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アジアを席巻する新変異型、新興型ロタウイルス感染症の流行動態と蔓延の分子機序

研究課題

研究課題/領域番号 22406017
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分海外学術
研究分野 衛生学
研究機関札幌医科大学

研究代表者

小林 宣道  札幌医科大学, 医学部, 教授 (80186759)

研究分担者 石埜 正穂  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (30232325)
鷲見 紋子  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (10363699)
漆原 範子  札幌医科大学, 医学部, 講師 (80396308)
ゴッシュ ソウビック  札幌医科大学, 医学部, 助教 (30597175)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
19,500千円 (直接経費: 15,000千円、間接経費: 4,500千円)
2012年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2011年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円)
2010年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円)
キーワードロタウイルス / 遺伝子型 / 新変異型 / 新興型 / 分子疫学 / アジア / 系統樹 / 遺伝子再集合(リアソートメント) / 遺伝子再集合体 / 全遺伝子分節 / 遺伝子配列 / 系統解析 / 変異型 / リアソートメント / 系統 / ゲノム / 全ゲノム
研究概要

主としてアジアの国々に分布が拡大している新変異型、新興型ロタウイルスの遺伝学的特徴を明らかにするため、ロタウイルスの全遺伝子配列とその系統解析を行った。中国ではG1P[8]とG3P[8]、バングラデシュではG2P[4]が主要な遺伝子型であったが、それらの中には動物ロタウイルスに由来すると推測される遺伝子分節を有する遺伝子再集合体が検出された。またVP4遺伝子型P[8]の新変異型P[8]bは中国、バングラデシュ、ミャンマーで検出され、世界的な新興型G9を伴うものが多かった。アジアおよび他の地域からの様々な新興型ロタウイルス(遺伝子型G1P[6], G2P[6], G3P[2]、G3P[6], G3P[9], G4P[10], G6P[9], G8P[1], G9P[19])の全遺伝子を解析したところ、それらは1)ヒトロタウイルスの異なる遺伝子群間の遺伝子再集合体、2)ヒトと動物ロタウイルス間の遺伝子再集合体、3)動物ロタウイルスが直接ヒトに伝播したと考えられるもの、に大別された。以上より、新変異型、新興型ロタウイルスのおもな出現機序は、遺伝子再集合と種間伝播であると考えられた。

報告書

(4件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (51件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (34件) (うち査読あり 34件) 学会発表 (17件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Effect of temperature, relative humidity, and rainfall on rotavirus infections in Kolkata,India.2013

    • 著者名/発表者名
      Sumi A, Rajendran K, Ramamurthy T, Krishnan T, Nair GB, Harigane K, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Epidemiol Infect

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complex evolutionary patterns of two rare human G3P[9] rotavirus strains possessing a feline/canine-like H6 genotype on an AU-1-like genotype constellation.2013

    • 著者名/発表者名
      Wang Y-H, Pang B-B, Zhou X, Ghosh S, Tang W-F, Peng J-S, Hu Q, Zhou D-J, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] hole genomic analyses of asymptomatic human G1P[6], G2P[6] and G3P[6] rotavirus strains reveal intergenogroup reassortment events and genome segments of artiodactyl origin.2013

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Urushibara N, Chawla-Sarkar M, Krishnan T, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The origin of two rare human P[10] rotavirus strains.2013

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Urushibara N, Kawaguchiya M, Shintani T, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 13 ページ: 292-300

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analyses of asymptomatic human G1P[6], G2P[6] and G3P[6] rotavirus strains reveal intergenogroup reassortment events and genome segments of artiodactyl origin.2013

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Urushibara N, Chawla-Sarkar M, Krishnan T, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 16C ページ: 165-173

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2012.12.019

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complex evolutionary patterns of two rare human G3P[9] rotavirus strains possessing a feline/canine-like H6 genotype on an AU-1-like genotype constellation.2013

