糖鎖情報を用いた糖鎖-タンパク質相互作用予測法の開発と実験的検証

• 研究課題/領域番号: 22500276
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体生命情報学
• 研究機関: 立命館大学
• 研究代表者: 伊藤 將弘 立命館大学, 生命科学部, 教授 (50388112)
• 研究分担者: 糸乗 前 滋賀大学, 教育学部, 教授 (90324558)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2012年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2011年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2010年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 糖鎖 / 相互作用 / MD 計算 / 構造 / SVM / サポートベクターマシン / バイオインフォマティクス / 糖転移酵素 / 糖脂質 / 進化系統解 / アノマー配置 / 類似距離 / タンパク質 / 分子進化 / ラマチャンドラマップ / 構造解析

研究概要

糖鎖残基間の相互作用の解析を、7種類の糖鎖系列に対し分子動力学法を用いて分子シミュレーションを行い,3つの糖鎖コンホメーションを変化させる要因を示唆した。またサポートベクターマシンを用いて,2つの脂質メディエータ(プロスタグランジン、スフィンゴ1リン酸)の受容体に対して阻害活性化合物の予測を行った。さらに予測された化学構造から活性に関する部分構造を詳細に解析した。

研究成果

• [雑誌論文] Biochemical studies on sphingolipids of Artemia franciscana:complex neutral glycosphingolipids (2013)
  • 著者名/発表者名: H.Kojima, Y.Tohsato, K.Kobayama, S.Itonori, M.Ito
  • 雑誌名: Glycoconjugate Journal 巻: 30 号: 3 ページ: 257-268
  • DOI: 10.1007/s10719-012-9436-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Parameter optimization and sensitivity analysis forlarge kinetic models using a real-coded genetic algorithm (2013)
  • 著者名/発表者名: Y.Tohsato, K.Ikuta, A.Shionoya, Y.Mazaki, M .I t o
  • 雑誌名: Genes 巻: 518 号: 1 ページ: 84-90
  • DOI: 10.1016/j.gene.2012.11.080
  • 査読あり
• [雑誌論文] ECOH: An Enzyme Commission number predictor using mutual information and a support vector machine (2013)
  • 著者名/発表者名: Y.Matsuta, M. I to , Y. Tohsato
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 29 号: 3 ページ: 365-372
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts700
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intrinsically disordered proteins in Human mitochondria (2012)
  • 著者名/発表者名: M.Ito, Y.Tohsato, H.Sugisawa, S.Kohara, S.Fukuchi, I.Nishikawa, K. Nishikawa
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 17 号: 10 ページ: 817-825
  • DOI: 10.1111/gtc.12000
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative proteomic analysis reveals differentially expressed proteins in Caenorhabditis eleganspgl-1 mutants grown at 20°C and 25°C (2012)
  • 著者名/発表者名: Y.Tohsato, K.Monobe, K. Suzuki, T.Hayano, I.Kawasaki, M .I t o
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 75 号: 15 ページ: 4792-4801
  • DOI: 10.1016/j.jprot.2012.04.038
  • 査読あり
• [雑誌論文] 機械学習によるEP2受容体を標的とした化合物の探索手法の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小原祥平, 遠里由佳子, 伊藤將弘
  • 雑誌名: 情報処理学会バイオ情報学(BIO) 巻: 26(8) ページ: 1-2
  • NAID: 110008605712
• [雑誌論文] 相互情報量とSVMを用いた酵素反応におけるEC番号の推定手法の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田祥彦, 伊藤將弘, 遠里由佳子
  • 雑誌名: 情報処理学会バイオ情報学(BIO) 巻: 26(7) ページ: 1-6
  • NAID: 110008605711
• [雑誌論文] 線虫C.elegansの発生ステージにおける定量プロテオーム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 物部香奈美, 遠里由佳子, 早野俊哉, 伊藤將弘
  • 雑誌名: 立命館大学理工学研究所紀要 巻: 70 ページ: 13-20
• [雑誌論文] 相互情報量とSVMを用いた酵素反応におけるEC番号の推定手法の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田祥彦, 伊藤將弘, 遠里由佳子
  • 雑誌名: 立命館大学理工学研究所紀要 巻: 70 ページ: 21-28
  • NAID: 110008605711
• [雑誌論文] Biochemical Studies on Sphingolipids of Artemia franciscana: Novel Neutral Glycosphingolipids (2011)
  • 著者名/発表者名: H.Kojima, T.Shimizu, M.Sugita, S . I to n or i , N.Fujita, M .I t o
  • 雑誌名: Journal of Lipid Research 巻: 52 号: 2 ページ: 308-317
  • DOI: 10.1194/jlr.m010173
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biochemical studies on sphingolipids of Artemia franciscana : novel neutral glycosphingolipids (2011)
  • 著者名/発表者名: Kojima, H., Shimizu, T., Sugita, M., Itonori, S., Fujita, N., Ito, M.
