ミトコンドリアRNAポリメラーゼ転写反応における酸化DNA損傷の影響

• 研究課題/領域番号: 22510060
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 放射線・化学物質影響科学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 倉岡 功 大阪大学, 大学院・基礎工学研究科, 准教授 (60335396)
• 連携研究者: 岩井 成憲 大阪大学大学院, 基礎工学研究科, 教授 (10168544)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2010年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: ミトコンドリア / RNAポリメラーゼ / 酸化DNA損傷

研究概要

細胞内のエネルギーを生産するミトコンドリアにおいて、その大量な酸素消費から多くの活性酸素が生じ、ミトコンドリア DNAに多くの酸化 DNA損傷を導くことが容易に想像できる。細胞はこの損傷の多いミトコンドリアにおいてどのように転写反応を進めるのだろうか?酸化 DNA損傷を含む DNAテンプレートに対して、プライマーRNAを対形成させ複合体を形成した後、ミトコンドリア RNAポリメラーゼにより RNA合成を観察した。その結果、ミトコンドリア RNAポリメラーゼは、酸化 DNA損傷を乗り越えることがわかった。

研究成果

• [雑誌論文] Establishment of a human cell line sta bly overexpressing mouse Nip45 and characte rization of Nip45 subcellular localization. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hashiguchi K, Ozaki M, Kuraoka I, Saitoh H
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 430 ページ: 72-72
• [雑誌論文] Miscoding properties of 8-ch loro-2′-deoxyguanosine, a hypochlorous aci d-induced DNA adduct, catalysed by huma n DNA polymerases. (2013)
  • 著者名/発表者名: Sassa A, Kamoshita N, Matsuda T, Ishi i Y, Kuraoka I, Nohmi T, Ohta T, Honma M, Yasui M
  • 雑誌名: Mutagenesis 巻: 28 ページ: 81-88
• [雑誌論文] Effects of DNA lesions on the transcription reaction of mitochondrial RNA p olymerase: implications for bypass RNA synt hesis on oxidative DNA lesions. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakanishi N, Fukuoh A, Kang D, Iwai S, Kuraoka I
  • 雑誌名: Mutagenesis 巻: 28 ページ: 117-123
• [雑誌論文] Establishment of a human cell line stably overexpressing mouse Nip45 and characterization of Nip45 subcellular localization. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hashiguchi K, Ozaki M, Kuraoka I, Saitoh H.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 430 ページ: 72-77
  • 査読あり
• [雑誌論文] Miscoding properties of 8-chloro-2'-deoxyguanosine, a hypochlorous acid-induced DNA adduct, catalysed by human DNA polymerases. (2013)
  • 著者名/発表者名: Sassa A, Kamoshita N, Matsuda T, Ishii Y, Kuraoka I, Nohmi T, Ohta T, Honma M, Yasui M.
  • 雑誌名: Mutagenesis 巻: 28 ページ: 81-88
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of DNA lesions on the transcription reaction of mitochondrial RNA polymerase: implications for bypass RNA synthesis on oxidative DNA lesions. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakanishi N, Fukuoh A, Kang D, Iwai S, Kuraoka I.
  • 雑誌名: Mutagenesis 巻: 28 ページ: 117-123
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of 5',8-cyclodeoxya denosine triphosphates on DNA synthesis. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kamakura N, Yamamoto J, Brooks PJ, Iwa i S, Kuraoka I.
  • 雑誌名: Chem Res Toxicol 巻: 25 ページ: 2718-2724
• [雑誌論文] Identification of small molecule prolife rating cell nuclear antigen (PCNA) inhibitor that disrupts interactions with PIP-box prot eins and inhibits DNA replication (2012)
  • 著者名/発表者名: Punchihewa C, Inoue A, Hishiki A, Fuji kawa Y, Connelly M, Evison B, Shao Y, Heath R, Kuraoka I, Rodrigues P, Hashimo to H, Kawanishi M, Sato M, Yagi T, Fujii N
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 287 ページ: 14289-14300
• [雑誌論文] Xeroderma p igmentosum group F protein binds to Eg5 and is required for proper mitosis: implicati ons for XP-F and XFE. (2012)
  • 著者名/発表者名: Tan LJ, Saijo M, Kuraoka I, Narita T, T akahata C, Iwai S, Tanaka K
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 17 ページ: 173-185
• [雑誌論文] When and Where Polymerase s Encounter DNA lesions (2012)
  • 著者名/発表者名: Kuraoka I
  • 雑誌名: Genes and Envir onment 巻: 34 ページ: 58-62
• [雑誌論文] Effects of 5',8-cyclodeoxyadenosine triphosphates on DNA synthesis. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kamakura N, Yamamoto J, Brooks PJ, Iwai S, Kuraoka I.
  • 雑誌名: Chem Res Toxicol. 巻: 25 ページ: 2718-2724
