網羅的ゲノム解析による前立腺癌バイオマーカーの探索

• 研究課題/領域番号: 22390306
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 泌尿器科学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 中川 英刀 独立行政法人理化学研究所, バイオマーカー探索開発チーム, チームリーダー (50361621)
• 連携研究者: 久保 充明 独立行政法人理化学研究所, ゲノム医科学研究センター, 副センター長 (30442958) ; 降幡 睦夫 高知大学, 医学部, 教授 (10209158) ; 高田 亮 岩手医科大学, 医学部, 助教 (00438467) ; 小川 修 京都大学, 医学部, 教授 (90260611)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円); 2012年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2011年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2010年度: 8,580千円 (直接経費: 6,600千円、間接経費: 1,980千円)
• キーワード: 前立腺癌 / ゲノム / GWAS / SNP / 前立腺がん / バイオマーカー / IRX4 / NKX3.1 / 8q24

研究概要

2010 年に発表したアジア人(日本人)で初の前立腺癌GWAS (genome-wide association study)のデータを基本に、さらなる日本人・日系人のサンプルを加えてGWAS を行い、新規の4つの前立腺癌関連SNP を同定した。IRX4 やGGCX などの新規の前立腺癌関連遺伝子の機能解析を行い、前立腺発癌の新たな機序を解明した。16 個のSNPを組み合わせて、日本人の前立腺癌のリスク診断モデルを開発し、その精度と再現性を確認した。