    • 著者名/発表者名
      Wang YH, Pang BB, Zhou X, Ghosh S, Tang WF, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 16C ページ: 103-112

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2013.01.016

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis of human G1P[8] rotavirus strains from different age groups in China.2012

    • 著者名/発表者名
      Shintani T, Ghosh S, Wang Y-H, Zhou X, Zhou D-J, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 4 ページ: 1289-1304

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis of a human G1P[9] rotavirus strain reveals intergenogroup reassortment events.2012

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Shintani T, Urushibara N, Taniguchi K, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Gen Virol

      巻: 93 ページ: 1700-1705

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis reveals the porcine origin of human G9P[19] rotavirus strains Mc323 and Mc345.2012

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Urushibara N, Taniguchi K, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 12 号: 2 ページ: 471-477

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2011.12.012

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evidence for the porcine origin of equine rotavirus strain H-1.2012

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Shintani T, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Vet Microbiol

      巻: 158 号: 3-4 ページ: 410-414

    • DOI

      10.1016/j.vetmic.2012.02.037

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole-genomic analysis of a human G1P[9] rotavirus strain reveals intergenogroup-reassortment events.2012

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Shintani T, Urushibara N, Taniguchi K, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Gen Virol

      巻: 93 号: 8 ページ: 1700-1705

    • DOI

      10.1099/vir.0.043026-0

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prevalence of human rotavirus genotypes in Wuhan, China during 2008-2011 : changing trend of predominant genotype and emergence of strains with P[8]b subtype of VP4 gene.2011

    • 著者名/発表者名
      Wang Y-H, Zhou X, Ghosh S, Zhou D-J, Pang B-B, Peng J-S, Hu Q, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Arch Virol

      巻: 156 ページ: 2221-2231

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis of rotavirus strains: current status and future prospects.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Future Microbiol

      巻: 6 ページ: 1049-1065

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis reveals the complex evolutionary dynamics of Kenyan G2P[4] human rotavirus strains.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Adachi N, Gatheru Z, Nyangao J, Yamamoto D, Ishino M, Urushibara N, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Gen Virol

      巻: 92 ページ: 2201-2208

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ghosh S, Paul SK, Yamamoto D, Nagashima S, Kobayashi N.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Paul SK, Yamamoto D, Nagashima S, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 11 ページ: 1481-1486

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detection and full genomic analysis of G6P[9] human rotavirus in Japan.2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D, Kawaguchiya M, Ghosh S, Ichikawa M, Numazaki K, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Virus Genes

      巻: 43 ページ: 215-223

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full genomic analyses of two human G2P[4] rotavirus strains isolated in 2005 : Identification of caprine-like VP3 gene.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Paul SK, Hossain MA, Alam MM, Ahmed MU, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Gen Virol.

      巻: 92 ページ: 1222-1227

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Emergence of G9 as a predominant genotype of human rotaviruses in Cuba.2011

    • 著者名/発表者名
      Ribas M, Nagashima S, Calzado A, Acosta G, Tejero Y, Cordero Y, PiedraD, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Med Virol

      巻: 83 ページ: 738-744

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Yamamoto D, Ghosh S, Kuzuya M, Wang Y-H, Zhou X, Chawla-Sarkar M, Paul SK, Ishino M, Kobayashi N.2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D, Ghosh S, Kuzuya M, Wang Y-H, Zhou X, Chawla-Sarkar M, Paul SK, Ishino M, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Gen Virol

      巻: 92 ページ: 361-369

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full Genomic analysis of a simian SA11-like G3P[2] Rotavirus strain isolated from an asymptomatic infant : identification of novel VP1, VP6, and NSP4 genotype.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Gatheru Z, Nyangao J, Adachi N, Urushibara N, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 11 ページ: 57-63