  • 雑誌名: J.Lipid Res. 巻: 52 ページ: 308-317
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dengue virus type 2 recognizes the carbohydrate moiety of neutral glycosphingolipids in mammalian and mosquito cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Wichit, S., Jittmittraphap, A., Hidari, K.I.P.J., Thaisomboonsuk, B., Petmitr, S., Ubol, S., Aoki, C., Itonori, S., Morita, K., Suzuki, T., Suzuki, Y., Jampangern, W.
  • 雑誌名: Microbiol Immunol 巻: 55 ページ: 135-140
  • NAID: 10031121452
  • 査読あり
• [雑誌論文] アメリカオオアカイカDosidicus gigasのスフィンゴ脂質の構造決定 (2011)
  • 著者名/発表者名: 糸乗前, 野崎仁崇, 原畠鷹, 秋田悠里, 橋本恭平, 小島寿夫, 西尾匡, 石川哲, 齋藤洋昭, 伊藤將弘, 杉田陸海
  • 雑誌名: 滋賀大学教育学部紀要,自然科学 巻: 60 ページ: 11-22
  • NAID: 120003004422
• [雑誌論文] セイヨウミツバチApis mellifera(雄蜂20日齢)におけるスフィンゴ糖脂質の構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 西尾匡, 小島寿夫, 遠里由佳子, 寺内白梅薫, 杉田陸海, 糸乗前, 伊藤將弘
  • 雑誌名: 立命館大学理工学研究所紀要 巻: 69 ページ: 99-108
• [雑誌論文] Computational Prediction of O-linked Glycosylation Sites that are Preferentially Mapped on Intrinsically Disordered Regions of Extracellular Proteins (2010)
  • 著者名/発表者名: I.Nishikawa, Y.Nakajima,M.Ito, S.Fukuchi, K.Homma,K.Nishikawa
  • 雑誌名: International Journal of Molecular Sciences 巻: 11 号: 12 ページ: 4991-5008
  • DOI: 10.3390/ijms11124991
  • 査読あり
• [雑誌論文] Environmental dependency of gene knockouts on phenotype microarray analysis in Escherichia coli (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Tohsato, T.Baba, Y. Mazaki,M.Ito, B.L.Wanner, H.Mori
  • 雑誌名: Journal Bioinformatics and Computational Biology 巻: 8 ページ: 1-17
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biochemical Studies on Sphingolipiof Artemia franciscana (I) Isolatioand Characterization of Sphingomyeli (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Kojima, T.Inoue, M.SugitaS.Itonori, M.Ito
  • 雑誌名: Lipids 巻: 45 号: 7 ページ: 635-643
  • DOI: 10.1007/s11745-010-3438-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biochemical studies on sphingolipid of Artemia franciscana (I) isolation and characterization of sphingomyelin (2010)
  • 著者名/発表者名: Kojima, H., Inoue, T., Sugita, M., Itonori, S., Ito, M.
