-154

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] D-アミノ酸の機能とバイオマーカーとしての可能性2013

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹、伊藤智和
    • 学会等名
      第3回予防早期医療創成センター ワークショップ
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] D-アミノ酸代謝関連酵素を用いたD-アミノ酸の定量と機能性評価2012

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹, 加藤 志郎, 伊藤 智和, 邊見久
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会シンポジウム
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2012-10-24
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] D-Amino acid as a novelbiofactor2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura T
    • 学会等名
      103rd AOCS Annual meeting &Expo
    • 発表場所
      Long Beach (USA)
    • 年月日
      2012-05-01
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] D-アミノ酸研究の展開と展望:分布、機能、代謝、食品・医薬への応用へ2012

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会ランチョンセミナー
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2012-03-25
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] D-アスパラギン酸酵素定量法の開発2012

    • 著者名/発表者名
      生田智之、加藤志郎、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学
    • 年月日
      2012-03-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Oenococcus oeniリジンラセマーゼの基質特異性に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      加藤志郎、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学
    • 年月日
      2012-03-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] D-Amino acid as a novel biofactor2012

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura Tohru
    • 学会等名
      103rd AOCS Annual meeting & Expo
    • 発表場所
      Long Beach Convention Center, USA
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] D-アミノ酸代謝関連酵素を用いたD-アミノ酸の定量と機能性評価2012

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹, 加藤 志郎, 伊藤 智和, 邊見 久
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Dictyostelium discoideumにおけるD-セリンの生理的役割2012

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹
    • 学会等名
      第2回日本細胞性粘菌学会
    • 発表場所
      東京大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] D-セリン定量キットの開発とヒト尿中D-セリン動態の解析2012

    • 著者名/発表者名
      高田紘江、石塚早記、伊藤智和、邊見久、柴田克己、吉村徹
    • 学会等名
      第8回D-アミノ酸研究会学術講演会
    • 発表場所
      滋賀医科大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Schizosaccharomyces pombe由来D-アミノ酸オキシダーゼ2012

    • 著者名/発表者名
      加藤志郎、鬼頭幸彦、安田尚正、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      第8回D-アミノ酸研究会学術講演会
    • 発表場所
      滋賀医科大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] D-アミノ酸研究の展開と展望:分布、機能、代謝、食品・医薬への応用へ2011

    • 著者名/発表者名
      吉村徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会ランチョンセミナー
    • 発表場所
      京都女子大学(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-25
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 真核生物のD-アミノ酸代謝関連酵素2011

    • 著者名/発表者名
      吉村 徹
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2011-09-24
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 真核生物のD-アミノ酸代謝関連酵素2011

    • 著者名/発表者名
      吉村徹
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      京都国際会議場(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ワイン乳酸菌Oenococcus oeni由来ラセマーゼの解析2011

    • 著者名/発表者名
      加藤志郎、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都国際会議場
    • 年月日
      2011-09-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 細胞性粘菌におけるD-セリンの生理的役割の解明2011

    • 著者名/発表者名
      萩泰典、伊藤智和、齊藤玉緒、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      第84回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都国際会議場
    • 年月日
      2011-09-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 細胞性粘菌におけるD-セリン代謝関連酵素とその生理機能2011

    • 著者名/発表者名
      萩泰典、伊藤智和、齊藤玉緒、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会
    • 発表場所
      京都女子大学
    • 年月日
      2011-09-23
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of D-amino acids production from lactic acid bacteria during fermentation of red and white wines2011

    • 著者名/発表者名
      Shiro Kato, Tatsuya Ishihara, Hironori Kobayashi, Maki Kawahara, Hisashi Hemmi, Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      International Union Microbiological Societies Sapporo 2011
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2011-09-10
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Lactobacillus属乳酸菌におけるD-アスパラギン酸代謝2011

    • 著者名/発表者名
      田上一輝、加藤志郎、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      第7回D-アミノ酸研究会学術講演会
    • 発表場所
      東京医科歯科大学
    • 年月日
      2011-09-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] PEG化D-セリンデヒドラーゼの調製と物性の解析2011

    • 著者名/発表者名
      高田紘江、磯部恵子、伊藤智和、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      第7回D-アミノ酸研究会学術講演会
    • 発表場所
      東京医科歯科大学
    • 年月日
      2011-09-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] GabR, a pyridoxal 5'-phosphate-dependent transcriptional regulator of Bacillus subtilis2011

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      The Third International Conference on Cofactors 03
    • 発表場所
      Finland,Turk(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ワイン乳酸菌Oenococcus oeni由来リジンラセマーゼの解析2011

    • 著者名/発表者名
      加藤志郎、川原麻季、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      (要旨集)
    • 年月日
      2011-03-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 真核細胞型D-セリンデヒドラターゼ:神経疾患解析への応用2011

    • 著者名/発表者名
      高田紘江、磯部恵子、伊藤智和、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      (要旨集)
    • 年月日
      2011-03-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ピリドキサールリン酸に依存する細菌の転写制御因子、GabR2011

    • 著者名/発表者名
      白木俊介、奥田啓太、深田はるみ、後藤勝、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      (要旨集)
    • 年月日
      2011-03-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 真核生物型D-セリンデヒドラーゼにおける亜鉛の意義2011

    • 著者名/発表者名
      伊藤智和、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2011年度大会
    • 発表場所
      (要旨集)
    • 年月日
      2011-03-26
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Eukaryotic D-serinedehydratase and its application toD-serine assay2010

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      The 65th West LakeInternational Symposium of ZhejianUniversity
    • 発表場所
      Zhejian(China)
    • 年月日
      2010-11-20
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Eukaryotic D-serine dehydratase and its application to D-serine assay2010

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      The 65th West Lake International Symposium of Zhejian University
    • 発表場所
      Zhejian University(中国)(招待講演)
    • 年月日
      2010-11-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 微生物酵素によるD-アミノ酸の定量2010

    • 著者名/発表者名
      吉村徹
    • 学会等名
      第62回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      宮崎シーガイア(招待講演)
    • 年月日
      2010-10-29
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 真核細胞型D-セリンデヒドラターゼ:酵素学的特性とD-セリン酵素定量法への応用2010

    • 著者名/発表者名
      吉村徹
    • 学会等名
      平成22年度日本農芸化学会中四国支部大会シンポジウム
    • 発表場所
      香川大学(招待講演)
    • 年月日
      2010-09-24
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ワイン発酵過程における菌叢とD-アミノ酸の動態2010

    • 著者名/発表者名
      加藤志郎、石原達也、川原麻紀、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      第6回D-アミノ酸研究会学術講演会
    • 発表場所
      富山国際会議場
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] ヨーグルトにおけるD-アミノ酸と菌叢2010

    • 著者名/発表者名
      田上一輝、加藤志郎、邊見久、吉村徹
    • 学会等名
      第6回D-アミノ酸研究会学術講演会
    • 発表場所
      富山国際会議場
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [産業財産権] 非タンパク性アミノ酸生産乳酸菌およびその用途2012

    • 発明者名
      吉村徹、加藤志郎
    • 権利者名
      国立大学法人名古屋大学
    • 産業財産権番号
      2012-033583
    • 出願年月日
      2012-02-20
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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