消化器癌の網羅的DNAメチル化解析による癌症例層別化

• 研究課題/領域番号: 22390255
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 消化器外科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 金田 篤志 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任准教授 (10313024)
• 連携研究者: 堤 修一 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任准教授 (30345152) ; 宇於崎 宏 東京大学, 医学部附属病院, 講師 (10296246)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 19,110千円 (直接経費: 14,700千円、間接経費: 4,410千円); 2012年度: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2011年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円); 2010年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円)
• キーワード: 小腸大腸肛門外科学 / 癌 / エピゲノム / エピジェネティクス / マイクロアレイ / 次世代シーケンサー / 情報工学

研究概要

胃癌は網羅的DNAメチル化解析により3群のエピジェノタイプに分類され、EBウィルス感染実験によりEBウィルス感染そのものが超高メチル化群の原因であることを証明した。大腸癌前癌病変を解析し、癌で認めたDNAメチル化エピジェノタイプは腺腫の段階ですでに完成しており、1%を占める鋸歯状腺腫がBRAF変異と強く相関する高メチル化群の前癌病変であり、99%を占める非鋸歯状腺腫がKRAS変異と強く相関する中メチル化群、および低メチル化群の2群の前癌病変であった。大腸異常陰窩は癌遺伝子変異はあったがメチル化異常の蓄積は非常に低レベルであった。