  • 雑誌名: Lipids 巻: 45 ページ: 635-643
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel neogala-series glycosphingolipids with terminal mannose and glucose residues from Hirsutella rhossiliensis, an aureobasidin A-resistant ascomycete fungus (2010)
  • 著者名/発表者名: Tani, Y., Funatsu, T., Ashida, H., Ito, M., Itonori, S., Sugita, M., Yamamoto, K
  • 雑誌名: Glycobiology 巻: 20 ページ: 433-441
  • 査読あり
• [雑誌論文] Computational Prediction of O-linked Glycosylation Sites that are Preferentially Mapped on Intrinsically Disordered Regions of Extracellular Proteins (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikuko Nishikawa, Yukiko Nakajima, Masahiro Ito, Satoshi Fukuchi, Keiichi Homma, Ken Nishikawa
  • 雑誌名: Int.J.Mol.Sci. 巻: 11 ページ: 4991-5008
  • 査読あり
• [雑誌論文] Environmental dependency of gene knockouts on phenotype microarray analysis in Escherichia coli. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yukako Tohsato, Tomoya Baba, Yusaku Mazaki, Masahiro Ito, Barry L.Wanner, Hirotada Mori
  • 雑誌名: Journal of Bioinformatics and Computational Biology 巻: 8 ページ: 1-17
  • 査読あり
• [雑誌論文] Invariant Vα14 natural killer T cell activation by edible mushroom acidic glycosphingolipids (2010)
  • 著者名/発表者名: Nozaki, H., Itonori, S., Sugita, M., Nakamura, K., Ohba, K., Ohnishi, M., Imai, K., Igarashi, Y., Suzuki, A., Kushi, Y.
  • 雑誌名: Biol Pharm Bull. 巻: 33 ページ: 580-584
  • NAID: 120006390475
  • 査読あり
• [学会発表] Parameter optimization and sensitivity analysis for large kinetic models using a real-coded genetic algorithm (2012)
  • 著者名/発表者名: Y.Tohsato, K.Ikuta, A.Shionoya, Y.Mazaki, M .I t o
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: 発表場所:台南(台湾)
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Phenotype microarrayanalysis of Escherichia coli using infinite relational model (2012)
  • 著者名/発表者名: H.Sugisawa, H.Fukuda,H.Mori, M.Ito, T.Taniguchi, Y.Tohsato
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: 発表場所:台南(台湾)
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Modeling of central metabolism with regulation of rpoS gene in Escherichia coli (2012)
  • 著者名/発表者名: A.Shionoya, K.Ikuta, H.Dose,H.Mori, M.Ito, Y.Tohsato
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: 台南(台湾)
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Parameter optimization and correlation analysis for a large kinetic model using a real-coded genetic algorithm (2012)
  • 著者名/発表者名: K.Ikuta, A.Shionoya, M .I t o, Y.Tohsato
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: 台南(台湾)
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Analysis of the phylogenetic profile of human glycosyltransferases (2012)
  • 著者名/発表者名: T.Tomono, Y.Tohsato, M.Ito
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: 台南(台湾)
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Expression and phenotype analyses of the sphingomyelin synthase genes in Caenorhabditis elegans (2012)
  • 著者名/発表者名: H.Yamaji, Y.Tohsato,K.Suzuki, M.Ito
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡,福岡県
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Proteomic analysis of hydrophobic proteins in nematode Caenorhabditis briggsae (2012)
  • 著者名/発表者名: T.Itami, N.Enna, Y.Tohsato,T.Hayano, M.Ito
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡,福岡県
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Comparative proteomic analysis for Caenorhabditis elegans pgl-1 mutants grown at 20°C and 25°C using 2D-DIGE (2012)
  • 著者名/発表者名: Y.Tohsato, K.Monobe,K.Suzuki, T.Hayano, I.Kawasaki, M.Ito
  • 学会等名: 5th East Asia C. elegans Meeting
  • 発表場所: 台北(台湾)
  • 年月日: 2012-06-28
• [学会発表] Quantitative analysis of mRNA expression profiles of ceramide-related genes using qRT-PCR (2012)
  • 著者名/発表者名: H.Yamaji, K.Hori, E.Watase,Y.Tohsato, K.Suzuki, M.Ito
  • 学会等名: 5th East Asia C. elegansMeeting
  • 発表場所: 台北(台湾)
  • 年月日: 2012-06-28
• [学会発表] Modeling and Parameter Optimization of the Central Carbon Metabolism of Escherichia coli using Real-coded Genetic Algorithm (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Mazaki, M .It o , H.Mori, Y.Tohsato
  • 学会等名: The 21th International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: 杭州,中国
  • 年月日: 2011-12-17