    • NAID

      120004247118

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full genomic analysis of a G8P[1] Rotavirus strain isolated from an asymptomatic infant in Kenya provides evidence for an artiodactyl-to-human interspecies transmission event.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Gatheru Z, Nyangao J, Adachi N, Urushibara N, Kobayashi N
    • 雑誌名

      J Med Virol

      巻: 83 ページ: 367-376

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detection and full genomic analysis of G6P[9] human rotavirus in Japan2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D., et al
    • 雑誌名

      Virus Genes

      巻: 43 ページ: 215-223

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full Genomic analysis of human rotavirus strains possessing the rare P[8]b VP4 subtype2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, et al
    • 雑誌名

      Infection Genetics and Evolution

      巻: 11 ページ: 1481-1486

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis reveals the complex evolutionary dynamics of Kenyan G2P[4] human rotavirus strains2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, et al
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 92 ページ: 2201-2208

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis of rotavirus strains : current status and future prospects2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Future Microbiology

      巻: 6 ページ: 1049-1065

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prevalence of human rotavirus genotypes in Wuhan, China during 2008-2011 : changing trend of predominant genotypes and emergence of strains with P[8]b subtype of VP4 gene2011

    • 著者名/発表者名
      Wang YH, et al
    • 雑誌名

      Archives of Virology

      巻: 156 ページ: 2221-2231

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis reveals the porcine origin of human G9P[19] rotavirus strains Mc323 and Mc3452011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S., et al
    • 雑誌名

      Infection Genetics and Evolution

      巻: 12 ページ: 471-477

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full genomic analysis of a G8P[1] Rotavirus strain isolated from an asymptomatic infant in Kenya provides evidence for an artiodactyl-to-human interspecies transmission event.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Medical Vrology

      巻: 83 ページ: 367-376

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full Genomic analysis of a simian SA11-like G3P[2] Rotavirus strain isolated from an asymptomatic infant : identification of novel VP1, VP6, and NSP4 genotype.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, et al.
    • 雑誌名

      Infection Genetics and Evolution

      巻: 11 ページ: 57-63

    • NAID

      120004247118

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full genomic analyses of two human G2P[4] rotavirus strains isolated in 2005 : Identification of caprine-like VP3 gene.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S., et al.
    • 雑誌名

      Journal af General Virology

      巻: (印刷中)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic analysis of human rotavirus in Myanmar : detection of Indian-Bangladeshi G1/G2 lineages, Chinese G3 lineage and OP354-like P[8] lineage (P[8]b subtype).2010

    • 著者名/発表者名
      Aung MS, Aung TS, Oo KY, Win N, Ghosh S, Yamamoto D, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Southeast Asian J Trop Med Public Health

      巻: 41 ページ: 1393-1404

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis on genetic diversity and molecular evolution of human group B rotaviruses based on whole genome segments.2010

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D., et al.
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 91 ページ: 1772-1781

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic characterization of human group C rotaviruses : identification of two lineages in VP3 gene.2010

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D., et al.
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 92 ページ: 361-369

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Emergence of G9 as a predominant genotype of human rotaviruses in Cuba.2010

    • 著者名/発表者名
      Ribas M., et al.
    • 雑誌名

      Journal of Medical Virology

      巻: 83 ページ: 738-744

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Interspecies transmission of rotaviruses evidenced by whole genomic sequence analysis2013

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Ghosh S.
    • 学会等名
      The 17th FAVA (Federation of Asian Veterinary Association) congress
    • 発表場所
      Taipei
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Interspecies transmission of rotaviruses evidenced by whole genomic sequence analysis.2013

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Ghosh S
    • 学会等名
      The 17th FAVA (Federation of Asian Veterinary Association) congress
    • 発表場所
      台北
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Molecular epidemiological analysis of G3P[9] rotaviruses from diarrheal patients in China2012

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Wang YH, Zhou X, Pang BB, Liu MQ, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ, Ghosh S.
    • 学会等名
      he 13thAsia-Pacific congress of Clinical Microbiology and Infection
    • 発表場所
      Beijing
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Whole genomic analysis of a rare human G1P[9] rotavirus strain.2012