研究成果

• [雑誌論文] Intermediate methylation epigenotype and its correlation to KRAS mutation in conventional colorectal adenoma (2012)
  • 著者名/発表者名: Yagi K, Takahashi H, Akagi K, Matsusaka K, Seto Y, Aburatani H, Nakajima A,Kaneda A
  • 雑誌名: Am J Pathology 巻: 180(2) 号: 2 ページ: 616-25
  • DOI: 10.1016/j.ajpath.2011.10.010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epstein-Barr virusinfection as an epigenetic driver of tumorigenesis (2012)
  • 著者名/発表者名: Kaneda A, Matsusaka K, Aburatani H, Fukayama M
  • 雑誌名: Cancer Research 巻: Vol.72 号: 14 ページ: 3445-3450
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-11-3919
  • 査読あり
• [雑誌論文] がんエピゲノムマーカー (2012)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 雑誌名: 日本臨床 巻: 70 ページ: 749-753
• [雑誌論文] がんエビゲノムマーカー (2012)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 雑誌名: 日本臨床 巻: (In press)(掲載確定)
• [雑誌論文] Two groups of DNA methylation markers to classify colorectal cancer into three epigenotypes (2011)
  • 著者名/発表者名: Kaneda, A., and Yagi, K
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 102 ページ: 18-24
  • NAID: 10029288084
• [雑誌論文] Classification of Epstein-Barr virus positive gastric cancers by definition of DNA methylation epigenotypes (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsusaka K, Kaneda A, Nagae G, Ushiku T, Kikuchi Y, Hino R, Uozaki H, Seto Y,Takada K, Aburatani H, Fukayama M
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 71(23) 号: 23 ページ: 7187-97
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-11-1349
  • 査読あり
• [雑誌論文] HCCとエビゲノム (2011)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 雑誌名: 肝胆膵 巻: 62 ページ: 933-943
• [雑誌論文] がんのエビゲノム異常 (2011)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 雑誌名: 細胞 巻: 43 ページ: 504-507
• [雑誌論文] Two groups of DNA methylation markers to classify colorectal cancer into three epigenotypes. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kaneda A, Yagi K
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 102 ページ: 18-24
  • NAID: 10029288084
  • 査読あり
• [雑誌論文] HCCとエピゲノム (2011)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 雑誌名: 肝胆膵 巻: 62(In press掲載確定)
• [雑誌論文] Identification of genes preferentially methylated in hepatitis C virus-related hepatocellular carcinoma (2010)
  • 著者名/発表者名: Deng, Y.B., Nagae, G., Midorikawa, Y., Yagi, K., Tsutsumi, S., Yamamoto, S., Hasegawa, K., Kokudo, N., Aburatani, H., and Kaneda, A
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 101 ページ: 1501-1510
  • NAID: 10026593919
• [雑誌論文] Identification of genes preferentially methylated in hepatitis C virus-related hepatocellular carcinoma. (2010)
  • 著者名/発表者名: Deng YB, Kaneda A, et al.
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 101 ページ: 1501-1510
  • NAID: 10026593919
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNAメチローム解析技術の発展と最新テクノロジー (2010)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 28 ページ: 1765-1773
• [雑誌論文] 癌診断とエピゲノム (2010)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 235 ページ: 1038-1044
• [学会発表] Accumulation of epigenetic alteration involved in gastrointestinal carcinogenesis (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Kaneda
  • 学会等名: 2nd Joint Global COE Symposium of The IMSUT & RCAST Global COE, The University of Tokyo and Chiba University Global COE "Current and Future Trends in Genome-based Immunity, Infection and Cance
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2013-01-28
• [学会発表] Infection of Epstein-Barr virus is epigenetic driver of tumorigenesis (2012)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Kaneda
  • 学会等名: 2nd Japanese-French Cancer Workshop
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2012-11-30
• [学会発表] 胃癌におけるDNA超高メチル化群とEBウィルス感染 (2012)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志ら
  • 学会等名: 第23回日本消化器
  • 発表場所: 徳島
  • 年月日: 2012-11-16
• [学会発表] 大腸癌における3群のエピジェノタイプと予後 (2012)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 学会等名: 日本消化器関連学会週間(JDDW)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2012-10-11
• [学会発表] エピゲノム異常と大腸癌発生 (2012)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 学会等名: 岩手県大腸癌病理研究会
  • 発表場所: 盛岡
  • 年月日: 2012-06-15
• [学会発表] PRC2 overexpression and H3K27me3 modification in small cell lung cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Teruyuki Sato, Atsushi Kaneda, et al.
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2011-10-04
• [学会発表] Markedly high methylation epigenotype identified in EB virus(+) gastric cancer and its induction by EB virus infection (2011)
  • 著者名/発表者名: Keisuke Matsusaka, Atsushi Kaneda
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] Decoding the genome and transcriptome of human pancreatic cancer by integrated next-generation sequencing technologies (2011)
  • 著者名/発表者名: Linghua Wang, Atsushi Kaneda, et al.
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] Development of DNA methylation epigenotypes and their correlation to oncogene mutation in colorectal adenoma (2011)
  • 著者名/発表者名: Koichi Yagi, Atsushi Kaneda, et al.
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] Epigenomic profiling of oral cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Sayaka Yoshiba, Atsushi Kaneda, et al.