• [学会発表] Prediction of EC Numbers from Chemical Structures in Enzymatic Reactions using Mutual Information (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Matsuda, M. I to , Y.Tohsato
  • 学会等名: The 21th International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: 杭州,中国
  • 年月日: 2011-12-17
• [学会発表] Intrinsically Disordered Regions in HumanMitochondrial Proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Ito, Y.Tohsato,H.Sugisawa, S.Kohara, I.Nishikawa,K.Nishikawa
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜,神奈川県
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] Phenotype Analysis for Single Knockout Mutants in Escherichia coli Using Phenotype MicroArray (2011)
  • 著者名/発表者名: H.Sugisawa, M .I t o, Y.Tohsato
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜,神奈川県
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] Phenotype Analysis for Single Knockout Mutants in Escherichia coli Using Phenotype MicroArray (2011)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Sugisawa, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] Quantitative Proteomic Analysis of3 Developmental Stages in Caenorhabditis elegans (2011)
  • 著者名/発表者名: K.Monobe, Y.Ishido, Y.Tohsato, T.Hayano, M.Ito
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜,神奈川県
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Quantitative Proteomic Analysis of Caenorhabditis elegans pgl-1Mutants Grown at 20 °C and 25 °C (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Tohsato, K.Monobe, T.Hayano, I.Kawasaki, M .I t o
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜,神奈川県
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Quantitative Proteomic Analysis of Caenorhabditis elegans pgl-1 Mutants Grown at 20℃ and 25℃ (2011)
  • 著者名/発表者名: Yukako Tohsato, Kanami Monobe, Toshiya Hayano, Ichiro Kawasaki, Masahiro Ito
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Quantitative Proteomic Analysis of 3 Developmental Stages in Caenorh abditis elegans (2011)
  • 著者名/発表者名: Kanami Monobe, Yusuke Ishido, Yukako Tohsato, Toshiya Hayano, Masahiro Ito
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Intrinsically Disordered Regions in Human Mitochondrial Proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Masahiro Ito, Yukako Tohsato, Hitoshi Sugisawa, Shohei Kohara, Ikuko Nishikawa, Ken Nishikawa
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] 相互情報量とSVMを用いた酵素反応におけるEC番号の推定手法の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松田祥彦,伊藤將弘,遠里由佳子
  • 学会等名: 情報処理学会第26回BIO情報研究会
  • 発表場所: 神戸大学,兵庫県
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] 機械学習によるEP2受容体を標的とした化合物の探索手法の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小原祥平,遠里由佳子,伊藤將弘
  • 学会等名: 情報処理学会第26回BIO情報研究会
  • 発表場所: 神戸大学,兵庫県
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] 機械学習によるEP2受容体を標的とした化合物の探索手法の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小原祥平, 遠里由佳子, 伊藤將弘
  • 学会等名: 情報処理学会第26回バイオ情報学研究会
  • 発表場所: 神戸大学(兵庫県)
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] 相互情報量とSVMを用いた酵素反応におけるEC番号の推定手法の開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松田祥彦, 伊藤將弘, 遠里由佳子
  • 学会等名: 情報処理学会第26回バイオ情報学研究会
  • 発表場所: 神戸大学(兵庫県)
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] ブラインシュリンプArtemiafranciscanaの中性糖脂質 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小島寿夫,樺山一哉,糸乗前,伊藤將弘
  • 学会等名: 第30回日本糖質学会年会
  • 発表場所: 長岡リリックホール,新潟県
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] 糖鎖多様性を示すカイコBombyxmori蛹の糖脂質構造の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 橋本恭平,鈴木孝枝,小島寿夫,伊藤將弘,杉田陸海,糸乗前
  • 学会等名: 第30回日本糖質学会年会
  • 発表場所: 長岡リリックホール,新潟県
  • 年月日: 2011-07-11
• [学会発表] Comparative proteome analysis of Caenorhabditis elegans cultured at 2 different temperatures 〓 20°C and 25°C (2011)
  • 著者名/発表者名: K.Monobe, Y.Ishido,A.Terasaswa, Y.Tohsato, T.Hayano,M.Ito
  • 学会等名: 18th International C. elegans Meeting
  • 発表場所: Los Angeles,U.S.A
  • 年月日: 2011-06-24
• [学会発表] Quantitative Proteomic Analysis of 3 Developmental Stages of Caenorhabditis briggsae by Using 2D DIGE and iTRAQ (2011)
  • 著者名/発表者名: A.Terasawa, Y.Tohsato,Y.Ishido, T.Hayano, M.Ito
  • 学会等名: 18th International C. elegans Meeting
  • 発表場所: Los Angeles,U.S.A.