研究成果

• [雑誌論文] Prostate cancer genomics by high-throughput technologies: genome-wide association study and sequencing analysis (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa H
  • 雑誌名: Endocr Relat Cancer 巻: (in press)
• [雑誌論文] Reproducibility, performance, and clinical utility of a genetic risk prediction model for prostate cancer in Japanese (2012)
  • 著者名/発表者名: Akamatsu S, Takahashi A, Takata R, Kubo M, Inoue T, Morizono T, Tsunoda T, Kamatani N, Haiman CA, Wan P, Chen GK, Le Marchand L, Kolonel LN, Henderson BE, Fujioka T, Habuchi T, Nakamura Y, Ogawa O, Nakagawa H
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 7
• [雑誌論文] Evaluating genetic risk for prostate cancer among Japanese and Latinos (2012)
  • 著者名/発表者名: Cheng I, Chen GK, Nakagawa H, He J, Wan P, Laurie C, Shen J, Sheng X, Pooler LC, Crenshaw AT, Mirel DB, Takahashi A, Kubo K, Nakamura Y, Al Olama AA, Benlloch S, Donovan JL, Guy M, Hamdy FC, Kote-Jarai Z, Neal DE, Wilkens LR, Monroe KR, Stram DO, Muir K, Eeles RA, Easton DF, Kolonel LN, Henderson BE, Le Marchand L, Haiman CA
  • 雑誌名: Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 巻: 21 ページ: 2048-2058
• [雑誌論文] Common variants at 11q12, 10q26 and 3p11.2 are associated with prostate cancer susceptibility in Japanese (2012)
  • 著者名/発表者名: Akamatsu S, Takata R, Haiman CA, Takahashi A, Inoue T, Kubo M, Furihata M, Kamatani N, Inazawa J, Chen GK, Le Marchand L, Kolonel LN, Katoh T, Yamano Y, Yamakado M, Takahashi H, Yamada H, Egawa S, Fujioka T, Henderson BE, Habuchi T, Ogawa O, Nakamura Y, Nakagawa H
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 44 ページ: 426-429
• [雑誌論文] IRX4 at 5p15 suppresses prostate cancer growth through the interaction with vitamin D receptor, conferring prostate cancer susceptibility (2012)
  • 著者名/発表者名: Nguyen HH, Takata R, Akamatsu S, Shigemizu D, Tsunoda T, Furihata M, Takahashi A, Kubo M, Kamatani N, Ogawa O, Fujioka T, Nakamura Y, Nakagawa H
  • 雑誌名: Hum Mol Genet 巻: 21 ページ: 2076-2085
• [雑誌論文] Prostate cancer genomics, biology, and risk assessment through genome-wide association studies (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa H, Akamatsu S, Takata R, Takahashi A, Kubo M, and Nakamura Y
  • 雑誌名: Cancer Sci 巻: 103 ページ: 607-613
• [雑誌論文] がんバイオマーカー研究開発の課題と現状 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中川英刀
  • 雑誌名: 日本臨床 巻: 70(5) ページ: 743-748
• [雑誌論文] 1. Prostate cancer genomics, biology, and risk assessment through genome-wide association studies (2012)
  • 著者名/発表者名: 中川英刀, 他
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 103 号: 4 ページ: 607-613
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2011.02193.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] IRX4 at 5p15 suppresses prostate cancer growth through the interaction with vitamin D receptor, conferring prostate cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: Ha Nguyen H, 他
  • 雑誌名: Human Molecular Genetics 巻: 21 号: 9 ページ: 2076-2085
  • DOI: 10.1093/hmg/dds025
  • 査読あり
• [雑誌論文] Common variants at 11q12, 10q26 and 3p11.2 are associated with prostate cancer susceptibility in Japanese (2012)
  • 著者名/発表者名: 赤松秀輔, 他
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 44 号: 4 ページ: 426-429
  • DOI: 10.1038/ng.1104
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reproducibility, performance, and clinical utility of a genetic risk prediction model for prostate cancer in Japanese. (2012)
  • 著者名/発表者名: 赤松秀輔
  • 雑誌名: Plos One 巻: 7 号: 10 ページ: 46454-46454
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0046454
  • 査読あり
• [雑誌論文] 前立腺癌 ゲノム解析による新規バイオマーカー探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川英刀
  • 雑誌名: 日本臨床 増刊号 巻: 69(5) ページ: 145-149
• [雑誌論文] Association of a novel long non-coding RNA in 8q24 with prostate cancer susceptibility (2011)
  • 著者名/発表者名: Suyoun Chung
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 102 ページ: 245-252
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study identifies five new prostate cancer susceptibility loci in the Japanese population. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ryo Takata
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 42 ページ: 751-754
  • 査読あり
• [雑誌論文] A functional variant in NKX3.1 associated with prostate cancer susceptibility down-regulates NKX3.1 expression. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shusuke Akamatsu
  • 雑誌名: Human Molecular Genetics 巻: 19 ページ: 4265-4272
  • 査読あり
• [雑誌論文] 5αDH-DOC (5α-dihydro-deoxycorticosterone) activates androgen receptor in castration-resistant prostate cancer. (2010)