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of small molecule proliferating cell nuclear antigen (PCNA) inhibitor that disrupts interactions with PIP-box proteins and inhibits DNA replication. (2012)
  • 著者名/発表者名: Punchihewa C, Inoue A, Hishiki A, Fujikawa Y, Connelly M, Evison B, Shao Y, Heath R, Kuraoka I, Rodrigues P, Hashimoto H, Kawanishi M, Sato M, Yagi T, Fujii N.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 巻: 287 ページ: 14289-14300
  • 査読あり
• [雑誌論文] Xeroderma pigmentosum group F protein binds to Eg5 and is required for proper mitosis : implications for XP-F and XFE (2012)
  • 著者名/発表者名: Tan LJ, Saijo M, Kuraoka I, Narita T, Takahata C, Iwai S, Tanaka K
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 16 ページ: 173-185
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of a small molecule PCNA inhibitor that disrupts interactions with PIP-Box proteins and inhibits DNA replication (2012)
  • 著者名/発表者名: Punchihewa C, Inoue A, Hishiki A, Fujikawa Y, Connelly M, Evison B, Shao Y, Heath R, Kuraoka I, Rodrigues P, Hashimoto H, Kawanishi M, Sato M, Yagi T, Fujii N
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] A method for detecting genetic toxicity using the RN A synthesis response to DNA damage. (2011)
  • 著者名/発表者名: Morita Y, Iwai S, Kuraoka I
  • 雑誌名: JTox icol Sci 巻: 36 ページ: 515-521
• [雑誌論文] Mutant Cockayne syn drome group B protein inhibits repair of D NA topoisomerase I-DNA covalent complex. (2011)
  • 著者名/発表者名: Horibata K, Saijo M, Bay MN, Lan L, Kuraoka I, Brooks PJ, Honma M, Nohmi T, Yasui A, Tanaka K
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 16 ページ: 101-114
• [雑誌論文] A method for detecting genetic toxicity using the RNA synthesis response to DNA damage (2011)
  • 著者名/発表者名: Morita Y, Iwai S, Kuraoka I
  • 雑誌名: J Toxicol Sci 巻: 5 ページ: 515-521
  • NAID: 10029481056
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of a Y-family DNA polym erase eta from the eukaryotic thermophile Alvinella pompejana (2010)
  • 著者名/発表者名: Kashiwagi S, Kuraoka I, Fujiwara Y, Hit omi K, Cheng QJ, Fuss, JO, Shin, DS, Masutani C, Tainer, JA, Hanaoka F, Iwai S
  • 雑誌名: J.Nucleic Acids
• [雑誌論文] MMXD, a TFIIH-indepen dent XPD-MMS19 protein complex involved in chromosome segregation. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ito S, Tan LJ, Andoh D, Narita T, Seki M, Hirano Y, Narita K, Kuraoka I, Hirao ka Y, Tanaka K
  • 雑誌名: Mol Cell 巻: 39 ページ: 632-40
• [雑誌論文] A non-isotopic assay uses bromouridine and RNA synthesis to detect DNA damage responses (2010)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa M, Iwai S, Kuraoka I
  • 雑誌名: Mutat Res 巻: 699 ページ: 62-66
• [雑誌論文] Fluorescent probes for the a nalysis of DNA strand scission in base exc ision repair. (2010)
  • 著者名/発表者名: atsumoto N, Toga T, Hayashi R, Suga sawa K, Katayanagi K. Ide H, Kuraoka I, Iwai S
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 38
• [雑誌論文] Polymerization by D NA polymerase eta is blocked by cis-diam minedichloroplatinum(II) 1,3-d(GpTpG) cros slink: Implications for cytotoxic effects in nucleotide excision repair-negative tumor ce lls. (2010)
  • 著者名/発表者名: Chijiwa S, Masutani C, Hanaoka F, Iwai S, Kuraoka I
  • 雑誌名: Carcinogenesis 巻: 31 ページ: 388-393
• [雑誌論文] Fluorescent probes for the analysis of DNA strand scission in base excision repair. (2010)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto N, Toga T, Hayashi R, Sugasawa K, Katayanagi K, Ide H, Kuraoka I, Iwai S
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 38
  • 査読あり
• [雑誌論文] A non-isotopic assay uses bromouridine and RNA synthesis to detect DNA damage responses. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa M, Iwai S, Kuraoka I.
  • 雑誌名: Mutat Res. 巻: 699 ページ: 62-66
  • 査読あり
• [雑誌論文] MMXD, a TFIIH-independent XPD-MMS19 protein complex involved in chromosome segregation. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ito S, Tan LJ, Andoh D, Narita T, Seki M, Hirano Y, Narita K, Kuraoka I, Hiraoka Y, Tanaka K