  • 年月日: 2011-06-24
• [学会発表] 軟体動物斧足類バカガイMactra chinensisの中性スフィンゴ糖脂質の構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 原畠鷹, 秋田悠里, 野崎仁崇, 橋本恭平, 西尾匡, 小島寿夫, 齋藤洋昭, 伊藤將弘, 杉田陸海, 糸乗前
  • 学会等名: 第53回日本脂質生化学会
  • 発表場所: ホテル東京ガーデンパレス(東京都)
  • 年月日: 2011-05-13
• [学会発表] Quantitative Proteomic Anaysis of 3 Deveopmenta Stages of Caenorhabditis briggsae by Using 2D DIGE and iTRAQ (2011)
  • 著者名/発表者名: Ayako Terasawa, Yukako Tohsato, Yusuke Ishido, Toshiya Hayano, Masahiro Ito
  • 学会等名: 18th Internationa C.elegans Meeting
  • 発表場所: Los Angeles, USA
• [学会発表] Comparative proteome analysis of Caenorhabditis elegans cultured at 2 different temperatures-20℃ and 25℃ (2011)
  • 著者名/発表者名: Kanami Monobe, Yusuke Ishido, Ayako Terasaswa, Yukako Tohsato, Toshiya Hayano, Masahiro Ito
  • 学会等名: 18th Internationa C.elegans Meeting
  • 発表場所: Los Angeles, USA
• [学会発表] 糖鎖多様性を示すカイコBombyx mori蛹の糖脂質構造の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 橋本恭平, 鈴木孝枝, 小島寿夫, 伊藤將弘, 杉田陸海, 糸乗前
  • 学会等名: 第30回日本糖質学会年会
  • 発表場所: 長岡リリックホール(新潟県)
• [学会発表] ブラインシュリンプArtemia franciscanaの中性糖脂質 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小島寿夫, 樺山一哉, 糸乗前, 伊藤將弘
  • 学会等名: 第30回日本糖質学会年会
  • 発表場所: 長岡リリックホール(新潟県)
• [学会発表] アメリカオオアカイカDosidicus gigas皮のヒト血液型糖鎖配列含有中性スフィンゴ糖脂質の構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 秋田悠里, 原畠鷹, 畑中萌, 橋本恭平, 伊藤將弘, 齋藤洋昭, 松原久, 杉田陸海, 糸乗前
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
• [学会発表] 子嚢菌類Mariannaea elegans由来の新奇糖脂質の構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 谷泰史, 中村香里, 沢良太, 斉藤秀樹, 伊藤將弘, 糸乗前, 三原久明
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府)
• [学会発表] Modeling and Parameter Optimization of the Central Carbon Metabolism of Escherichia coli using Real-coded Genetic Algorithm (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshihiko Matsuda, Hirotada Mori, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
  • 学会等名: GIW2010 (The 21st International Conference on Genome Informatics)
  • 発表場所: Hangzhou, China
  • 年月日: 2010-12-16
• [学会発表] Prediction of EC Numbers from Chemical Structures in Enzymatic Reactions using Mutual Information (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshihiko Matsuda, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
  • 学会等名: GIW2010 (The 21st International Conference on Genome Informatics)
  • 発表場所: Hangzhou, China
  • 年月日: 2010-12-16
• [学会発表] Environmental Dependency of Gene Knockouts on Phenotype Microarray Analysis Escherichia coli (2010)
  • 著者名/発表者名: Yukako Tohsato, Tomboy Baba, Yusaku Mazaki, Masahiro Ito, Barry L.Wanner, Hirotada Mori
  • 学会等名: GIW2010 (The 21st International Conference on Genome Informatics)
  • 発表場所: Hangzhou, China
  • 年月日: 2010-12-16
• [学会発表] Prediction of partial gene regulatory network ofC.elegans early embryo (2010)
  • 著者名/発表者名: 真栄城哲也, 岡野文香, 山中伸一, 物部香奈美, 松田祥彦, 伊藤將弘
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会,第83回日本生化学会年会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] 線虫プロテオームプロジェクト:培養温度20□の線虫Caenorhabditis briggsaeの発生ステージ比較プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 生石剛規, 寺澤彩子, 石堂佑典, 遠里由佳子, 物部香奈美, 松田祥彦, 早野俊哉, 伊藤將弘