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] 大腸癌前癌病変におけるDNAメチル化エピジェノタイプ (2011)
  • 著者名/発表者名: 八木浩一、金田篤志, ら
  • 学会等名: 第5回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2011-05-19
• [学会発表] 甲状腺乳頭癌、濾胞癌におけるエピジェネティック変異に関する検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 菊池弥寿子、金田篤志, ら
  • 学会等名: 第5回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2011-05-19
• [学会発表] DNA Methylation Profiling of Papillary and Follicular Thyroid Cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Yasuko Kikuchi, Atsushi Kaneda, et al.
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] The role of inflammatory genes in cellular senescence (2010)
  • 著者名/発表者名: Katayama Y, Kaneda A, et al.
  • 学会等名: 第33回分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] 癌遺伝子変異と相関するエピジェノタイプと、癌遺伝子変異による早期細胞老化における重要因子のゲノム探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 金田篤志, ら
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大坂
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] ゲノムワイドなプロモーターメチル化解析による肝癌の分子生物学的層別化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 永江玄太、金田篤志, ら
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大坂
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] 口腔癌におけるエピゲノム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 葭葉清香、金田篤志, ら
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大坂
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] 甲状腺腫瘍におけるDNAメチル化のプロファイリングおよび遺伝子変化について (2010)
  • 著者名/発表者名: 菊池弥寿子、金田篤志, ら
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大坂
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] 肺小細胞癌株のヒストン修飾異常に関する検討 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤輝幸、金田篤志, ら
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大坂
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] 定量的メチル化解析による大腸癌・腺腫のエピジェノタイピング (2010)
  • 著者名/発表者名: 八木浩一、金田篤志ら
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-22
• [学会発表] 定量的メチル化解析による大腸癌・腺腫のエピジェノタイピング (2010)
  • 著者名/発表者名: 八木浩一、金田篤志, ら
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大坂
  • 年月日: 2010-09-22
• [学会発表] EBV関連胃癌におけるDNAメチル化の網羅的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松坂恵介、金田篤志, ら
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大坂
  • 年月日: 2010-09-22
• [学会発表] Three epigenotypes of colorectal cancer revealed by epigenotyping through quantitative DNA methylation analysis (2010)
  • 著者名/発表者名: Kaneda A
  • 学会等名: The 3rd World Cancer Congress 2010
  • 発表場所: Singapore, Republic of Singapore
  • 年月日: 2010-06-23
• [学会発表] Three epigenotypes of colorectal cancer revealed by epigenotyping through quantitative DNA methylation analysis (2010)
  • 著者名/発表者名: Kaneda A
  • 学会等名: The 3^<rd> World Cancer Congress 2010
  • 発表場所: Singapore, Republic of Singapore
  • 年月日: 2010-06-23
• [学会発表] DNAメチル化情報を用いた大腸癌の3つのエピジェノタイプの同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 八木浩一、金田篤志, ら
  • 学会等名: 第4回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 米子
  • 年月日: 2010-05-29
• [学会発表] 甲状腺乳頭癌におけるDNAメチル化解析
  • 著者名/発表者名: 菊池弥寿子、金田篤志ら
  • 学会等名: 第６回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] DNA methylation alteration of Epstein-Barr virus genome and host cellular genome in EBV infection into gastric cels
  • 著者名/発表者名: Keisuke Matsusaka, Atsushi Kaneda, et al.
  • 学会等名: 第７１回日本癌学会総会
  • 発表場所: 札幌
• [学会発表] DNA methylation Analysis of Papillary Thyroid Cancer
  • 著者名/発表者名: Yasuko Kikuchi, Atsushi Kaneda, et al.
  • 学会等名: 第７１回日本癌学会総会
  • 発表場所: 札幌
• [学会発表] Analysis of histone modification alteration in gastric cancer cells during Epstein-Barr virus infection
  • 著者名/発表者名: Sayaka Funata, Atsushi Kaneda, et al.
  • 学会等名: 第７１回日本癌学会総会
  • 発表場所: 札幌
• [学会発表] 大腸癌における３群のエピジェノタイプと予後.
  • 著者名/発表者名: 金田篤志
  • 学会等名: 日本消化器関連学会週間(JDDW).
  • 発表場所: 神戸
  • 招待講演
• [学会発表] 胃癌におけるDNA超高メチル化群とEBウィルス感染.
  • 著者名/発表者名: 金田篤志ら
  • 学会等名: 第23回日本消化器癌発生学会総会シンポジウム
  • 発表場所: 徳島
• [学会発表] Infection of Epstein-Barr virus is epigenetic driver of tumorigenesis.
  • 著者名/発表者名: Atsushi Kaneda
  • 学会等名: 2nd Japanese-French Cancer Workshop
  • 発表場所: 徳島
• [学会発表] Accumulation of epigenetic alteration involved in gastrointestinal carcinogenesis.
  • 著者名/発表者名: Atsushi Kaneda
  • 学会等名: 2nd Joint Global COE Symposium of The IMSUT & RCAST Global COE, The University of Tokyo and Chiba University Global COE “Current and Future Trends in Genome-based Immunity, Infection and Cancer”
  • 発表場所: 東京
  • 招待講演
• [図書] In "Epigenomics From Chromatin Biology to Therapeutics" (2012)
  • 著者名/発表者名: Kaneda A
• [図書] Cancer classification by genome-wide and quantitative DNA methylation analyses. In "Epigenomics From Chromatin Biology to Therapeutics"(Krishnarao Appasani Ed.) (2012)
  • 著者名/発表者名: Kaneda A
  • 出版者: Cambridge University Press
• [備考]
  • URL: http://www.genome.rcast.u-tokyo.ac.jp/
• [備考]
  • URL: http://www.genome.rcast.u-tokyo.ac.jp/
• [備考]
  • URL: http://www.genome.reast.u-tokyo.ac.jp/
• [産業財産権] 癌細胞の存否を判定する方法および癌患者の予後を判定する方法 (2010)
  • 発明者名: 金田篤志ら
  • 権利者名: 京大学など
  • 出願年月日: 2010-06-30
• [産業財産権] 特許 (2010)
  • 発明者名: 金田篤志, ら
  • 権利者名: 東京大学, など
  • 出願年月日: 2010-06-30
  • 外国
• [産業財産権] 特許 (2010)
  • 発明者名: 金田篤志, ら
  • 権利者名: 東京大学など
  • 出願年月日: 2010-06-30
  • 外国