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Shintani T, Taniguchi K, Kobayashi N
    • 学会等名
      9th Japan-China Conference of Virology
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Moleculae epidemiological analysis of G3P[9] rotaviruses from diarrheal patients in China.2012

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Wang YH, Zhou X, Pang BB, Liu MQ, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ, Ghosh S
    • 学会等名
      The 13th Asia-Pacific congress of Clinical Microbiology and Infection,
    • 発表場所
      北京
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Whole genomic analysis of a rare human G4P[10] rotavirus strain.2012

    • 著者名/発表者名
      ゴッシュ ソウビック、漆原範子、川口谷充代、新谷つづみ、小林宣道
    • 学会等名
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
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      2012 実績報告書
  • [学会発表] 全遺伝子配列に基づく中国のG1P[8]ロタウイルス株の系統遺伝学的解析.2012

    • 著者名/発表者名
      新谷つづみ、ゴッシュ ソウビック、ワン ユアンホン、小林宣道
    • 学会等名
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Whole genomic analysis of G3P[9] rotaviruses fromdiarrheal patients in China.2012

    • 著者名/発表者名
      小林宣道、ゴッシュ ソウビック、新谷つづみ、ワン ユアンホン
    • 学会等名
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Full genomic analysis of human G2P[4] rotavirus strains from Africa2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Adachi N Gatheru Z, Nyangao J, Ishino M, Urushibara N, Kobayashi N
    • 学会等名
      15^<th> International Congress of Virology
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-09-13
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Full-genomic analysis of human rotavirus strains which have VP4 genes belonging to a rare P[8] subtype (P[8]B)2011

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Ghosh S, Paul SK, Nagashima S
    • 学会等名
      15^<th> International Congress of Virology
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-09-13
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Full genomic analysis of rare G6P[9] human rotavirus detected in Japan2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D, Kawaguchiya M, Ghosh S, Ichikawa M, Numazaki K, Kobayashi N
    • 学会等名
      15^<th> International Congress of Virology
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-09-13
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Full genomic analysis of rare G6P[9] human rotavirus detected in Japan2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D, Kawaguchiya M, Ghosh S, Ichikawa M, Numazaki K, Kobayashi N.
    • 学会等名
      15thInternational Congress of Virology
    • 発表場所
      Sapporo
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Full-genomic analysis of human rotavirus strains which have VP4 genes belonging to a rare P[8] subtype (P[8]B)2011

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Ghosh S, Paul SK, Nagashima S.
    • 学会等名
      15thInternational Congress of Virology
    • 発表場所
      Sapporo
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Full genomic analysis of human G2P[4] rotavirus strains from Africa2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Adachi N, Gatheru Z, Nyangao J, Ishino M, Urushibara N, Kobayashi N.
    • 学会等名
      15thInternational Congress of Virology
    • 発表場所
      Sapporo.
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Full genomic analysis of an artiodactyl-like group A rotavirus G8P[1] strain detected from an asymptomatic infant in Kenya.2010

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Kobayashi N.
    • 学会等名
      12th Western Pacific Congress on Chemotherapy and Infectious Diseases
    • 発表場所
      シンガポール
    • 年月日
      2010-12-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Genetic diversity and molecular evolution of human group B rotaviruses based on full-length sequences of whole genome segments.2010

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, et al.
    • 学会等名
      The 8th Japan-China International Conference of Virology.
    • 発表場所
      ハルピン
    • 年月日
      2010-07-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Full genomic analysis of an artiodactyl-like group A rotavirus G8P[1] strain detected from an asymptomatic infant in Kenya2010

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Kobayashi N.
    • 学会等名
      12th Western Pacific Congress on Chemotherapy and Infectious Diseases
    • 発表場所
      Singapore
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

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公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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