研究課題
基盤研究(C)
本研究では、核移行シグナル予測ツールの植物対応版(cNLS Mapper II)の開発、および核外移行シグナル予測ツール(NESmapper)の開発を行った。NES予測ツールの開発では、4つのNESクラスについて作成したNES活性プロファイルを基にNESmapperを開発した。テストデータを用いたNES予測テストでは、ネガティブデータからのNES予測を10%以下に抑え、ポジティブデータの8割以上を予測することに成功した。開発したNES予測プログラムの予測精度は、既存のNES予測ツールの予測精度を上回るものであり、最も有用なNES予測ツールとして提供できることが期待される。
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DNA Research
巻: (Epub ahead of print) 号: 3 ページ: 231-241
10.1093/dnares/dst053
PLoS One
巻: 8 号: 10 ページ: e75402-e75402
10.1371/journal.pone.0075402
Plant Journal
巻: 74 号: 12 ページ: 174-183
10.1371/journal.pone.0083720
巻: 8 号: 7 ページ: e68529-e68529
10.1371/journal.pone.0068529
Nature Biotechnology
巻: 30 号: 2 ページ: 174-178
10.1038/nbt.2095
Carcinogenesis.
巻: 10 号: 10 ページ: 1854-1862
10.1093/carcin/bgs193
生化学
巻: 82 ページ: 37-40
10026607748
http://www.jbsoc.or.jp/back_no/82-7