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会年会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 線虫プロテオームプロジェクト:2D-DIGEとiTRAQを用いた培養温度27.5□における線虫Caenorhabditis briggsaeの発生ステージ比較定量プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺澤彩子, 石堂佑典, 松田祥彦, 遠里由佳子, 早野俊哉, 伊藤將弘
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会年会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 線虫プロテオームプロジェクト:培養温度25□における線虫Caenorhabditis elegansの発生ステージ比較プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石堂佑典, 物部香奈美, 寺澤彩子, 生石剛規, 遠里由佳子, 早野俊哉, 伊藤將弘
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会,第83回日本生化学会年会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 線虫プロテオームプロジェクト:培養温度20□における線虫Caenorhabditis elegansの発生ステージ比較プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 物部香奈美, 石堂佑典, 松田祥彦, 遠里由佳子, 早野俊哉, 伊藤將弘
  • 学会等名: BMB2010(第33回日本分子生物学会年会,第83回日本生化学会年会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] ブラインシュリンプ(節足動物甲殻綱)における中性糖脂質 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小島寿夫, 糸乗前, 杉田陸海, 藤田典久, 伊藤將弘
  • 学会等名: 第83回日本生化学会大会 第33回日本分子生物学年会 合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] セイヨウミツバチApis mellifera(雄蜂20日齢)におけるスフィンゴ型中性糖脂質の構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西尾匡, 小島寿夫, 橋本健, 立藤智基, 寺内白梅薫, 杉田陸海, 糸乗前, 伊藤將弘
  • 学会等名: 第83回日本生化学会大会 第33回日本分子生物学年会 合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] アメリカオオアカイカDosidicus gigas皮のスフィンゴ脂質 (2010)
  • 著者名/発表者名: 野崎仁崇, 原畠鷹, 橋本恭平, 西尾匡, 小島寿夫, 石川哲, 齋藤洋昭, 伊藤將弘, 杉田陸海, 糸乗前
  • 学会等名: 第49回日本油化学会年会
  • 発表場所: 北海道大学(北海道)
  • 年月日: 2010-09-16
• [学会発表] セイヨウミツバチApis mellifera(雄蜂20日齢)におけるセラミドホスホエタノールアミンとスフィンゴミエリンの構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西尾匡, 小島寿夫, 橋本健, 立藤智基, 寺内白梅薫, 杉田陸海, 糸乗前, 伊藤將弘
  • 学会等名: 第49回日本油化学会年会
  • 発表場所: 北海道大学(北海道)
  • 年月日: 2010-09-16
• [学会発表] Biochemical studies on the sphingolipids of Artemia franciscana (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Kojima, T.Inoue, M. Sugita,S.Itonori, M.Ito
  • 学会等名: 51st International Conference on the Bioscience of Lipids
  • 発表場所: Bilbao,Spain
  • 年月日: 2010-09-07
• [学会発表] Biochemical studies on the sphingolipids of Artemia franciscana (2010)
  • 著者名/発表者名: Kojima, H., Sugita, M., Itonori, S., Ito, M.
  • 学会等名: 51st International Conference on the Bioscience of Lipids
  • 発表場所: Bilbao, Spain
  • 年月日: 2010-09-07
• [学会発表] Characterization of a Glucuronic Acid-containing Glycosphingolipid from the Giant Ezo Scallop Pationopecten yessoensis (2010)
  • 著者名/発表者名: S.Itonori, A.Higashino,K.Hashimoto, H.Nozaki, H.Kojima,M.Ito, H.Saito, M.Sugita
  • 学会等名: The 25th Inernational Carbohydratem Symposium
  • 発表場所: 幕張メッセ,千葉県
  • 年月日: 2010-08-02
• [学会発表] Characterization of Glucuronic Acid-containing Glycosphingolipid from the Giant Ezo Scallop Pationopecten yessoensis (2010)
  • 著者名/発表者名: Itonori, S., Higashino, A., Hashimoto, K., Nozaki, H., Kojima, H., Ito, M., Saito, H., Sugita, M.