  • 著者名/発表者名: Motohide Uemura
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 101 ページ: 1897-1904
  • 査読あり
• [学会発表] Prostate Cancer Genomics by Genome-wide Association Study (2012)
  • 学会等名: Human Genome Variation and Complex Genome Analysis HGV2012
  • 発表場所: 上海
  • 年月日: 2012-09-07
• [学会発表] Prostate Cancer Genomics, Biology, and Risk Estimation through Genome-Wide Association Study (2012)
  • 学会等名: 日英個別化医療ワークショップ
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-02-14
• [学会発表] Prostate Cancer Genomics, Biology, and Risk Estimation through Genome-wide Association Study (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa H
  • 学会等名: 13th International Meeting on Human Genome Variation and Complex Genome Analysis
  • 発表場所: Shanghai, China
  • 招待講演
• [学会発表] Prostate cancer genomics by genome-wide association study (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川英刀
  • 学会等名: 第42回高松宮妃癌研究シンポジウム
  • 発表場所: グランドパレスホテル(東京)(招待講演)
  • 年月日: 2011-11-08
• [学会発表] A follow-up study of a GWAS identifies four novel prostate cancer susceptibility loci in the Japanese (2011)
  • 著者名/発表者名: 赤松秀輔
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場(名古屋)
  • 年月日: 2011-10-04
• [学会発表] Risk estimation model with multiple common genetic variants for Japanese prostate cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: 高田亮
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場(名古屋)
  • 年月日: 2011-10-04
• [学会発表] Identifying of IRX4 at chromosome 5p15 as a novel tumor suppressor in prostate cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Ha Hai Nguyen
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場(名古屋)
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] Functional Analysis of the Prostate Cancer Loci Identified by GWAS -NKX3.1 and 8q24- (2011)
  • 学会等名: The Cancer Post Genome-Wide Association Initiative NCI
  • 発表場所: Bethesda, USA
  • 年月日: 2011-01-13
• [学会発表] Functional Analysis of the Prostate Cancer Loci Identified by GWAS-NKX3.1 and 8q24- (2011)
  • 著者名/発表者名: 中川英刀
  • 学会等名: The Cancer Post GWAS Initiative Meeting (NIH)
  • 発表場所: 米国・Bethesda
  • 年月日: 2011-01-13
• [学会発表] Prostate Cancer Genomics by Genome-wide Association Study (2011)
  • 学会等名: 高松宮妃国際シンポジウム
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] A follow-up study of a GWAS identifies four novel prostate cancer susceptibility loci in the Japanese (2011)
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] Risk estimation model with multiple common genetic variants for Japanese prostate cancer (2011)
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] Identifying IRX4 at chromosome 5p15 as a novel tumor suppressor in prostate cancer (2011)
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] Genome-wide association study identifies multiple susceptibility loci for prostate cancer in a Japanese population (2010)
  • 学会等名: 10^(th) Annual Meeting of East Asian Union of Human Genetics Societies
  • 発表場所: 済南
  • 年月日: 2010-10-09
• [学会発表] Functional variants in NKX3.1 Conferring Prostate Cancer Susceptibility by Down-regulating NKX3.1 Expression (2010)
  • 著者名/発表者名: 赤松秀輔
  • 学会等名: 日本癌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] Genome-wide association study identifies multiple new susceptibility loci for prostate cancer in the Japanese population (2010)
  • 著者名/発表者名: 高田亮
  • 学会等名: 日本癌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] 前立腺癌のゲノミックス:ゲノム解析からの前立腺癌の理解 (2010)
  • 学会等名: 第98回日本泌尿器科学会総会
  • 発表場所: 盛岡
  • 年月日: 2010-04-29
• [学会発表] 前立腺癌のgenomics:ゲノム解析からの前立腺癌の理解 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中川英刀
  • 学会等名: 日本泌尿器科学会総会
  • 発表場所: 盛岡
  • 年月日: 2010-04-29
• [学会発表] Functional variants in NKX3.1 Conferring Prostate Cancer Susceptibility by Down-regulating NKX3.1 Expression (2010)
  • 学会等名: 第69回日本癌学会総会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] Genome-wide association study identifies multiple new susceptibility loci for prostate cancer in the Japanese population (2010)
  • 学会等名: 第69回日本癌学会総会
  • 発表場所: 大阪
• [備考] 2012年10月5日 遺伝子多型を組み合わせた日本人のための前立腺がんリスク診断法を開発
• [備考] 2012年2月24日 前立腺がんの発症に関わる4つの遺伝子多型を新たに発見
• [備考]
  • URL: http://www.riken.go.jp/r-world/info/release/press/2010/100802/index.html
• [産業財産権] 一塩基多型に基づく前立腺癌の検査方法 (2011)
  • 発明者名: 中川英刀、久保充明、高橋篤、赤松秀輔、高田亮、小川修、中村祐輔
  • 産業財産権番号: 2011-019051
  • 出願年月日: 2011-01-31
• [産業財産権] 一塩基多型に基づく前立腺癌の検査方法 (2011)
  • 発明者名: 中川英刀, 他
  • 権利者名: 理化学研究所, 他
  • 産業財産権番号: 2011-001905
  • 出願年月日: 2011-01-31