  • 雑誌名: Mol.Cell. 巻: 39 ページ: 632-640
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of a Y-Family DNA Polymerase eta from the Eukaryotic Thermophile Alvinella pompejana. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kashiwagi S, Kuraoka I, Fujiwara Y, Hitomi K, Cheng QJ, Fuss JO, Shin DS, Masutani C, Tainer JA, Hanaoka F, Iwai S.
  • 雑誌名: J Nucleic Acids. ページ: 701472-701472
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutant Cockayne syndrome group B protein inhibits repair of DNA topoisomerase I-DNA covalent complex. (2010)
  • 著者名/発表者名: Horibata K, Saijo M, Bay MN, Lan L, Kuraoka I, Brooks PJ, Honma M, Nohmi T, Yasui A, Tanaka K.
  • 雑誌名: Genes Cells. 巻: 16 ページ: 101-114
  • 査読あり
• [学会発表] New function of a struc ture-specific nuclease human endonuclea se V (2012)
  • 著者名/発表者名: Isao Kuraoka
  • 学会等名: EMBO workshop Structure-specific nucleases in DNA replication & repair
  • 発表場所: Cote DAzur, France
  • 年月日: 2012-09-18
• [学会発表] ミトコンドリア RNAポリメラーゼ転写反応における酸化 DNA損傷の影響 (2012)
  • 著者名/発表者名: 倉岡 功
  • 学会等名: 日本放射線影響学会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2012-09-07
• [学会発表] New function of human e ndonuclease V (2012)
  • 著者名/発表者名: Isao Kuraoka
  • 学会等名: US-JAPAN DNA repair meet ing
  • 発表場所: VIRGINIA, USA
  • 年月日: 2012-04-12
• [学会発表] New function of human endonuclease V (2012)
  • 著者名/発表者名: Isao Kuraoka
  • 学会等名: US-JAPAN DNA REPAIR MEETING
  • 発表場所: VIRGINIA, USA
  • 招待講演
• [学会発表] New fuction of a structure-specific nuclease human endonuclease V (2012)
  • 著者名/発表者名: Isao Kuraoka
  • 学会等名: EMBO Workshop Structure-specific nucleases in DNA replication & repair
  • 発表場所: Cote D’Azur, France
  • 招待講演
• [学会発表] ミトコンドリアRNAポリメラーゼ転写反応における酸化DNA損傷の影響 (2012)
  • 著者名/発表者名: 倉岡功
  • 学会等名: 日本放射線影響学会第55回大会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Effects of oxidative DNA les ions on transcription by mitochondria R NA polymerase (2011)
  • 著者名/発表者名: 倉岡 功
  • 学会等名: 第34回大会日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Effects of oxidative DNA lesions on transcription by mitochondria RNA polymerase (2011)
  • 著者名/発表者名: 倉岡功
  • 学会等名: 第34回大会日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)(招待講演)
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] ヒトFLJ35220タンパク質の機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 森田陽子、岩井成憲、倉岡功
  • 学会等名: 日本環境変異原学会第40回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2011-11-21
• [学会発表] ヒトFLJ35220タンパク質の機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 森田陽子、岩井成憲、倉岡功
  • 学会等名: 日本環境変異原学会第40回大会
  • 発表場所: 学術総合センター(東京都)
  • 年月日: 2011-11-21
• [学会発表] An Assay for Genetic Toxicity using Transcription-Response to Damaged DNA (2010)
  • 著者名/発表者名: 倉岡 功
  • 学会等名: 2nd Asian Conference on Environmental Mutagens
  • 発表場所: Pataya, Thai
  • 年月日: 2010-12-16
• [学会発表] An Assay for Genetic Toxicity using Transcription-Response to Damaged DNA (2010)
  • 著者名/発表者名: 倉岡功
  • 学会等名: 2^<nd> Asian Conference on Environmental Mutagens
  • 発表場所: パタヤ(タイ)
  • 年月日: 2010-12-16
• [学会発表] 損傷 DNAを鋳型にした RNA伸長反応と変異の分子メカニズム (2010)
  • 著者名/発表者名: 倉岡 功
  • 学会等名: 第39回日本環境変異原学会
  • 発表場所: 筑波
  • 年月日: 2010-11-16
• [学会発表] 損傷DNAを鋳型にしたRNA伸長反応と変異の分子メカニズム (2010)
  • 著者名/発表者名: 倉岡功
  • 学会等名: 第39回日本環境変異原学会
  • 発表場所: 筑波(招待講演)
  • 年月日: 2010-11-16
• [学会発表] A cis-Diamminedichloroplatinum (II) 1,3-d(GpTpG) crosslinks blocks polymeriz ation by DNA polymerase h (2010)
  • 著者名/発表者名: 倉岡 功
  • 学会等名: 第37回国際核酸科学シンポジウム
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] A cis-Diamminedichloroplatinum(II)1,3-d(GpTpG)crosslinks blocks polymerization by DNA polymerase h (2010)
  • 著者名/発表者名: 倉岡功
  • 学会等名: 第37回国際核酸科学シンポジウム
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2010-11-10
• [学会発表] RNA合成阻害を用いた non R I-DNA損傷検出系 (2010)
  • 著者名/発表者名: 倉岡 功
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-22
• [学会発表] RNA合成阻害を用いたnon RI-DNA損傷検出系 (2010)
  • 著者名/発表者名: 倉岡功
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-22