  • 学会等名: 25th International Carbohydrate Symposium
  • 発表場所: 幕張メッセ(千葉県)
  • 年月日: 2010-08-02
• [学会発表] Identification and quantitative analysis of protein expression during the developmental stages of Caenorhabditis briggsae (2010)
  • 著者名/発表者名: Ayako Terasawa, Dai Sasahara, Shizuka Hino, Toshiya Hayano, Masahiro Ito.
  • 学会等名: 4th East Asia C.elegans Meeting
  • 発表場所: オリンピックメモリアルセンター(東京都)
  • 年月日: 2010-07-11
• [学会発表] カイコBombyx mori蛹の中性スフィンゴ糖脂質の構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 橋本恭平, 小島寿夫, 西尾匡, 伊藤將弘, 杉田陸海, 糸乗前
  • 学会等名: 第52回日本脂質生化学会
  • 発表場所: 群馬大学(群馬県)
  • 年月日: 2010-06-14
• [学会発表] Parameter optimization and sensitivity analysis for large kinetic models using a real-coded genetic algorithm
  • 著者名/発表者名: Yukako Tohsato, Kunihiko Ikuta, Akitaka Shionoya, Yusaku Mazaki, Masahiro Ito
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: Tainan, Taiwan
• [学会発表] Phenotype microarray analysis of Escherichia coli using infinite relational model
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Sugisawa, Hajime Fukuda, Hirotada Mori, Masahiro Ito, Tadahiro Taniguchi, Yukako Tohsato
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: Tainan, Taiwan
• [学会発表] Modeling of central metabolism with regulation of rpoS gene in Escherichia coli
  • 著者名/発表者名: Akitaka Shionoya, Kunihiko Ikuta, Hitomi Dose, Hirotada Mori, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: Tainan, Taiwan
• [学会発表] Parameter optimization and correlation analysis for a large kinetic model using a real-coded genetic algorithm
  • 著者名/発表者名: Kunihiko Ikuta, Akitaka Shionoya, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: Tainan, Taiwan
• [学会発表] Analysis of the phylogenetic profile of human glycosyltransferases
  • 著者名/発表者名: Takayoshi Tomono, Yukako Tohsato, Masahiro Ito
  • 学会等名: The 23rd International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: Tainan, Taiwan
• [学会発表] Expression and phenotype analyses of the sphingomyelin synthase genes in Caenorhabditis elegans
  • 著者名/発表者名: Haruka Yamaji, Yukako Tohsato, Kenji Suzuki, Masahiro Ito
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡，福岡県
• [学会発表] Proteomic analysis of hydrophobic proteins in nematode Caenorhabditis briggsae
  • 著者名/発表者名: Tetsushi Itami, Narumi Enna, Yukako Tohsato, Toshiya Hayano, Masahiro Ito
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡，福岡県
• [学会発表] Quantitative proteomic analysis at 3 developmental stages of Caenorhabditis elegans cultured at 25°C
  • 著者名/発表者名: Narumi Enna, Kanami Monobe, Yusuke Ishido, Yukako Tohsato, Toshiya Hayano, Masahiro Ito
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡，福岡県
• [学会発表] Comparative proteomic analysis for Caenorhabditis elegans pgl-1 mutants grown at 20°C and 25°C using 2D-DIGE
  • 著者名/発表者名: Yukako Tohsato, Kanami Monobe, Kenji Suzuki, Toshiya Hayano, Ichiro Kawasaki, Masahiro Ito
  • 学会等名: 5th East Asia C. elegans Meeting
  • 発表場所: Taipei, Taiwan
• [学会発表] Quantitative analysis of mRNA expression profiles of ceramide-related genes using qRT-PCR
  • 著者名/発表者名: Haruka Yamaji, Kousuke Hori, Emiko Watase, Yukako Tohsato, Kenji Suzuki, Masahiro Ito
  • 学会等名: 5th East Asia C. elegans Meeting
  • 発表場所: Taipei, Taiwan
• [備考]
  • URL: http://research-db.ritsumei.ac.jp/Profiles/28/0002777/profile.html
• [備考]
  • URL: http://research-db.ritsumei.ac.jp/Profiles/28/0002777/profile.html